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        甘蔗花葉病毒侵染玉米后硫氧還蛋白M1,M3的表達(dá)譜變化

        2012-05-10 02:07:58孫炳劍王振躍
        關(guān)鍵詞:花葉病毒侵染定量

        施 艷,孫 虎,孫炳劍,王振躍

        (1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,河南鄭州450002;2.河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)所,河南鄭州450002)

        甘蔗花葉病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)是馬鈴薯Y病毒屬的成員之一,已有文獻(xiàn)報(bào)道,通過(guò)抑制性消減雜交和基因芯片技術(shù)研究寄主對(duì)甘蔗花葉病毒的抗性[1]以及SCMV抗性基因的定位[2,3].已有研究通過(guò)抑制性消減雜交技術(shù)研究了病毒侵染后玉米寄主基因的差異表達(dá),并且克隆了其中一個(gè)病毒侵染后誘導(dǎo)表達(dá)的基因玉米硫氧還蛋白M2,發(fā)現(xiàn)玉米硫氧還蛋白 M2對(duì) SCMV的侵染是起到抑制作用的.硫氧還蛋白是一類(lèi)相對(duì)分子質(zhì)量約為12 kD的小蛋白.所有的硫氧還蛋白都具有一個(gè)保守的活性中心,Trp-Cys-Gly(Ala)-Pro-Cys,活性中心中的這2個(gè)半胱氨酸起到氧化還原作用[4].隨著對(duì)植物中的硫氧還蛋白特別是擬南芥(Arabidopsis thaliana)中的硫氧還蛋白研究的深入,硫氧還蛋白在植物中的許多重要作用也逐步顯示出來(lái)[5~10],在水稻中,通過(guò)轉(zhuǎn)基因的方法敲除水稻硫氧還蛋白酶的表達(dá),結(jié)果表明,水稻硫氧還蛋白酶在植物的生長(zhǎng)和發(fā)育過(guò)程中有至關(guān)重要的作用[11].擬南芥硫氧還蛋白m3(Trxm3)主要存在于非綠色組織的質(zhì)體內(nèi),通過(guò)基因突變發(fā)現(xiàn)Trxm3與胞間連絲的調(diào)控有關(guān),Trxm3突變的植株中胞間連絲的分支增多并且胼胝質(zhì)的積累也加強(qiáng)[12].為了成功建立侵染,病毒通過(guò)利用寄主因子來(lái)幫助它進(jìn)行復(fù)制和移動(dòng).在病毒侵染的不同階段,許多參與寄主新陳代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及防衛(wèi)反應(yīng)的基因的表達(dá)譜會(huì)發(fā)生變化[13~15],因此,研究病毒侵染后寄主差異表達(dá)的基因?qū)⒂兄诹私獠《镜那秩緳C(jī)制.本研究采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法研究了SCMV侵染后的不同階段玉米硫氧還蛋白M1和M3表達(dá)水平的變化,分析玉米中不同硫氧還蛋白M與SCMV侵染的相關(guān)性,為進(jìn)一步深入研究玉米硫氧還蛋白M的在抗病毒反應(yīng)中的機(jī)制提供證據(jù).

        1 材料與方法

        1.1 植物材料

        以玉米(Zea mays L.)品種綜31為試驗(yàn)材料.

        1.2 病毒接種與葉片采集

        在人工氣候室種植玉米品種綜31,待玉米長(zhǎng)到三葉期選擇長(zhǎng)勢(shì)好,生長(zhǎng)狀態(tài)一致的玉米幼苗分別接種對(duì)照0.01 mol·L-1磷酸緩沖液(phosphate buffer,PB)和甘蔗花葉病毒(SCMV)侵染的玉米汁液.

        接種后 2,6,10,14 d,分別采取對(duì)照接種和SCMV接種的玉米的第1片系統(tǒng)葉,接種后8 d系統(tǒng)葉片上可以觀(guān)察到花葉癥狀.

        1.3 玉米的RNA提取與cDNA合成

        利用 Trizol提取總 RNA,利用 TaKaRa的DNase進(jìn)行總RNA處理,以質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA的完整性,利用微量分光光度計(jì)Nanodrop檢測(cè)RNA的含量和純度.每個(gè)樣品取0.5 μg總RNA進(jìn)行第1鏈cDNA合成,方法參照Promega公司的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶使用說(shuō)明進(jìn)行.

        1.4 實(shí)時(shí)熒光RT-PCR引物設(shè)計(jì)

        根據(jù)已經(jīng)發(fā)表的Trm序列,利用軟件Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)Real-time PCR的內(nèi)參引物和目的片段引物,引物序列見(jiàn)表1.

        1.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系

        Real time PCR應(yīng)用ABI 7500擴(kuò)增儀的操作方法.按照 TAKARASYBR Premix Ex Taq(Perfect Real Time)的方法操作,反應(yīng)條件如下:94℃,30 s;94 ℃,5 s;58 ℃,20 s;72 ℃,35 s.40個(gè)循環(huán).

        1.6 數(shù)據(jù)分析

        試驗(yàn)重復(fù)3次,采用Microsoft Excel處理數(shù)據(jù),用SAS8.2軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,顯著性測(cè)驗(yàn)在0.05水平進(jìn)行.

        表1 Real-time PCR引物序列Table 1 Primer sequence for real-time PCR

        2 結(jié)果與分析

        2.1 玉米總RNA質(zhì)量分析及cDNA第1鏈合成

        利用Trizol提取總RNA,通過(guò)微量分光光度計(jì)Nanodrop檢測(cè)RNA的濃度和純度(表2).由表2可見(jiàn),紫外吸光值A(chǔ)260/A280的比值均為1.8~2.0,表明提取的總RNA的純度較高,采用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),可以發(fā)現(xiàn)RNA條帶清晰,沒(méi)有拖帶現(xiàn)象,表明提取的總RNA的純度和完整性較好,可以用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析.

        表2 玉米總RNA純度和質(zhì)量濃度Table 2 Purity and concentration of total RNAmg·L-1

        圖1 玉米總RNA瓊脂糖凝膠電泳分析Fig.1 Agrose gel analysis of total RNA in maize

        2.2 實(shí)時(shí)熒光定量體系的建立

        玉米硫氧還蛋白M1(ZmTrm1)在模板量為2.5 mg·L-1時(shí),退火溫度為58℃時(shí)擴(kuò)增曲線(xiàn)的Ct值為22,介于15~30,表明有良好的擴(kuò)增,融解曲線(xiàn)只有單一的融解峰,表明ZmTrm1是特異性擴(kuò)增.玉米硫氧還蛋白 M3(ZmTrm3)在模板量為25 mg·L-1時(shí),擴(kuò)增曲線(xiàn)的Ct值為24,融解曲線(xiàn)顯示單一的融解峰,表明ZmTrm3也是特異性擴(kuò)增(圖2).

        圖2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增的融解曲線(xiàn)Fig.2 Melting curve of real-time PCR

        2.3 SCMV侵染后不同階段ZmTrm1和ZmTrm3表達(dá)水平分析

        通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析ZmTrm1在SCMV接種后2,6,10和14 d的表達(dá)水平.從圖3和圖4可以看出,在接種后2,6和10 d,SCMV接種葉片與對(duì)照接種葉片ZmTrm1和ZmTrm3表達(dá)水平差異不顯著,P值均 >0.05,在接種后 14 d,SCMV接種的葉片中的ZmTrm1和ZmTrm3表達(dá)水平顯著下降.

        3 討論

        硫氧還蛋白通過(guò)調(diào)控二硫鍵的氧化還原作用于一系列的靶標(biāo)蛋白,從而影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育,已有報(bào)道表明,硫氧還蛋白參與了細(xì)胞內(nèi)的維生素合成、蛋白折疊和轉(zhuǎn)運(yùn)、蛋白降解以及淀粉降解等過(guò)程[16~18],此外,楊樹(shù)中的葉綠體硫氧還蛋白 m調(diào)控的過(guò)氧化物氧化酶參與了病菌的防衛(wèi)反應(yīng)[19].

        實(shí)時(shí)熒光定量PCR已被廣泛地應(yīng)用于功能基因表達(dá)的定量分析[20],本研究采用SYBR Green I隨機(jī)摻入法是根據(jù)熒光染料與DNA雙鏈結(jié)合后釋放熒光的特點(diǎn)而建立的一種實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù),它的成本相對(duì)TaqMan探針?lè)ㄒ?,而且不需要探?由于SYBR Green結(jié)合DNA雙鏈?zhǔn)欠翘禺愋越Y(jié)合,因此非特異性擴(kuò)增可能會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,本研究通過(guò)對(duì)擴(kuò)增的融解曲線(xiàn)的分析可以發(fā)現(xiàn),只有單一的融解峰,因此,本試驗(yàn)設(shè)計(jì)的引物保證了PCR擴(kuò)增的特異性以及相對(duì)定量的可靠性.

        ZmTrm1和ZmTrm3的表達(dá)水平在SCMV接種后2,6,10 d與對(duì)照沒(méi)有顯著差異,而在接種后14 d ZmTrm1和ZmTrm3的表達(dá)水平顯著降低,兩者受病毒調(diào)控表達(dá)水平的變化不同與ZmTrm2表達(dá)水平的變化.已有研究表明,ZmTrm2在接種后10 d顯著上調(diào)表達(dá),對(duì) SCMV的侵染起到抑制作用[21],而 ZmTrm1和 ZmTrm3 在接種后 10 d 表達(dá)水平?jīng)]有顯著變化,只是在SCMV侵染后期表達(dá)水平要顯著下降,這可能是由于病毒侵染后期,葉片中葉綠體結(jié)構(gòu)遭受破壞,光合作用變?nèi)跛鸬?硫氧還蛋白M是一種定位于葉綠體中,通過(guò)光調(diào)節(jié)碳代謝途徑發(fā)揮作用,因此葉綠體結(jié)構(gòu)的破壞可能會(huì)影響硫氧還蛋白M的表達(dá).硫氧還蛋白是一類(lèi)重要的氧化還原調(diào)節(jié)蛋白,不同的硫氧還蛋白M在病毒侵染的過(guò)程中發(fā)揮了不同的作用,本研究發(fā)現(xiàn)硫氧還蛋白M1和M3在SCMV侵染的后期表達(dá)水平顯著降低,通過(guò)影響防衛(wèi)反應(yīng)途徑的相關(guān)靶標(biāo)蛋白發(fā)揮作用,從而間接地影響病毒侵染.

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