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        4,9-二[N-(2-二甲氨基)乙基]-9-吖啶胺-4-甲酰胺與蛋白質(zhì)相互作用

        2011-04-09 08:36:46張麗娟
        化學(xué)工業(yè)與工程 2011年3期

        張麗娟

        (福建生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院藥學(xué)系,福建 福州 350002)

        有關(guān)蛋白質(zhì)的研究是目前生命科學(xué)和化學(xué)領(lǐng)域中一個(gè)十分活躍的課題[1-2]。尋找新的、無(wú)毒害無(wú)污染、發(fā)光強(qiáng)度高和選擇性強(qiáng)的熒光探針則是目前國(guó)內(nèi)外對(duì)蛋白質(zhì)研究的重要方向。吖啶-4-酰胺衍生物探針在國(guó)內(nèi)外的應(yīng)用研究較少,開(kāi)展這方面的研究對(duì)于拓展吖啶類(lèi)熒光探針的應(yīng)用范圍,開(kāi)發(fā)性能更優(yōu)良的生物大分子熒光探針具有重要意義。在9-氯吖啶-4-甲酰氯的基礎(chǔ)上,同時(shí)在4位、9位上引入2個(gè)N-(2-二甲氨乙基)取代基,合成了具有生物活性的4,9-二[N-(2-二甲氨基)乙基]-9-吖啶胺-4-甲酰胺(簡(jiǎn)寫(xiě)DNAF)。DNAF做為一種新的熒光探針,具有良好親水性和熒光產(chǎn)率;此外,其不含氨基羧基等酸堿基團(tuán),在酸性體系中,2個(gè)N-(2-二甲氨乙基)取代基具有更高的正電荷,環(huán)境酸堿度變化對(duì)其影響降低。

        探索了DNAF對(duì)蛋白質(zhì)內(nèi)源熒光猝滅的猝滅機(jī)制,并通過(guò)熒光猝滅試驗(yàn),研究了DNAF與牛血清白蛋白(簡(jiǎn)寫(xiě)B(tài)SA)的結(jié)合作用機(jī)理。

        1 儀器與試劑

        Varian Cary Eclipse 熒光光譜儀(美國(guó)VARIAN);Perkin-Elmer Lambda 800 紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)(美國(guó));PHS-3C型酸度計(jì)(上海大普儀器有限公司)。

        DNAF由實(shí)驗(yàn)室自制,配成3.0×10-4mol/L和1.5×10-4mol/L的儲(chǔ)備液,4 ℃條件下避光保存;牛血清白蛋白(BSA)(Sanland-chem Internation Inc.)配成含0.1 mol/L NaCl的1.0×10-4mol/L的儲(chǔ)備液,存于4 ℃避光條件下;Tris-HCl 緩沖溶液(pH值為7.0)。所用試劑均為生化純與分析純,試驗(yàn)用水均為二次去離子水。

        2 試驗(yàn)方法

        在一系列5 mL刻度試管中加入pH值為7.0的Tris-HCl緩沖溶液2.0 mL,0.5 mL BSA(1.0×10-4mol/L)溶液,不同體積的DNAF(3.0×10-4mol/L)溶液,用水稀釋至刻度,搖勻,分別在不同溫度下,測(cè)定BSA的熒光光譜。激發(fā)波長(zhǎng)280 nm,發(fā)射波長(zhǎng)290~500 nm,狹縫寬度均為5 nm。

        3 結(jié)果與討論

        3.1 DNAF對(duì)BSA熒光猝滅的機(jī)理

        為了闡明給體BSA的猝滅機(jī)理,固定c(BSA) 為1.0×10-5mol/L,λex為280 nm,pH值為7.0,分別在12、24和36 ℃下,測(cè)定DNAF-BSA體系的熒光光譜。以F0/F為縱坐標(biāo),c為橫坐標(biāo)作Stern-Volmer圖,見(jiàn)圖1。以(F0-F)-1為縱坐標(biāo),c-1為橫坐標(biāo)作Lineweaver-Burk圖,見(jiàn)圖2。

        圖1 不同溫度條件下BSA與DNAF作用的Stern-Volmer曲線Fig.1 The Stern-Volmer curves of BSA quenched by DNAF at different temperature

        由圖1可以看出,隨著溫度的上升,BSA猝滅曲線斜率降低,初步判斷可能為靜態(tài)猝滅。

        圖2 不同溫度條件下BSA-DNAF作用Lineweaver-Burk曲線Fig.2 The Lineweaver-Burk curves of BSA-DNAF at different temperature

        為了進(jìn)一步證實(shí)此猝滅過(guò)程,利用方程式(1),將此過(guò)程按動(dòng)態(tài)猝滅過(guò)程處理。

        F0/F=1+Kqτ0[Q]=1+Ksv[Q]

        (1)

        式中,F(xiàn)0、F分別為猝滅劑不存在、存在時(shí)的熒光強(qiáng)度;Kq為雙分子猝滅過(guò)程速率常數(shù),L/(mol·s);Ksv為動(dòng)態(tài)猝滅常數(shù),L/mol;τ0為猝滅劑不存在時(shí)熒光分子平均壽命,s;[Q]為猝滅劑濃度,mol/L。

        熒光分子的平均壽命τ0約為10-8s[3],故由猝滅曲線斜率可求得12、24和36 ℃時(shí)Kq見(jiàn)表1。

        由表1可知,Kq值大于各類(lèi)猝滅劑對(duì)分子的最大擴(kuò)散碰撞猝滅常數(shù)2.0×1010L/(mol·s)[4],因此原假設(shè)不成立,猝滅不是由動(dòng)態(tài)猝滅過(guò)程引起的,而是靜態(tài)猝滅過(guò)程。利用靜態(tài)猝滅公式(2):

        表1 BSA與DNAF在不同溫度條件下作用的結(jié)果[按式(1)]Table 1 Experiment results of BSA quenched by DNAF at different temperature(according to eq(1))

        1/(F0-F)=1/F0+KD/F0[Q]

        (2)

        作不同溫度下的Lineweaver-Burk曲線(見(jiàn)圖2),由直線斜率求得BSA與DNAF在12、24和36 ℃時(shí)的解離常數(shù)KD,結(jié)果見(jiàn)表2。

        表2 BSA與DNAF在不同溫度條件下作用的結(jié)果[按式(2)]Table 2 Experiment results of BSA quenched by DNAF at different temperature(according to eq(2))

        由表2可見(jiàn)溫度對(duì)猝滅的影響不大,說(shuō)明BSA與DNAF有較強(qiáng)的結(jié)合。

        3.2 DNAF與BSA作用的結(jié)合常數(shù)和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)

        圖3為15 ℃時(shí)在牛血清白蛋白溶液體系中,隨著DNAF濃度的增加,BSA的熒光猝滅譜圖。343 nm處為BSA的熒光猝滅情況,451 nm處為在BSA作用下的不同濃度的DNAF的熒光增強(qiáng)情況,c(DNAF)從1到9對(duì)應(yīng)的濃度分別為0、0.4×10-5、0.8×10-5、1.2×10-5、1.6×10-5、2.0×10-5、2.4×10-5、2.8×10-5和3.2×10-5mol/L,c(BSA)為1.0×10-5mol/L。

        圖3 溶液中BSA與DNAF相互作用的熒光光譜Fig. 3 Fluorescence spectra of interaction between BSA and DNAF in aqueous solution

        (3)

        由343 nm處的試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)一步應(yīng)用公式(3)處理,得到圖4。

        隨著大數(shù)據(jù)的廣泛應(yīng)用,數(shù)據(jù)挖掘?qū)τ陔娮由虅?wù)的發(fā)展也起著很大影響,利用數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),可以有效的提高用戶(hù)訪問(wèn)數(shù)量,優(yōu)化網(wǎng)站訪問(wèn)效率,挖掘潛在用戶(hù)、優(yōu)化出售商品性能和提高網(wǎng)站安全環(huán)境等級(jí)等作用。

        圖4 lg[(F0-F)/F]對(duì)lg[Q]作圖Fig.4 The plot of lg[(F0-F)/F] versus lg[Q]

        從圖4可以看出,在DNAF由低到高的整個(gè)濃度范圍都呈現(xiàn)良好的線性,與公式(3)吻合良好,表明這一過(guò)程屬于靜態(tài)猝滅過(guò)程。由所得的直線求算出DNAF與BSA結(jié)合時(shí)的結(jié)合常數(shù)KA=5.46×103,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)n為0.98??梢?jiàn)DNAF與BSA可發(fā)生相互作用,且結(jié)合作用較強(qiáng)。

        3.3 DNAF與蛋白質(zhì)的主要結(jié)合力的確定

        在(24±2) ℃下測(cè)定BSA的熒光光譜,當(dāng)溫度變化不大時(shí),反應(yīng)焓變可以看作是一個(gè)常數(shù)。根據(jù)公式(4)和(5):

        ln (KA2/KA1)=(1/T1-1/T2)ΔH/R

        (4)

        ΔG=-RTlnKA=ΔH-TΔS

        (5)

        可求出24 ℃時(shí)DNAF焓變?chǔ)為-30.35 kJ/mol;熵變?chǔ)為-30.77 J/(mol·K);反應(yīng)自由能變?chǔ)為-21.21 kJ/mol。由于ΔH<0,ΔS<0,根據(jù)熱力學(xué)參數(shù)與作用力的關(guān)系,可知DNAF與BSA結(jié)合的作用力類(lèi)型主要是氫鍵與范德華力。

        3.4 BSA與DNAF間的能量轉(zhuǎn)移和結(jié)合距離

        在一系列5 mL刻度試管中加入pH值為7.0的 Tris-HCl緩沖溶液2.0 mL,空白組加入0.5 mL的BSA(1.0×10-4mol/L)溶液,對(duì)照組加入0.5 mL的BSA(1.0×10-4mol/L)溶液及0.33 mL的DNAF(1.5×10-4mol/L)溶液,使二者物質(zhì)的量之比為1:1。用水稀釋至刻度,搖勻,在15 ℃下測(cè)定空白組和對(duì)照組的熒光光譜,測(cè)定對(duì)照組的紫外吸收光譜。

        通過(guò)上述的試驗(yàn)中測(cè)定猝滅速率常數(shù)的結(jié)果,在廣泛的溫度范圍內(nèi)猝滅速率常數(shù)Kq值處于1011L/(mol·s)數(shù)量級(jí)。圖5為n(BSA):n(DNAF)為1:1,c(BSA)為1.0×10-5mol/L,c(DNAF)為1.0×10-5mol/L時(shí)體系的吸收譜和相同濃度的BSA的熒光發(fā)射譜的重疊光譜圖。

        圖5 熒光發(fā)射光譜與紫外吸收光譜的譜圖重疊Fig.5 Overlap of the fluorescence emission spectra and absorption spectra

        BSA的吸收光譜與發(fā)射光譜有相當(dāng)重疊面積,求得該圖中光譜重疊部分(285~500 nm)的積分面積J為9.73×10-14(cm3·L)/mol,初步判定為遵循F?rster非輻射能量轉(zhuǎn)移機(jī)制[5]。BSA分子中在134和212位處有2個(gè)色氨酸殘基,BSA熒光(λem=335 nm)主要來(lái)自于第212位的色氨酸殘基。在上述試驗(yàn)條件下,偶極空間取向因子K2可取受供能體各向隨機(jī)分布的平均值2/3[6],供能體熒光量子產(chǎn)率Φ通常取蛋白質(zhì)中色氨酸的量子產(chǎn)率0.118[7],介質(zhì)折射指數(shù)N一般取水和有機(jī)物折射指數(shù)的平均值1.336[8]。據(jù)公式(6)和(7),可計(jì)算相關(guān)信息。

        式中,R0為臨界距離,nm;K2為偶極空間取向因子;N為介質(zhì)的折射指數(shù);Φ為授體的光量子效率;J為授體(蛋白質(zhì))熒光發(fā)射光譜與受體(染料)吸收光譜間的光譜重疊積分,cm3·L/mol;E為能量轉(zhuǎn)移效率;r為授體-受體間距離,nm。

        分別求得臨界距離R0為3.58 nm;能量轉(zhuǎn)移效率E為0.12;從而求出BSA中第212位色氨酸殘基與DNAF分子間的距離r為4.99 nm。

        4 結(jié)論

        利用合成的一種新型的蛋白質(zhì)分子熒光探針DNAF,對(duì)其與BSA的相互作用進(jìn)行了研究。得知DNAF對(duì)BSA的熒光猝滅為靜態(tài)猝滅機(jī)制,測(cè)定了相應(yīng)的熱力學(xué)參數(shù)ΔH為-30.35 kJ/mol,ΔG為-21.21 kJ/mol,ΔS為-30.77 J/(mol·K),結(jié)合位點(diǎn)數(shù)n為0.98及表觀結(jié)合常數(shù)KA為5.46×103,計(jì)算了供體BSA和受體DNAF的距離r為4.99 nm,能量轉(zhuǎn)移效率E為0.12。證明氫鍵作用和范德華力對(duì)兩者結(jié)合起到重要作用,DNAF與BSA的能量轉(zhuǎn)移機(jī)制符合F?rster非輻射能量轉(zhuǎn)移理論。

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