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        海南島象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)的種類鑒定及其rDNA-ITS序列分析

        2012-10-12 08:14:02符美英肖彤斌黃偉明陳綿才
        生物安全學(xué)報(bào) 2012年1期
        關(guān)鍵詞:酯酶海南島花紋

        符美英,芮 凱,肖彤斌,黃偉明,陳綿才

        海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)環(huán)境與植物保護(hù)研究所,海南省植物病蟲(chóng)害防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南海口571100

        根結(jié)線蟲(chóng)Meloidogyne spp.是一類在經(jīng)濟(jì)上極為重要的植物專性寄生線蟲(chóng),廣泛分布于世界各地,在35°S與35°N之間的地區(qū)分布最多(汪來(lái)發(fā)等,2001)。目前已報(bào)道有90多個(gè)種,但Karssen et al.(1999)認(rèn)為僅81個(gè)為有效種。根結(jié)線蟲(chóng)可寄生2000多種植物,是普遍且重要的農(nóng)作物病原線蟲(chóng),一般造成農(nóng)作物減產(chǎn)10% ~20%,嚴(yán)重的達(dá)75%以上。

        海南島是我國(guó)唯一的熱帶陸海海域省份,氣候條件優(yōu)越,一年四季均適合農(nóng)作物的生長(zhǎng)。隨著熱帶現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展,農(nóng)作物復(fù)種指數(shù)不斷提高,根結(jié)線蟲(chóng)病發(fā)生與危害日趨嚴(yán)重,給農(nóng)作物的產(chǎn)量和品質(zhì)造成較大影響,已成為制約熱帶特色現(xiàn)代農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的主要障礙因子。

        在根結(jié)線蟲(chóng)的形態(tài)學(xué)分類中,會(huì)陰花紋一直被認(rèn)為最具有應(yīng)用價(jià)值(趙洪海,1999)。但由于一些種類個(gè)體間會(huì)陰花紋變異較大,如果僅憑此特征作為鑒定依據(jù),可能導(dǎo)致鑒定誤差(卓侃等,2008)?;诟Y(jié)線蟲(chóng)同工酶特別是酯酶和蘋果酸脫氫酶譜型的穩(wěn)定性,將其應(yīng)用于根結(jié)線蟲(chóng)分類鑒定已越來(lái)越受到植物線蟲(chóng)學(xué)者的重視和關(guān)注。近年來(lái),分子生物學(xué)技術(shù)作為一種輔助手段也廣泛應(yīng)用于根結(jié)線蟲(chóng)的分類鑒定中。Powers et al.(1993)用PCR技術(shù)研究了南方根結(jié)線蟲(chóng)M.incongnita Kofoid et White等8種根結(jié)線蟲(chóng)的線粒體DNA(mtDNA),得到了不同大小的擴(kuò)增片段,一些不能區(qū)分的片段,則通過(guò)進(jìn)一步酶切鑒定。ITS(intemal transeribed spacer region)是一個(gè)通用的遺傳標(biāo)記,被廣泛應(yīng)用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)、預(yù)測(cè)種群結(jié)構(gòu)、評(píng)估種群進(jìn)化過(guò)程,以及確定分類地位等方面。廖金鈴(2001)對(duì)根結(jié)線蟲(chóng)核糖體DNA的ITS區(qū)進(jìn)行研究,通過(guò)分析熒光AFLP片段和對(duì)18S DNA、ITS區(qū)、26S DNA進(jìn)行擴(kuò)增、克隆與測(cè)序,成功地鑒定出花生根結(jié)線蟲(chóng)M.arenaria(Neal)Chitwood、南方根結(jié)線蟲(chóng)、瓜哇根結(jié)線蟲(chóng)M.javanica Treub和最近描述的一個(gè)新種番禺根結(jié)線蟲(chóng)M.panyuensis Liao。

        象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)是一種重要的植物病原線蟲(chóng),現(xiàn)已廣泛分布于世界四大洲的熱帶亞熱帶地區(qū),歐洲及地中海植物保護(hù)組織(EPPO)已將其列入檢疫名單。我國(guó)當(dāng)前僅在海南省和廣東省發(fā)現(xiàn)該蟲(chóng)(卓侃等,2008),且國(guó)內(nèi)關(guān)于象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)的報(bào)道也較少。據(jù)此,筆者試圖運(yùn)用形態(tài)學(xué)、酯酶表型和分子生物學(xué)方法對(duì)海南島象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)進(jìn)行全面而準(zhǔn)確的鑒定,并對(duì)其分子特征加以分析,旨在為今后開(kāi)展進(jìn)一步研究提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試蟲(chóng)源

        供試病原根結(jié)線蟲(chóng)采集于海南島各主要農(nóng)作物主產(chǎn)區(qū),分別將單卵塊接種于預(yù)先用消毒土培植的感病品種番茄根上,進(jìn)行活體保存,待用。

        1.2 形態(tài)學(xué)鑒定

        1.2.1 雌蟲(chóng)主要形態(tài)特征觀察 觀察頭部、尾部特征等,每個(gè)種群共觀測(cè)20頭。主要測(cè)計(jì)指標(biāo)為體長(zhǎng)、最大體寬、口針長(zhǎng)、DGO(背食道腺開(kāi)口至口針基部球的距離)、口針基部球高、口針基部球?qū)?、中食道球長(zhǎng)、中食道球?qū)挕?/p>

        1.2.2 2齡幼蟲(chóng)(J2)形態(tài)觀察及測(cè)量 主要觀察頭部和尾部特征,每個(gè)種群共觀測(cè)20頭。測(cè)計(jì)指標(biāo)除了1.2.1中涉及的指標(biāo)外,還包括尾長(zhǎng)、透明尾長(zhǎng)和a值(體長(zhǎng)/最大體寬)。

        1.2.3 會(huì)陰花紋的制作與觀察 用挑針在體視顯微鏡下解剖根結(jié),每個(gè)種群挑取成熟雌蟲(chóng)20頭移入硬塑料板上的清水滴中,修切后剔除雜物,并用清水清洗3次;然后將包含完整會(huì)陰花紋的角質(zhì)膜轉(zhuǎn)移到載玻片上,加蓋玻片;干燥后在顯微鏡下觀察會(huì)陰花紋的形態(tài)特征并拍照。

        1.3 同工酶分析

        運(yùn)用常規(guī)聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)進(jìn)行同工酶分析。電泳分析采用北京六一儀器廠生產(chǎn)的DYY-6B型電泳儀,7%分離膠和4%濃縮膠,每孔加入20頭純化培養(yǎng)的年輕雌蟲(chóng)酶提取物。酯酶染色參照胡凱基(1988)的方法。以已鑒定的爪哇根結(jié)線蟲(chóng)樣本作為參照系。酯酶表型的命名按照Esbenshade&Triantaphyllou(1985)的方法。

        1.4 DNA 的提取

        參照萬(wàn)新龍等(2007)的方法稍做改進(jìn),用挑針將單頭根結(jié)線蟲(chóng)雌蟲(chóng)從根結(jié)中挑出,放入200 μL的PCR管中,加入8 μL滅菌水,并用槍頭將線蟲(chóng)蟲(chóng)體戳破,直至內(nèi)含物溢出;再加入2 μL 5×裂解buffer(10 × PCR buffer與1000 μg·mL-1蛋白酶 K,按等體積比混合);將PCR管轉(zhuǎn)移到-70℃冰箱中,冷凍30 min;將冷凍后的PCR管置于PCR儀中,65℃ 1 h,95℃ 10 min;掌上離心機(jī)瞬時(shí)離心后,取上清液用于PCR擴(kuò)增或置于-20℃冰箱中備用。

        1.5 mtDNA PCR 擴(kuò)增

        采用引物#C2F3(5'-GGTCAATGTCAGAAATTTGTGG-3')和#1108(5'-TACCTTTGACCAATCACGCT-3')對(duì)根結(jié)線蟲(chóng)mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列進(jìn)行擴(kuò)增(黃偉明等,2011)。反應(yīng)總體系為25 μL,引物各 1.0 μL,Perfectshot Ex Taq 12.5 μL(大連寶生物),模板 DNA 0.5 μL,ddH2O 10 μL。反應(yīng)參數(shù):94℃預(yù)變性4 min;94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸1.5 min,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。

        取10 μL PCR產(chǎn)物在濃度為1.5%的瓊脂糖凝膠上檢測(cè)所擴(kuò)增片段的大小,用凝膠成像系統(tǒng)觀察、拍照。

        1.6 rDNA-ITS 序列擴(kuò)增

        采用Vrain et al.(1992)設(shè)計(jì)的18S和28S引物(由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成),其序列分別為:5'-TTGATTACGTCCCTGCCCTTT-3'和5'-TTTCACTCGCCGTTACTAAGG-3',對(duì)根結(jié)線蟲(chóng)的rDNA-ITS進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)總體系為25 μL,引物各 1.0 μL,Perfectshot Ex Taq 12.5 μL(大連寶生物工程有限公司),模板 DNA 0.5 μL,ddH2O 10 μL。反應(yīng)參數(shù):94℃預(yù)變性4 min;94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。擴(kuò)增片段大小的檢測(cè)方法與1.5一致。

        1.7 PCR產(chǎn)物的克隆、測(cè)序與比對(duì)分析

        對(duì)獲得的mtDNA和ITS條帶進(jìn)行回收,將純化后的PCR產(chǎn)物與pGEM-T Easy Vector載體(Promega)于4℃下連接12 h以上后,采用熱擊法轉(zhuǎn)化到E.coli DH5a感受態(tài)細(xì)胞中。在含有氨芐Ampicillin(100 mg·L-1)、IPTG(24 mg·L-1)和 X-gal(20 mg·L-1)的LB篩選平板上挑取單個(gè)白色菌落于含有氨芐(100 mg·L-1)的液體LB中搖菌過(guò)夜。采用質(zhì)粒提取試劑盒(OMEGA)提取重組質(zhì)粒DNA,經(jīng)PCR鑒定后,篩選出含有正確插入片段的重組克隆進(jìn)行測(cè)序(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司)。采用MEGA軟件包中的Neighbor-Joining聚類分析法對(duì)所測(cè)定的序列進(jìn)行比對(duì)分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 形態(tài)學(xué)鑒定

        2.1.1 觀測(cè)值 通過(guò)顯微鏡觀察,對(duì)采自海南島的10個(gè)純化種群進(jìn)行初步的會(huì)陰花紋觀察和形態(tài)學(xué)測(cè)量、比對(duì)。雌蟲(chóng)呈梨形或球形,無(wú)后端突;頭區(qū)和頸區(qū)分界不明顯,唇盤圓盤狀;口針細(xì),略向背面彎曲;基部球粗大。J2線形,頭區(qū)與蟲(chóng)體有明顯的分界線。初步鑒定為象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)。詳細(xì)測(cè)量數(shù)據(jù)見(jiàn)表1。

        2.1.2 會(huì)陰花紋特征 10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群會(huì)陰花紋的主要特征較一致,主要表現(xiàn)在整體呈卵圓形到橢圓形,背弓較高,線紋較細(xì)、由平滑到波浪狀,尾尖區(qū)環(huán)紋不規(guī)則,側(cè)線不明顯(圖1)。與劉昊等(2005)描述的象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)會(huì)陰花紋形態(tài)一致。

        2.2 同工酶鑒定

        對(duì)各種群年輕雌蟲(chóng)的酯酶進(jìn)行電泳分析,并參照Esbenshade&Triantaphyllou(1985)的方法分類,發(fā)現(xiàn)10個(gè)種群(表2)的酯酶譜型均為VS1-S1型,其中1SG和4HBJ種群的酯酶圖譜見(jiàn)圖2。結(jié)合形態(tài)學(xué)結(jié)果,進(jìn)一步確認(rèn)10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群均為象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)。

        表1 象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)的形態(tài)學(xué)測(cè)量數(shù)據(jù)Table 1 Measure data for morphology of M.enterolobii

        圖1 象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)會(huì)陰花紋Fig.1 Perineal patterns of M.enterolobii

        表2 象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)10個(gè)種群的酯酶譜型Table 2 Phenotypes of esterases for 10 different populations of M.enterolobii

        圖2 象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)酯酶電泳圖Fig.2 Phenotypes of esterases for M.enterolobii in comparison with M.javanica.

        2.3 mtDNA-PCR 擴(kuò)增結(jié)果

        用引物#C2F3和#1108對(duì)表1中10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列進(jìn)行擴(kuò)增,均可獲得700 bp的條帶(圖3)。這與有關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)一致。

        2.4 rDNA-ITS-PCR 擴(kuò)增結(jié)果

        用引物18S和28S擴(kuò)增rDNA的ITS區(qū)序列,10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群的ITS片段均為750 bp左右(圖4)。

        2.5 序列測(cè)定與分析

        對(duì)4HBJ種群的mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列和rDNA-ITS區(qū)序列分別進(jìn)行克隆與測(cè)序,得到大小為705和765 bp的片段,將測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank中已有的DNA序列進(jìn)行同源性比較。發(fā)現(xiàn)與4HBJ種群mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列同源性最高的是象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)(GQ870255.1),達(dá)100%。比對(duì)結(jié)果進(jìn)一步證明4HBJ種群為象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)。與4HBJ種群的rDNA-ITS區(qū)序列同源性最高的也是象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)(JF309153.1),為98%;而與南方根結(jié)線蟲(chóng)、爪哇根結(jié)線蟲(chóng)、花生根結(jié)線蟲(chóng)的同源性僅為88%左右(圖5)。

        圖3 10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.3 PCR amplified mtDNA between COⅡ and LRNA for 10 populations of root-knot nematodes

        圖4 10個(gè)根結(jié)線蟲(chóng)種群rDNA-ITS區(qū)序列PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.4 PCR amplified results of rDNA-ITS for 10 populations of root-knot nematodes

        圖5 4HBJ種群rDNA-ITS區(qū)序列的聚類分析Fig.5 The clustering analysis of rDNA-ITS of 4HBJ population

        3 討論

        本研究運(yùn)用形態(tài)學(xué)、同工酶電泳和 mtDNAPCR技術(shù)相結(jié)合的方法,準(zhǔn)確鑒定出海南島農(nóng)作物上的象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)。楊寶君(1983)于海南省儋州市野生象耳豆樹(shù)上發(fā)現(xiàn)象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)并鑒定為新種。本研究首次于海南島栽培的葫蘆科蔬菜(苦瓜、絲瓜、南瓜、黃瓜、葫蘆瓜)、辣椒和南藥植物(海巴戟、沉香、丁香)上發(fā)現(xiàn)該線蟲(chóng)。

        4HBJ種群mtDNA的COⅡ和LRNA基因間序列與Genbank上公布的象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)(GQ870255.1)的同源性高達(dá)100%,可以確定該種群為象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)。

        常見(jiàn)根結(jié)線蟲(chóng)種類如南方根結(jié)線蟲(chóng)、爪哇根結(jié)線蟲(chóng)和花生根結(jié)線蟲(chóng)的rDNA-ITS區(qū)差異很小,有報(bào)道認(rèn)為這一分子特征不能用于常見(jiàn)根結(jié)線蟲(chóng)的種類鑒定。本研究發(fā)現(xiàn),4HBJ種群的rDNA-ITS區(qū)序列與象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)(JF309153.1)的同源性高達(dá)98%,而與南方根結(jié)線蟲(chóng)、爪哇根結(jié)線蟲(chóng)和花生根結(jié)線蟲(chóng)的同源性僅為88%左右。這表明象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)rDNA-ITS區(qū)序列測(cè)定比對(duì)可作為其鑒定的1種方法,也闡明了象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)與其他常見(jiàn)根結(jié)線蟲(chóng)種類的遺傳距離相對(duì)較遠(yuǎn),對(duì)于進(jìn)一步開(kāi)展象耳豆根結(jié)線蟲(chóng)研究具有重要參考價(jià)值。

        胡凱基.1988.酯酶在根結(jié)線蟲(chóng)分類上應(yīng)用的研究.林業(yè)科學(xué)研究,(6):650-656.

        黃偉明,陳綿才,肖彤斌,王會(huì)芳,徐建華.2011.海南島葫蘆科蔬菜根結(jié)線蟲(chóng)種類鑒定.植物保護(hù),37(1):70-73.

        廖金鈴.2001.根結(jié)線蟲(chóng)的鑒定及其DNA多態(tài)性研究.廣州:華南農(nóng)業(yè)大學(xué).

        劉昊,龍海,鄢小寧,崔汝強(qiáng),李迅東,王彬,周健勇.2005.海南島番石榴根結(jié)線蟲(chóng)病病原的種類鑒定及其寄主范圍的測(cè)試.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),28(4):55-59.

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        卓侃,胡茂秀,廖金鈴,崔汝強(qiáng),李迅東,王彬,周健勇.2008.廣東省和海南省象耳根結(jié)線蟲(chóng)的鑒定.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),27(2):193-197.

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