四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與理學(xué)院 趙海霞 趙培培 陳 惠 吳 琦*
膠原蛋白酶是可作用于膠原或變性明膠而不作用于其他蛋白質(zhì)的酶類(lèi),其可以斷裂膠原蛋白,斷裂的碎片自動(dòng)變性,進(jìn)而被普通蛋白酶水解(Gallop和Seifter,1963)。 膠原蛋白酶對(duì)膠原蛋白的特異降解性,使其廣泛應(yīng)用于飼料工業(yè)、環(huán)境保護(hù)、醫(yī)學(xué)、食品工業(yè)和化工等領(lǐng)域。膠原酶包括動(dòng)物源膠原酶和微生物源膠原酶。目前報(bào)道的膠原酶產(chǎn)生菌主要有Bacillus pumilus(吳琦等,2007)、Bacillus licoeniformis (Asdornnithee 等 ,1994),Bacillus sp. (Nakayama 等 ,2000)、Borrelio burgdorferi (Grab 等,1996)、Streptococcus gordonii(Juarez 和 Stinson,1999)和 Clostridum perfringens(Matsushita等,1994)。本研究從土樣中篩選到一株膠原蛋白酶產(chǎn)生菌,經(jīng)試驗(yàn)鑒定為粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescen),以期為進(jìn)一步的應(yīng)用研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 樣品來(lái)源 雅安市畜肉市場(chǎng)和污水口等處采集土樣和水樣。
1.1.2 主要藥品及試劑 引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;rTaq DNA聚合酶、dNTP、T4 DNA Ligase、pMD18-T Vector凝膠回收試劑盒、DNA MarkerVII、蛋白質(zhì)Marker均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;氨芐青霉素(100 μg/mL),酸性 Ⅲ 型 膠 原 蛋 白 (Sigma 公 司 ),NaCl、HgCl、NaOH、濃HCl、胰蛋白胨、酵母浸出粉、葡萄糖、K2HPO4·3H2O、蔗糖、MgCl2、聚乙二醇 20000、瓊脂粉、瓊脂糖和Tris等。
1.1.3 培養(yǎng)基 按照楊光垚等 (2004)配置培養(yǎng)基。 種子培養(yǎng)基(1000 mL):牛肉膏 5 g,NaCl 5 g,蛋白胨 10 g,pH 7.2 ~ 7.4;富集培養(yǎng)基(1000 mL):明膠 1 g,NaCl 5 g, 蛋白胨 5 g,pH 7.2 ~ 7.5;初篩培養(yǎng)基(1000 mL):明膠 20 g,NaCl 0.1 g,蛋白胨 5 g,KH2PO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,pH 7.2 ~7.5;復(fù)篩培養(yǎng)基(1000 mL):葡萄糖 20 g,酵母粉1.5 g, 胰蛋白胨 10 g,CaC120.05 g,NaH2PO4·2H2O 0.5 g,K2HPO4·3H2O 2.5 g,pH 7.0 ~ 7.2。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 膠原蛋白酶產(chǎn)生菌的篩選
1.2.1.1 富集培養(yǎng) 取樣品2 g或2 mL,用生理鹽水18 mL浸泡搖勻后放置10 min,在沸水浴中處理5 min,冷卻后按0.5%的量取懸浮液接種于裝有富集培養(yǎng)基的三角瓶中,180 r/min,37℃搖瓶培養(yǎng)2 d。
1.2.1.2 膠原蛋白酶產(chǎn)生菌的初篩 將富集培養(yǎng)液進(jìn)行梯度稀釋至 10-6,10-7,10-8三個(gè)梯度,各取50 μL進(jìn)行涂布初篩平板,涂布均勻后放入37℃溫箱中培養(yǎng)24 h。觀察菌落生長(zhǎng)情況,選取具有隱約透明圈的菌落,轉(zhuǎn)接平板,編號(hào)記錄。將初篩菌在37℃溫箱中培養(yǎng)24 h,在平板菌落周?chē)渭铀嵝怨噭渲車(chē)霈F(xiàn)透明圈者為陽(yáng)性。挑選明膠水解圈與菌落直徑比值較大的菌株保存。1.2.1.3 牛皮消化試驗(yàn) 挑選明膠水解圈與菌落直徑比值較大的菌株,分別接種于種子培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)2 d。剪取約0.5 g重的新鮮小牛皮,滅菌后裝入試管,每管加入種子培養(yǎng)基上清液各2 mL(4000 r/min 離心 10 min),并標(biāo)上對(duì)應(yīng)的號(hào),另取一管加入2 mL無(wú)菌種子培養(yǎng)基作為陰性對(duì)照,蓋上棉塞,室溫放置2 d,每12 h搖動(dòng)一次,以便牛皮與酶液充分接觸。兩天后取出牛皮進(jìn)行對(duì)照觀察。
1.2.2 膠原蛋白酶活性檢測(cè) 采用茚三酮顯色法,以Ⅲ型膠原蛋白作為底物,測(cè)定反應(yīng)所釋放的水溶性氨基酸、短肽,以甘氨酸顯色制定標(biāo)準(zhǔn)曲線。酶活力單位定義為:在37℃,pH7.5條件下,1 mL酶液每分鐘水解膠原產(chǎn)生相當(dāng)于1 μmol甘氨酸的量為1個(gè)酶活力單位(U)。
1.2.3 菌種鑒定
1.2.3.1 生理生化鑒定 根據(jù)分離菌的菌落和菌體形態(tài),芽孢的有無(wú)和著生情況,革蘭氏染色以及生理生化反應(yīng),按《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》進(jìn)行初步分類(lèi)(東秀珠和蔡妙英,2001)。
1.2.3.2 16S rDNA的擴(kuò)增與序列分析 將菌種接種于20 mL/150 mL種子培養(yǎng)基,37℃ 180 r/min培養(yǎng)12 h,采用革蘭氏陽(yáng)性菌DNA out抽提試劑盒 (天澤基因工程有限公司)提取菌株總DNA。
上 游 引 物 序 列 (27F):AGAGTTTGATCCTGGCTCAG, 下游引物序列 (1492R):TACGG(C/T)TACCTTGTTACGACTT。 PCR 反應(yīng)體系 (25 μL)為:10×buffer2.5 μL,25 μM 的 MgCl20.5 μL,2.5 mM dNTP0.5 μL,上游引物 1 μL,下游引物 1 μL,總 DNA0.5 μL,5 U/μL 的 rTaq DNA 聚 合酶 0.5 μL,超純水18.5 μL。 PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性 5 min;95 ℃ 45 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1.5 min,循環(huán)30次;72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)T載體克隆后,送上海英駿 (invitrogen)生物技術(shù)有限公司進(jìn)行序列測(cè)定。
1.2.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析 將菌株16S rDNA測(cè)序結(jié)果采用Blasting程序,與GenBank(http://ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)核酸數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)分析,進(jìn)行分子遺傳學(xué)鑒定(龍?chǎng)┖完惔嫔纾?006)。
2.1 膠原蛋白酶產(chǎn)生菌的篩選及牛皮消化試驗(yàn)
經(jīng)富集培養(yǎng)后,梯度稀釋涂布于初篩平板上,確定具有明膠水解活性的菌株。初篩菌株經(jīng)種子培養(yǎng)基培養(yǎng)后,取上清液對(duì)新鮮小牛皮進(jìn)行室溫消化,從中篩選對(duì)牛皮消化效果好的菌株。結(jié)果表明,菌株Col-C的培養(yǎng)液能在48 h內(nèi)對(duì)犢牛皮有消化作用,牛皮明顯變薄,而陰性對(duì)照組牛皮無(wú)明顯變化(見(jiàn)圖1)。因此,菌株Col-C能分泌膠原蛋白酶,且具有較強(qiáng)消化牛皮的能力。
圖1 牛皮消化試驗(yàn)
2.2 膠原蛋白酶活力測(cè)定 采用茚三酮顯色法測(cè)定膠原蛋白酶活力,顯色后在570 nm處測(cè)光密度吸收值,測(cè)得Col-C的膠原蛋白酶活力達(dá)到21.19 U/mL。
2.3 菌種鑒定
2.3.1 形態(tài)觀察 挑取該菌接于初篩平板上37℃培養(yǎng)24 h,菌落呈圓形,凸出平板。邊緣整齊,表面光滑,有亮澤。無(wú)褶皺,具有粘性,不透明,邊緣呈乳白色,菌落中間呈現(xiàn)粉紅色。滴加酸性汞試劑后,在菌落周?chē)梢?jiàn)明顯透明水解圈,透明水解圈直徑與菌落直徑之比約為3.1∶1。光學(xué)顯微鏡下觀察,該菌為革蘭氏陰性菌,菌的大小約0.5 μm×(0.5 ~ 1.0)μm,周身鞭毛,能運(yùn)動(dòng),無(wú)莢膜,無(wú)芽胞。
2.3.2 生理生化鑒定 菌株Col-C的生理生化鑒定結(jié)果見(jiàn)表1。根據(jù)形態(tài)學(xué)及生理生化培養(yǎng)特性比較,參考《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》,將菌株Col-C初步鑒定為粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescen)。
表1 菌株Col-C的生化培養(yǎng)特性鑒定結(jié)果
2.3.3 16S rDNA的擴(kuò)增和序列分析驗(yàn) 采用16S rDNA特異引物對(duì)菌株Col-C的總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約1.5 kb的單一擴(kuò)增產(chǎn)物,結(jié)果見(jiàn)圖2。經(jīng)T載體克隆,進(jìn)行序列測(cè)定。結(jié)果表明,擴(kuò)增片段長(zhǎng)1507 bp,具有典型的16S rDNA特征。采用Blasting,將該序列與GenBank的核酸數(shù)據(jù)進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果表明,比對(duì)擊中近10條同源率高的序列,該序列與粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescen)16S rDNA同源性為99%。因此,將此具有膠原蛋白酶活性的菌株Col-C鑒定為粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescen)。
圖2 菌株Col-C 16S rDNA的PCR產(chǎn)物電泳圖
皮革蛋白粉飼料,是以制革工業(yè)的廢料(鉻革渣)為原料,經(jīng)過(guò)水解與脫鉻及熟化、干燥、粉碎等工藝加工而成的一種高蛋白質(zhì)飼料(趙玉蓉等,2003)。在飼料中適量添加可以替代部分魚(yú)粉用于節(jié)省飼養(yǎng)成本(付京花和唐雪蓮,2011)。目前,國(guó)內(nèi)已有報(bào)道應(yīng)用于育肥豬 (仔豬)(黃國(guó)發(fā)和邸平勝,2006;邸平勝和白生貴,2006;王九峰等,1998)、蛋雞(范貽洋,1989;張修全,1987)和草魚(yú)(趙玉蓉等,2003)等的飼養(yǎng)中。但由于膠原蛋白為硬蛋白,動(dòng)物消化道難以真正做到有效消化吸收。因此,如果添加適量膠原蛋白酶,一方面可以解決膠原蛋白有效消化的問(wèn)題,還可以適當(dāng)增加皮革蛋白在飼料中的添加量,進(jìn)一步降低飼料成本。
膠原蛋白酶可通過(guò)動(dòng)物內(nèi)臟提取或微生物發(fā)酵獲得。由于微生物來(lái)源的膠原酶較動(dòng)物膠原酶作用底物廣、對(duì)底物作用位點(diǎn)多、可通過(guò)發(fā)酵大量獲得等優(yōu)點(diǎn),而動(dòng)物膠原酶含量少、成本高、不易提取,因而研發(fā)微生物來(lái)源的膠原酶具有現(xiàn)實(shí)意義。本文從土壤中篩選到的粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescen)天然酶活為21.19U/mL,具有較高的研究?jī)r(jià)值。
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