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        大豆Em(LEA1)蛋白保守結構域的結構和聚集特性

        2012-04-12 00:00:00薛蓉鄒永東鄭易之吳亦潔李曉晶裴奉奎
        分析化學 2012年4期

        摘 要 采用圓二色譜(CD)和核磁共振波譜(NMR)方法研究了大豆Em(LEA1)蛋白保守基序EmC和Em2M多肽在不同環(huán)境中的結構及聚集行為。研究表明,在水和DMPG溶液中,兩種多肽主要以無規(guī)結構形式存在。在50% TFE 溶液中,EmC多肽折疊結構增加,含疏水殘基的部分區(qū)域可能形成α螺旋結構,且分子以二聚體形式存在;而Em2M則以單體形式存在,且有序結構較少。以上結果表明,環(huán)境變化可能導致兩種多肽的空間結構和聚集行為改變,這有助于理解Em蛋白在不同環(huán)境中的結構特點,及其重要區(qū)域在全長蛋白中所起的作用。

        關鍵詞 晚期胚胎發(fā)生富集(LEA1)蛋白; 核磁共振; 結構; 聚集

        1 引 言

        晚期胚胎發(fā)生富集(Late embryogenesis abundant,LEA)蛋白是一類與植物抗逆反應相關的重要蛋白質。根據其表達模式和序列特點,可將其分為7組\\。其中第一組LEA蛋白(簡稱為LEA1)全長序列高度保守,富含甘氨酸和帶電氨基酸,且在氨基端、中部和羧基端分別存在不同20氨基酸基序\\。LEA1蛋白主要存在于植物界中,在一些細菌和甲殼綱動物,如豐年蝦等生物體中也發(fā)現(xiàn)了此類蛋白\\。已有研究表明,小麥PM1959、大豆Em和小麥TaEm蛋白(LEA1)的表達可以提高多種生物(如轉基因植物、酵母和大腸桿菌重組子)對干旱、高鹽和滲透等脅迫的耐受性\\。體外實驗證明,小麥Em和大豆Em等(LEA1)可保護乳酸脫氫酶(LDH)或檸檬酸合成酶免于因高溫、干燥和冰凍脅迫所引起的酶活性喪失\\,LEA1蛋白可能具有多重保護功能。因此,揭示LEA1蛋白的保護功能,理解其作用機理,可為有效利用LEA基因,培育抗逆植物新品種提供重要的基礎資料。

        在天然狀態(tài)下,LEA蛋白為無規(guī)結構蛋白\\。Tunnacliffe等\\指出,LEA蛋白結構的可塑性可能是實現(xiàn)多功能的重要基礎。在水溶液中, LEA1蛋白多以自由卷曲和少量α螺旋結構存在。當遇干燥脅迫或在醇溶液中,LEA1蛋白的α螺旋含量增多,預示著LEA1蛋白的α螺旋結構將參與對細胞的保護作用\\。小麥Em蛋白(LEA1)N端的α螺旋結構對經干燥脅迫的酶活性的保護作用是必需的\\。因此,研究LEA1蛋白和其重要結構域的結構及其隨環(huán)境的變化,有助于揭示在各種環(huán)境脅迫下LEA1蛋白與其它分子間可能發(fā)生的相互作用,及保護生物大分子等過程。

        大豆Em蛋白屬LEA1蛋白,可編碼105個氨基酸,其中的第44~63位氨基酸為保守的中部20氨基酸基序(EmM區(qū)),該基序前面有43個氨基酸片段(EmN區(qū)),基序后面有42個氨基酸片段(EmC區(qū))。本課題組最近報告,大豆Em蛋白全長蛋白、EmC、Em2M(含2個M區(qū))和EmN片段的表達均可賦予重組大腸桿菌對高鹽的耐受性,而且還可以通過穩(wěn)定LDH酶蛋白結構、阻止其聚集而保護凍融脅迫下的LDH酶活性\\。

        為了認識Em蛋白和其保守結構域的結構,及其隨環(huán)境變化的特點,并為進一步理解其重要區(qū)域在全長蛋白中所起的作用提供有用的結構信息,本研究采用圓二色譜(CD)和核磁共振波譜(NMR)方法研究了EmC和Em2M多肽在水、50% TFE溶液和陰性脂質體(DMPG)等不同環(huán)境下的結構和聚集行為。2 實驗部分

        2.1 材料

        多肽EmC和Em2M(表1)的表達、純化及鑒定參見文獻 \\。氘代三氟乙醇(TFEd2;98%,Cambridge Isotope Laboratories公司);二肉豆蔻酰磷脂酰甘油(DMPG,Avanti Polar Lipids Inc公司);氯仿和甲醇(東莞市東江化學試劑有限公司)。

        表1 多肽氨基酸序列(50個氨基酸)

        Table 1 Sequence of peptides (50 amino acid)

        M domain of soybean LEAI protein Em (Em2M)GSHMASGGQTRKEQLGTEGYQEMGRKTSGGQTRKEQLGTEGYQEMGRKTSC domain of soybean LEAI protein Em (EmC)GSHMASGGLSTVDKSGEERAQEEGIGIDESKFRTGNNKNQNQNEDQDKTS

        2.2 分析方法

        2.2.1 遠紫外圓二色譜(FarUV CD) (1)樣品制備 A. 水溶液中樣品:將適量肽直接溶于20 mmol/L磷酸鹽緩沖溶液(pH 7.4)中,使肽的終濃度為7

        mol/L,磷脂與肽的濃度比為100∶1,混合溶液在35 ℃水浴中超聲1 h。(2) 儀器 Jasco J815圓二色譜儀。石英比色皿光程為0.1 cm,波長范圍190~250 nm;帶寬1.0 nm;所有實驗均在20 ℃進行。每個樣品掃描2次,每張譜圖取2次的平均值。所有肽膜體系的譜圖均為經過扣除單獨的磷脂膜(背底)后的結果,以平均殘基摩爾橢偏率θ表示:

        θ=θobs10lcn(1)

        θobs是實驗所測的橢偏率(mdeg),l是石英比色皿的路徑長度(cm),c是肽的濃度(mol/L),n是多肽所含氨基酸個數(shù)。

        蛋白質二級結構是通過CDPro軟件進行分析得到的。軟件由3個常用的程序SELCON3, CDSSTR和CONTIN組成。以48個參考蛋白對CD譜進行分析,并取3種程序計算結果的平均值。

        2.2.2 核磁共振波譜 樣品制備:將適量的EmC和Em2M多肽分別溶于50% TFEd2溶液,使多肽的終濃度為2.88 mmol/L。

        用于結構測定的核磁實驗均在布魯克AVANCE 600 MHz核磁共振波譜儀上完成,探頭為配備了X, Y, Z梯度線圈的5 mm三共振反式探頭。選用TSPd4作為內標。實驗溫度為298 K,所有二維1H譜均采用了壓水峰技術。TOCSY和NOESY實驗采用儀器自帶的標準脈沖序列進行采樣,混合時間分別為100和200 ms。采樣數(shù)據矩陣2048

        512,累加96~168次。采用標準Bruker軟件(XWINNMR 3.5版本)進行譜圖處理,處理后的譜圖用SPARKY軟件進行分析。

         

        擴散排序(DOSY)核磁共振實驗在配備有Z軸梯度場的三共振反向檢測探頭的布魯克AVANCE 500MHz核磁共振波譜儀上完成,實驗溫度為298 K。肽擴散系數(shù)的測定采用了含有WATERGATE壓水峰技術的BPPSTE(Bipolar Pulse Pair Stimulated Echo)脈沖序列。水或TFE擴散系數(shù)的測定采用不含壓水峰技術的STE(Stimulated Echo)脈沖序列。

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