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        甘肅新選育黨參品系與主栽品種的RAPD分析

        2012-03-13 07:16:54陳錫蓮高新彥史萬斌劉效瑞
        草業(yè)科學(xué) 2012年12期
        關(guān)鍵詞:黨參品系多態(tài)性

        楊 寧,陳錫蓮,高新彥,史萬斌,劉效瑞

        (1.西北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,甘肅 蘭州 730070; 2.蘭州市城關(guān)區(qū)徐家山林場,甘肅 蘭州 730000;3.定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心,甘肅 定西 743000)

        我國對中藥材的研究已有幾千年的歷史,中藥材資源豐富,是世界中藥材的主產(chǎn)國。甘肅省中藥種植歷史悠久,是全國藥用黨參(Codonopsispilosula)種植的主產(chǎn)區(qū)。中藥材的品質(zhì)關(guān)系到臨床用藥的安全有效,發(fā)展道地藥材是實現(xiàn)中藥現(xiàn)代化的關(guān)鍵,也是占有市場、增強產(chǎn)品競爭力的基本保障。目前,產(chǎn)生道地藥材地域性現(xiàn)象的原因除了與栽培方法、生態(tài)環(huán)境、加工方法有關(guān)外,還與物種居群的遺傳特異性有關(guān),這可能是造成道地藥材與非道地藥材品質(zhì)差異的原因。道地藥材與非道地藥材在形態(tài)和生藥性狀等特征上的差別并不顯著,應(yīng)用傳統(tǒng)方法鑒別道地藥材變得困難。因此,藥材道地性研究已經(jīng)成為中醫(yī)藥科研的重要課題[1-2]。

        黨參為桔??浦参铮h參及其同屬多種植物的干燥根可入藥,其性味甘平、無毒,有補中益氣、生津止渴等功效。主治脾胃虛弱、中氣不足、肺氣虧虛、熱病傷津、氣短口渴、血虛萎黃、頭暈心慌等癥, 是我國傳統(tǒng)的補益藥[3]。甘肅黨參產(chǎn)量居全國之首,主要生產(chǎn)于甘肅的武都、文縣、宕昌、岷縣、渭源、漳縣等地[4]。目前黨參生產(chǎn)中,普遍使用傳統(tǒng)栽培育種方法,品系親緣關(guān)系不明確,缺乏品系鑒定的分子依據(jù),這已經(jīng)成為甘肅黨參產(chǎn)業(yè)發(fā)展的限制瓶頸之一。隨機擴增DNA多態(tài)性(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)技術(shù)以其操作簡單、快速、花費少、DNA用量少、無放射性等優(yōu)點,被廣泛應(yīng)用于中草藥種質(zhì)資源親緣關(guān)系鑒定、遺傳多樣性及藥材道地性研究等方面[5-8]。

        本研究正是基于甘肅省黨參生產(chǎn)及實際銷售中不能提供科學(xué)的藥材道地性鑒定方法等問題,利用RAPD技術(shù)對甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心新選育黨參8個品系和2個主栽品種進行分析鑒定,考證其遺傳多樣性和親緣關(guān)系,以期為甘肅省黨參的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展提供部分分子生物學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1試驗材料 本試驗所用10個黨參樣品由甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心提供,采集于2010年6月。摘取10個黨參樣品的幼葉,用硅膠干燥后帶回實驗室。供試樣品編號見表1。

        1.2方法

        1.2.1總DNA的提取 用SDS方法[9-10]提取植物基因組DNA。將足量黨參的葉片加液氮研磨,加提取液后水浴保溫,而后加入適量氯仿-異戊醇,離心后加無水乙醇使DNA析出。

        1.2.2PCR擴增 反應(yīng)在BIO-RAD普通型PCR儀上進行,RAPD引物由北京奧科生物技術(shù)公司生產(chǎn),所用Taq酶及dNTPs購自天根生化科技(北京)有限公司。

        引物篩選參照張建清等[11]的方法,略作修改。RAPD反應(yīng)體系:100 ng·μL-1模板DNA 1 μL,10 μmol·L-1隨機引物2 μL,2.5 μmol·L-1dNTPs 1 μL,10×Buffer 2.5 μL,2.5 U·μL-1Taq酶 0.5 μL,加ddH2O至25 μL。

        表1 供試材料編號、名稱和采集數(shù)Table 1 Number, name and collection quantity of the tested materials

        擴增程序:94 ℃預(yù)變性5 min后,94 ℃ 1 min,34.5 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,共計43個循環(huán),最后72 ℃延伸10 min。

        采用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(EB)染色,UVI凝膠圖像分析系統(tǒng)觀察照相。每個試驗至少重復(fù)3次。

        1.2.3數(shù)據(jù)處理 參照Williams等[12]的方法,電泳擴增圖譜中的每一條帶(DNA片段)均為一個分子標(biāo)記(Marker),且代表一個引物結(jié)合位點,所有位點的二元數(shù)據(jù)是通過統(tǒng)計標(biāo)記各分子在相同電泳遷移率下(相同分子量片段)的有無得到的,有DNA擴增帶(顯性)為1,無帶(隱性)記為0,強帶和弱帶賦值為1。由NTSYS-PC 統(tǒng)計分析軟件系統(tǒng)中的Dice得到材料間的相似系數(shù)矩陣,建立系統(tǒng)聚類分支樹狀圖。重復(fù)試驗中能穩(wěn)定出現(xiàn)的差異帶即多態(tài)性位點用于數(shù)據(jù)分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1RAPD多態(tài)性分析 通過篩選,從60條隨機引物中選擇譜帶清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性較豐富的14條隨機引物用于PCR擴增反應(yīng)(表2)。14條引物共擴增出159個位點,其中多態(tài)性位點比率為46.43%,不同引物的擴增位點變幅為7~16個,平均每條引物能擴增出11.4個位點,圖1為3號和5號引物的擴增結(jié)果。

        表2 引物序列和擴增結(jié)果Table 2 Primers and amplified results

        圖1 引物P3(左圖)和P5(右圖)擴增的RAPD帶型Fig.1 RAPD results generated by P3 (left) and P5 (right) primers

        2.2遺傳距離和聚類分析 用NTSYS-PS統(tǒng)計分析軟件中的Dice方法得到材料間的遺傳相似性系數(shù)和遺傳距離(表3),供試材料間遺傳相似系數(shù)(GS)值的變化范圍為0.771 9~0.964 9,其平均值為0.834 2。相似系數(shù)越大,材料間的遺傳距離越?。幌嗨葡禂?shù)越小,反之親緣關(guān)系越遠。本研究所采用黨參資源為甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心選育的8個新品系和2個主栽品種,即RAPD標(biāo)記的是種間多態(tài)性,相似系數(shù)值變化范圍較小,此結(jié)論與盛麗等[13]在當(dāng)歸種質(zhì)資源RAPD分析中獲得的結(jié)果相似。

        根據(jù)RAPD數(shù)據(jù)得到的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離圖,按UPGMA法進行聚類分析,建立聚類分支樹狀圖(圖2)。DS6品系與所有其他供試材料的親緣關(guān)系最遠,可單獨聚為一類;DS3品系與DS8品種的親緣關(guān)系最近,其相似系數(shù)為0.964 9。其他黨參材料間的遺傳相似系數(shù)變化不大,表明黨參的種間遺傳關(guān)系較近。

        表3 10個黨參品種(品系)間的遺傳相似性系數(shù)和遺傳距離Table 3 Genetic similarity coefficient and genetic distance among 10 Codonopsis pilosula varieties (strains)

        圖2 10個黨參品種(品系)的UPGMA聚類圖Fig.2 UPGMA cluster analysis of 10 Codonopsis pilosula varieties (strains)

        3 討論與小結(jié)

        3.1RAPD-PCR體系的建立 影響PCR擴增條帶的因素有模板DNA、引物、dNTPs量、Taq酶、退火溫度、電泳中的瓊脂糖質(zhì)量分數(shù)、電泳時間。本試驗在前期工作中對模板DNA含量、引物含量、dNTPs含量、Taq酶含量4個因素進行了優(yōu)化分析,進而建立了適合黨參材料的RAPD-PCR擴增反應(yīng)體系,并對引物退火溫度和電泳中瓊脂糖質(zhì)量分數(shù)進行了梯度篩選,最終確定黨參的最適RAPD-PCR體系為100 ng·μL-1模板DNA 1 μL,10 μmol·L-1隨機引物2 μL,2.5 μmol·L-1dNTPs 1 μL,10×Buffer 2.5 μL,2.5 U·μL-1Taq酶 0.5 μL,ddH2O 18 μL;RAPD引物最佳退火溫度為34.5 ℃,最適瓊脂糖質(zhì)量分數(shù)為1.2%。此體系的建立可為其他黨參品種的RAPD擴增提供參照依據(jù)。

        3.210個黨參材料間的遺傳相似性和多樣性 RAPD是一種顯性標(biāo)記,能從分子水平上揭示材料間存在的遺傳差異[14-16]。本研究從60條隨機引物中篩選出譜帶清晰并呈多態(tài)性的14條引物,結(jié)果證明其穩(wěn)定性較好。不同供試材料在同一引物的RAPD圖譜中的主譜帶基本一致,說明它們的遺傳背景具有很大的相似性,這是鑒定黨參真?zhèn)蔚闹匾獦?biāo)記,可以用于黨參藥材道地性鑒定。另外,不同品種的次譜帶之間存在不同程度的差異,說明不同黨參品系間的遺傳背景也具有一定的多樣性。遺傳相似性及聚類分析表明,甘肅省黨參種質(zhì)資源間的變異范圍較小,種間遺傳關(guān)系較近。這種情況可能是在黨參種植過程中,各個品種之間的地理分布近,并且桔??浦参锒酁楫惢ㄊ诜郏瑥亩裹h參品種間相互授粉的幾率大大提高,造成種間的遺傳關(guān)系較近。本研究中品種DS8和品種DS10分別為選育黨參品種渭黨1號和渭黨2號。品系DS3與品種DS8的親緣關(guān)系最近,其相似系數(shù)為0.964 9,二者可以進一步與品系DS1聚為一類,這3個材料與品種DS10(渭黨2號)的遺傳距離較遠;品系DS6與其他所有供試材料的親緣關(guān)系最遠,可單獨聚為一類。本研究所得結(jié)果可為甘肅省黨參種質(zhì)資源的優(yōu)化提供部分分子生物學(xué)依據(jù)。

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