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        IL13RΑ2 SNPs與非小細(xì)胞肺癌的相關(guān)性研究

        2012-06-25 08:41:38賀霄羽熊鶯
        關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

        賀霄羽,熊鶯,孫 午

        (1、南昌市三三四醫(yī)院,江西 南昌 330024;2、九江市第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 九江 332000)

        肺癌是常見的導(dǎo)致死亡的惡性腫瘤之一,在我國肺癌死亡占癌癥死亡病因的第3 位,且發(fā)病率有逐年增加的趨勢。肺癌分為小細(xì)胞肺癌(SCLC,15%~25%)和NSCLC(NSCLC,75%~85%),而NSCLC 占到原發(fā)肺癌的80%~85%。肺癌是一種多基因遺傳病,目前已發(fā)現(xiàn)很多NSCLC 相關(guān)基因,如RAS 基因家族、MYC 基因家族、ERBB 基因家族、P53、RB等[1],研究發(fā)現(xiàn)體內(nèi)眾多免疫細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞分泌的多種生長因子和細(xì)胞因子在正常組織內(nèi)不表達(dá)或痕量表達(dá),而在腫瘤尤其是惡性腫瘤有表達(dá)。本研究可推測NSCLC 患者外周血中檢測到IL-13Rα2 蛋白的表達(dá)。IL-13Rα2 基 因(IL13RΑ2)位于Xq13.1-q28,共有九個外顯子,其中第七外顯子上有一個cSNPs(rs17095919),我們已知雖然吸煙是肺癌發(fā)病的高風(fēng)險因素,但只有10%~15%的吸煙者最終發(fā)展成為肺癌,說明了個體基因差異性對肺癌的易感性起了重要作用。本實(shí)驗(yàn)主要研究這個cSNPs 是否與NSCLC 易感性相關(guān),為NSCLC 早期診斷提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料 550型號微孔板酶標(biāo)儀(伯樂太平洋有限公司);Real-time PCR 試劑(全式金公司);ELISA試劑盒(美國R&D 公司);實(shí)時熒光定量PCR 儀(達(dá)安7600);生物安全柜(復(fù)星公司)。

        1.2 方法 50例原發(fā)性肺癌患者為2011年3月至2012年3月在南昌市三三四醫(yī)院和九江市第一人民醫(yī)院胸外科進(jìn)行手術(shù)治療的患者,術(shù)前未行化療和放療,所有的標(biāo)本均經(jīng)組織病理學(xué)確診為原發(fā)性肺癌。50個無腫瘤病史和體征的正常對照隨機(jī)選自江西地區(qū)例行體檢的健康人群。標(biāo)本采集及外周血白細(xì)胞DNA的提取所有研究個體均采集外周靜脈血5ml,經(jīng)枸櫞酸鈉抗凝,4℃冰箱保存。

        1.2.1 ELISA 法檢測NSCLC 病例組與健康對照組之間靜脈血IL-13Rα2 蛋白表達(dá)差異。

        1.2.2 采血后一周內(nèi)以蛋白酶K 消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細(xì)胞DNA。

        1.2.3 應(yīng)用針對C和T等位基因的Taqman 探針對基因型鑒定,分析NSCLC 病例組和健康對照組IL13RΑ2 SNP 位點(diǎn)的基因型。IL13RΑ2 rs17095919(C256T) 引物為:Forward primer 5’-ACCTTTGCCGCCAGTCTATCTTAC -3’;Reverse primer 5’ -TGTCGGGTTTCATTTGTTGTTTTC-3’,針對C和T等位基因的Taqman 探針。反應(yīng)體系總體積為25μl,包括模板DNA2μl,10×緩沖 液2.5μl,250 mmol/L MgCl20.3μl,10 mmol/L dNTP 0.7μl,正向引物0.5μl,反向引物0.5μl,特異性探針0.5μl。余量用蒸餾水補(bǔ)足。反應(yīng)條件:95℃15 min,接著是45個循環(huán):95℃變性20 s,58℃退火20 s,72 ℃延伸20 s。直接觀察實(shí)時熒光定量PCR的反應(yīng)曲線,擴(kuò)增曲線發(fā)生抬高的證實(shí)為存在與Taqman 探針對應(yīng)的等位基因。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)使用SPSS13.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 ELISA 方法檢測結(jié)果可以發(fā)現(xiàn)正常人幾乎無IL-13Rα2 蛋白的表達(dá),NSCLC 病例組IL-13Rα2蛋白水平達(dá)到5.7ng/ml(SD=0.34),與健康對照組之間相比靜脈血IL-13Rα2 蛋白表達(dá)明顯增加(P<0.05)。

        2.2 NSCLC 患者和健康對照組的IL13RΑ2的等位基因頻率分布見表1,等位基因頻率分別為49.0%、51.0%和48%、52%,經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,無顯著性差異。在兩組人群中,等位基因C和T 頻率均符合Hardy-Weinberg 平衡法則。NSCLC 患者和健康對照組的IL13RΑ2的基因型分布見表2,可以發(fā)現(xiàn)NSCLC 患者IL13RΑ2的基因型C/T與健康對照存在顯著差異,因此可以認(rèn)為IL-13RA2的C/T 基因型與NSCLC 易感性相關(guān),其他基因型在組間分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與NSCLC 易感性無關(guān)。

        表1 等位基因頻率分布

        3 討論

        我國肺癌的發(fā)病率和死亡率逐年升高,位居城市人口中惡性腫瘤之首。表皮生長因子受體(EGFR)在多種惡性腫瘤的發(fā)病和加重過程中起了重要作用,在臺灣人群中EGFR 基因的多態(tài)性與不吸煙的女性肺腺癌患者發(fā)病過程高度相關(guān)[2]。國內(nèi)對肺癌診斷的聯(lián)合指標(biāo)進(jìn)行了廣泛的研究,包括TPS、NSE、CEA、LunXmRNA 及血清骨保護(hù)素等指標(biāo)在肺癌診斷中價值[3-5]。韓國的1項(xiàng)研究表明了轉(zhuǎn)化生長因子TGF-β 基因SNPs與肺癌的發(fā)病和預(yù)后的關(guān)系,A-1572G,C-509T和T+869C 在雜合子基因型攜帶者的重度吸煙者肺癌發(fā)病風(fēng)險高[6]。這些眾多研究表明細(xì)胞因子及其受體基因表達(dá)的多態(tài)性與肺癌的發(fā)病風(fēng)險增加和病程發(fā)展高度相關(guān)。IL-13 主要由激活的輔助T 淋巴細(xì)胞(Th2)細(xì)胞、肥大細(xì)胞、自然殺傷細(xì)胞和嗜堿性粒細(xì)胞產(chǎn)生,它是一種多功能的細(xì)胞因子,起著調(diào)節(jié)炎癥、黏液產(chǎn)生、組織重建和纖維化的作用。我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)IL-13的高親和力受體IL-13Rα2 過度表達(dá)在許多種固體癌細(xì)胞上如小兒腦瘤、惡性膠質(zhì)瘤、卵巢癌、星形細(xì)胞瘤等。這說明IL-13Rα2的表達(dá)與癌癥高度相關(guān)。IL-13的高親和力受體:IL-13 受體α2 在正常組織表達(dá)很低,O'Toole M等人用一種獨(dú)特ELISA 方法研究證實(shí)正常人血漿中無IL-13Rα2表達(dá)[7],卻在腫瘤上有著高表達(dá)。Daines MO等人研究證實(shí)IL-13Rα2 有三種形式:細(xì)胞膜表面、細(xì)胞內(nèi)和一種可溶形式 (sIL-13Rα2),IL-13Rα2 蛋白主要存在細(xì)胞內(nèi),膜表面IL-13Rα2 釋放于介質(zhì)中即表現(xiàn)為sIL-13Rα2,并且胞質(zhì)內(nèi)IL-13Rα2 不斷運(yùn)輸至細(xì)胞表面補(bǔ)充膜表面IL-13Rα2[8]。而sIL-13Rα2的表達(dá)可被炎癥反應(yīng)[9]、寄生蟲感染[10]、變態(tài)反應(yīng)和激惹[11]所誘導(dǎo),本實(shí)驗(yàn)也證實(shí)了sIL-13Rα2與NSCLC 有關(guān)。因?yàn)閏SNPs可以進(jìn)行疾病的遺傳連鎖分析及關(guān)聯(lián)分析,用于疾病易感基因定位,本研究進(jìn)一步證實(shí)IL-13RA2 基因cSNPs:rs17095919(IL13RΑ2 第七外顯子第一密碼子256 位置C/T)SNP與NSCLC的發(fā)病風(fēng)險相關(guān)。其中NSCLC組的C/T 雜和基因型頻率明顯高于對照組,其他基因型在各組間分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示IL-13RA2 基因C/T 基因型為NSCLC 易感基因型,IL-13RA2 其他基因型與NSCLC 無關(guān)。遺傳學(xué)家認(rèn)為,對復(fù)雜多基因疾病的研究,要綜合考慮種族、樣本量、實(shí)驗(yàn)手段、統(tǒng)計(jì)方法,甚至不同疾病的生理、病理等多方面因素的考慮,才能得到科學(xué)的、可信的結(jié)論。因此我們通過對IL-13RA2 單核苷酸多態(tài)性與NSCLC的發(fā)生機(jī)制深入研究,確定了IL-13RA2 SNPs的C/T 基因型與NSCLC的強(qiáng)相關(guān)關(guān)系,對NSCLC的診斷和治療將更有針對性,甚至做到個體化。同時建立有效的預(yù)警系統(tǒng)后,達(dá)到有效的一級預(yù)防目的,將大大減少NSCLC 患者的發(fā)病率,從而降低NSCLC 患者的診療費(fèi)用。NSCLC 鱗癌和腺癌IL13RΑ2 單核苷酸多態(tài)性之間的相關(guān)性在本研究中未發(fā)現(xiàn)顯著性差異,但有待進(jìn)一步研究。

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