王貴華,陳義鋒,劉明明,陳翠云,趙亞榮
(北京大北農(nóng)動(dòng)物醫(yī)學(xué)研究中心,北京 100097)
由豬圓環(huán)病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV-2)引起的斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(Postweaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)自20世紀(jì)90年代初被鑒定以來,該病已給世界養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重危害。研究表明,PCV-2感染除了造成PMWS,同時(shí)還與豬呼吸道綜合癥(Porcine respiratory disease complex,PRDC)、豬皮炎和腎病綜合 征 (porcine dermatitis and nephropathy syndrome,PNDS)、先天性震顫、繁殖障礙、胎兒心肌炎和擴(kuò)張性壞死性肺炎等豬圓環(huán)病毒?。≒orcine circovirus associated-disease,PCVAD)密切相關(guān)[1],已成為影響世界養(yǎng)豬業(yè)的最重要的病毒性傳染病。
流行病學(xué)調(diào)查[2-3]表明,當(dāng)前我國豬場(chǎng)的 PCV-2感染已相當(dāng)普遍,由PCV-2感染引起的PCVAD已經(jīng)給我國養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,而且PCV-2基因組在不斷地發(fā)生變異,PCV-2b基因型已取代PCV-2a成為當(dāng)前的優(yōu)墊基因型毒株[4],新毒株或新基因型仍在不斷出現(xiàn)[5]。為了解當(dāng)前國內(nèi)感染豬群中PCV-2的基因變異情況,并為PCV-2的分子流行病學(xué)、感染及預(yù)防控制提供參考,本研究對(duì)來自山東、山西、北京和河北的PCV-2PCR檢測(cè)核酸陽性的病料進(jìn)行PCV-2分離鑒定。
1.1.1 組織病料 采自山東、山西、北京和河北的具有PMWS癥狀和剖檢病變的自然病例的淋巴結(jié)(氣管支氣管淋巴結(jié)、腸系膜淋巴結(jié)、腹股溝淋巴結(jié))、肺臟、脾臟和扁桃體等組織,置于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 細(xì)胞和血清 PK-15A細(xì)胞由北京大北農(nóng)動(dòng)物醫(yī)學(xué)研究中心實(shí)驗(yàn)室保存;感受態(tài)JM109細(xì)胞為北京索來寶公司產(chǎn)品;胎牛血清為Gibco公司產(chǎn)品;PCV-2陽性血清由周繼勇教授惠贈(zèng)。
1.1.3 試劑 EX-Taq DNA聚合酶(含10×buffer,dNTPs)為寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;DNA Marker DL 2 000為北京博邁德公司產(chǎn)品;PCV-1和PCV-2PCR檢測(cè)試劑盒為中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心產(chǎn)品;FITC標(biāo)記羊抗豬IgG為Lifeholder公司產(chǎn)品;MEM、EDTA、胰酶(1/250)為Gibco公司產(chǎn)品;D-Glucosmine-HCl,為Sigma公司產(chǎn)品,pMD-18TSimple載體和DNA Ligase為寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;細(xì)菌質(zhì)粒DNA抽提試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒和血液、組織細(xì)胞DNA抽提試劑盒均為北京天根生化科技有限公司產(chǎn)品。
1.2.1 PCR檢測(cè) 按照豬圓環(huán)病毒聚合酶鏈反應(yīng)試劑盒說明書進(jìn)行檢測(cè),即同時(shí)用三條引物P1(5′-CCGCGGGCTGGCTGAACTT-3′)、P2(5′-CTCGGCTATGCGCTCCAAAATG-3′)和 P3 (5′-ACCCCCGCCACCGCTACC-3′)分別對(duì)病料中 PCV-1(P1和P2擴(kuò)增產(chǎn)物為652bp)和PCV-2(P1和P3擴(kuò)增產(chǎn)物為1 154bp)進(jìn)行檢測(cè)。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min;94℃30s,62℃45s,72℃45s,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10min。
1.2.2 病毒分離 取PCR檢測(cè)PCV-2陽性的病料,經(jīng)處理后按50mL/L的比例接種60%~70%融合的PCV陰性的PK-15A細(xì)胞,置37℃,體積分?jǐn)?shù)為5%的CO2培養(yǎng)箱中吸附30min,加入含20 mL/L新生牛血清和3mmol/L的D-氨基葡萄糖鹽酸的MEM細(xì)胞維持液,37℃繼續(xù)培養(yǎng)48h,連續(xù)盲傳3代。觀察是否有病變產(chǎn)生,并將第3代細(xì)胞置-15℃/室溫反復(fù)凍融3次,3 000r/min離心20 min,取上清進(jìn)行PCR(同1.2.1法)和IFA鑒定。
1.2.3 特異性鑒定(用IFA法) 將已長成單層的PK-15A細(xì)胞(24孔板)倒去生長液,以50mL/L的比例接入各分離株的盲傳細(xì)胞培養(yǎng)物并設(shè)重復(fù)孔4孔,同時(shí)設(shè)陰陽性對(duì)照。置37℃,體積分?jǐn)?shù)為5%的CO2培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24h,換含3mmol/L的D-氨基葡萄糖鹽酸的MEM維持液,繼續(xù)培養(yǎng)24h。棄去維持液,用0.01mol/L pH 7.4PBS洗滌3次,冷丙酮固定細(xì)胞,50μL/孔,4℃30min,棄丙酮,室溫下干燥,用0.01mol/L pH7.4PBS洗滌1次,加入1∶100稀釋的PCV-2抗體,50μL/孔,37℃1h;移去孔內(nèi)液體,用0.01mol/L pH7.4PBS洗滌5次,每次3min;加入1:20稀釋的FITC標(biāo)記的羊抗豬二抗,50μL/孔,37℃1h;移去孔內(nèi)液體,用0.01 mol/L pH7.4PBS洗滌5次,每次3min,在熒光顯微鏡下觀察結(jié)果。
1.2.4 全基因組克隆和測(cè)序 參考文獻(xiàn)[6]合成了兩 對(duì) 引 物 P1:5′-CGAATTCAACCTTA ACCTTTCTTATTC -3 和 P2:5′-ATGAATTCTGGCCCTGCTCCC-3′,擴(kuò)增條件為:95℃變性5min;94℃45s,54℃45s,72℃1min;共進(jìn)行35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10min,PCR產(chǎn)物凝膠回收,連接至pMD-18TSimple載體,轉(zhuǎn)化至JM109細(xì)胞,搖菌擴(kuò)增,并將鑒定為陽性的重組質(zhì)粒送檢測(cè)序。并用MEGA5的Neighbor-Joining法繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹。PCR檢測(cè)結(jié)果表明,5個(gè)分離株均可擴(kuò)增出1 154bp片段,與PCV-2陽性對(duì)照一致,均未檢測(cè)到與PCV-1陽性對(duì)照一致大?。?52bp)的特異性片段。
PCV-2各 分 離 株 DBN-SD02、DBN-SX07、DBNBJ08、DBN-HB12和DBN-HB13PCR檢驗(yàn)結(jié)果見圖1。
圖1 病料中PCV-2的PCR檢測(cè)結(jié)果Fig.1 PCR detection result of PCV-2in samples
PCV-2各分離株DBN-SD02、DBN-SX07、DBNBJ08、DBN-HB12和 DBN-HB13株感染PK15A 細(xì)胞后,感染細(xì)胞均可與PCV-2陽性血清特異性結(jié)合,并被FITC標(biāo)記的羊抗豬二抗結(jié)合,熒光顯微鏡下見到感染細(xì)胞的細(xì)胞漿內(nèi)和胞核內(nèi)均有大量綠色熒光物質(zhì)著染,而健康細(xì)胞對(duì)照孔則未見到特異性熒光(圖2)。表明PCV-2各分離株均可被PCV-2陽性血清特異性識(shí)別。
圖2 PCV-2各分離株特異性鑒定結(jié)果(200×)Fig.2 Specificity identification of PCV-2isolates by IFA (200×)
用全基因組序列擴(kuò)增引物分別對(duì)PCV-2DBNSD02、DBN-SX07、DBN-BJ08、DBN-HB12和 DBNHB13株的基因組進(jìn)行PCR擴(kuò)增(圖3)。
全基因組PCR產(chǎn)物分別經(jīng)切膠回收,連接至T載體,送博邁德測(cè)序,測(cè)序結(jié)果提交GenBank,登錄號(hào)分別為FJ660967、FJ660968、FJ660969、FJ660970和FJ660971。
利用MEGA5的Neighbor-Joining法將所分離5株P(guān)CV-2(帶下劃線)的ORF2和全基因組序列分別與PCV-2aPCV-2bPCV-2c基因型參考毒株進(jìn)行比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析,大于50% 的Bootstrap Test(1 000replicates)的Bootstrap值顯示在鄰支之間,結(jié)果見圖4。
圖4上為依據(jù)ORF2推導(dǎo)氨基酸序列比對(duì)結(jié)果繪制的系統(tǒng)進(jìn)化樹;圖4下為依據(jù)全基因組核苷酸序列比對(duì)結(jié)果繪制的系統(tǒng)根據(jù)進(jìn)化樹。由圖可知,兩種方法所繪制的系統(tǒng)進(jìn)化樹均表明所分離的5株P(guān)CV-2(下劃線)中有4株(DBN-HB12、DBN-SD02、DBN-SX07和DBN-HB13)屬于PCV-2b基因型,僅DBN-BJ 08株為PCV-2a基因型。
圖3 PCV-2各分離毒株全基因擴(kuò)增結(jié)果Fig.3 The genome amplification results of PCV-2isolates
圖4 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig.4 Phylogenetic tree analysis
關(guān)于PCV-2兩種基因型的命名,不同的研究組織常使用不同的命名,如“A”和“B”、“SG1”和“SG2”、“1”和“2”、“b”和“a”,以及根據(jù)限制性多態(tài)性片段(RFLP)模式分成的“321”和“422”等,面對(duì)這種局面,Grau-Roma L等[8]提出了一種客觀精確命名PCV-2基因型的方法,該方法根據(jù)序列間遺傳距離(p-distance)不同進(jìn)行分類,遺傳距離的計(jì)算方法是用差異的核苷酸位點(diǎn)數(shù)除以總位點(diǎn)數(shù)[9],通過構(gòu)建遺傳距離直方圖,確定不同基因型間的最低檢測(cè)值。通過這項(xiàng)技術(shù),已經(jīng)有3種基因型的PCV-2病毒被鑒定出來,分別為 PCV-2a、PCV-2b、PCV-2c。并且分別將GenBank中最早的報(bào)道的原型毒株AF055392和 AF055394分別作為PCV-2a和PCV-2b參考株,將20世紀(jì)80年代只有在丹麥發(fā)現(xiàn)的PCV-2EU148503作為PCV-2c的參考株。有證據(jù)顯示,在1997年-2003年之間,不論是否存在PMWS疾病,豬場(chǎng)當(dāng)中都是PCV-2a基因型病毒占主導(dǎo)地位,而從2004年P(guān)MWS暴發(fā)之后,PCV-2b毒株則變得越來越普遍。PCV-2c型病毒只有20世紀(jì)80年代在丹麥發(fā)現(xiàn)過,那時(shí)PMWS尚未出現(xiàn),或者至少尚未被發(fā)現(xiàn)[10]。
本研究從疑似PMWS病例中分離鑒定了5個(gè)PCV-2毒株,并且對(duì)其全基因組進(jìn)行了克隆和測(cè)序,分別以推導(dǎo)ORF2氨基酸序列和全基因組核苷酸序列與參考株進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果均顯示有4株為PCV-2b亞型,1株為PCV-2a亞型,表明基于PCV-2全基因組序列或ORF2序列對(duì)其基因型進(jìn)行鑒定所獲得的結(jié)果是一致的,這與Olvera A等[11]的研究結(jié)果一致,同時(shí)也表明PCV-2b基因型是我國當(dāng)前PCV-2的主要流行血清型。
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