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        Shaker通道電壓感受器S3-S4片段末端氨基酸分析

        2012-12-03 08:09:08尚德志張麗艷汲坤沈薇牟均
        關(guān)鍵詞:效率

        尚德志,張麗艷,汲坤,沈薇,牟均

        (沈陽醫(yī)學(xué)院1.口腔醫(yī)學(xué)院頜面外科;2.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病理生理教研室;3.國資處,沈陽11003 4)

        電壓門控鉀通道(Kv)由電壓感受器(S1-S4)和孔道區(qū)域(S5-P-S6)組成。傳統(tǒng)的電壓門控機(jī)制Shaker模型建立在大量電生理數(shù)據(jù)基礎(chǔ)之上,認(rèn)為S3-S4是跨膜片段,S4因帶有大量電荷,位于由S1-S3片段及相鄰亞單位的S5組成的水性環(huán)境中間[1]。隨著古細(xì)菌電壓門控KvAP蛋白X-ray結(jié)晶的成功,學(xué)者們又提出了1個(gè)新的電壓門控機(jī)制模型,即KvAP模型。該模型認(rèn)為S3-S4形成1個(gè)槳狀物,游離于孔道區(qū)域之外,靜息狀態(tài)時(shí),平行于膜的內(nèi)表面,除極化時(shí),通過杠桿式外移轉(zhuǎn)為跨膜片段[2]。兩大機(jī)制模型分歧的焦點(diǎn)在于電壓感受器S4的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),如S4在膜中所處的位置,S4與其他跨膜片段的空間位置關(guān)系等。膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析是研究膜蛋白的各個(gè)跨膜片段在蛋白合成的同時(shí)如何整合到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,并最終形成什么樣的跨膜結(jié)構(gòu)。糖基化反應(yīng)常被用來分析膜蛋白的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)[3],而糖基化反應(yīng)是否有效進(jìn)行取決于其糖基化受體位點(diǎn)是否符合12-14規(guī)則[4],此規(guī)則已被用來分析膜蛋白跨膜區(qū)的邊界[5]。本研究采用膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析和糖基化掃描方法分析了Kv家族中具有代表性的Shaker通道的電壓感受器S3-S4的膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),旨在推斷其在膜中所處的位置,為分析電壓門控機(jī)制提供了結(jié)構(gòu)上的信息。

        1 材料與方法

        1.1 質(zhì)粒構(gòu)建

        采用2步PCR方法,去除Shaker通道的N端,以增加該蛋白的體外合成效率,同時(shí)通過點(diǎn)變異的方式去除Shaker通道位于S1-S2連接中的2個(gè)內(nèi)源性糖基化受體位點(diǎn)N259和N263,然后把來自于人帶3蛋白中含有1個(gè)糖基化受體位點(diǎn)的G-loop插入到S3-S4連接中,以分析S3-S4的膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),最后把編碼ShakerS1-S4(K198-F401)區(qū)域的DNA融合到攜帶有PL報(bào)告基因的pCITE-2a載體(No-vagen,Madison,WI)中(圖1A)。

        1.2 無細(xì)胞系統(tǒng)蛋白轉(zhuǎn)錄、翻譯及轉(zhuǎn)運(yùn)實(shí)驗(yàn)

        將所有質(zhì)粒通過ScaI酶切線性化,在標(biāo)準(zhǔn)條件下利用T7 RNA多聚酶進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄,37℃,1 h。把獲得的mRNA在含有或不含有狗胰腺粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)小泡(rough microsome,RM)的兔網(wǎng)織紅細(xì)胞抽出液系統(tǒng)中進(jìn)行體外蛋白合成和轉(zhuǎn)運(yùn),30℃,1 h。采用蛋白激酶K對(duì)在含有RM條件下合成的蛋白產(chǎn)物進(jìn)一步進(jìn)行蛋白水解實(shí)驗(yàn),用[35S]蛋氨酸標(biāo)記蛋白,SDS-PAGE電泳分離蛋白產(chǎn)物,最后進(jìn)行同位素自顯影。

        1.3 糖基化掃描方法

        在已獲得有效糖基化的ShakerS1-S4構(gòu)建體基礎(chǔ)上,把NSS受體位點(diǎn)分別引進(jìn)到S3-S4連接的不同位置(圖2A),然后根據(jù)糖基化的有無及其程度和12-14規(guī)則來推測可能的S3、S4跨膜末端。糖基化效率由糖基化的蛋白帶的強(qiáng)度除以糖基化蛋白帶與未被糖基化的蛋白帶強(qiáng)度之和計(jì)算獲得。有效的糖基化效率定義為至少應(yīng)該達(dá)到最大糖基化效率的一半,突然的糖基化效率下降可視為該糖基化位點(diǎn)超出所謂的12-14距離。

        2 結(jié)果

        2.1 Shaker中S1-S4的膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析

        在未添加RM的條件下,ShakerS1-S4-PL經(jīng)體外合成后,出現(xiàn)1條分子量約為50 kDa的蛋白帶,這是未被糖基化的蛋白帶(圖1B)。在RM存在的條件下,出現(xiàn)1條明顯的糖基化蛋白帶,分子量比未被糖基化的蛋白帶多出約3 kDa。在RM存在條件下獲得的蛋白經(jīng)過蛋白激酶K處理后,所有蛋白帶消失。提示Shaker的S3-S4能被有效地轉(zhuǎn)移整合到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,S3是以Ncyt/Cexo的方向,S4是以Ncyt/Cexo的方向插入到膜上的(圖1C)。

        2.2 Shaker中S3、S4片斷末端氨基酸殘基分析

        圖2B為糖基化掃描的SDS-PAGE結(jié)果,其糖基化效率見圖3A。NSS位點(diǎn)在G20的構(gòu)建體是基礎(chǔ)質(zhì)粒(同圖1),其糖基化效率(36.0%±1.8%)與圖1相似,為有效糖基化。第1個(gè)被糖基化的受體位點(diǎn)位于殘基342,其糖基化效率為28.0%±2%;最后1個(gè)被糖基化的受體位點(diǎn)位于殘基345,其糖基化效率為18.0%±0.8%,說明這2個(gè)受體位點(diǎn)恰好位于能與寡糖基轉(zhuǎn)移酶的活性位點(diǎn)結(jié)合的最短距離。雖然最后幾個(gè)糖基化位點(diǎn)的效率偏低,但均能達(dá)到最大效率的50%,G38位點(diǎn)除外。根據(jù)12-14規(guī)則,可推測出Shaker中S3-S4跨膜片段的末端氨基酸位置(圖3C)。Shaker通道中,S3的C端位于T329,S4的N端位于L358。

        2.3 Shaker中S3、S4片段膜中位置分析

        SOSUI疏水性分析發(fā)現(xiàn)S3的N端起始于V311,C 端終止于 T329;S4的 N 端起始于 L358,C端終止于R377,見圖3B。其S3的C端殘基和S4的N端殘基與圖3C推測出的數(shù)據(jù)一致,由此推論Shaker的S3與S4均為跨膜片段。

        3 討論

        目前,常利用無細(xì)胞系統(tǒng)進(jìn)行膜蛋白的體外轉(zhuǎn)錄、翻譯和轉(zhuǎn)運(yùn)實(shí)驗(yàn),然后根據(jù)合成的蛋白肽鏈?zhǔn)欠癜l(fā)生糖基化反應(yīng),以及是否被蛋白水解酶降解等特點(diǎn),分析膜蛋白的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)[3]。蛋白肽鏈的糖基化反應(yīng)通常在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜腔內(nèi)進(jìn)行,在寡糖基轉(zhuǎn)移酶的作用下,1個(gè)糖基化受體位點(diǎn)(Nsn-X-Ser/Thr,其中X為任何一種氨基酸)接受1個(gè)高甘露糖基寡聚糖,其分子量會(huì)增加2.5 kDa。圖1B中,在RM存在的條件下,糖基化蛋白帶的出現(xiàn)說明S3-S4連接位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)(細(xì)胞外),所以其人工導(dǎo)入的G-loop上的糖基化受體位點(diǎn)才能被糖基化。糖基化效率為(37.0±2.0)%,說明該位點(diǎn)被有效地糖基化。位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)的蛋白肽鏈除了可發(fā)生糖基化反應(yīng)外,因受到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的保護(hù),不會(huì)被蛋白水解酶降解。圖1B中,在RM存在下獲得的蛋白肽鏈經(jīng)過蛋白激酶K處理后,所有蛋白帶消失,說明S1-S4蛋白肽鏈C端(含報(bào)告蛋白PL)位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔外(細(xì)胞內(nèi)),因而被蛋白激酶K消化降解。由這些結(jié)果推斷出S3是以Ncyt/Cexo的方向,S4是以Ncyt/Cexo的方向整合到膜上的。

        膜蛋白的糖基化反應(yīng)是否有效進(jìn)行取決于膜蛋白的糖基化受體位點(diǎn)能否與膜上寡糖基轉(zhuǎn)移酶的活性位點(diǎn)結(jié)合,而該活性位點(diǎn)距內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜有一定的距離。1993年Nilsson等[4]利用大腸桿菌前導(dǎo)肽酶提出了12-14規(guī)則,認(rèn)為糖基化受體位點(diǎn)的N端距內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜表面至少有12個(gè)殘基的距離,C端至少有14個(gè)殘基的距離,才能被有效糖基化[4]。

        本研究通過糖基化掃描的方法,根據(jù)12-14規(guī)則,推測出ShakerS3-S4片段的細(xì)胞外末端氨基酸殘基,并由此推測出其在膜中可能的位置。因?yàn)槟さ鞍自趦?nèi)質(zhì)網(wǎng)翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)的同時(shí)進(jìn)行折疊,形成蛋白的3級(jí)結(jié)構(gòu),因而其膜整合的一些結(jié)構(gòu)信息可能代表著膜蛋白的最終結(jié)構(gòu)信息。目前,對(duì)于Kv通道電壓門控機(jī)制的研究主要集中在電生理和X-ray結(jié)晶方面[6,7],本研究試圖從膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析的角度對(duì)其進(jìn)行評(píng)價(jià)。我們的糖基化掃描結(jié)果認(rèn)為Shaker的S3、S4為跨膜片斷,與傳統(tǒng)的Shaker電壓門控機(jī)制模型一致,為電壓門控機(jī)制的研究提供了線索。

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