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        鴨流感病毒HA基因遺傳變異分析

        2012-11-20 05:48:40馬德明解觀增楊志隆河北省故城縣畜牧水產(chǎn)局河北衡水253800莊燕飛常維山山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)科院山東泰安
        山東畜牧獸醫(yī) 2012年8期
        關(guān)鍵詞:遺傳變異進(jìn)化樹(shù)流感病毒

        馬德明 解觀增 楊志隆 (河北省故城縣畜牧水產(chǎn)局 河北 衡水 253800) 莊燕飛 常維山 (山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)科院 山東 泰安)

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        鴨流感病毒HA基因遺傳變異分析

        馬德明 解觀增 楊志隆 (河北省故城縣畜牧水產(chǎn)局 河北 衡水 253800) 莊燕飛 常維山*(山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)科院 山東 泰安)

        本文根據(jù)近年來(lái)中國(guó)醫(yī)學(xué)機(jī)構(gòu)發(fā)表的分離自我國(guó)鴨群的流感病毒HA基因,與我國(guó)正在使用的流感疫苗等毒株的HA基因進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,目前我國(guó)流行的鴨流感病毒與H5N1 Re-5最接近,但是也有一定程度的變異。

        鴨流感病毒 血凝素基因 遺傳變異

        引起鴨發(fā)病并造成損失的流感病毒以H5亞型毒株最為常見(jiàn),一般小鴨比老鴨易感。健康鴨接觸病鴨或被病毒污染的飼料、設(shè)備、運(yùn)載工具、蛋筐、衣物、鞋帽等就會(huì)感染發(fā)病,并迅速傳播開(kāi)來(lái)。該病一年四季均可發(fā)生,但以每年冬季至次年初夏多發(fā),特別是氣候驟變、寒流過(guò)后或陰雨連綿的天氣最易暴發(fā)。該病傳播極快,在數(shù)天內(nèi)即可蔓延到鄰近鴨場(chǎng)。單純鴨流感死亡率很低或無(wú)死亡,多因繼發(fā)感染而導(dǎo)致死亡,但是近年來(lái)單純鴨流感病毒感染也可造成嚴(yán)重的損失。本文分析了兩株我國(guó)醫(yī)學(xué)機(jī)構(gòu)發(fā)表的分離自我國(guó)鴨糞便和圈養(yǎng)鴨群的流感病毒HA基因與我國(guó)正在使用的禽流感疫苗等毒株的HA基因的進(jìn)行了遺傳變異分析。

        1 材料與方法

        1.1 基因來(lái)源 見(jiàn)表1。

        表1 基因來(lái)源

        注:CY098790由中國(guó)疾病預(yù)防與控制中心分離[1],JN646713由杭州某醫(yī)院分離[2], GU596984由揚(yáng)州大學(xué)分離[3]。

        1.2 同源性比較與進(jìn)化樹(shù)分析 將表1中病毒序列從GENBANK上下載,利用DNAStar軟件比較同源性、制作進(jìn)化樹(shù)。

        2 結(jié)果

        2.1 鴨流感病毒HA基因同源性比較 近年我國(guó)來(lái)分離的鴨流感病毒與其他流感病毒HA基因同源性比較,見(jiàn)表2。

        表2 近年來(lái)分離的鴨流感病毒與其他流感病毒HA基因同源性比較

        由表2可以看出2009年分離的CY098790與Re-5的HA基因的同源性為97.3%;2011年分離的JN646713與Re-5的同源性為94%。

        2.2 鴨流感病毒HA基因遺傳進(jìn)化樹(shù) 近年我國(guó)來(lái)分離的鴨流感病毒與其他鴨流感病毒HA進(jìn)化關(guān)系,見(jiàn)圖1。

        圖1 鴨流感病毒HA基因遺傳進(jìn)化樹(shù)

        由圖1可以看出,2009年分離的CY098790與Re-5和2008年分離的GU596984可聚為同一支,2011年分離的JN935004與CY098751為另一支,Re-1和Re-4與上述毒株相距更遠(yuǎn)。

        3 討論

        近年來(lái),國(guó)內(nèi)獸醫(yī)領(lǐng)域鮮有鴨高致病性禽流感病毒的研究報(bào)告。我國(guó)目前使用的H5N1 Re-4、H5N1 Re-5疫苗原始毒株都是2006年分離的[4],距今已6年,本文證明在此期間我國(guó)流行的H5N1已發(fā)生了一定程度的變異。

        根據(jù)遺傳進(jìn)化樹(shù)圖可知,2009年以前分離的鴨流感病毒可與Re-5分為一支,2011年分離的鴨流感病毒與目前使用的三株疫苗毒株H5N1 Re-1,Re-4,Re-5親緣關(guān)系都有一定距離,雖然與Re-5親緣關(guān)系相對(duì)較近,但是已不屬于同一家族。有鑒于此,我國(guó)疫苗研發(fā)部門應(yīng)盡快推出新的鴨用流感(H5N1)疫苗。

        [1] Xiu-Feng Wan,Libo Dong,Yu Lan,et al.Indications that Live Poultry Markets Are a Major Source of Human H5N1 Influenza Virus Infection in China. J Virol. 2011,85(24): 13432–13438

        [2] Hai-Bo,W., Chao-Tan,G., Ru-Feng,L.,et al.Characterization of a highly pathogenic H5N1 avian influenza virus isolated from ducks in Eastern China in 2011. Arch. Virol. 2012,157(6): 1131-1136

        [3] 顧敏, 劉文博, 曹軍平等. 1株含H9N2內(nèi)部基因的H5N1亞型基因重配禽流感病毒的全基因測(cè)序及遺傳進(jìn)化分析[J]. 病毒學(xué)報(bào), 2010, 26(4): 298-304.

        [4] 田國(guó)彬, 曾顯營(yíng), 鐘功勛等. H5N1亞型禽流感變異株滅活疫苗種毒Re-4株的生物學(xué)特性及免疫原性研究[J]. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào), 2009, 31(9): 717-720.

        (2012–07–29)

        S834.2

        A

        1007-1733(2012)08-0014-02

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