叢 瑞 佟小非 劉三都 謝 勇 尤 紅
(1.首都醫(yī)科大學附屬北京友誼醫(yī)院肝病中心,北京 100050;2.貴州省黔南州人民醫(yī)院感染科,貴州 黔南 558000;3.貴州省平塘鎮(zhèn)人民醫(yī)院感染科,貴州 黔南 558300)
近期多項全基因組關聯(lián)分析研究(genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn)白細胞介素28B(interleukin-28B,IL-28B)的基因多態(tài)性(編碼Ⅲ型干擾素IFN-λ3)不僅與丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染者對治療的應答有關,還與急性HCV感染者的自發(fā)清除高度相關,這些位點包括rs12979860、rs8099917、 rs10853728、 rs12980275、 rs4803219、rs4803223、rs8105790 等[1-5]。然而在目前的研究中,來自中國人的研究所占比例較少,且這些研究均來自中國臺灣及美國舊金山。所以本研究探討IL-28B基因多態(tài)性與我國HCV感染者自發(fā)清除的關系。
本研究共納入122例HCV抗體陽性的丙型肝炎病毒感染者,其中男性59例,女性63例,平均年齡24.4歲。在122例HCV感染者中有10例無法推斷其可能的感染時間。
根據(jù)2004年頒布的《丙型肝炎防治指南》中規(guī)定:自發(fā)清除者為有輸血史、應用血液制品史或明確的HCV暴露史,經(jīng)檢測HCV抗體陽性,而HCV RNA陰性的HCV感染者;慢性丙型肝炎(chronic hepatitis C,CHC)患者為HCV感染超過6個月,或發(fā)病日期不明、無肝炎史,但肝臟組織病理學檢查符合慢性肝炎,或根據(jù)癥狀、體征、實驗室及影像學檢查結果綜合分析,亦可診斷。這些患者均未經(jīng)過干擾素聯(lián)合利巴韋林的抗病毒治療。
1.3.1 基因組DNA提取及IL-28B基因分型
取患者外周血凝塊0.5 mL,采用離心柱方法(天根DP308提血試劑盒)提取全基因組DNA,按照說明書進行操作。采用紫外分光光度儀(Eppendorf公司,德國)檢測DNA濃度。運用PCR的方法對GWAS研究的候選基因:rs12979860、rs8099917、rs10853728、rs12980275、rs4803219、rs4803223、rs8105790 擴增后用3730測序儀測序并分型(由上海英駿生物技術有限公司完成)。PCR反應條件:95℃預變性10 min;95℃變性30 s,55℃復性30 s,72℃延伸40 s,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。7個位點的引物設計由Pubmed Primer blast設計,由賽百盛公司合成,引物序列見表1。
表1 PCR測序引物Tab.1 Primers for PCR sequencing
1.3.2 HCV病毒定量
HCV定量檢測采用匹基試劑檢測,購自深圳匹基生物工程有限公司,檢測過程嚴格按照說明書進行,檢測下限為1 000拷貝/mL。
采用SPSS 11.5統(tǒng)計學軟件對結果進行處理,采用χ2檢驗分析不同IL-28B基因型、性別與HCV感染者自發(fā)清除病毒的關系。采用非參數(shù)秩和檢驗比較不同基因型患者病毒定量的關系。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
圖1 IL-28B基因的7個SNP位點的位置Fig.1 Site of 7 SNPs around IL-28B gene SNP:single nucleotide polymorphism.
122例患者中24例(19.7%)患者獲得了自發(fā)清除,98例(80.3%)轉為慢性丙型肝炎。自發(fā)清除組中,男性13例(54.2%),慢性丙型肝炎組中,男性46例(46.9%),兩者間性別差異無統(tǒng)計學意義。在明確感染時間的112例感染者中自發(fā)清除組的平均感染年齡為(17.8±14.7)歲,而慢性丙型肝炎組為(28.8±14.6)歲,兩者差異有統(tǒng)計學意義(P=0.002),詳見表2。
表2 入組患者臨床特征Tab.2 General data between spontaneous clearance group and non-clearance group n(%)
本研究中7個SNP位點中不同基因型患者間的自發(fā)清除率差異均無統(tǒng)計學意義(圖2)。
圖2 IL-28B基因型與HCV自發(fā)清除的關系Fig.2 IL-28B genotype and HCV spontaneous clearance
rs12979860位點在自發(fā)清除組中CC型22人,CT型為2人,慢性丙型肝炎組中CC型74人,CT型24人。CC基因型與CT基因型2者自發(fā)清除率分別為22.9%(22/96)、7.7%(2/26),P=0.146;rs8099917位點在自發(fā)清除組中TT型22人,TG型為2人,慢性丙型肝炎組中TT型78人,TG型20人。2種基因型自發(fā)清除率分別為22%(22/100)、9.1%(2/22),P=0.279;rs12853728位點在自發(fā)清除組中CC型17人,CG型為7人,慢性丙型肝炎組中CC型58人,CG型40人,2種基因型自發(fā)清除率分別為22.7%(17/75),14.9%(7/47),P=0.293;rs12980275 位點在自發(fā)清除組中AA型22人,AG型2人,慢性丙型肝炎組中AA型75人,AG型22人。兩種基因型自發(fā)清除率分別為 22.7%(22/97),8.3%(2/24),P=0.196。rs4803219位點自發(fā)清除組中CC型22人,CT型2人,慢性丙型肝炎組CC型77人,CT型21人,兩種基因型自發(fā)清除率分別為22.2%(22/43),8.7%(2/78),P=0.238;rs4803223位點自發(fā)清除組AA型16人,AG型8人,慢性丙型肝炎組AA型80人,AG型18人,2者自發(fā)清除率分別為16.7%(16/96),30.8%(8/36),P=0.109;rs8105790位點自發(fā)清除組TT型22人,TC組2人,慢性丙型肝炎組TT型73人,TC組25人。2種基因型自發(fā)清除率分別為23.2%(22/95),7.4%(2/27),P=0.123,詳見表3。
表3 IL-28B基因7個SNP位點與HCV自發(fā)清除Tab.3 7 SNP of IL-28B genotype and HCV spontaneous clearance n(%)
本研究入組的122例患者中,經(jīng)檢測HCV RNA,其中98例患者病毒定量為陽性,成為慢性丙型肝炎患者,病毒水平中位數(shù)為5.58 log IU/mL,具體檢測結果見表4。在98例慢性丙型肝炎患者中,29例(29.6%)患者轉氨酶升高。
表4 慢性丙型肝炎患者臨床特征Tab.4 General data in chronically infected group
檢測慢性丙型肝炎患者未經(jīng)干擾素聯(lián)合利巴韋林治療前的基線病毒水平,采用非參數(shù)秩和檢驗比較rs12979860位點CC及CT型二者病毒載量水平(Z=-2.07,P=0.83);rs8099917位點TT型與TG型比較(Z=-0.366,P=0.715);rs10853728位點CC型與CG型比較(Z=-1.034,P=0.301);rs12980275位點AA型與AG型比較(Z=-1.034,P=0.301);rs4803219位點CC型與CT型比較(Z=-0.697,P=0.486);rs4803223位點AA型與AG型比較(Z=-0.005,P=0.996);rs8105790位點TT型與TC型比較(Z=-1.011,P=0.312),結果差異均無統(tǒng)計學意義。
本研究通過對IL-28B周圍7個SNP位點與HCV感染者自發(fā)清除之間關系的探討,發(fā)現(xiàn)IL-28B基因與我國HCV感染者自發(fā)清除無顯著關聯(lián)性,但患者感染時的年齡卻與HCV感染者能否自發(fā)清除病毒高度相關。來自美國的橫斷面研究[5]顯示:年齡大于20歲的HCV感染者感染后慢性化率為30%,然而小于20歲的HCV感染者為76%。另一個來自意大利的研究[6]也表明:12-25歲的HCV感染者慢性化率為56%,而年齡大于25歲的患者慢性化率則為87%。由此可見,感染時年齡越小,則自發(fā)清除率越高。本研究中自發(fā)清除組患者平均年齡較慢性化組平均年齡低,并且年齡小于20歲較大于20歲感染者自發(fā)清除率高,這些結果進一步證實年齡與HCV清除及疾病進展有關。
此外,對已經(jīng)發(fā)展為慢性丙型肝炎的患者,我們也未發(fā)現(xiàn)IL-28B基因型與病毒載量的高低有關。王東生[7]等研究了我國394例HCV感染者rs12979860位點與HCV自發(fā)清除的關系,其中自發(fā)清除者60例,慢性丙型肝炎患者339例,結果與本研究結果類似,也未發(fā)現(xiàn)差異有統(tǒng)計學意義。究其原因,可能是由于rs12979860在我國人群中T等位基因頻率(本研究中為10%,王東生等[7]研究中為 6%)較歐洲人群(32.6%)[2]低。并且由于IL-28B基因周圍的SNP位點為基因多態(tài)性位點,不如突變位點對疾病的影響顯著。
總之,宿主因素在急性丙型肝炎病毒感染的自發(fā)清除過程中起著十分重要的作用,IL-28B基因多態(tài)性可能預測HCV自發(fā)清除率,然而仍有其他的影響因素需要進一步深入研究,尤其在我國HCV感染人群中尤為重要。
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