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        南繁條件下轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物的影響

        2012-10-12 08:14:00黃啟星孔祥義王旭初郭安平海南大學(xué)農(nóng)學(xué)院海南海口5708中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所海南???70三亞市南繁科學(xué)技術(shù)研究院海南三亞57000
        生物安全學(xué)報(bào) 2012年1期
        關(guān)鍵詞:南繁放線菌根際

        徐 林,黃啟星,左 嬌,孔祥義,王旭初,郭安平海南大學(xué)農(nóng)學(xué)院,海南???708;中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所,海南???70;三亞市南繁科學(xué)技術(shù)研究院,海南三亞57000

        南繁是指秋冬季節(jié)全國(guó)各地人員到海南從事農(nóng)作物品種選育、種子生產(chǎn)和種質(zhì)鑒定等活動(dòng)。長(zhǎng)期以來,海南省南部三亞、樂東、陵水等地形成了南繁基地。南繁地區(qū)是我國(guó)獨(dú)一無二的天然大溫室,能夠提供動(dòng)植物周年生長(zhǎng)、繁殖的優(yōu)良自然條件(陳冠銘等,2006),為縮短農(nóng)作物繁育年限和加速世代繁育提供了條件。近年來,隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)的發(fā)展,轉(zhuǎn)基因作物安全評(píng)價(jià)備受關(guān)注。為保障南繁育種區(qū)的育種安全,急需在加強(qiáng)對(duì)轉(zhuǎn)基因作物監(jiān)管的同時(shí),研究南繁條件下轉(zhuǎn)基因作物對(duì)環(huán)境的影響,為開展轉(zhuǎn)基因作物育種安全評(píng)價(jià)提供支撐。土壤微生物群落結(jié)構(gòu)是衡量土壤質(zhì)量的指標(biāo)之一(Sharma et al.,2011)。因此,研究轉(zhuǎn)基因作物對(duì)根際土壤微生物的影響已經(jīng)成為轉(zhuǎn)基因作物安全評(píng)價(jià)的一項(xiàng)重要內(nèi)容。國(guó)內(nèi)外關(guān)于轉(zhuǎn)基因作物對(duì)其根際土壤微生物的影響已屢見報(bào)道(張美俊等,2008;Andreote et al.,2009),但針對(duì)南繁條件下的此類研究較少(王昊等,2011)。本研究經(jīng)過對(duì)水稻3個(gè)種植周期的試驗(yàn),探討轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤可培養(yǎng)微生物的影響,以期為在南繁區(qū)開展轉(zhuǎn)基因水稻的安全評(píng)價(jià)提供數(shù)據(jù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 水稻品種

        本研究選取轉(zhuǎn)cry1Ab/cry1Ac基因水稻華恢1號(hào)(TT51)為材料,以其親本水稻明恢63(MH63)為對(duì)照。2種材料均由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所提供。

        1.2 種植規(guī)格

        試驗(yàn)田位于海南省三亞市南繁科學(xué)技術(shù)研究院內(nèi)(18°18'10″N、109°24'44″E),海拔 27 m。試驗(yàn)地為砂壤土,肥力中等偏上。試驗(yàn)地面積為30 m×20 m,周圍有圍墻隔離。轉(zhuǎn)基因水稻種植區(qū)面積(5×5)m2,株行距20 cm×20 cm,其余地塊均種植非轉(zhuǎn)基因水稻,不同水稻由田埂進(jìn)行隔離。種植期間未施用農(nóng)藥。

        1.3 土壤樣品采集

        在水稻種植中心區(qū)域,采用對(duì)角線采樣法隨機(jī)多點(diǎn)采樣,然后均勻混合成1個(gè)樣品。每10 d采1次樣。將土壤樣品置于室內(nèi),自然風(fēng)干。

        1.4 根際土壤理化性質(zhì)監(jiān)測(cè)

        將在水稻幼苗期和收獲期采集的土壤經(jīng)20目過篩后,分別對(duì)其理化性質(zhì)進(jìn)行測(cè)定。測(cè)定指標(biāo)包括pH,全氮、堿解氮、全磷、速效磷、全鉀、速效鉀等含量。該部分試驗(yàn)委托中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院分析測(cè)試中心檢測(cè)。

        1.5 土壤微生物培養(yǎng)和計(jì)數(shù)

        采用平板菌落計(jì)數(shù)法(沈萍等,1999)對(duì)土壤微生物進(jìn)行計(jì)數(shù)。細(xì)菌、放線菌和真菌分別用牛肉膏蛋白胨、高氏一號(hào)和孟加拉紅培養(yǎng)基培養(yǎng)。采用人工計(jì)數(shù)方法統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)量,計(jì)算每克干土中的菌落數(shù)/(CFU·g-1)。

        1.6 細(xì)菌種屬鑒定

        根據(jù)菌落形態(tài),從每個(gè)樣品中挑選30個(gè)單菌落進(jìn)行平板劃線純化。提取菌體DNA,使用16S通用引物27F、1492R(王昊等,2011)對(duì)細(xì)菌、放線菌16S rDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。采用AxyPrep DNA gel extraction Kit回收目的條帶,送上海生工生物工程公司測(cè)序。采用BLAST序列比對(duì)方法,將測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),初步鑒定到屬一級(jí)。

        1.7 土壤線蟲的計(jì)數(shù)

        參考王昊等(2011)報(bào)道的方法統(tǒng)計(jì)土壤線蟲數(shù)量。

        1.8 數(shù)據(jù)分析

        運(yùn)用Microsoft excel 2007軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行t-test等統(tǒng)計(jì)分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 根際土壤理化性質(zhì)

        由表1可以看出,水稻收獲期與幼苗期相比,TT51和MH63都存在以下情況:土壤pH略有上升;全氮含量基本未發(fā)生變化;堿解氮含量明顯上升;全磷含量大幅度降低;速效磷、速效鉀含量均明顯上升。不同的是,TT51幼苗期土壤的有機(jī)質(zhì)少于收獲期,而MH63則相反;TT51收獲期全鉀含量高于幼苗期,而MH63在2個(gè)時(shí)期的全鉀含量變化較小。此外,在幼苗期或收獲期,TT51與MH63各土壤理化指標(biāo)的差異較小,說明TT51對(duì)其根際土壤理化性質(zhì)的影響較小。

        表1 水稻幼苗期和收獲期土樣理化性質(zhì)Table 1 Chemical properties of soil sampled at the start of the experiments and after the growth of non-transgenic rice and transgenic rice at the Plant Breeding Base of Hainan

        2.2 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物數(shù)量組成的影響

        由表2可以看出,細(xì)菌方面,在3個(gè)種植周期(42個(gè)監(jiān)測(cè)時(shí)間點(diǎn))中,有16個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)出現(xiàn)明顯變化。TT51根際土壤細(xì)菌群落數(shù)量顯著高于對(duì)照MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有7個(gè)(P<0.05),其中,極顯著高于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有3個(gè)(P<0.01);TT51根際土壤細(xì)菌群落數(shù)量顯著低于MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有9個(gè)(P<0.05),其中,極顯著低于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有3個(gè)(P<0.01)。

        真菌方面,在3個(gè)種植周期(42個(gè)監(jiān)測(cè)時(shí)間點(diǎn))中,有21個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)出現(xiàn)明顯變化。TT51根際土壤真菌數(shù)量顯著高于對(duì)照MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有5個(gè)(P<0.05),其中,極顯著高于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有3個(gè)(P<0.01);TT51根際土壤真菌數(shù)量顯著低于MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有16個(gè)(P<0.05),其中,極顯著低于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有7個(gè)(P<0.01)。

        放線菌方面,在3個(gè)種植周期(42個(gè)監(jiān)測(cè)時(shí)間點(diǎn))中,有20個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)出現(xiàn)明顯變化。TT51根際土壤放線菌數(shù)量顯著高于對(duì)照MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有10個(gè)(P<0.05),其中,極顯著高于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有8個(gè)(P<0.01);TT51根際土壤放線菌數(shù)量顯著低于MH63的監(jiān)測(cè)有10個(gè)(P<0.05),其中,極顯著低于對(duì)照的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有3個(gè)(P<0.01)。

        此外,通過連續(xù)3個(gè)種植周期監(jiān)測(cè)水稻根際土壤微生物種群數(shù)量,發(fā)現(xiàn)土壤微生物種群數(shù)量變化與水稻生育期之間無明顯相關(guān)性。TT51與對(duì)照MH63根際土壤細(xì)菌、真菌和放線菌的數(shù)量變化趨勢(shì)相似。從總體上看,轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)土壤微生物數(shù)量未造成明顯影響。僅有個(gè)別監(jiān)測(cè)時(shí)間點(diǎn)顯示兩者間存在明顯差異,但變化不成規(guī)律,這可能是由于采樣和計(jì)數(shù)誤差造成。

        2.3 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物物種組成的影響

        采集第一種植周期水稻收獲時(shí)的土壤,分別用牛肉膏蛋白胨、高氏一號(hào)培養(yǎng)基培養(yǎng),純化細(xì)菌、放線菌。分子鑒定及與GenBank序列BlastN比對(duì)結(jié)果顯示,TT51與MH63細(xì)菌種類大體相同,為芽孢桿菌屬Bacillus、假單胞菌屬Pseudomonas、鏈霉菌屬Streptomyces(表3)。

        2.4 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤線蟲的影響

        在第三種植周期(14個(gè)監(jiān)測(cè)時(shí)間點(diǎn))中,有6個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)出現(xiàn)明顯變化。TT51根際土壤線蟲數(shù)量顯著高于對(duì)照MH63的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有5個(gè),MH63根際土壤線蟲數(shù)量顯著高于TT51的監(jiān)測(cè)點(diǎn)有1個(gè)(圖1)。

        3 結(jié)論與討論

        本研究在南繁條件下連續(xù)2年對(duì)轉(zhuǎn)cry1Ab/cry1Ac水稻根際土壤可培養(yǎng)微生物群落數(shù)量動(dòng)態(tài)進(jìn)行了監(jiān)測(cè)。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)cry1Ab/cry1Ac基因水稻TT51對(duì)根際土壤細(xì)菌、真菌和放線菌的群落數(shù)量沒有明顯影響,這與 Kim et al.(2008)和 Wu et al.(2009)的研究結(jié)果一致。此外,Lee et al.(2011)運(yùn)用T-RFLP和實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法對(duì)轉(zhuǎn)基因水稻的根際細(xì)菌、真菌群落進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)與非轉(zhuǎn)基因水稻相比,轉(zhuǎn)基因水稻不會(huì)對(duì)土壤細(xì)菌和真菌的群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生影響。然而,楊保軍等(2009)認(rèn)為,轉(zhuǎn)基因水稻根際土壤細(xì)菌、真菌和放線菌數(shù)量顯著高于非轉(zhuǎn)Bt基因水稻MH63,并且轉(zhuǎn)Bt基因水稻對(duì)根際細(xì)菌數(shù)量的影響與水稻生育期相關(guān)。本研究中僅有部分監(jiān)測(cè)結(jié)果顯示轉(zhuǎn)基因水稻與其對(duì)照的根際土壤微生物數(shù)量存在明顯差異,其中既有轉(zhuǎn)基因水稻根際土壤微生物數(shù)量顯著高于非轉(zhuǎn)基因的情況,也有相反的情況,但總體變化趨勢(shì)一致。這可能是由平板計(jì)數(shù)的技術(shù)特點(diǎn)和大田試驗(yàn)中多種不可控條件(如氣候、溫度)等因素造成。因此,目前獲得的初步結(jié)論仍有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

        表2 水稻根際土壤細(xì)菌、真菌和放線菌群落數(shù)量變化Table 2 Population dynamics of bacteria,fungi and actinomyces isolated from rice rhizosphere soil

        表3 水稻根際土壤細(xì)菌序列BlastN比對(duì)結(jié)果Table 3 BlastN results of rice rhizosphere soil bacterial sequences

        圖1 水稻根際土壤線蟲群落數(shù)量變化Fig.1 Population dynamics of nematode isolated from rice rhizosphere soil

        土壤微生物種屬鑒定結(jié)果顯示,TT51與MH63根際主要微生物類群一致。但由于在常規(guī)培養(yǎng)條件下,土壤中可培養(yǎng)微生物不到其總量的1%,僅鑒定出3個(gè)屬,即芽孢桿菌屬、鏈霉菌屬、假單胞菌屬。經(jīng)過連續(xù)3個(gè)種植周期的監(jiān)測(cè),發(fā)現(xiàn)種植轉(zhuǎn)基因水稻短期不會(huì)對(duì)其根際土壤微生物種類構(gòu)成產(chǎn)生明顯影響,也不會(huì)對(duì)根際微生物產(chǎn)生累積影響。

        土壤微生物群落結(jié)構(gòu)是土壤生態(tài)監(jiān)測(cè)的重要內(nèi)容,因此,轉(zhuǎn)基因作物對(duì)其根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的影響還有待進(jìn)一步研究,特別是采用新技術(shù)(如宏基因組測(cè)序)對(duì)不可培養(yǎng)微生物的研究。此外,植物主要通過植物組織(包括植物殘茬和花粉)(Icoz & Stotzky,2008;Wu et al.,2009)和根部分泌物(Bardgett et al.,1999)影響土壤微生物的多樣性。轉(zhuǎn)基因植物組織降解后,具有生物活性的外源片段有可能向土壤微生物發(fā)生基因橫向轉(zhuǎn)移(Pontiroli et al.,2009),從而使土壤微生物獲得新的性狀,進(jìn)而改變土壤微生物多樣性(包括生物多樣性和功能多樣性),造成潛在的生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)。因此,后續(xù)研究還可采取ELISA等技術(shù)探討外源基因及其表達(dá)產(chǎn)物對(duì)土壤微生物的影響(付慶靈,2011)。

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