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        三氧化二砷對(duì)MRL/lpr狼瘡小鼠脾臟CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化的影響

        2010-08-21 06:40:50朱載華孫莉陳丹張乾坤嘉婷鄒正平朱小春
        關(guān)鍵詞:狼瘡脾臟甲基化

        朱載華,孫莉,陳丹,張乾坤,嘉婷,鄒正平,朱小春

        (溫州醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院 風(fēng)濕免疫科,浙江 溫州 325000)

        系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)是常見(jiàn)的自身免疫性疾病,目前尚無(wú)根治方法,其發(fā)病機(jī)制尚未完全清楚,目前認(rèn)為表觀遺傳學(xué)機(jī)制,特別是DNA甲基化在系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病機(jī)制中起了非常重要的作用。三氧化二砷(ATO)作為我國(guó)中藥砒霜的主要成分,在臨床上用于治療急性早幼粒細(xì)胞白血病取得一定療效[1],且已有研究證實(shí),ATO能下調(diào)MRL/lpr狼瘡小鼠FasL、IFN-γ、自身抗體、RF等水平,抑制淋巴組織增生、皮膚損害、肺和腎臟的炎性浸潤(rùn)、腎臟的免疫復(fù)合物沉積并延長(zhǎng)MRL/lpr狼瘡小鼠生存時(shí)間[2]。本課題組亦有研究證實(shí)ATO能降低BXSB小鼠血清中抗dsDNA水平,抑制腎小球中IgG的沉著,延長(zhǎng)狼瘡鼠的生存時(shí)間[3]。鑒于DNA甲基化在SLE的發(fā)病機(jī)制中的重要作用及ATO對(duì)MRL/lpr狼瘡小鼠的治療作用,本研究將討論ATO對(duì)MRL/lpr狼瘡小鼠脾臟CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化水平的影響,從遺傳學(xué)的發(fā)病機(jī)制方面為ATO治療SLE提供重要的依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 藥物和試劑 ATO、5-氮雜胞苷(5-AzaC)和植物血凝素P(PHA-P)均為Sigma公司產(chǎn)品;白介素-2(IL-2)為上海華新生物高技術(shù)有限公司產(chǎn)品;RPMI 1640和胎牛血清(FCS)為Gibco公司產(chǎn)品;淋巴細(xì)胞分離液為天津市灝洋生物制品科技有限責(zé)任公司產(chǎn)品;Dynal Mouse CD4 Nega-tive Isolation Kit為挪威Dynal公司產(chǎn)品;流式相關(guān)的大鼠抗小鼠TH細(xì)胞IgG-FITC為eBioscience公司產(chǎn)品;基因組DNA小量抽提試劑盒和質(zhì)粒小量抽提試劑盒均為碧云天生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;DNA 甲基化試劑盒和DNA凝膠回收試劑盒為ZYMO公司產(chǎn)品;PCR試劑盒、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)和5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖(X-Gal)均為大連寶生物工程有限公司產(chǎn)品;PCR引物序列由上?;瞪镉邢薰竞铣?;E.coli DH5α為本實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 16~18周雌性MRL/lpr狼瘡小鼠,體重33~36 g;16~18周雌性C57BL/6J小鼠,體重25~30 g購(gòu)自上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司,SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物房飼養(yǎng)。

        1.3 細(xì)胞培養(yǎng)與處理 取雌性MRL/lpr狼瘡小鼠6只,雌性C57BL/6J小鼠8只,頸椎脫臼法處死,無(wú)菌條件下分離脾臟,并采用密度梯度離心法自脾臟中分離小鼠單個(gè)核細(xì)胞,免疫磁珠法分選脾臟CD4+T細(xì)胞,流式細(xì)胞術(shù)(FACS)檢測(cè)細(xì)胞純度。用10%FCS1640將MRL/lpr小鼠淋巴脾臟CD4+T細(xì)胞濃度調(diào)整為1×106/mL,重懸于24孔板(1 mL/孔)。于37 ℃、5% CO2孵箱培養(yǎng)。各組細(xì)胞培養(yǎng)后均采用臺(tái)盼藍(lán)染色法測(cè)定細(xì)胞存活率。細(xì)胞存活率=(染色陰性細(xì)胞數(shù)/細(xì)胞總數(shù))×100%。各組均大于95%。體外經(jīng)PHA-P(終濃度20μg/mL)和IL-2(終濃度1000 IU/mL)刺激48 h后隨機(jī)進(jìn)行如下分組:①PBS組(n=9):空白對(duì)照;②ATO組(n=9):1μmol/L ATO作用24 h;③ATO+5-AzaC組(n=9):1μmol/L 5-AzaC作用72 h后1μmol/L ATO作用24 h。

        1.4 基因組DNA抽提及亞硫酸氫鹽修飾 收集各分組細(xì)胞懸液于Eppendorf管,離心后采用碧云天基因組DNA小量抽提試劑盒抽提DNA,用貝克曼分光光度儀DU800檢測(cè)DNA純度,各組DNA OD260/OD280的范圍均在1.8至2.0之間。抽提得到的基因組DNA,采用ZYMO公司DNA甲基化試劑盒進(jìn)行亞硫酸氫鹽修飾。DNA經(jīng)亞硫酸氫鹽修飾后,CpG島中的非甲基化胞嘧啶(C)轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ║),經(jīng)PCR擴(kuò)增后轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏ぃ═);而CpG島中的甲基化胞嘧啶(mC)仍保留為胞嘧啶(C)。CpG島以外序列中的胞嘧啶(C)均轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ║),經(jīng)PCR擴(kuò)增后均為胸腺嘧啶(T)。

        1.5 PCR擴(kuò)增IFN-γ基因啟動(dòng)子、DNA凝膠回收、克隆、轉(zhuǎn)化及測(cè)序 以亞硫酸氫鹽修飾的基因組DNA為模板,采用巢式PCR進(jìn)行擴(kuò)增,PCR引物序列參照文獻(xiàn)[4],即外部引物:5’-GGTGTGAAGTAAAAGT GTTTTTAGAGAATTTTAT,3’-CAATAACAACCAAAAACAA CCATAAAAAAAAACT;內(nèi)部引物:5’-TAGAGAATTTTATAA GAATGGTATAGGTGGGTAT,3’-CCATAAAAAAAAAC TACAAAACCAAAATACAATA。總反應(yīng)體系50μL:10×PCR Buffer 5μL、dNTP Mixture 4μL、上下游引物(20 pmol/mL)各0.5μL、Takara Taq 0.25μL、樣本DNA 1μL、去離子水38.75μL,采用降落PCR擴(kuò)增,退火溫度先從59 ℃到52 ℃,每2個(gè)循環(huán)下降1 ℃,再50 ℃擴(kuò)增30個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增后的DNA用2%瓊脂糖膠進(jìn)行分離,采用ZYMO公司DNA凝膠回收試劑盒回收目的DNA。回收的DNA和pMD-19T載體16 ℃連接30 min,按文獻(xiàn)[5]制備感受態(tài)細(xì)胞E.coli DH5α,連接物轉(zhuǎn)染細(xì)胞,均勻涂布于含有X-Gal、IPTG和氨芐西林(Amp)的LB-瓊脂平板培養(yǎng)基上37 ℃培養(yǎng)過(guò)夜。從LB平板上挑取單個(gè)白色菌落,接種入LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃震蕩培養(yǎng)過(guò)夜。取菌液,采用碧云天質(zhì)粒小量抽提試劑盒抽提質(zhì)粒。質(zhì)粒抽提初步電泳鑒定后送上海英駿生物技術(shù)服務(wù)有限公司測(cè)序。

        1.6 測(cè)序結(jié)果分析 采用基于網(wǎng)絡(luò)的在線生物信息學(xué)工具QUMA[6]分析測(cè)序結(jié)果。IFN-γ基因啟動(dòng)子平均甲基化率=(啟動(dòng)子區(qū)甲基化的CpG個(gè)數(shù)/啟動(dòng)子區(qū)總CpG個(gè)數(shù))×100%。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 兩組之間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),方差不齊時(shí)采用校正t檢驗(yàn),多組間比較采用方差分析,方差不齊時(shí)采用Dunnett’s t3檢驗(yàn)。

        2 結(jié)果

        采用CpG對(duì)平均甲基化程度來(lái)評(píng)估啟動(dòng)子甲基化水平。IFN-γ啟動(dòng)子區(qū)包含6個(gè)CpG位點(diǎn),MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ啟動(dòng)子CpG位點(diǎn)分布及各不同藥物處理組甲基化狀態(tài)見(jiàn)圖1,圖2為測(cè)序圖,截取圖1中各組中第一個(gè)克隆為代表。PBS組MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ啟動(dòng)子平均甲基化水平低于C57BL/6J小鼠,差異有顯著性(平均甲基化率0.074±0.121 vs 0.639±0.245,P=0.001)。MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞ATO處理組平均甲基化水平上升,與PBS空白對(duì)照組差異有顯著性(平均甲基化率0.407±0.324 vs 0.074±0.121,P=0.044);ATO+5-AzaC組的甲基化水平上升,與PBS空白對(duì)照組差異有顯著性(平均甲基化率0.482±0.386 vs 0.074±0.324,P=0.038);ATO組與ATO+5-AzaC組的甲基化水平差異無(wú)顯著性(平均甲基化率0.407±0.324 vs 0.482±0.386,P=0.959)(見(jiàn)圖3)。

        圖1 亞硫酸氫鹽修飾的MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化分析,圓圈代表CpG位點(diǎn),●表示甲基化狀態(tài),○表示非甲基化狀態(tài)

        圖2 MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞各不同藥物處理組的測(cè)序圖,取各組中第一個(gè)克隆為代表,**為CpG位點(diǎn)標(biāo)志

        圖3 MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞不同藥物處理組的IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化水平(n=9,F(xiàn)=4.736,*P<0.05)

        3 討論

        SLE患者T細(xì)胞DNA呈低甲基化水平,其基因組DNA甲基化程度為1%,低于正常人的2.5%~4.5%,且SLE患者T細(xì)胞DNA甲基化酶(DNMT)的活性僅為正常人的1/3~1/2[7]。甲基化抑制劑如5-AzaC處理鼠或人克隆CD4+T細(xì)胞后,能改變基因的表達(dá),誘發(fā)狼瘡樣綜合征[8],提示T細(xì)胞DNA低甲基化可能在SLE發(fā)病中起重要的作用。Bird等[9-11]報(bào)道,導(dǎo)致IFN-γ基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)量增加的主要機(jī)制是IFN-γ基因啟動(dòng)子低甲基化。用亞硫酸氫鹽測(cè)序法顯示人和小鼠T細(xì)胞中IFN-γ基因啟動(dòng)子區(qū)域均有5~7個(gè)CpG對(duì),這些位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)與IFN-γ轉(zhuǎn)錄翻譯水平呈負(fù)相關(guān)。

        Fas基因隱性突變的MRL/lpr小鼠作為常用的SLE動(dòng)物模型之一,其出現(xiàn)與人類SLE類似的自身免疫綜合征,發(fā)病期DNA甲基化水平明顯下降,DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1(Dnmt1)表達(dá)明顯下降[12-14]。本實(shí)驗(yàn)中PBS組MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子平均甲基化率為0.074±0.121,相對(duì)于正常對(duì)照C57BL/6J小鼠PBS組的0.639±0.245,顯示明顯去甲基化,與Mizugaki等[13]的研究相一致,進(jìn)一步驗(yàn)證了DNA低甲基化和狼瘡的發(fā)病具有一定的相關(guān)性。

        本課題組體外實(shí)驗(yàn)[15]已證實(shí)1μmol/L濃度ATO作用24 h,能夠逆轉(zhuǎn)MRL/lpr狼瘡小鼠CD4+T細(xì)胞活化狀態(tài)下IFN-γ分泌和轉(zhuǎn)錄水平的異常高表達(dá),但其機(jī)制尚不清楚。研究表明砷劑能通過(guò)改變DNA甲基化水平來(lái)影響、調(diào)控著某些基因的轉(zhuǎn)錄,Chanda等發(fā)現(xiàn)砷劑能引起p53和p16基因啟動(dòng)子的高甲基化,其甲基化程度與砷的劑量呈正相關(guān)。故本實(shí)驗(yàn)假設(shè)ATO通過(guò)促進(jìn)CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子的甲基化,從而抑制其基因的表達(dá)。已有實(shí)驗(yàn)證實(shí)ATO能提高M(jìn)RL/lpr小鼠的脾臟與淋巴結(jié)DNA整體甲基化水平[16],但只是間接說(shuō)明ATO抑制T細(xì)胞IFN-γ的轉(zhuǎn)錄可能是通過(guò)DNA甲基化途經(jīng)來(lái)調(diào)控,本實(shí)驗(yàn)則直接測(cè)定MRL/lpr狼瘡小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化率來(lái)證實(shí)上述的假設(shè)。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示ATO處理的MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞平均甲基化水平與空白對(duì)照組相比有明顯的上升(平均甲基化率0.407±0.324 vs 0.074±0.121,P=0.044),加入甲基化特異性抑制劑5-AzaC,ATO仍然能促進(jìn)MRL/lpr小鼠CD4+T細(xì)胞IFN-γ啟動(dòng)子的甲基化(平均甲基化率0.482±0.386 vs 0.074±0.324,P=0.038),進(jìn)一步肯定了ATO促進(jìn)CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子的甲基化的作用。

        綜上所述,MRL/lpr小鼠脾臟CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子呈低甲基化水平,1μmol/L ATO作用24 h能提高活化狀態(tài)下以及5-AzaC預(yù)處理后的MRL/lpr小鼠脾臟CD4+T細(xì)胞IFN-γ基因啟動(dòng)子甲基化水平。但是ATO是否通過(guò)DNMT與DNA去甲基化酶(dMTase)相互作用,從而影響甲基化水平,尚未清楚,這是我們下一步研究的重點(diǎn)。

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