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        熒光定量PCR法檢測鄰苯二甲酸酯的研究

        2012-04-29 14:29:38白舟等
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年4期

        白舟等

        摘要:建立了一種利用外切酶保護-熒光定量PCR檢測環(huán)境激素鄰苯二甲酸酯的方法。將從魚肝臟中提取含雌激素受體的細(xì)胞溶質(zhì),與不同濃度的鄰苯二甲酸酯結(jié)合,采用常規(guī)PCR方法擴增制備雙鏈結(jié)合DNA,將其與配體-受體復(fù)合物反應(yīng)的結(jié)合物,用核酸外切酶ExoⅢ和S1核酸酶處理,消解游離DNA,并以消解后產(chǎn)物作為模板,進行熒光定量PCR擴增反應(yīng),建立Ct值與鄰苯二甲酸酯質(zhì)量濃度C(g/L)的對數(shù)標(biāo)準(zhǔn)曲線:Ct=-0.273 lg(C)+6.320。將該方法應(yīng)用于水樣中鄰苯二甲酸酯的檢測,最低檢測限達到10~100 μg/mL。該法準(zhǔn)確度高、抗干擾性強、適用于檢測大批量環(huán)境樣品中鄰苯二甲酸酯。

        關(guān)鍵詞:鄰苯二甲酸酯;熒光定量PCR;核酸外切酶

        中圖分類號:X826;X56文獻標(biāo)識碼:A文章編號:0439-8114(2012)04-0823-04

        鄰苯二甲酸酯(Phthalates)是塑料的增塑劑,用于增大產(chǎn)品的可塑性和提高產(chǎn)品的強度[1]。隨著塑料工業(yè)的迅速發(fā)展和塑料制品的廣泛應(yīng)用,這類污染物已大量進入環(huán)境,普遍存在于土壤、底泥、水體、生物、空氣及大氣降塵物等環(huán)境中[2,3],對環(huán)境的不利影響也逐漸凸顯。研究表明,鄰苯二甲酸酯具有急性毒性、致癌性和致畸性等多種生物毒性[4-6],而且鄰苯二甲酸酯水解和光解速率都非常緩慢,已成為一種全球性的環(huán)境有機污染物,被中國環(huán)境檢測總站和美國EPA列為優(yōu)先控制污染物[7]。

        目前,鄰苯二甲酸酯的檢測方法包括:氣相色譜法[8]、液相色譜法[9]、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法(GC-MS)[10]以及熒光法[11]等。由于這類方法檢測成本高,操作復(fù)雜,分析時間長,因此不利于對環(huán)境樣品的快速分析。

        近年來,隨著生物技術(shù)的發(fā)展,利用具有高靈敏度的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)檢測技術(shù)檢測鄰苯二甲酸酯正逐漸受到關(guān)注。目前,PCR技術(shù)主要用于檢測鄰苯二甲酸酯的雌激素效應(yīng)[12-15],而直接用于檢測環(huán)境樣本中鄰苯二甲酸酯含量的研究報道較少。

        鄰苯二甲酸酯作為雌激素受體的配體,能夠與雌激素受體結(jié)合并能誘導(dǎo)雌激素受體介導(dǎo)的基因表達,其作用過程為:鄰苯二甲酸酯與細(xì)胞膜或細(xì)胞質(zhì)中的雌激素受體結(jié)合,然后這種結(jié)合體遷移到細(xì)胞核并與核內(nèi)DNA上雌激素反應(yīng)位點結(jié)合,上行調(diào)節(jié)雌激素響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯,翻譯產(chǎn)物蛋白質(zhì)進入相應(yīng)的靶組織或靶器官,從而引起雌激素效應(yīng)[16]。根據(jù)此原理,建立檢測鄰苯二甲酸酯的核酸外切酶保護-熒光定量PCR分析方法。用鄰苯二甲酸酯誘導(dǎo)雌激素受體與特異性的雙鏈DNA結(jié)合,游離的DNA被S1核酸酶降解,以酶切產(chǎn)物作為模板,進行熒光定量PCR反應(yīng)。由于傳統(tǒng)的酶切保護分析方法[17]靈敏度低,假陽性率高。本試驗在傳統(tǒng)酶切保護基礎(chǔ)上,進一步利用S1核酸酶完全切除ExoⅢ酶切后留下的單鏈,使游離的DNA不能被擴增,并結(jié)合SYBR Green I熒光定量PCR技術(shù)對水樣中PAEs含量進行檢測。

        1材料與方法

        1.1試劑

        鄰苯二甲酸二甲酯,PCR試劑盒,SYBR Green I PCR mix,核酸外切酶ExoⅢ,S1核酸酶,其他試劑均為國藥集團化學(xué)試劑有限公司生產(chǎn)。

        主要實驗儀器包括UV-2000紫外分光光度計、Rotor-gene 3000熒光定量PCR儀、DYY-11型電泳儀(北京市六一儀器廠)、Tanon-2500R數(shù)碼凝膠圖像處理系統(tǒng)(上海天能科技有限公司)。

        1.2引物設(shè)計

        利用primer premier 5.0引物設(shè)計軟件設(shè)計含有雌激素反應(yīng)位點的上下游引物,由上海英駿生物科技有限公司合成。引物序列如下:上游引物R1: 5′CAG GTC AGA GTG ACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′;下游引物R2: 5′GTC CAG TCT CAC TGG ACA GGC AAC TAT GGA TG 3′。下劃線標(biāo)明了雌激素反應(yīng)位點,模板為稀釋50倍后的pUC19質(zhì)粒[18]。

        1.3方法

        1.3.1含有受體細(xì)胞溶質(zhì)的提取取體長為12 cm左右的鯉魚(20尾),用含0.05 mg/L的鄰苯二甲酸酯的水喂養(yǎng)兩周后,取魚肝臟,用冰上預(yù)冷的0.15 mol/L氯化鉀溶液去除肝臟外血液后,吸干其表面水分,按照m(肝臟,mg)∶v(緩沖液,mL)=1∶4的比例加入HEDG緩沖液(冰上預(yù)冷)后勻漿。勻漿液于12 000 r/min離心1 h,收集上清,即為含有雌激素受體的細(xì)胞溶質(zhì),分裝后于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.2 結(jié)合DNA的制備每50 μL擴增體系中包含:滅菌雙蒸水36 μL、pUC19質(zhì)粒模板工作液2 μL、10倍PCR緩沖液5 μL、10 mmol/L的四種核苷酸的混合物(dNTPs)1 μL、上下游引物(10 μmol/L)各2 μL、2 U/μL Taq酶2 μL。常規(guī)PCR循環(huán)步驟:預(yù)變性94℃、5 min;變性94 ℃、30 s;退火58 ℃、40 s;延伸72 ℃、40 s;循環(huán)30次,最終延伸72 ℃、5 min。PCR產(chǎn)物于質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的瓊脂糖凝膠電泳分離,用PCR產(chǎn)物快速純化試劑盒純化回收。

        1.3.3配體-受體-結(jié)合DNA復(fù)合物的制備與酶切將1 g/L的PAEs按10倍比稀釋為1.0×10-1 g/L~1.0×10-9 g/L,各?。保唉蹋?,加入細(xì)胞溶質(zhì)250 μL,于20 ℃振蕩溫育2 h。加入0.2 mL質(zhì)量分?jǐn)?shù)為60%的羥基磷灰石(HAP)混勻,冰浴30 min, 在4℃以3 500 r/mim離心1 min,棄上清。上述沉淀中加入1 mL含質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.05% T-80的HEDG緩沖液,同條件離心15 min,重復(fù)3次,最后1次棄上清,加入0.2 mol/L的磷酸緩沖液0.4 mL,間歇振蕩3次,離心15 min,取上清,即為配體-受體復(fù)合物。

        從上述不同濃度配體-受體復(fù)合物中,每管取出20 μL于1.5 mL小管中,加入2 μL結(jié)合DNA,繼續(xù)20℃溫育15 min,此時溶液中為配體-受體-結(jié)合DNA復(fù)合物。

        酶切步驟:從上述配體-受體-結(jié)合DNA復(fù)合物中各?。保?μL于1.5 mL小管中,加入2 μL ExoⅢ核酸外切酶緩沖液,6 μL Hepes緩沖液,使總體積為20 μL,混勻后37℃溫育15 min;每管再加入ExoⅢ 100 U,混勻后于37℃溫育15 min;按照體積比為1∶3的比例,加入S1核酸酶(2 U/μL)混合液,37℃溫育30 min;再各加入4 μL S1核酸酶終止液,70℃滅活10 min,得到熒光定量PCR的模板。

        1.4熒光定量PCR條件

        每20 μL體系中包含SYBR Green I Master mix 10 μL(MgCl2最佳質(zhì)量濃度為2 μmol/L)、上下游引物(10 μmol/L)各1 μL、配體-受體結(jié)合DNA復(fù)合物酶切產(chǎn)物作為模板2.5 μL、滅菌雙蒸水5.5 μL。熒光定量PCR循環(huán)步驟:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,58℃退火40 s,72℃延伸1 min,循環(huán)40次,最后在72 ℃延伸5 min。

        2結(jié)果與分析

        2.1結(jié)合DNA的凝膠電泳分析

        常規(guī)PCR擴增后產(chǎn)物于質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的瓊脂糖凝膠電泳分析(圖1)。結(jié)合DNA為長度1 024 bp的雙鏈DNA,與設(shè)計的雙鏈DNA長度相符。用PCR產(chǎn)物快速純化試劑盒純化回收后,用紫外分光光度法測得OD260 nm/OD280 nm值為1.86,表明回收DNA純度高。

        2.2配體-受體復(fù)合物的SPR鑒定

        表面等離子體共振(Surface plasmon resonance,SPR)技術(shù)具有免標(biāo)記、實時在線檢測、高靈敏度、非破壞性及高選擇性等優(yōu)點[18]。本試驗采用SPR定性鑒定雌激素受體蛋白與鄰苯二甲酸酯結(jié)合情況(圖2、3)。

        隨著復(fù)合物中加入鄰苯二甲酸酯配體濃度的增加,配體-受體復(fù)合物的SPR響應(yīng)強度增強。在加入鄰苯二甲酸酯濃度在1.0×10-9~1.0 g/L范圍內(nèi),鄰苯二甲酸酯配體濃度與受體-配體復(fù)合物的SPR響應(yīng)強度之間基本呈線性關(guān)系。說明在此濃度范圍內(nèi),加入含雌激素受體的細(xì)胞質(zhì)為250 μL時,鄰苯二甲酸酯可與雌激素受體結(jié)合。

        2.3不同濃度鄰苯二甲酸酯誘導(dǎo)結(jié)合DNA的SYBR Green I熒光定量PCR

        以不同濃度的鄰苯二甲酸酯制備的配體-受體-結(jié)合DNA復(fù)合物,經(jīng)過外切酶保護處理,作為熒光定量PCR模板進行擴增,擴增曲線見圖4和圖5。鄰苯二甲酸酯配體質(zhì)量濃度C(g/L)對數(shù)與Ct值具有線性關(guān)系,兩者關(guān)系式為Ct=-0.273*log(C)+6.320,R2=0.994 8,本方法對鄰苯二甲酸酯的檢出限為10-10 g/L,在低濃度水平下,Ct并未出現(xiàn)顯著變化。

        本試驗的受試水樣來源于松江東華大學(xué)北側(cè)的張家浜河河水,樣本經(jīng)過預(yù)處理后進行檢測,結(jié)果如圖6所示,其線性檢測范圍為10~100 μg/mL。

        2.4特異性分析

        將多氯聯(lián)苯和雙酚A代替鄰苯二甲酸酯后,按1.4中所述方法進行熒光定量PCR擴增,未發(fā)現(xiàn)擴增信號,表明多氯聯(lián)苯和雙酚A并沒有與受體結(jié)合,而鄰苯二甲酸酯能與受體結(jié)合,說明此方法特異性較好。

        2.5加標(biāo)回收分析

        用不含鄰苯二甲酸酯的水樣進行加標(biāo)回收試驗。加標(biāo)回收結(jié)果見表1。由結(jié)果可知,回收率為81.6%~97.6%,相對標(biāo)準(zhǔn)偏差為2.69%~4.45%。由表1可以看出,本文建立的外切酶保護-熒光定量PCR方法準(zhǔn)確度高,可以較好地應(yīng)用于環(huán)境中鄰苯二甲酸酯的檢測。

        3結(jié)論

        建立了一種利用外切酶保護-熒光定量PCR檢測方法,用S1核酸酶完全切除核酸外切酶ExoⅢ酶切后留下的單鏈,使游離DNA完全不能被PCR擴增出來,提高了靈敏度。以配體-受體-DNA復(fù)合物為模板進行PCR擴增,當(dāng)配體-受體-DNA復(fù)合物中加入的鄰苯二甲酸酯質(zhì)量濃度在10-9~10-1 g/L范圍內(nèi)時,鄰苯二甲酸酯對數(shù)濃度與Ct值線性關(guān)系為Ct=-0.273lg(C)+6.320。水樣樣本的檢測范圍達10~100 μg/mL。該方法可同時處理多個樣品,且靈敏度高,準(zhǔn)確性好,抗干擾性強,檢測過程僅2~3 h,為高通量快速檢測環(huán)境樣品中的鄰苯二甲酸酯提供了新方法。

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