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        短頸劍線蟲(chóng)和喜馬拉雅劍線蟲(chóng)的形態(tài)與rDNA分子特征

        2012-06-19 04:42:44趙立榮葛建軍王衛(wèi)芳古少常張永瑜胡學(xué)難馮黎霞吳海榮
        關(guān)鍵詞:喜馬拉雅進(jìn)化樹(shù)蟲(chóng)體

        趙立榮,葛建軍,王衛(wèi)芳,古少常,張永瑜,胡學(xué)難,馮黎霞,吳海榮

        (1廣東出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心,廣東廣州510623;2中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院動(dòng)植物檢驗(yàn)檢疫研究所,北京100029;3高明出入境檢驗(yàn)檢疫局,廣東高明528500)

        劍線蟲(chóng)Xiphinema Cobb,1913隸屬于矛線目Dorylaimida Pearse,1942,長(zhǎng)針科 Longidoridae(Thorne,1935)Meyl,1961,劍亞科 Xiphinematinae Dalmasso,1969.劍線蟲(chóng)是一類重要的植物外寄生線蟲(chóng),可寄生于植物根部,影響根系長(zhǎng)勢(shì),甚至造成根部腫大或壞死等癥狀.2010年4月,廣東出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心接受高明出入境檢驗(yàn)檢疫局送檢的采自日本羅漢松根際的2份土壤樣品.從樣品中分離獲得劍線蟲(chóng),經(jīng)形態(tài)觀察、測(cè)量,以及 rDNA-ITS、D2D3區(qū)擴(kuò)增、測(cè)序及系統(tǒng)進(jìn)化分析,分別鑒定為短頸劍線蟲(chóng)Xiphinema brevicollum Lordello et Da Costa,1961和喜馬拉雅劍線蟲(chóng)X.himalayense Ahmad,Lamberti,Rawat,Agostinelli et Srivastava,1998.短頸劍線蟲(chóng)在10 多個(gè)國(guó)家有發(fā)生[1],F(xiàn)ritzsche等[2]曾報(bào)道在實(shí)驗(yàn)室條件下短頸劍線蟲(chóng)傳播番茄環(huán)斑病毒,但是Trudgill等[3]認(rèn)為其傳毒證據(jù)不充分;喜馬拉雅劍線蟲(chóng)僅報(bào)道印度境內(nèi)的加瓦爾喜馬拉雅山上海拔1 850 m處野草根際[4],其傳毒能力有待進(jìn)一步考證.

        1 材料與方法

        1.1 樣品的采集和線蟲(chóng)的分離

        采集羅漢松根際土壤,將土壤樣品淺盤(pán)浸泡10~24 h,用線蟲(chóng)篩分離線蟲(chóng).

        1.2 線蟲(chóng)形態(tài)鑒定

        分離獲得的線蟲(chóng)60~62℃水浴處理2~3 min,將線蟲(chóng)殺死,用FG固定液[V(甲醛)∶V(甘油)∶V(蒸餾水)=10∶1∶89)固定.在光學(xué)顯微鏡下進(jìn)行形態(tài)觀察與測(cè)量.形態(tài)測(cè)計(jì)采用Deman公式中的參數(shù)符號(hào)[5].

        1.3 線蟲(chóng)分子鑒定

        1.3.1 線蟲(chóng)DNA提取 在200 μL Eppendorf管中加入8 μL預(yù)冷的 PCR Buffer.在平玻片上滴20 μL ddH2O,挑入1條線蟲(chóng),用手術(shù)刀將線蟲(chóng)切成2至多段,然后迅速吸取含盡量多的這些線蟲(chóng)片段的懸浮液 10 μL,加入含有 8 μL PCR Buffer液的 Eppendorf管中,再向管中加入2 μL預(yù)冷的1 mg/mL蛋白酶K,使總體積為20 μL.迅速將管放入-70℃冰箱至少10 min,而后將Eppendorf管置于PCR儀中65℃恒溫60 min,以降解DNase,接著95℃恒溫10 min,以變性蛋白酶K,此時(shí)即可取此DNA懸浮液1~2 μL直接做PCR或-20℃保存.

        1.3.2 分子檢測(cè) ①PCR擴(kuò)增.PCR反應(yīng)體系包括:10 × PCR Buffer 5 μL,dNTP(10 mmol/L)1 μL,引物(10 μmol/L)1 μL,模板 DNA 4 μL,ddH2O 39.75 μL,TaqDNA 聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,總體積50 μL.

        ②ITS區(qū)引物及擴(kuò)增程序.采用通用引物,上游引物為 5'-ttgattacgtccctgcccttt-3',下游引物為 5'-tttcactcgccgttactaagg-3'[6].擴(kuò)增程序?yàn)?95 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 1.5 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 5 min;4℃保溫.

        ③D2D3區(qū)引物及擴(kuò)增程序.采用通用引物,上游引物為5'-acaagtaccgtgagggaaagttg-3',下游引物為5'-tcggaaggaaccagctacta-3'[7],擴(kuò) 增 程 序 為 95 ℃3 min;95 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 1.5 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 5 min;4℃保溫.

        ④PCR產(chǎn)物的檢測(cè)及克隆、測(cè)序、系統(tǒng)進(jìn)化分析.使用10 g/L的瓊脂糖凝膠電泳,電壓10 V/cm,取PCR產(chǎn)物5 μL上樣.電泳30 min后,在紫外燈下觀察.將片段割膠純化、回收,連接到pMD-18T載體后轉(zhuǎn)入大腸埃希菌Escherichia coli JM109菌株中,篩選陽(yáng)性菌落測(cè)序.以錢(qián)氏劍線蟲(chóng)X.chambersi作為外群,將獲得的序列數(shù)據(jù)與GenBank上相似性較高的美洲劍線蟲(chóng)序列進(jìn)行ME系統(tǒng)進(jìn)化分析.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 短頸劍線蟲(chóng)形態(tài)鑒定

        雌蟲(chóng):熱殺死后蟲(chóng)體向腹面彎曲呈“C”形,兩端漸細(xì).唇區(qū)圓,縊縮明顯.齒尖針細(xì)長(zhǎng)、針狀、高度硬化,齒尖針基部呈叉狀,齒托基部呈顯著的凸緣狀;齒針導(dǎo)環(huán)為雙環(huán),后環(huán)高度骨化,導(dǎo)環(huán)位于齒尖針后部靠近齒尖針與齒托相連接處.陰門(mén)位于蟲(chóng)體中部,橫裂,占陰門(mén)處體寬的1/3左右,子宮內(nèi)無(wú)特殊分化.生殖腺對(duì)生、均發(fā)育完全,生殖腺較短、卵巢回折.尾短圓錐形,有輕微指狀突起,尾長(zhǎng)等于或略長(zhǎng)于肛門(mén)處體寬(圖1A~1C).

        圖1 短頸劍線蟲(chóng)(A~C)和喜馬拉雅劍線蟲(chóng)(D~F)形態(tài)特征圖Fig.1 Photomicrographs of Xiphinema brevicollum(A-C)and X.himalayense(D-F)

        雄蟲(chóng):未見(jiàn).

        幼蟲(chóng):蟲(chóng)體熱殺死后呈“C”形,彎曲程度小于成蟲(chóng).尾錐形,c'大于成蟲(chóng),尾端尖圓,有輕微指狀突起.分離到1條幼蟲(chóng)(估計(jì)2齡或3齡):體長(zhǎng)988.1 μm,齒尖針長(zhǎng)60.3 μm,齒托長(zhǎng)38.9 μm,替代齒尖針長(zhǎng)71.2 μm,尾長(zhǎng)30.6 μm,a=35,b=4.6,c=32.0,c'=1.7.

        短頸劍線蟲(chóng)形態(tài)測(cè)量值見(jiàn)表1.根據(jù)Lamberti等[10]檢索表,從日本羅漢松根際截獲的劍線蟲(chóng)特征代碼為 A3、B1、C2、D2/1、E2、F1、G2、H2、I2.除了 C值和I值偏大外,其他特征代碼都符合 Xiphinema diffusum Lamberti& Bleve-Zacheo,1979.該線蟲(chóng)的鑒定特征及測(cè)量值與Lamberti等[8]對(duì)X.diffusum的描述基本相符,只是尾偏長(zhǎng),但差異不大.

        另外,鑒于彌散劍線蟲(chóng)X.diffusum和短頸劍線蟲(chóng)X.brevicollum的多個(gè)鑒定特征及測(cè)量值(表1)交叉重疊,根據(jù) Luc等[9]觀點(diǎn),將 X.diffusum 作為 X.brevicollum的同物異名.因此該蟲(chóng)初步判斷為短頸劍線蟲(chóng) X.brevicollum Lordello et Da Costa,1961.

        表1 短頸劍線蟲(chóng)日本種群與模式標(biāo)本的形態(tài)測(cè)量值Tab.1 Morphometrics of Xiphinema brevicollum popuLations from Japan and paratypes

        2.2 喜馬拉雅劍線蟲(chóng)形態(tài)鑒定

        雌蟲(chóng):熱殺死后蟲(chóng)體呈“C”形.頭部連續(xù),側(cè)器囊倒馬鐙形.齒尖針細(xì)長(zhǎng)、針狀、高度硬化,齒尖針基部呈叉狀,齒托基部呈顯著的凸緣狀;齒針導(dǎo)環(huán)為雙環(huán),后環(huán)高度骨化,導(dǎo)環(huán)位于齒尖針后部靠近齒尖針與齒托相連接處.陰門(mén)位于蟲(chóng)體中部稍后,陰門(mén)橫裂.雙生殖腺、對(duì)生、等長(zhǎng);卵巢回折覆蓋整個(gè)輸卵管部分,內(nèi)部充滿細(xì)菌.尾短圓錐形,背面彎曲、腹面直或略彎,尾端圓,尾長(zhǎng)等于或略短于肛門(mén)處體寬(圖1D~1F).

        雄蟲(chóng):未見(jiàn).

        幼蟲(chóng):熱殺死后蟲(chóng)體成“J”形.根據(jù)蟲(chóng)體長(zhǎng)度、齒針長(zhǎng)度及替代齒針長(zhǎng)度,劃分4個(gè)齡期,隨著齡期增長(zhǎng)身體彎曲程度加大,尾變短,c'變小.

        喜馬拉雅劍線蟲(chóng)形態(tài)測(cè)量值見(jiàn)表2.根據(jù)Lamberti等[10]檢索表,從日本羅漢松根際截獲的劍線蟲(chóng)測(cè)量特征代碼為 A5、B2、C1、D2/3、E3、F1、G1、H2、I2.除了D值偏小外,其他特征代碼都符合Xiphinema himalayense Ahmad,Lamberti,Rawat,Agostinelli et Srivastava,1998代碼.

        表2 喜馬拉雅劍線蟲(chóng)日本種群與Xiphinema himalayense模式標(biāo)本的形態(tài)測(cè)量值Tab.2 Morphometrics of Xiphinema himalayense popuLations from Japan and paratype from India

        該線蟲(chóng)的鑒定特征及測(cè)量值與Ahmad等[4]對(duì)X.himalayense的描述基本相符,只是蟲(chóng)體偏短,但差異不大.因此初步判斷該蟲(chóng)為喜馬拉雅劍線蟲(chóng)X.himalayense Ahmad,Lamberti,Rawat,Agostinelli et Srivastava,1998.

        2.3 分子生物學(xué)特征

        2.3.1 ITS區(qū)分子生物學(xué)特征 ①短頸劍線蟲(chóng)ITS區(qū)分子生物學(xué)特征:短頸劍線蟲(chóng)的ITS區(qū)擴(kuò)增1 448 bp的片段(GenBank登錄序列號(hào):HQ184474).通過(guò)Clustal W進(jìn)行BLAST比對(duì),HQ184474與GenBank上注冊(cè)的序列 AY359858(X.diffusum)、AY430181(X. brevicollum)、AY580057(X. brevicollum)、AY430190(X.brevicollum)相似性99.2%以上.在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù) (圖 2)中 HQ184474與 AY359858、AY430181、AY580057、AY430190 位于同一分支,親緣關(guān)系很近.比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析證實(shí)Luc等[9]的觀點(diǎn),即X.diffusum為 X.brevicollum的同物異名,同時(shí)進(jìn)一步確認(rèn)該蟲(chóng)為短頸劍線蟲(chóng)X.brevicollum.

        ②喜馬拉雅劍線蟲(chóng) ITS區(qū)分子生物學(xué)特征:喜馬拉雅劍線蟲(chóng)的ITS區(qū)擴(kuò)增1 390 bp的片段(Gen-Bank登錄序列號(hào):JN091971),通過(guò)Clustal W進(jìn)行BLAST比對(duì),JN091971與 X.brevicollum相似性較低,低于97.3%.在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2)中,JN091971與X.brevicollum、X.incognitum親緣關(guān)系較近,與Ahmad等[4]描述的近似種吻合.

        圖2 基于ITS序列的美洲劍線蟲(chóng)ME系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Phylogeny of the Xiphinema americanum group inferred from ME analysis of ITS expansion regions

        2.3.2 D2D3區(qū)分子生物學(xué)特征 ①短頸劍線蟲(chóng)D2D3區(qū)分子生物學(xué)特征:短頸劍線蟲(chóng)D2D3區(qū)擴(kuò)增833 bp的片段(GenBank登錄序列號(hào):HQ184473).在NCBI上進(jìn)行 BLAST比對(duì),與 AY601604(X.brevicollum)、HM163209(X.brevicollum)相似性99.9%以上.在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3)中HQ184473與AY601604(X.brevicollum)位于同一分支,親緣關(guān)系很近.從比對(duì)和進(jìn)化分析結(jié)果進(jìn)一步確認(rèn)該蟲(chóng)為短頸劍線蟲(chóng)X.brevicollum.

        圖3 基于D2D3序列的美洲劍線蟲(chóng)ME系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.3 Phylogeny of the Xiphinema americanum group inferred from ME analysis of D2D3 expansion regions

        ②喜馬拉雅劍線蟲(chóng)D2D3區(qū)分子生物學(xué)特征:喜馬拉雅劍線蟲(chóng)D2D3區(qū)擴(kuò)增831 bp的片段(GenBank登錄序列號(hào):JN091972).在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3)中,與X.brevicollum、X.taylori親緣關(guān)系較近,與 Ahmad等[4]描述的近似種吻合.

        3 討論

        短頸劍線蟲(chóng)和喜馬拉雅劍線蟲(chóng)都屬于美洲劍線蟲(chóng)組Xiphinema americanum group,由于美洲劍線蟲(chóng)組內(nèi)部分種間的差異非常小,甚至交叉重疊,rDNA序列的相似性很高,美洲劍線蟲(chóng)組的有效種數(shù)量存在爭(zhēng)議,如Lamberti等[10]認(rèn)為有49個(gè)有效種,Luc等[9]認(rèn)為有34個(gè)有效種.本文對(duì) X.diffusum 和 X.brevicollum線蟲(chóng)進(jìn)行形態(tài)比較及rDNA序列分析,兩者形態(tài)特征及測(cè)量值重疊,在ITS系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中兩者處于同一分支,說(shuō)明這2種線蟲(chóng)屬于同一種線蟲(chóng),與 Luc等[9]認(rèn)為 X.diffusum 是 X.brevicollum 的同物異名結(jié)論吻合.

        基于rDNA-ITS、D2D3序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),與 Lazarova等[11]基于 rDNA-18S和 mtDNA序列、Lamberti等[12]基于形態(tài)特征建立的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本類似.基于rDNA序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)不僅從一定水平上揭示了劍線蟲(chóng)屬內(nèi)種群間的親緣關(guān)系,也從另外一個(gè)角度支持了目前的形態(tài)分類觀點(diǎn),rDNA序列可以作為劍線蟲(chóng)種類鑒定和進(jìn)化分析的良好指標(biāo).

        短頸劍線蟲(chóng)于2011年在日本報(bào)道[13].本文首次報(bào)道了喜馬拉雅劍線蟲(chóng)在日本分布,并公布了這2種線蟲(chóng)ITS、D2D3序列.

        短頸劍線蟲(chóng)和喜馬拉雅劍線蟲(chóng)為國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局首次截獲.目前短頸劍線蟲(chóng)只在我國(guó)的江蘇、浙江、湖南、廣西等省區(qū)局部分布[14].喜馬拉雅劍線蟲(chóng)在我國(guó)沒(méi)有分布記載.所以,應(yīng)加強(qiáng)進(jìn)境植物的審批和監(jiān)管,以保護(hù)我國(guó)農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)的安全.

        致謝:短頸劍線蟲(chóng)標(biāo)本經(jīng)浙江大學(xué)鄭經(jīng)武教授的復(fù)核,在此深表謝意!

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