魏 明 何 勇 金 強(qiáng) 田志宏
(長(zhǎng)江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 湖北 荊州 434025)
高羊茅(Festuca arundinacea)又名葦狀羊茅,葦狀狐茅,是禾本科羊茅屬(Fescue)多年生叢生草本植物,是冷地型禾本科草種中抗熱抗干旱性最強(qiáng)的草種之一[1]。近幾十年來(lái),高羊茅越來(lái)越多的應(yīng)用于草坪,新品種也逐年增加。如何快速準(zhǔn)確地區(qū)分這些品種成為草坪工作者共同關(guān)注的問題。由于我國(guó)除少量的結(jié)縷草品種外,其余草種長(zhǎng)期以來(lái)一直依賴于國(guó)外引種[2],加之國(guó)內(nèi)部分種子經(jīng)營(yíng)者片面追求經(jīng)濟(jì)效益而忽視質(zhì)量,造成國(guó)內(nèi)市場(chǎng)上高羊茅品種混雜、親緣關(guān)系不清,給良種保護(hù)和新種開發(fā)帶來(lái)了極大的不便。
在成熟谷類種子中,總蛋白約為種子干重的7%~16%,其中大部分為貯藏蛋白。通常根據(jù)蛋白質(zhì)的溶解性,將種子貯藏蛋白質(zhì)分為4類:水溶蛋白、鹽溶蛋白、醇溶蛋白和堿(或酸)溶蛋白[3]。禾本科種子中的貯藏蛋白,呈現(xiàn)豐富的多樣性,并且很少受植物生長(zhǎng)環(huán)境、世代和收獲年限的影響。貯藏蛋白是影響種子品質(zhì)的因素之一,自Bushuk于1978年提出醇溶蛋白的酸性聚丙烯酰胺凝膠電泳(A-PAGE)方法以來(lái)[4],種子貯藏蛋白便作為遺傳標(biāo)記已被廣泛應(yīng)用于禾谷類作物種、屬間關(guān)系、種內(nèi)遺傳多樣性分析、品種鑒定及植物繁育系統(tǒng)的鑒別[5-10],但在草坪草的品種鑒定方面卻鮮有報(bào)道。
為了滿足我國(guó)草坪業(yè)的進(jìn)一步發(fā)展需求,本文采用種子貯藏蛋白電泳技術(shù),對(duì)市售高羊茅種子進(jìn)行貯藏蛋白分析,以求從蛋白質(zhì)水平上探討高羊茅的遺傳多樣性,闡明其種子蛋白水平的遺傳差異,為高羊茅品種間遺傳差異及高羊茅種質(zhì)資源的分類鑒定提供一定參考。
選用近年來(lái)國(guó)內(nèi)市場(chǎng)較為常見的18個(gè)高羊茅品種(表1)。
1.2.1 樣品制備
每個(gè)品種取完整籽粒200粒,去穎殼后經(jīng)粉碎機(jī)粉碎,過80目篩,取樣品0.08g裝入1.5mL離心管中,加入樣品提取劑1mL,震蕩5min搖勻。在室溫下放置(水溶蛋白室溫浸提24h,醇溶蛋白室溫浸提12h),再將離心管轉(zhuǎn)移至沸水浴中煮沸10 min,最后在12000r/min的速度下離心10min,上清液即為種子貯藏蛋白質(zhì)的提取液,取上清液4℃貯藏備用[11]。
表1 供試高羊茅品種表
1.2.2 電泳
參照農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《玉米種子純度鹽溶蛋白電泳鑒定方法》(NT/T499-2001)[12]中的乳酸-聚丙烯酰胺凝膠電泳方法,對(duì)其進(jìn)行改進(jìn)(表2),使用北京六一儀器廠制造的DYY-10三恒型電泳儀和DYY-Ⅲ28B型垂直雙板夾芯式電泳槽,水溶蛋白用50%甘油做提取劑,醇溶蛋白用75%乙二醇做提取劑,不連續(xù)SDS-PAGE濃縮膠的濃度為5%,分離膠濃度為12%可以達(dá)到最佳的分離效果。濃縮膠、分離膠配方見表2。
表2 凝膠的配制
1.2.3 染色
膠板剝離后,加入至少5倍分離膠體積的固定液(80%甲醇,20%冰乙酸)固定1 h,溴酚藍(lán)指示劑由藍(lán)色變?yōu)辄S色后,倒去固定液,蒸餾水沖洗數(shù)次,加入與固定液等體積染色液(0.125 g考馬斯亮蘭R-250溶于250 mL固定液)染色3 h以上或40℃染色40 min,倒去染色液,蒸餾水沖洗數(shù)次,洗凈凝膠表面殘留染色液[22-24],(5%甲醇、7.5%冰乙酸)震蕩脫色,每30 min更換一次脫色液,直至背景脫至無(wú)色,10%的醋酸溶液中保存或拍照保存。
1.2.4 貯藏蛋白電泳譜帶統(tǒng)計(jì)及聚類分析
用0、1表示電泳譜帶的有無(wú),在相同遷移位置上有蛋白質(zhì)譜帶的記為1,無(wú)帶記為0,建立資料數(shù)據(jù)庫(kù)并使用軟件NTSYSpc 2.1進(jìn)行高羊茅品種聚類分析。
18個(gè)品種的高羊茅種子水溶蛋白共表現(xiàn)出20條譜帶(圖1、圖2),最多的表現(xiàn)出18條帶,最少的表現(xiàn)出15條帶,但各品種間的條帶差異不大,特異性的條帶不多(圖2)。
圖1 18個(gè)品種的高羊茅種子水溶蛋白電泳圖譜
圖2 18個(gè)品種的高羊茅種子水溶蛋白電泳圖譜示意圖
18個(gè)品種的高羊茅種子醇溶蛋白共表現(xiàn)出27條譜帶(圖3、圖4),最多的表現(xiàn)出24條帶,最少的表現(xiàn)出11條帶。條帶特異性比較明顯(圖4)。
圖3 18個(gè)品種的高羊茅種子醇溶蛋白電泳圖譜條帶
圖4 18個(gè)品種的高羊茅種子醇溶蛋白電泳圖譜條帶
高羊茅貯藏蛋白中的鹽溶蛋白和醇溶蛋白聚丙烯酰胺凝膠電泳圖譜,從不同角度反映了供試品種的蛋白質(zhì)多態(tài)性,但進(jìn)行綜合比較發(fā)現(xiàn)用水溶蛋白做聚類分析效果不佳,不能完全區(qū)分品種,因此采用醇溶蛋白來(lái)做聚類分析。
表3 18個(gè)品種的高羊茅遺傳相似性系數(shù)
按Nei氏 (1983)公式計(jì)算品系間的遺傳相似性系數(shù)(GS)(表 3)。 GS=2Nij/(Ni+Nj),其中 Ni為材料 i中出現(xiàn)的條帶數(shù),Nj為材料j中出現(xiàn)的條帶數(shù),Nij為材料i和材料j共有的條帶數(shù)。遺傳差異即遺傳距離GD=1-GS。遺傳相似系數(shù)從 0.3333333到 0.9629630。
以各品種遺傳相似系數(shù)為基礎(chǔ),利用軟件NTSYSpc 2.1中的非加權(quán)組法(UPGMA)進(jìn)行高羊茅品種聚類分析,從圖5看來(lái),以帶型遺傳相似性系數(shù)GS=0.67為度,可將18個(gè)供試品種劃分為2個(gè)類群:園里、RTF、凌志Ⅱ、千年盛世、雅典娜、踏火、紅寶石、3A、貝殼、愛瑞3號(hào)和頂峰聚為一類(類Ⅰ);時(shí)尚、翠碧A、法恩、銳步、火鳳凰、獵狗5號(hào)和選手聚為另一類(類Ⅱ)。
圖5 18個(gè)品種的高羊茅聚類分析樹狀圖
分子生物學(xué)研究表明,品種之間的差異主要取決于遺傳物質(zhì)的差異,蛋白質(zhì)是基因的產(chǎn)物,可作為品種鑒定的依據(jù)[13]。本實(shí)驗(yàn)利用SDS-PAGE對(duì)市售的18個(gè)品種的高羊茅種子貯藏蛋白進(jìn)行分析,共得到水溶蛋白譜帶20條、醇溶蛋白譜帶27條,綜合比較后發(fā)現(xiàn)各品種間的水溶蛋白譜帶差異不大,特異性的條帶不多,醇溶蛋白譜帶特異性比較明顯,遺傳相似系數(shù)從0.3333333到0.9629630,可見在高羊茅品種間有一定數(shù)量的種子貯藏蛋白編碼基因的等位變異,同時(shí)也表明通過種子貯藏蛋白電泳可對(duì)高羊茅的品種鑒定以及育種和種植提供一定的參考,但在育種工作中,尚需要結(jié)合不同品種的性狀表現(xiàn),對(duì)這些品種的聚類分析結(jié)果給以合理的理解,并將其應(yīng)用在親本選配中進(jìn)行生態(tài)育種。由于并非所有的基因都編碼或影響種子貯藏蛋白,所以有些重要性狀的遺傳尚需要結(jié)合同功酶或DNA譜帶的分析。
在不連續(xù)電泳系統(tǒng)中,濃縮膠的存在可濃縮樣品、提高電泳譜帶的分辨率,但減少了分離膠的有效面積和樣品的電泳距離,使電泳譜帶不能很好地加以區(qū)分[8],這種情況在本實(shí)驗(yàn)中也有發(fā)生,在進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)中將根據(jù)實(shí)際情況做進(jìn)一步改進(jìn),使之更加體現(xiàn)品種鑒定高效、快速的特點(diǎn)。
[1]孫吉雄.草坪學(xué)[M].北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社,2003,3:89-90.
[2]高志民,王雁.草坪草引種栽培研究現(xiàn)狀及存在的問題[J].中國(guó)草地,2000(3):60-65.
[3]阮禹松,趙文明.種子鹽溶球蛋白的結(jié)構(gòu)特征[J].西北植物學(xué)報(bào),2002,22(4):999-1003.
[4]Bushuk W.Wheat cultivar identification by gliadin electrophoregrams[J].Can J Plant Sci, 1978,58:505-515.
[5]胡志昂,王洪新.蛋白質(zhì)多樣性和品種鑒定[J].植物學(xué)報(bào),1991,33(7):556-564.
[6]馬瑞君,李常寶,劉艷玲,等.四種沙棘種子可溶性蛋白譜帶分析研究[J].沙棘,1997,10(3):3-9.
[7]黃秀麗,莊東紅,胡忠,等.南瓜屬4個(gè)栽培種種子蛋白質(zhì)電泳分析[J].武漢植物學(xué)研究,2005,23(2):183-187.
[8]孫雁,朱有勇,朱永平,等.蛋白質(zhì)電泳在豌豆品種鑒定中的應(yīng)用[J].種子,2004,23(2):25,30.
[9]J.L.Karihaloo , Manjeet Kaur and Sonika Singh.Seed protein diversity in Solanum melongena L.and its wild and weedy relatives[J].Genetic Resources and Crop Evolution,2002,49:533-537.
[11]馬國(guó)芳,李鈞敏,邊才苗.白菜種子貯藏蛋白的聚丙烯酰胺凝膠電泳分析[J].中國(guó)蔬菜,2004(3):33,34.
[12]NT/T499-2001米種子純度鹽溶蛋白電泳鑒定方法[S].
[13]顏啟傳,鄧光聯(lián),支巨振.農(nóng)作物品種電泳鑒定手冊(cè)[M].上海:上海科學(xué)技術(shù)出版社,1998.