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        海參溶菌酶基因克隆及在畢赤酵母中的表達與純化

        2010-09-27 02:07:06峰,娜,
        關(guān)鍵詞:畢赤溶菌酶條帶

        谷 躍 峰, 叢 麗 娜, 駱 寧

        ( 大連工業(yè)大學(xué) 生物與食品工程學(xué)院, 遼寧 大連 116034 )

        0 引 言

        溶菌酶(Lysozyme,EC3.2.1.17)是一種堿性球蛋白,該酶主要通過水解細菌細胞壁N-乙酰胞壁酸和N-乙酰氨基葡萄糖之間的β-1,4糖苷鍵,破壞肽聚糖支架,導(dǎo)致細胞壁破裂內(nèi)容物逸出,從而使細菌溶解的。人和動物細胞無細胞壁結(jié)構(gòu)亦無肽聚糖,故溶菌酶對人體和動物細胞無毒性作用,所以作為天然防腐劑的溶菌酶在食品工業(yè)中有廣闊的應(yīng)用價值[1]。溶菌酶的來源十分廣泛,已知的可分為6類:c-型、g-型、i-型、植物溶菌酶、細菌溶菌酶和噬菌體溶菌酶[2]。海參溶菌酶即屬于i-型溶菌酶。巴斯德畢赤酵母(Pichiapastoris)表達系統(tǒng)是目前分子生物學(xué)領(lǐng)域中用于表達重組蛋白的標(biāo)準工具之一[3],該系統(tǒng)具有高表達、高穩(wěn)定性、高分泌、表達后加工、高密度發(fā)酵培養(yǎng)等優(yōu)點。目前已有數(shù)百種外源蛋白在該表達系統(tǒng)中成功表達[4],其中也有研究者成功表達出了溶菌酶[5-6],但 i-型溶菌酶在畢赤酵母中表達的研究還未見報道。本實驗就是研究SJL在畢赤酵母中表達的可行性。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        1.1.1 菌種與試劑

        海刺參,由大連獐子島漁業(yè)集團提供;畢赤酵母GS115、表達載體pPIC9K和Trizol試劑等,Invitrogen公司;大腸桿菌DH5α、克隆載體pMD18-T、限制性核酸內(nèi)切酶(EcoRⅠ、NotⅠ、BglⅡ)、TaKaRa one step RNA PCR Kit (AMV),TaKaRa Biotechnology(大連)公司;普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒,TIANGEN生化科技(北京)有限公司;G418,德國Merck公司。

        1.1.2 培養(yǎng)基

        YPD:1%酵母提取物,2%胰蛋白胨,2%葡萄糖,1.5%瓊脂粉。用于菌體的生長、篩選及保藏。

        MD:1.34%酵母氮源(YNB),2%葡萄糖,4×10-7生物素,1.5%瓊脂粉。用于篩選菌株的表現(xiàn)型。

        MM:1.34%酵母氮源,0.5%甲醇(體積分數(shù)),4×10-7生物素,1.5%瓊脂粉。用于篩選菌株的表現(xiàn)型。

        BMGY:1%酵母提取物,2%胰蛋白胨,100 mmol/L磷酸鉀緩沖液(pH 6.0),1.34%酵母氮源,4×10-7生物素,1%甘油。用于誘導(dǎo)表達前菌體的生長。

        BMMY:1%酵母提取物,2%胰蛋白胨,100 mmol/L磷酸鉀緩沖液(pH 6.0),1.34%酵母氮源,4×10-7生物素,0.5%甲醇。用于誘導(dǎo)表達。

        1.2 方 法

        1.2.1 引物設(shè)計

        根據(jù)SJL基因的CDS區(qū)序列,使用軟件Primer Premier 5.0設(shè)計特異性引物,上、下游引物分別命名為HS-1和HS-2,其中分別在上游引物中引入EcoRⅠ酶切位點,下游引物中引入NotⅠ酶切位點,如下:

        HS-1:5′--GCAGAATTCATGCAAGTTCCTTCTGATTGC--3′

        HS-2:5′--AAGTTTGCGGCCGCTCAGTTGTTGCTCAT--3′

        1.2.2 SJL基因的擴增

        從新鮮的海參腸組織中利用Trizol試劑法提取總RNA,并以此為模板,利用TaKaRa one step RNA PCR Kit (AMV)試劑盒和設(shè)計好的引物,通過一步法RT-PCR擴增SJL基因。PCR循環(huán)參數(shù)為:50 ℃ 30 min,94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。將SJL基因連接到克隆載體pMD18-T上,構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD18-T-SJL,并將其轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中,挑陽性菌落,經(jīng)菌落PCR鑒定后送交TaKaRa Biotechnology(大連)公司測序驗證。

        1.2.3 重組畢赤酵母的構(gòu)建

        從驗證正確的菌株中回收pMD18-T-SJL,用EcoRⅠ和NotⅠ雙酶切,回收SJL基因,連接到同樣經(jīng)雙酶切的表達載體pPIC9K中,構(gòu)建真核重組表達質(zhì)粒pPIC9K-SJL。再將pPIC9K-SJL經(jīng)BglⅡ線性化后,采用PEG1000轉(zhuǎn)化法將其轉(zhuǎn)化至畢赤酵母GS115中,構(gòu)建重組畢赤酵母,挑取單菌落。同時構(gòu)建陰性對照菌株,即將不包含SJL基因的表達載體pPIC9K轉(zhuǎn)化至畢赤酵母GS115中。將得到的單菌落分別點在MD和MM培養(yǎng)基上,通過比較生長速度來確定得到的菌株的表型,再經(jīng)含梯度濃度G418(0.25~4.0 mg/mL)的YPD培養(yǎng)基篩選出高拷貝陽性菌株,從中篩選出有活性的菌株。

        1.2.4 SJL的誘導(dǎo)表達發(fā)酵分析

        將重組畢赤酵母菌株接種于10 mL BMGY液體種子培養(yǎng)基中,30 ℃搖床培養(yǎng)18 h。再按10%接種量轉(zhuǎn)接至25 mL BMGY液體培養(yǎng)基,30 ℃搖床擴大培養(yǎng)18 h,離心收集菌體。將細胞沉淀全部轉(zhuǎn)移至25 mL BMMY液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,28 ℃搖床培養(yǎng),每隔24 h取樣,并補加甲醇(終體積分數(shù)為0.5%)。96 h后結(jié)束誘導(dǎo)表達,通過SDS-PAGE電泳分析表達情況。

        1.2.5 SJL表達產(chǎn)物純化

        將誘導(dǎo)表達后的發(fā)酵液經(jīng)4 000 r/min離心,收集上清液。在上清液中加入硫酸銨至飽和度達40%,4 ℃沉淀過夜后離心,取上清液,補加硫酸銨至飽和度達到60%,4 ℃沉淀過夜后離心,沉淀用0.02 mol/L的磷酸鈉緩沖液(pH 6.0)溶解、透析,得到粗酶液。

        稱取12 g CM52-纖維素,用蒸餾水浸泡后裝柱,經(jīng)預(yù)處理后將粗酶液上柱,先用0.02 mol/L的磷酸鈉緩沖液(pH 6.0)洗脫,再用由緩沖液配制的KCl溶液(60、120、180、240、300 mmol/L)進行分級梯度洗脫,體積流量為1 mL/min。用分布收集器收集(每管收集3 mL)。取峰值管中的流出液,用SDS-PAGE電泳檢測。采用Bradford方法[7]分別測定誘導(dǎo)表達后和純化后的蛋白含量,比濁法[8]測定表達后和純化后的酶活力。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 SJL基因的擴增結(jié)果

        從新鮮的海參腸組織中提取總RNA,并用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果見圖1。提取的RNA條帶清晰,28S rRNA和18S rRNA條帶之間沒有模糊條帶,提取成功,可用作模板進行RT-PCR。RT-PCR產(chǎn)物用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果見圖2。在圖中約400 bp處有明顯的條帶,而且條帶明亮,擴增成功。

        M,500 bp DNA Marker;1,提取的總RNA樣品圖1 總RNA提取Fig.1 Extraction of total RNA

        M,100 bp DNA Marker;1,SJL的PCR產(chǎn)物;2,陰性對照

        2.2 重組畢赤酵母的構(gòu)建

        重組表達載體pPIC9K-SJL轉(zhuǎn)化畢赤酵母GS115后,涂布于MD固體培養(yǎng)基上,挑取單菌落,所有菌株均為組氨酸利用正常型,即His+型。再經(jīng)MD和MM固體培養(yǎng)基確定其表型均為Muts,即甲醇利用緩慢型,與理論相符。經(jīng)G418篩選,在質(zhì)量濃度為4.0 mg/mL的YPD平板培養(yǎng)基上,共得到7株有活性的高拷貝轉(zhuǎn)化子,并通過菌落PCR驗證,引物為HS-1和HS-2,結(jié)果見圖3。圖中顯示泳道2在400 bp處有條帶,而作為陰性對照的泳道1在此處沒有條帶,說明菌株中確實含有SJL基因。

        M,100 bp DNA Marker;1,陰性對照;2,重組畢赤酵母

        2.3 SJL的誘導(dǎo)表達發(fā)酵結(jié)果

        重組SJL畢赤酵母菌株經(jīng)甲醇誘導(dǎo)表達液體發(fā)酵,并定時取樣分析。將處理的樣品經(jīng)12%的SDS-PAGE凝膠電泳檢測,結(jié)果見圖4。泳道1為陰性對照,在14.3 ku處無條帶,而泳道2~5分別為24、48、72、96 h時取的樣品,在14.3 ku處均有條帶,而且72 h時表達量最高。表達出的蛋白分子質(zhì)量大小與雞蛋清溶菌酶的相符。

        M,Protein MW Marker;1,陰性對照;2~5,誘導(dǎo)24~96 h時發(fā)酵上清液圖4 SJL誘導(dǎo)表達的SDS-PAGE分析Fig.4 SDS-PAGE analysis of the expressed SJL

        2.4 SJL表達產(chǎn)物的純化

        發(fā)酵液的上清液經(jīng)硫酸銨沉淀和離子交換層析后,其純化結(jié)果見圖5。利用Bradford方法測得表達后和純化后的蛋白總量,比濁法測定表達后和純化后的總活力。經(jīng)計算,表達后的發(fā)酵上清液的比活力為6.3 U/mg,純化后的SJL比活力為26.9 U/mg,純化倍數(shù)為4.3倍,總活力回收率為28.1%。

        M,Protein MW Marker;1,硫酸銨沉淀后粗酶液;2,純化后的SJL圖5 純化后的SDS-PAGE分析Fig.5 SDS-PAGE analysis of the purified SJL

        3 結(jié) 論

        目前,海參溶菌酶(SJL)基因的全序列測序工作已由本實驗室完成并提交到GenBank[9],并且SJL已經(jīng)在大腸桿菌中得到了成功表達[10],但產(chǎn)品得率較低,原因是SJL在胞內(nèi)表達以包涵體形式存在,所以純化步驟較繁瑣。由于SJL來源于真核細胞,所以在理論上真核細胞比原核細胞更有利于該酶的表達,而且畢赤酵母的翻譯后修飾功能,能夠使SJL得到正確的加工和折疊。另外,分泌型表達載體pPIC9K的使用,也促使該純化過程比原核細胞的胞內(nèi)表達得到簡化。本研究結(jié)果表明,SJL已在畢赤酵母中得到成功的表達,純化后的比活力為26.9 U/mg,比在大腸桿菌中表達純化后的比活力[10]提高了40%,但與天然SJL相比仍存在一定的差距[11]。影響SJL產(chǎn)量和活性的因素很多,如培養(yǎng)條件、外源基因自身結(jié)構(gòu)特性、蛋白酶降解、糖基化及純化工藝等。因此,今后還要對發(fā)酵條件和純化工藝作進一步研究,必要時還可對菌種進行改良。

        i-型(i-type)溶菌酶作為溶菌酶家族的一個新成員,近年來得到了廣泛的研究[12]。該重組海參溶菌酶畢赤酵母工程菌的成功構(gòu)建為進一步研究海洋生物新型溶菌酶的生物活性及其工業(yè)化生產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。

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