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        白色念珠菌臨床株基因分型及耐藥性研究

        2010-08-21 06:40:48卓佳陳柏坤黃慧燕徐瑜張洪勤
        關(guān)鍵詞:內(nèi)含子念珠菌B型

        卓佳,陳柏坤,黃慧燕,徐瑜,張洪勤

        (溫州醫(yī)學(xué)院,浙江 溫州 325035,1.生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心;2.附屬第二醫(yī)院)

        白色念珠菌廣泛分布于自然界,也是人體的一種條件致病菌,正常人體的皮膚、口腔、腸道、肛門、陰道等處均可分離出該菌。近年來,隨著免疫抑制劑、介入性檢查治療手段的廣泛應(yīng)用,腫瘤化療、放療,器官移植,艾滋病和社會(huì)老齡化等因素引起的免疫功能低下人群比例增高,臨床真菌感染呈上升趨勢(shì),尤其是近年來抗真菌感染的治療或者預(yù)防性治療,導(dǎo)致真菌感染菌株及耐藥趨勢(shì)發(fā)生變化[1]。本研究采用PCR分型方法,對(duì)臨床分離的121株白色念珠菌進(jìn)行基因分型,并對(duì)不同基因型白色念珠菌進(jìn)行藥物敏感性研究。

        1 材料和方法

        1.1 菌株來源 2006年7月至2008年3月間溫州醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院臨床分離的121株白色念珠菌。標(biāo)本來源于痰、咽拭子、生殖道分泌物、尿液、血液、糞便、腹水、傷口分泌物等。質(zhì)控菌株為白色念珠菌ATCC60193,購自衛(wèi)生部臨床檢驗(yàn)中心。

        1.2 儀器和試劑 法國科瑪嘉顯色培養(yǎng)基(CHRO Magar Candida)、API 20C AUX系統(tǒng)購自法國生物梅里埃公司;沙保弱瓊脂培養(yǎng)基、玉米-吐溫80培養(yǎng)基、含2%葡萄糖和0.5μg/mL美蘭的M-H瓊脂培養(yǎng)基、YEPD培養(yǎng)基(用于酵母原生質(zhì)體融合):酵母粉10 g,蛋白胨20 g,葡萄糖20 g,蒸餾水1000 mL,pH6.0(自制);2%蝸牛酶;原生質(zhì)緩沖液:1 mol/L山梨醇,0.02 mol/L檸檬酸,0.02 mol/L磷酸氫二鈉,pH5.8;SE緩沖液:1 mol/L山梨醇,0.0625 mol/L EDTA,pH 8.0;丹麥ROSCO Neo-Sensitab抗真菌藥敏紙片:制霉菌素(NYS)50μg/片,氟康唑(FL)25μg/片、酮康唑(KET)15μg/片,咪康唑(MTC)10μg/片,兩性霉素B(AMB)10μg/片,伊曲康唑(IT)8μg/片,由杭州康裕貿(mào)易有限公司提供;PCR使用試劑,包括Taq聚合酶以及引物的合成,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司產(chǎn)品;梯度PCR儀(Eppendorf公司);Bio-RAD凝膠成像及分析系統(tǒng)(gel-Doc2000美國)。

        1.3 菌株的分離鑒定 標(biāo)本按常規(guī)方法分離培養(yǎng),對(duì)臨床懷疑真菌感染的標(biāo)本接種沙保弱培養(yǎng)基,將分離到的酵母樣真菌接種于科瑪嘉顯色培養(yǎng)基,37 ℃孵育48 h,根據(jù)生長菌落的顏色作出鑒定,綠色菌落是白色念珠菌,紫色菌落是近平滑念珠菌,藍(lán)色菌落是熱帶念珠菌。

        1.4 白色念珠菌DNA的提取 取沙保弱平板純培養(yǎng)的單個(gè)菌落接種于YEPD培養(yǎng)基中,35 ℃震蕩培養(yǎng)過夜。2000 r/min離心10 min,棄上清液。三蒸水洗2次。菌體加600μL 2%蝸牛酶溶于原生質(zhì)緩沖液,30 ℃水浴2 h。3000 r/min離心10 min,棄上清液。SE緩沖液 400μL懸浮細(xì)胞。3000 r/min離心10 min,棄上清液。沉淀加入450μL TE緩沖液,10% SDS 50μL,65 ℃水浴30 min。加200μL 5 mol/L乙酸鉀,冰浴1 h。12000 r/min離心5 min,取上清液,加等體積無水異丙醇,混勻,-20 ℃靜置20 min。12000 r/min離心20 min,棄上清液。加70%無水乙醇500μL,混勻,12000 r/min離心5 min,棄上清液,自然干燥,溶解于50μL TE緩沖液,-20 ℃保存。

        1.5 白色念珠菌基因分型 采用特異引物擴(kuò)增白色念珠菌基因組DNA的25SrDNA基因的內(nèi)含子區(qū),以內(nèi)含子大小及其中可轉(zhuǎn)座I型內(nèi)含子片段的缺失或插入作為分型依據(jù)[2]。一對(duì)分型引物P1、P2分別位于可轉(zhuǎn)座內(nèi)含子的兩翼。

        P1:5’-ATA AGG GAA GTC GGC AAA ATA GAT CCG TAA-3’(up),30 mer,

        P2:5’-CCT TGG CTG TGG TTT CGC TAG ATA GTA GAT-3’(down),30 mer;

        PCR反應(yīng)總體積30μL,含TaqDNA聚合酶0.2μL(1 U),dNTP1.5μL,引物P1、P2各1μL。擴(kuò)增程序:預(yù)變性94 ℃ 3 min;94 ℃ 1 min,60 ℃ 40 s,72 ℃ 1 min,共30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。

        1.6 藥敏試驗(yàn) 吸取一定量的0.5McFland菌懸液用生理鹽水1:1稀釋。以無菌棉拭子蘸取稀釋后的菌懸液從3個(gè)方向分別均勻接種于含2%葡萄糖和0.5μg/mL美蘭的M-H瓊脂培養(yǎng)基上,室溫靜置5~15 min,用無菌鑷子將藥敏紙片貼于瓊脂表面。室溫置15 min后轉(zhuǎn)入35 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)18~24 h(未見生長者應(yīng)培養(yǎng)24~48 h),判定標(biāo)準(zhǔn)按美國臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)(NCCLS)酵母菌紙片擴(kuò)散法敏感試驗(yàn)2003年方案[3],按要求測(cè)量抑菌環(huán)直徑,讀取藥敏結(jié)果。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 率的比較采用x2檢驗(yàn)。

        2 結(jié)果

        2.1 基因分型結(jié)果 以P1、P2為引物,以白色念珠菌DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物出現(xiàn)3種電泳圖譜,據(jù)此分為3型:A型為450 bp的單一條帶,B型為840 bp的單一條帶,C型出現(xiàn)450 bp和840 bp2條帶。質(zhì)控菌株白色念珠菌ATCC60193的電泳圖譜與A型相同。121株白色念珠菌的分型結(jié)果為:A型83株,B型27株,C型11株。見圖1。

        2.2 不同基因型白色念珠菌的耐藥性分析 3種基因型白色念珠菌對(duì)伊曲康唑、氟康唑、咪康唑的耐藥率差異有顯著性(P<0.05)。B型白色念珠菌對(duì)氟康唑、咪康唑的的耐藥率明顯高于A型菌株(分別為x2=4.682,P=0.030;x2=3.912,P=0.048)。C型伊曲康唑的耐藥率明顯高于A型菌株(x2=4.220,P=0.040)。具體見表1。

        表1 A、B、C型白色念珠菌耐藥性分析

        3 討論

        隨著白色念珠菌臨床病例不斷增加,分子分型技術(shù)已成為研究念珠菌病流行病學(xué)及合理選擇藥物的基礎(chǔ)。rDNA廣泛存在于各種生物體內(nèi),在進(jìn)化過程中具有相同的起源和功能,可以反映物種間的進(jìn)化關(guān)系,已被廣泛應(yīng)用于多種生物的鑒定、分型及物種進(jìn)化分析。據(jù)證實(shí)[2,4],白色念珠菌在25SrDNA編碼區(qū)內(nèi)存在一可轉(zhuǎn)座I型內(nèi)含子,內(nèi)含子中至少存在三個(gè)插入片段:252、341、379 bp。形成可轉(zhuǎn)座I型內(nèi)含子的大小可有三種:379 bp(插入379 bp)、621 bp(插入379 bp和252 bp)、962 bp(插入379 bp、252 bp和341 bp)。5種型別中,A型(450 bp)無內(nèi)含子,B型(840 bp)為379 bp內(nèi)含子,D型(1080 bp)為621 bp內(nèi)含子,E型(1400 bp)為962 bp內(nèi)含子。379 bp內(nèi)含子對(duì)基因中核糖體串聯(lián)區(qū)的不對(duì)稱插入形成C型(450和840 bp),也有學(xué)者認(rèn)為C型可能是A型和B型通過有性繁殖方式產(chǎn)生的,或是兩組的過渡型,但是目前還沒有定論。

        本實(shí)驗(yàn)中121株臨床分離的白色念珠菌經(jīng)PCR分為三型:A型67株,B型43株,C型11株。未發(fā)現(xiàn)D型(1080 bp)和E型(1400 bp)。A型為主要基因型,A型比例遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于其他兩型,與國內(nèi)亓慶國等[5]研究相一致;而Chen等[6]對(duì)臺(tái)灣分離的65株白色念珠菌分析表明A、B型比例相當(dāng),表明不同地區(qū)或不同研究對(duì)象白色念珠菌基因型的分布是不同的。

        121株白色念珠菌的基因分型和真菌藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)合分析,發(fā)現(xiàn)3種基因型白色念珠菌對(duì)伊曲康唑、氟康唑、咪康唑的耐藥率差異有顯著性(P<0.05),對(duì)其他抗真菌藥物的耐藥率差異無顯著性。B型和C型白色念珠菌對(duì)唑類藥物的耐藥率明顯高于A型菌株。由此推論白色念珠菌特定基因型可能對(duì)某種抗真菌藥物易產(chǎn)生耐藥性,至于其耐藥機(jī)制是否與I型內(nèi)含子有關(guān),目前還沒有相關(guān)報(bào)道,有待于進(jìn)一步研究。

        臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)積極開展真菌耐藥性監(jiān)測(cè),為臨床提供用藥依據(jù),指導(dǎo)臨床合理使用抗真菌藥物,以達(dá)到有針對(duì)性的治療目標(biāo),預(yù)防和控制耐藥菌株的產(chǎn)生和增加。恰當(dāng)?shù)幕蚍中涂蔀檠芯堪咨钪榫R床耐藥的分子機(jī)制及流行病學(xué)調(diào)查提供基礎(chǔ),對(duì)控制真菌感染具有重大意義。

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