毛芳芳, 王亞軍, 羅 希, 魏積福, 鄭裕國(guó)
(浙江工業(yè)大學(xué) 生物工程研究所 生物轉(zhuǎn)化與生物凈化教育部工程中心,浙江 杭州 310014)
冠狀動(dòng)脈心臟病是世界上造成死亡最主要的疾病之一。世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,每年死于冠狀動(dòng)脈心臟病的人數(shù)超過(guò)760萬(wàn)。流行病學(xué)研究證實(shí)冠狀動(dòng)脈心臟病與高膽固醇血癥有很大的關(guān)系。許多降膽固醇藥物被成功開(kāi)發(fā)并上市[1],其中阿托伐他汀鈣最暢銷(xiāo),2008年銷(xiāo)售額達(dá)到300億美元[2]。6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯是合成阿托伐他汀鈣的關(guān)鍵手性前體[3],傳統(tǒng)的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯化學(xué)合成法不僅使用昂貴的硼烷類(lèi)試劑和正丁基鋰,而且要在低于-60 ℃的條件下進(jìn)行反應(yīng),消耗大量的能量和有機(jī)溶劑[4~6]。
生物轉(zhuǎn)化與生物催化提供了一種高效、溫和、環(huán)境友好、選擇性高的手性合成方法[7]。羰基還原酶普遍存在于細(xì)菌、酵母及真菌中,為生物不對(duì)稱還原酮酯制備光學(xué)純?chǔ)?羥基酯提供了一條有效的途徑,已成功應(yīng)用于化學(xué)制品、食品、農(nóng)用化學(xué)品和制藥工業(yè)等來(lái)制備手性醇[8]。然而,大多數(shù)天然羰基還原酶催化的不對(duì)稱還原都遵守Prelog法則,具有反Prelog法則的立體選擇性羰基還原酶十分稀少,其精確機(jī)理也尚不清楚[9]。作者篩選得到一株具有非對(duì)映選擇性還原6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯活性的菌株X25 ,對(duì)其進(jìn)行鑒定,并考察了其催化性能。合成機(jī)理見(jiàn)圖1。
圖1 羰基還原酶不對(duì)稱還原6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯制備6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯
6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯標(biāo)準(zhǔn)品,Toronto化學(xué)制品研究公司;6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯,浙江新東港藥業(yè)股份有限公司;蛋白胨、酵母膏、瓊脂,市售生化試劑;其它試劑均為分析純。
富集培養(yǎng)基(g·L-1):葡萄糖50.0,黃豆芽100.0 (稱取100.0 g黃豆芽,加水煮沸30 min后紗布過(guò)濾),6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯11.4,pH值自然。
斜面培養(yǎng)基(g·L-1):葡萄糖50.0,黃豆芽100.0 (稱取100.0 g黃豆芽,加水煮沸30 min后紗布過(guò)濾),瓊脂20.0,pH值自然。
發(fā)酵培養(yǎng)基(g·L-1):葡萄糖20.0,酵母膏20.0,NaCl 1.0, KH2PO42.5,(NH4)2HPO42.5,MgSO40.030, 6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯0.2% (體積分?jǐn)?shù)),pH值7.0。培養(yǎng)基滅菌冷卻后添加6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯,以誘導(dǎo)提高羰基還原酶活性。
酶活定義:在30 ℃、pH值7.0條件下,每分鐘催化生成1 μmol 6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯所需的酶量定義為一個(gè)酶活單位。
用于菌株篩選的土樣采集于全國(guó)各地。稱取1.0 g土樣,分散到10.0 mL 0.85%(質(zhì)量濃度)生理鹽水中,移取2.0 mL土壤懸浮液接種至盛有28.0 mL富集培養(yǎng)基的250 mL搖瓶中,28 ℃、150 r·min-1培養(yǎng)至培養(yǎng)基渾濁。移取2.0 mL培養(yǎng)液接種至28.0 mL無(wú)菌富集培養(yǎng)基中,在上述條件下培養(yǎng)至培養(yǎng)基渾濁。連續(xù)富集3次后稀釋涂固體平板,30 ℃培養(yǎng)至長(zhǎng)出清晰的單菌落,挑取單菌落接種至斜面培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)36 h后于4 ℃冰箱中保存。
斜面接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,30 ℃培養(yǎng)48 h后取20 mL發(fā)酵液離心收集菌體檢測(cè)還原酶活性。挑選活力和選擇性最好的菌株X25,對(duì)其進(jìn)行分離純化鑒定。鑒定過(guò)的菌株用20%(體積分?jǐn)?shù))甘油保存于-80 ℃低溫冰箱中。
利用Biolog自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)考察菌株X25對(duì)65種不同碳源的代謝情況。將菌株接種于酵母平板培養(yǎng)基,28 ℃恒溫培養(yǎng)2 d,用無(wú)菌棉簽將平板上的菌體轉(zhuǎn)移并分散于無(wú)菌水中,混勻,制成菌懸液,用濁度計(jì)調(diào)整透光率至47%。分別移取菌懸液至Biolog YT微孔鑒定板,每孔100 μL。將微孔鑒定板放在28 ℃培養(yǎng)箱中,分別培養(yǎng)24 h、48 h和72 h后置于Biolog讀數(shù)儀上讀取結(jié)果。
分子鑒定首先提取X25的基因組DNA,利用引物pITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′和pITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′,在PTC-200型PCR儀 (Bio-Rad,USA)上進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增條件如下:95 ℃,4 min;94 ℃ 50 s,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1.5 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃,10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并用AxyPrep DNA 凝膠回收試劑盒回收目的DNA。根據(jù)T/A克隆步驟(Takara,日本)將得到的目的基因與pMD18-T載體連接[10]。將重組的質(zhì)粒導(dǎo)入感受態(tài)E.coliJM109[11],然后在含有50 μg·mL-1氨卞青霉素的LB平板上生長(zhǎng)。將陽(yáng)性克隆記為E.coliJM109/pMD18-T-X25,并電泳檢測(cè)。E.coliJM109/pMD18-T-X25于37 ℃在含有氨卞青霉素的LB平板上培養(yǎng)過(guò)夜,收集菌體,用AxyPrep質(zhì)粒DNA小量試劑盒提取質(zhì)粒后對(duì)基因序列進(jìn)行檢測(cè)。Blast所獲得的序列用于和GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因序列進(jìn)行對(duì)比。18S rDNA全序列用CLUSTAL W ver.1.81 A軟件包排序,用MEGAversion 2.1軟件包中的 Kimura2-Parameter Distance 模型計(jì)算進(jìn)化距離,用Neighbour-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),1000次隨機(jī)抽樣,計(jì)算自引導(dǎo)值,以評(píng)估系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的置信度。
取0.5 gP.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞分散于10 mL含20 g·L-1葡萄糖的磷酸緩沖溶液(pH值7.0,50 mmol·L-1)中,30 ℃預(yù)熱2.0 min后加入6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯 (終濃度10 g·L-1)?;靹颍?0 ℃反應(yīng)10 h,轉(zhuǎn)化過(guò)程中每隔2 h取樣0.8 mL,用100 μL HCl滅活,然后用同樣濃度的100 μL NaOH溶液中和,12 000 r·min-1離心10 min,上清液經(jīng)0.45 μm微濾膜過(guò)濾。取澄清濾液測(cè)定生成的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯濃度和殘余6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯濃度。
6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯、6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯及其非對(duì)映異構(gòu)體用LC-20AD型高效液相色譜儀(島津)檢測(cè)。色譜條件為:大連依利特Hypersil ODS2 C18柱 (4.6 mm×250 mm,2.5 μm),流動(dòng)相為乙腈-水(1∶3,體積比),流速1.0 mL·min-1,柱溫30 ℃。
對(duì)篩選得到的菌種進(jìn)行酶活和非對(duì)映選擇性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)菌株X25作用6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的羰基還原酶活性最強(qiáng)、非對(duì)映選擇性最高,產(chǎn)物構(gòu)型符合反Prelog法則。菌株X25細(xì)胞呈卵狀或瓜子狀,細(xì)胞大小(1.4~2.5) μm×(1.4~5.0) μm,在平板上形成圓形、乳白色、不透明、中間凸起、表面光滑的菌落(圖2)。Biolog鑒定結(jié)果見(jiàn)表1。
由表1可知,菌株X25能夠較好地利用42種碳源,對(duì)其它23種碳源不能利用或利用能力較弱?;贐iolog鑒定系統(tǒng)分析結(jié)果,菌株X25與PichiaguilliermondiiA標(biāo)準(zhǔn)菌株相似,相似性指數(shù)為1.000。
表1 菌株X-25對(duì)Biolog YT板上65種碳源的利用能力
注:+,陽(yáng)性;-,陰性;B,交界。
圖2 菌株X25在豆芽汁平板上的菌落形態(tài)
提取菌株X25的18S rDNA,測(cè)序后,從Gen-Bank數(shù)據(jù)庫(kù)挑取與X25 18S rDNA 序列相似的序列,并用MegAlign 軟件(DNASTAR公司,美國(guó))繪制進(jìn)化發(fā)育樹(shù)(圖3)。將獲得的序列與GenBank中的數(shù)據(jù)進(jìn)行相似性分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)菌株X25與Pichiaguilliermondii(FJ 969194.1)同源性最高 (100%/607 bps,18S rDNA)。因此,菌株X25屬于Pichia屬的Guilliermondii種,中文名稱為季也蒙畢赤酵母。基于生理生化特征與18S rDNA分子鑒定,菌株X25被鑒定為季也蒙畢赤酵母。該菌株保存于中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(CCTCC),菌種保藏號(hào)CCTCC M 2011386。
圖3 菌株X25的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)
將P.guilliermondiiX25接種于常用畢赤酵母培養(yǎng)基,每隔2 h取樣分析發(fā)酵液羰基還原酶活性,結(jié)果見(jiàn)圖4。
圖4 培養(yǎng)時(shí)間對(duì)P.guilliermondii X25生物量、羰基還原酶活性和非對(duì)映選擇性的影響
由圖4可知,培養(yǎng)時(shí)間對(duì)P.guilliermondiiX25羰基還原酶活性、非對(duì)映選擇性和生物量影響顯著,培養(yǎng)40 h后,P.guilliermondiiX25 發(fā)酵液羰基還原酶活性達(dá)到峰值,約24.79 U·L-1。在整個(gè)培養(yǎng)進(jìn)程中,非對(duì)映選擇性介于11.7~15.4之間,表明P.guilliermondiiX25具有較好的非對(duì)映選擇性。
溫度、pH值對(duì)P.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞羰基還原酶活性的影響見(jiàn)圖5。
圖5 溫度(a)、pH值(b)對(duì)P.guilliermondii X25靜息細(xì)胞羰基還原酶活性的影響
由圖5可知,在溫度22~43 ℃范圍內(nèi),P.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞表現(xiàn)出較好的非對(duì)映選擇性,產(chǎn)物de值在90%左右,35 ℃時(shí)P.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞羰基還原酶活性達(dá)到最高,約44.3 U·L-1,溫度超過(guò)37 ℃時(shí),酶活性急劇下降(圖5 a);在pH值5.0~8.0范圍內(nèi),P.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞羰基還原酶具有較好的活性和非對(duì)映選擇性,在pH值7.0的磷酸緩沖溶液中酶活性最高,達(dá)到74.04 U·L-1(圖5b)。
P.guilliermondiiX25非對(duì)映選擇性還原6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯進(jìn)程曲線見(jiàn)圖6。
圖6 P.guilliermondii X25非對(duì)映選擇性還原6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯進(jìn)程
由圖6可知,轉(zhuǎn)化1 h時(shí),底物6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯轉(zhuǎn)化率為3.4%,產(chǎn)物6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯de值接近100%;隨著轉(zhuǎn)化時(shí)間的延長(zhǎng),6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯濃度顯著降低,然而6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯de值隨即降至90.4%。這與P.guilliermondiiX25的非對(duì)映選擇性介于11.7~15.4之間有關(guān),高的底物轉(zhuǎn)化率導(dǎo)致低的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯de值。
從自然環(huán)境中篩選獲得一株對(duì)6-氰基-(5R)-羥基-3-羰基己酸叔丁酯具有羰基還原酶活性的菌株X25,結(jié)合表型特征、生理生化特征和分子遺傳學(xué)鑒定,該菌株屬于Pichiaguilliermondii。利用P.guilliermondiiX25靜息細(xì)胞成功建立了光學(xué)純6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的生物催化合成工藝,最佳催化條件為35 ℃、pH值7.0;在低底物轉(zhuǎn)化率時(shí),能夠制備光學(xué)純6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯。豐富了他汀類(lèi)藥物關(guān)鍵手性側(cè)鏈的合成技術(shù)。鑒于P.guilliermondiiX25羰基還原酶的活性和非對(duì)映選擇性仍有提升空間,利用現(xiàn)代生物技術(shù)對(duì)該羰基還原酶進(jìn)行后續(xù)分子改造十分必要。
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