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        雙向凝膠電泳技術(shù)在中醫(yī)證候研究中的應(yīng)用

        2010-04-13 10:06:33
        世界中醫(yī)藥 2010年5期
        關(guān)鍵詞:雙向電泳凝膠電泳組學(xué)

        陳 冰

        (中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究所,北京市東直門內(nèi)南小街 16號(hào),100700)

        雙向凝膠電泳技術(shù)自從問(wèn)世以來(lái)便廣泛應(yīng)用于各種領(lǐng)域,現(xiàn)已成為蛋白質(zhì)組學(xué)的核心技術(shù),由于其整體性、實(shí)時(shí)性等特點(diǎn),近年來(lái)大量應(yīng)用于中醫(yī)證候研究方面。本文擬對(duì)雙向電泳技術(shù)在證候研究中的應(yīng)用做一綜述。

        1 雙向電泳技術(shù)原理及應(yīng)用

        雙向電泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)是根據(jù)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)和分子量的不同,通過(guò)兩次方向互相垂直的高分辨率等電聚焦電泳和十二烷基磺酸鈉一聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE),將帶不同凈電荷和不同分子量的蛋白質(zhì)二維平面上呈點(diǎn)狀分開的技術(shù)。雙向電泳技術(shù) 1975年由意大利生化學(xué)家O'Farrell發(fā)明[1],可以在一個(gè)平面上分離出數(shù)以千計(jì)的蛋白質(zhì),適用于整體水平生命活動(dòng)規(guī)律的研究[2]。它以高分辨率、簡(jiǎn)單、快速等優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究,是目前分離復(fù)雜蛋白質(zhì)組分最常用的工具。通過(guò)雙向電泳得到差異蛋白后,可結(jié)合其他蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法進(jìn)一步分析,如結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行差異蛋白質(zhì)的鑒定、相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索,將所獲結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析等。因此說(shuō),雙向電泳是蛋白質(zhì)組學(xué)的核心技術(shù)。

        雙向電泳技術(shù)包括蛋白樣品制備、等電聚焦、SDSPAGE、染色等步驟。樣品制備非常關(guān)鍵,合理的樣品制備可保證 2-DE的重復(fù)性。盡量減少蛋白提取過(guò)程中的降解和丟失,以提高分辨率。等點(diǎn)聚焦是在存在 p H梯度和電場(chǎng)的條件下,蛋白質(zhì)分子向其凈電荷為零的 p H處移動(dòng),當(dāng)樣本中的每一個(gè)蛋白質(zhì)均達(dá)到其電荷為零的 pH位置時(shí),樣品蛋白質(zhì)就根據(jù)其等電點(diǎn)得到分離。SDS-PAGE有垂直和水平 2種方式。垂直方式是目前常用的電泳方式,陰離子去垢劑十二烷基磺酸鈉同蛋白質(zhì)合后形成項(xiàng)鏈樣結(jié)構(gòu),并以 114∶1的比例結(jié)合,從而使蛋白質(zhì)帶有凈負(fù)電荷,使蛋白電泳時(shí)移動(dòng)距離與其分子量呈正比。

        雙向電泳常用的染色方法有考染色、銀染、熒光染色等方法。熒光差異雙向凝膠電泳(DIGE)是目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究的熱門技術(shù)[3-4]。它是通過(guò)熒光染料與蛋白質(zhì)中的賴氨酸殘基進(jìn)行結(jié)合,把不同熒光素標(biāo)記的樣品在同一塊凝膠上進(jìn)行分離,用不同波長(zhǎng)的激光激發(fā)后可以顯示不同的顏色。DIGE技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)是采用幾種不同的熒光染料(Cy3、Cy5、Cy2)分別標(biāo)記不同的蛋白質(zhì)樣品,并設(shè)立內(nèi)標(biāo),可以在同一塊膠上同時(shí)分離 2種以上蛋白質(zhì)樣品,比較同一蛋白在不同樣品中的豐度[5-6]。由于每塊凝膠中加入了內(nèi)標(biāo),降低了普通雙向凝膠電泳中不同凝膠間的誤差,減少了實(shí)驗(yàn)重復(fù)次數(shù);且靈敏度高,可以對(duì)相對(duì)微量的蛋白質(zhì)進(jìn)行定量研究。DIGE實(shí)驗(yàn)中一般用 Cy2標(biāo)記內(nèi)標(biāo),用 Cy3、Cy5分別交叉標(biāo)記不同膠間的樣品,這就避免了不同染料對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響。其分析軟件能自動(dòng)進(jìn)行蛋白質(zhì)點(diǎn)的識(shí)別和匹配,可消除人為因素,增加實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性[7-8]。因此,DIGE技術(shù)具有較高的敏感性、特異性及較寬的動(dòng)態(tài)范圍等優(yōu)點(diǎn),非常適用于樣本數(shù)較少,蛋白豐度范圍大的實(shí)驗(yàn)研究。目前已有學(xué)者將該項(xiàng)技術(shù)應(yīng)用于證候特征的研究方面,唐利華等發(fā)現(xiàn)了 17個(gè)差異蛋白質(zhì)可能與腎陽(yáng)虛疾病有關(guān)[9]。雙向電泳技術(shù)還可以根據(jù)研究者的需要結(jié)合其他蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù),如蛋白質(zhì)芯片、S質(zhì)譜等,目前雙向電泳加質(zhì)譜已經(jīng)成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的基本方法。

        2 雙向電泳技術(shù)是研究中醫(yī)證候的重要方法

        中醫(yī)證候是指在致病因素作用下,機(jī)體內(nèi)外環(huán)境各系統(tǒng)之間相互關(guān)系發(fā)生紊亂所產(chǎn)生的綜合反應(yīng),是反映疾病處于某一階段病因、病性、病位、病勢(shì)等病理因素的綜合性診斷概念,是致病因素與機(jī)體反應(yīng)兩方面情況的綜合。證,是指對(duì)疾病所處的一定階段的病機(jī)概括,或非疾病機(jī)體的一定階段的機(jī)體狀態(tài)的概括;候,是指這種病機(jī)或狀態(tài)的可被觀察到的外在表現(xiàn)[10]。

        蛋白質(zhì)組的概念最早由澳大利亞學(xué)者 Wilkins和Williams提出[11],指由一個(gè)基因組、細(xì)胞、組織或生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以細(xì)胞或組織不同時(shí)間、環(huán)境的所有蛋白質(zhì)為研究對(duì)象,從整體上研究蛋白質(zhì)的種類、相互作用以及功能結(jié)構(gòu)的一門科學(xué)。而證候的整體性、時(shí)相性等特點(diǎn)與蛋白質(zhì)組學(xué)時(shí)空性與整體性的特點(diǎn)十分貼近。因此,應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)方法對(duì)證候本質(zhì)進(jìn)行研究已經(jīng)成為一種公認(rèn)的方法,而作為蛋白質(zhì)組學(xué)中最重要的技術(shù)——雙向電泳,更是被廣泛使用。將蛋白組學(xué)引入證實(shí)質(zhì)研究,更有利于動(dòng)態(tài)地揭示同一個(gè)研究對(duì)象不同時(shí)期的變動(dòng)性,更符合證研究自身的特點(diǎn)。對(duì)不同中醫(yī)證候產(chǎn)生前后蛋白質(zhì)組學(xué)研究,探究中醫(yī)證候產(chǎn)生的物質(zhì)基礎(chǔ)支配機(jī)制,可以揭示中醫(yī)證候的科學(xué)內(nèi)涵,能夠?yàn)橹嗅t(yī)診斷的客觀化提供依據(jù)和方法。尋找與證候相關(guān)的差異標(biāo)志蛋白群,制定標(biāo)準(zhǔn)參照物,使得疾病的辨證分型及用藥具有客觀性、準(zhǔn)確性及重復(fù)性[12]。

        3 雙向電泳技術(shù)在中醫(yī)證候研究中的應(yīng)用

        以雙向電泳技術(shù)為代表的蛋白質(zhì)組學(xué)方法近些年來(lái)已經(jīng)大量應(yīng)用于中醫(yī)證候的研究中。劉萍[13]等通過(guò)雙向電泳技術(shù),成功建立了脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清 2-DE圖譜。其中在正常對(duì)照組雙向電泳圖譜上觀察到了 1463±179個(gè)蛋白點(diǎn),而重癥肌無(wú)力組共觀察到 1508±89個(gè)蛋白點(diǎn)。選取具有明顯差異的21個(gè)蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,共鑒定出 8種差異蛋白。趙慧輝[14]等采用雙向凝膠電泳結(jié)合基質(zhì)輔助激光解析/電離 -飛行時(shí)間質(zhì)譜對(duì) 8例心絞痛血瘀證患者血瘀證程度變化前后的血漿進(jìn)行比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究,尋找心絞痛血瘀證相關(guān)蛋白。結(jié)果初步發(fā)現(xiàn)了 Clusterin、ApoA-I在血瘀證程度變輕后表達(dá)增加,而 Fibrinogenβchain、Vitamin D-Binding Protein、Haptoglobin βchain、Albumin isoform在血瘀證程度變輕后表達(dá)降低。譚秦湘等[15]以不同疾病組肝郁證患者和正常人的血清為樣本,采用雙向凝膠電泳分離蛋白質(zhì)組分,通過(guò)分析比較正常組與肝郁證組血清蛋白質(zhì)圖譜,探詢其物質(zhì)基礎(chǔ),經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn)肝郁證差異蛋白質(zhì)群。張嫻[16]等在對(duì)自發(fā)性高血壓大鼠組和高血壓肝陽(yáng)上亢模型組大鼠肝臟蛋白質(zhì)組的雙向電泳分析中發(fā)現(xiàn),大部分蛋白集中分布在 PI 5~8的區(qū)域。研究人員認(rèn)為應(yīng)用蛋白質(zhì)組分析技術(shù)能較全面地了解模型的蛋白表達(dá)情況,有利于篩選證候相關(guān)蛋白,是研究中醫(yī)證候的可行途徑之一。戰(zhàn)麗彬[17]等應(yīng)用雙向電泳技術(shù),通過(guò)2-DE圖像分析軟件 ImageMaster 5.0對(duì)大鼠脾陰虛組和空白對(duì)照組海馬蛋白質(zhì)組進(jìn)行分析,可分辨 2組蛋白斑點(diǎn)數(shù)目分別為(2027±61)個(gè)和(1917±207)個(gè)。將圖譜部分區(qū)域放大后顯示出明顯差異,初步篩選出脾陰虛大鼠海馬蛋白質(zhì)組的差異表達(dá),研究人員推測(cè)與學(xué)習(xí)記憶相關(guān)。劉希成[18]利用雙向電泳優(yōu)化分離了除去高豐度蛋白(白蛋白和 IgG)的老年體虛腎陽(yáng)虛患者(以健康組為參照)的血清樣本,對(duì)比分析pH4~7范圍的 2-DE圖譜,發(fā)現(xiàn)腎陽(yáng)虛患者和參照組的平均蛋白點(diǎn)分別為(393±32)和(455±19)個(gè)。其中腎陽(yáng)虛證候表達(dá)量上調(diào) 2倍(P<0.05)以上的蛋白點(diǎn)有 26個(gè),下調(diào) 2倍以上的有 33個(gè)。結(jié)合質(zhì)譜獲得上述差異蛋白的肽質(zhì)量指紋圖譜,并經(jīng)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索共鑒定出了 49種差異蛋白質(zhì),其中有 10種在腎陽(yáng)虛血清中特異表達(dá),有 6種在健康組血清中特異表達(dá)。蛋白功能分析發(fā)現(xiàn),其中 33種蛋白質(zhì)的差異表達(dá)與腎陽(yáng)虛證密切相關(guān)。蛋白質(zhì) TCRβ及 transthyretin的蛋白印跡實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了 2-DE的結(jié)果。研究人員認(rèn)為該研究結(jié)果為闡明中醫(yī)腎陽(yáng)虛證的機(jī)理提供了一條新途徑。除此之外,還有學(xué)者利用雙向電泳技術(shù)對(duì)血虛證[19]、慢性胃炎濕證[20]等證候類型進(jìn)行了研究。

        4 存在問(wèn)題與展望

        雙向電泳的分辨率較高,近年來(lái)被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等研究領(lǐng)域。但仍存在諸多問(wèn)題:1)重復(fù)性差,自動(dòng)化程度低;2)低豐度蛋白質(zhì)、極酸及極堿性蛋白質(zhì)、分子量過(guò)大或過(guò)小的蛋白質(zhì)及膜蛋白等分離困難。針對(duì)上述問(wèn)題,可采用如二維色譜、二維毛細(xì)管電泳、液相色譜 -毛細(xì)管電泳等新型分離技術(shù)作為雙向電泳的補(bǔ)充。而且隨著高通量和高精度蛋白質(zhì)新型檢測(cè)技術(shù)的出現(xiàn),雙向電泳技術(shù)可以得到進(jìn)一步完善。雙向電泳技術(shù)結(jié)合蛋白質(zhì)的生物質(zhì)譜鑒定及其與生物信息學(xué)的結(jié)合一系列方法的建立,必將為中醫(yī)證候的研究提供更完備的支持。

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