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        應(yīng)用雙質(zhì)粒共表達(dá)體系提高融合蛋白GGH在畢赤酵母GS115中的表達(dá)量

        2011-02-09 09:31:48王慧竇文芳張曉梅許泓瑜許正宏
        生物工程學(xué)報 2011年7期
        關(guān)鍵詞:醋酸纖維酵母菌落

        王慧,竇文芳,張曉梅,許泓瑜,許正宏,2

        1 江南大學(xué) 醫(yī)藥學(xué)院制藥工程研究室,無錫 214122

        2 江南大學(xué) 工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,無錫 214122

        胰高血糖素樣多肽1 (Glucagon-like peptide-1,GLP-1) 是由腸道L細(xì)胞合成和分泌的一個由30個氨基酸組成的具有促進(jìn)胰島素分泌功能的多肽,體內(nèi)外研究顯示GLP-1能增強(qiáng)葡萄糖依賴性的胰島素分泌,減少食物的攝取,減慢胃的排空,以及抑制胰高血糖素的分泌、刺激胰 β細(xì)胞增殖,促進(jìn)胰島再生,又能抑制胰β細(xì)胞的凋亡,是現(xiàn)有糖尿病藥物無可比擬的[1-4]。但是,由于 GLP-1在體內(nèi)易被二肽酰基肽酶Ⅳ (DPPⅣ) 降解和腎臟清除導(dǎo)致半衰期很短,限制了其臨床應(yīng)用[5]。為克服該缺點(diǎn),本實(shí)驗(yàn)室前期通過重疊PCR將兩個GLP-1突變串聯(lián)體分子與一個人血清白蛋白HSA分子融合 (ggh),并實(shí)現(xiàn)了其在巴斯德畢赤酵母 Pichia pastoris中的表達(dá)[6]。

        pPIC9K和 pPICZαB同屬于巴斯德畢赤酵母分泌型表達(dá)載體,可以通過同源重組的方式分別在畢赤酵母基因組HIS4位點(diǎn)與AOX1位點(diǎn)進(jìn)行整合,實(shí)現(xiàn)在同一宿主菌中的共表達(dá),從而提高目標(biāo)蛋白在畢赤酵母中的基因劑量,在一定范圍內(nèi)可以提高目標(biāo)蛋白的表達(dá)量。Williams等將 pPIC9K和pPICZαA質(zhì)粒同時整合到畢赤酵母GS115中,建立雙質(zhì)粒共表達(dá)體系,從而提高了明膠在畢赤酵母GS115中的表達(dá)量,由原來的 54.4 mg/L提高至80.2 mg/L[7]。

        本實(shí)驗(yàn)室前期將 GGH基因克隆到畢赤酵母分泌型表達(dá)質(zhì)粒 pPIC9K,構(gòu)建了重組菌 GS115/F2,搖瓶培養(yǎng)80 h其目的蛋白表達(dá)量達(dá)到328 mg/L[8]。本研究通過構(gòu)建pPIC9K和pPICZαB雙質(zhì)粒共表達(dá)體系,進(jìn)一步提高了融合蛋白GGH在畢赤酵母中的表達(dá)量,為該藥物分子的規(guī)模化制備奠定了基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌體和載體

        大腸桿菌E. coli JM109由本實(shí)驗(yàn)室保存;質(zhì)粒pPIC9K-ggh、pMD19-T-gapdh和畢赤酵母表達(dá)菌株 GS115/F2由本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建并保存;pPICZαB購自 Invitrogen公司;pMD19-T Simple Vector為TaKaRa公司產(chǎn)品。

        1.1.2 主要試劑

        各種限制性內(nèi)切酶、Taq DNA聚合酶、T4 DNA連接酶、DNA和蛋白Marker等購自TaKaRa公司,質(zhì)粒抽提試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒均購自上海捷瑞生物有限公司,酵母氮基、Zeocin、HRP-DAB底物顯色液等均為上海生工產(chǎn)品,GLP-1和 HSA單克隆抗體等購自優(yōu)寧維公司,引物由上海捷瑞生物有限公司合成,其余試劑均購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 酵母表達(dá)載體pPICZαB-ggh的構(gòu)建

        設(shè)計合成分別帶有KpnⅠ和 NotⅠ兩種酶切位點(diǎn)的GGH引物,引物P1、P2序列見表1 (下劃線所示為酶切位點(diǎn))。以 pPIC9K-ggh為模板,P1、P2為引物,擴(kuò)增出5′端和3′端分別帶有KpnⅠ和NotⅠ兩種酶切位點(diǎn)的 ggh基因,然后和 pMD19-T Simple Vector相連轉(zhuǎn)化至E. coli JM109,用含有100 mg/L Amp的LB平板篩選陽性克隆驗(yàn)證,并抽提質(zhì)粒用 KpnⅠ和 NotⅠ雙酶切后連接至畢赤酵母表達(dá)載體 pPICZαB中,重組表達(dá)載體pPICZαB-ggh轉(zhuǎn)化至E. coli JM109,用含有25 mg/LZeocin的LB平板篩選陽性克隆,并進(jìn)行PCR和雙酶切鑒定。

        表1 本研究中所用引物Table 1 Primers used in this study

        1.2.2 重組表達(dá)質(zhì)粒的線性化和電轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞

        取 5~10 μg鑒定和測序正確的 pPICZαB-ggh重組表達(dá)質(zhì)粒,用 PmeⅠ單酶切使之線性化,瓊脂糖凝膠電泳回收5.6 kb片段,?20 ℃保存?zhèn)溆?。參考相關(guān)文獻(xiàn)制備畢赤酵母GS115/F2感受態(tài)細(xì)胞[9],分別取 80 μL和 5 μL的線性化的重組表達(dá)質(zhì)粒pPICZαB-ggh混合,用 Bio-Rad電轉(zhuǎn)儀于參數(shù)1.5 kV、25 μF、200 ?、時間常數(shù)5 ms進(jìn)行電轉(zhuǎn)化,立即加入l mL 1 mol/L冰浴山梨醇,在30 ℃條件下孵育2 h。取200 μL涂布于含有1 000 μg/mL Zeocin的MD平板上,30 ℃培養(yǎng)2~3 d至出現(xiàn)轉(zhuǎn)化子。

        1.2.3 免疫斑點(diǎn)法篩選高表達(dá)菌株

        將0.45 μm的醋酸纖維素薄膜平置于長有菌落的含有1 000 mg/L Zeocin的MD平板上,用涂布棒輕壓使醋酸纖維素薄膜完全濕潤并趕盡氣泡,使所有菌落轉(zhuǎn)移到醋酸纖維素薄膜上,并在BMMY平板上置同樣大小的0.22 μm的硝酸纖維素薄膜,趕出氣泡,將醋酸纖維素薄膜菌落面向上置于硝酸纖維素薄膜上,30 ℃培養(yǎng)80 h,將上層醋酸纖維素薄膜轉(zhuǎn)移至MD平板上,4 ℃保存。將下層硝酸纖維素薄膜取出,5%脫脂奶封閉 2 h或 4 ℃過夜,用TBST (含有0.05%吐溫-20的TBS) 洗膜5 min,重復(fù)3次,用兔抗人血清白蛋白多抗37 ℃孵育2 h,用TBST洗膜5 min,重復(fù)3次,再用二抗結(jié)合,37 ℃孵育2 h,用TBST洗膜5 min,重復(fù)3次,加入新鮮配置的DAB顯色液,染色5 min后用TBST清洗,挑選出染色顏色較深的菌落進(jìn)行搖瓶培養(yǎng)和誘導(dǎo)。

        1.2.4 誘導(dǎo)表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物分析

        挑取膜上顏色由深到淺的單菌落接種于10 mL的YPD培養(yǎng)基,培養(yǎng)24 h,5%接種量轉(zhuǎn)接到裝有60 mL含3%甘油的BMGY培養(yǎng)基的500 mL三角瓶中,初始OD600為1,30 ℃、120 r/min振蕩培養(yǎng)過夜,24 h后離心收集菌體,用20 mL含有3%甲醇的BMMY培養(yǎng)基重懸菌體后誘導(dǎo)表達(dá),每隔24小時補(bǔ)加甲醇至終濃度為 3%,甲醇誘導(dǎo) 80 h后OD600約為200,10 000 r/min離心10 min,收集上清,用尿微量白蛋白試劑盒測發(fā)酵上清液中的目的蛋白含量[6],發(fā)酵液離心后取上清等體積進(jìn)行SDS-PAGE分析。

        1.2.5 重組畢赤酵母基因組的提取和PCR鑒定陽性克隆

        提取高產(chǎn)菌GS115/F3和出發(fā)菌株GS115/F2的基因組DNA,加入RNase A消除RNA的干擾。以pPICZαB質(zhì)粒上的抗性基因,即Zeocin基因?yàn)閿U(kuò)增目的片段設(shè)計引物P3、P4,序列見表1,對提取的酵母基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增驗(yàn)證。

        1.2.6 Q-PCR鑒定高產(chǎn)菌的目的基因拷貝數(shù)

        以三磷酸甘油醛脫氫酶基因 (gapdh) 為內(nèi)源參照基因。根據(jù)引物設(shè)計軟件 Primer 5設(shè)計基因gapdh (P5、P6)、ggh (P7、P8) 片段引物 (表1),進(jìn)行PCR擴(kuò)增,回收基因片段并與pMD19-T質(zhì)粒相連,建立單拷貝的重組質(zhì)粒,即pMD19-T-gapdh質(zhì)粒和 pMD19-T-ggh質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌 JM109中,驗(yàn)證并提取重組質(zhì)粒,通過梯度稀釋,從而建立了gapdh基因和ggh基因的循環(huán)數(shù) (Ct值) 與起始模板數(shù)的相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)曲線。Q-PCR的條件是:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火45 s,72 ℃延伸30 s,讀板,40次循環(huán);72 ℃終延伸5 min;65 ℃到94 ℃繪制熔解度曲線,每0.5 ℃讀板1次,1次1 s;16 ℃保溫至結(jié)束。Q-PCR的體系是:模板 0.5 μL,引物各 0.2 μL,SYBR 12.5 μL,ddH2O 11.6 μL。

        以 gapdh為參照基因,檢測待測樣品中的 ggh基因表達(dá)水平的差異,以原始菌株GS115/F2為校準(zhǔn)樣本,以高產(chǎn)菌株GS115/F3為待測樣本,比較待測樣本相對校準(zhǔn)樣本的表達(dá)差異。利用 2?△△Ct法對其分析。

        1.2.7 Western blotting鑒定融合蛋白的表達(dá)

        將原始出發(fā)菌株GS115/F2和高產(chǎn)菌株GS115/F3的發(fā)酵液離心取上清,200 V電壓下進(jìn)行SDS-PAGE電泳,100 V電壓下轉(zhuǎn)膜60 min至硝酸纖維素膜上,5%脫脂奶粉4 ℃封閉過夜,TBST洗膜3次,分別加入鼠抗人血清白蛋白單抗和鼠抗人GLP-1單抗結(jié)合 (抗體均以1∶1 000稀釋),37 ℃孵育2 h,去除抗體,TBST洗膜3次。再加入辣根過氧化物酶標(biāo)記的抗鼠的二抗 (1∶1 000稀釋),37 ℃下孵育2 h,去除二抗,TBST洗膜3次之后,加DAB顯色。

        2 結(jié)果

        2.1 表達(dá)載體pPICZαB-ggh的構(gòu)建及鑒定

        構(gòu)建了含有 ggh基因的畢赤酵母重組表達(dá)質(zhì)粒pPICZαB-ggh,構(gòu)建流程如圖1所示,然后對其進(jìn)行PCR及 KpnⅠ/NotⅠ雙酶切鑒定 (圖略)。重組的pPICZαB-ggh經(jīng)PCR及雙酶切都可以得到大小為2 000 bp左右的DNA片段,測序結(jié)果顯示DNA序列無突變,表明重組表達(dá)載體pPICZαB-ggh構(gòu)建成功。

        2.2 免疫學(xué)方法篩選高產(chǎn)菌株

        將線性化的重組質(zhì)粒pPICZαB-ggh電轉(zhuǎn)化畢赤酵母GS115/F2感受態(tài)細(xì)胞,30 ℃培養(yǎng)2~3 d后在每塊平板的上層醋酸纖維素膜上長出約100~1 000個左右轉(zhuǎn)化子。將上層醋酸纖維素薄膜轉(zhuǎn)移至MD平板上,4 ℃保存。取下層的硝酸纖維素薄膜進(jìn)行免疫顯色,鑒定轉(zhuǎn)化子的表達(dá)水平的高低,結(jié)果見圖2。每個染色點(diǎn)對應(yīng)于上層醋酸纖維素薄膜上的相應(yīng)菌落,從圖 2可以看出不同菌落的顯色強(qiáng)度有明顯差異。挑取圖 2上箭頭所指顏色由深到淺的順序?qū)?yīng)的單菌落進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),取發(fā)酵上清進(jìn)行SDS-PAGE分析,結(jié)果見圖 3。從圖 3可以看出免疫顯色深的斑點(diǎn)對應(yīng)的菌落的表達(dá)量明顯高于免疫顯色淺的斑點(diǎn)對應(yīng)的菌落,并利用此方法獲得一株融合蛋白GGH高表達(dá)菌落GS115/F3。

        圖1 重組質(zhì)粒pPICZαB-ggh的構(gòu)建Fig. 1 Construction of the recombinant plasmid pPICZαB-ggh.

        圖2 免疫學(xué)方法篩選結(jié)果Fig. 2 Tansformants screend with immunology method. Several intensely stained colonies are indicated with arrows.

        圖3 SDS-PAGE分析不同菌株誘導(dǎo)72 h表達(dá)的GGHFig. 3 SDS-PAGE annlysis of GGH expressed in Pichia pastoris. M: protein marker; 1?9: SDS-PAGE analysis of shake flask supernatant of eight transformants screened with two-layer membrane method.

        考察了GS115/F3和GS115/F2在搖瓶中的發(fā)酵過程,結(jié)果如圖4所示,生長24 h后用甲醇誘導(dǎo),兩株菌在生長方面并沒有明顯的差異,但是其外源蛋白的表達(dá)量卻有顯著的差異,OD600為 200時GS115/F3和 GS115/F2的表達(dá)量分別為328 mg/L和491 mg/L,單位OD的菌體融合蛋白的表達(dá)量提高了49.7%。

        2.3 Q-PCR確定高產(chǎn)菌的基因拷貝數(shù)

        為考察融合蛋白表達(dá)量的增加是否由基因拷貝數(shù)的增加引起的,提取 pMD19-T-pagdh質(zhì)粒和pMD19-T-ggh質(zhì)粒,分別稀釋8個梯度,同時進(jìn)行熒光定量 PCR,反應(yīng)結(jié)束后,程序自動生成標(biāo)準(zhǔn)曲線和熔解度曲線,gapdh標(biāo)準(zhǔn)曲線為:y=?0.2925x+ 2.14,r2=0.999,ggh標(biāo)準(zhǔn)曲線為y=?0.3506x+3.22,r2=0.996,樣品曲線落在標(biāo)準(zhǔn)曲線范圍之內(nèi),反應(yīng)的熔解峰單一,熒光定量PCR的引物特異性較高。應(yīng)用2?△△Ct法分析得到的高產(chǎn)菌GS115/F3和出發(fā)菌株GS115/F2相比,基因劑量提高了 26.7%,尿微量白蛋白試劑盒測試融合蛋白產(chǎn)量提高了49.7%。

        圖4 GS115/F2和GS115/F3的生長曲線和融合蛋白表達(dá)曲線Fig. 4 Cell growth curve and fusion expression curve of GS115/F2 and GS115/F3.

        2.4 Western blotting鑒定融合蛋白的表達(dá)

        為鑒定經(jīng)雙質(zhì)粒體系改造的高表達(dá)菌株GS115/F3表達(dá)的融合蛋白 GGH 與出發(fā)菌株GS115/F2是否一致,用人白蛋白一抗和人胰高血糖素樣肽-1一抗對其進(jìn)行Western blotting鑒定,如圖5所示,表達(dá)宿主經(jīng)雙質(zhì)粒體系改造前后蛋白質(zhì)的分子量均是7.3 kDa,表明宿主菌株的改造沒有影響融合蛋白的特性,融合蛋白GGH同時具有人白蛋白和人胰高血糖素樣肽-1的免疫原性。在66.4 kDa和44.3 kDa中間出現(xiàn)的一個陽性條帶,經(jīng)測序是GGH的降解條帶。

        3 討論

        為了從大量重組菌中篩選得到高產(chǎn)菌,本實(shí)驗(yàn)將免疫斑點(diǎn)法[10]結(jié)合高濃度抗生素平板對其進(jìn)行篩選,抗生素平板上生長的菌落影印在醋酸纖維素薄膜上,誘導(dǎo)分泌的蛋白透過醋酸纖維素膜結(jié)合在硝酸纖維素膜上。免疫斑點(diǎn)法選用免疫方法對酵母的分泌蛋白進(jìn)行檢測,篩選高表達(dá)的轉(zhuǎn)化子,且每次可同時篩選幾百個轉(zhuǎn)化子,免疫顯色后各菌落的外泌蛋白量之間的對比明顯、直觀,可以直接挑選染色較深的單菌落進(jìn)行液體培養(yǎng)基誘導(dǎo)表達(dá)。這個方法簡化了篩選高產(chǎn)菌株的工作量,并且可靠性更高。因?yàn)楦邼舛鹊目股乜剐栽诤芏嗲闆r并不能真實(shí)反映表達(dá)量,某些拷貝在整合時目的基因可能丟失,僅剩下抗生素抗性,出現(xiàn)假陽性。結(jié)果表明,所篩選的高表達(dá)菌落與實(shí)際液體培養(yǎng)基誘導(dǎo)表達(dá)情況相符。免疫斑點(diǎn)法篩選的特點(diǎn)是必須應(yīng)用已知蛋白的相應(yīng)抗體進(jìn)行篩選,因此,對于尚無抗體的新蛋白或者比較昂貴的抗體應(yīng)用較難。

        圖5 (GLP-1A2G)2-HAS融合蛋白的Western blotting鑒定Fig. 5 Western blotting analysis of (GLP-1A2G)2-HSA. M: protein marker; 1: fusion protein of GS115/F3 hybridized with GLP-1 monoclone antibody; 2: fusion protein of GS115/F2 hybridized with GLP-1 monoclone antibody; 3: fusion protein of GS115/F3 hybridized with HSA monoclone antibody; 4: fusion protein of GS115/F2 hybridized with HSA monoclone antibody.

        在任何表達(dá)系統(tǒng)中外源蛋白的表達(dá)水平受多種因素的影響。畢赤酵母中宿主表型、基因劑量、外源基因特性、外源蛋白的理化性質(zhì)和發(fā)酵條件的優(yōu)化控制等都是影響蛋白質(zhì)表達(dá)水平的重要因素。有報道在畢赤酵母中增加目的基因的拷貝數(shù)可以提高外源蛋白的表達(dá)量[11],人血清白蛋白的分泌量和基因劑量呈正相關(guān)在菌株克魯維氏酵母 Kluyveromyces中早已被驗(yàn)證[12]。一般提高基因劑量的方法大部分都是通過在體外構(gòu)建多拷貝的目的基因串聯(lián)以同源重組的方式整合到酵母基因組中,然后通過高濃度的抗生素來篩選高表達(dá)的轉(zhuǎn)化子;Marx等將質(zhì)粒整合到畢赤酵母核糖體 DNA位點(diǎn)上,利用結(jié)合核糖體DNA有效轉(zhuǎn)錄的特點(diǎn),將血清白蛋白HSA基因在畢赤酵母中的轉(zhuǎn)錄效率提高了40%[13]。本研究證明了兩次電轉(zhuǎn)攜帶有同種目的基因的不同分泌型表達(dá)質(zhì)粒,通過高濃度的抗生素結(jié)合免疫法篩選,不僅可以提高目的基因的拷貝數(shù),并且在一定范圍內(nèi)提高了外源蛋白的表達(dá)量。這種雙質(zhì)粒共表達(dá)體系不僅可以提高單一蛋白在宿主中的表達(dá)量,還可以實(shí)現(xiàn)兩種不同的蛋白在同一宿主中的共表達(dá)。

        本實(shí)驗(yàn)通過建立雙質(zhì)粒共表達(dá)體系提高融合蛋白GGH在畢赤酵母中的表達(dá),然后通過高濃度的抗生素抗性結(jié)合免疫斑點(diǎn)法進(jìn)行高通量的篩選,獲得的高產(chǎn)菌GS115/F3融合蛋白的表達(dá)量將近提高了一半,和出發(fā)菌株GS115/F2相比表達(dá)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)一致。影響外源蛋白在畢赤酵母中的表達(dá)因素還很多,它不僅受外源基因特性的影響,也受到宿主菌、Mut表型、酶切和糖基化及培養(yǎng)條件的影響,所以應(yīng)從影響畢赤酵母蛋白表達(dá)的多種因素著手提高融合蛋白GGH的表達(dá)量,實(shí)現(xiàn)規(guī)模化制備。

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