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        microRNAs的臨床運用探討

        2010-04-12 17:41:47郭建生陳士偉
        實驗與檢驗醫(yī)學 2010年6期
        關(guān)鍵詞:癌基因肺癌基因

        郭建生,陳士偉

        (1、空軍杭州航空醫(yī)學鑒定訓練中心,浙江 杭州 310007;2、長海醫(yī)院實驗診斷科,上海 200433)

        1993 年Lee等[1]利用遺傳分析的方法在秀麗隱桿線蟲中發(fā)現(xiàn)第一個22個核苷酸的小分子非編碼RNA-lin-4開始,microRNA(miRNA)被帶入了研究領(lǐng)域,但直到最近幾年這類基因的多樣性和廣泛性才被揭示出來。一系列的研究表明,microRNA在機體正常發(fā)育、分化、生長及凋亡中發(fā)揮重要的作用,如胚胎發(fā)育、細胞生長和凋亡、血細胞分化、神經(jīng)元的極性、胰島素分泌、大腦形態(tài)形成、心臟發(fā)生和脂肪代謝等,隨著研究的進展,對miRNA的研究從量的表象變化已經(jīng)慢慢過渡到作用機制,進入了更深一步的研究。隨著檢測方法的進步,一個新的領(lǐng)域—循環(huán)miRNA也逐漸成為科研的熱點,成為潛在的檢測標志物和治療靶向點。miRNA與多種疾病的發(fā)生發(fā)展存在密切的關(guān)系,本文對此進行部分闡述。

        1 miRNA概述

        miRNA(miRNA)是一類有大約1923個核苷酸組成的非編碼小分子RNA,廣泛存在于真核生物中,在細胞增殖、分化、凋亡、個體發(fā)育、病毒感染及腫瘤的發(fā)生發(fā)展等方面具有重要的生物學功能。它們由細胞核內(nèi)基因組DNA轉(zhuǎn)錄成RNA,經(jīng)過特異性核酸酶drosha第一次切割形成pre-microRNA,利用運輸?shù)鞍?5到達胞漿后再經(jīng)過Dicer酶的第二次切割而得到成熟miRNA,其通過RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RNA-induced silencing complex,RISC)靶向到達 mRNA,與靶基因 3’端非翻譯區(qū)(3’UTR)完全或部分互補結(jié)合,導(dǎo)致靶mRNA翻譯抑制并參與RNA干擾反應(yīng),使相應(yīng)基因表達水平下降[2]。miRNA與靶mRNA完全互補配對后,mRNA被降解,若miRNA與靶mRNA不完全互補,則起到封閉靶mRNA的作用,抑制其翻譯過程[3]。編碼miRNA的基因占全部預(yù)測基因的1~5%,每種miRNA可調(diào)控多種靶基因,一個靶基因可能受不同miRNA的調(diào)控,改變?nèi)祟惖鞍谆虻谋磉_,維持機體的功能[4]。

        2 miRNA與疾病

        2.1 miRNA與腫瘤

        miRNA表達與腫瘤的相關(guān)性是最有吸引力的研究。提取腫瘤組織細胞的RNA,利用microarray分析發(fā)現(xiàn)多種腫瘤組織與周圍的正常組織相比較miRNA表達水平有不同程度的上調(diào)或下調(diào),發(fā)生miRNA圖譜改變,這一現(xiàn)象初步肯定了腫瘤發(fā)生與miRNA表達之間具有一定的相關(guān)性。已經(jīng)有大量文獻報道疾病中有關(guān)的組織或細胞miRNA圖譜發(fā)生變化,特別是腫瘤miRNA表達譜可以提示其組織來源,同時也證明miRNA表達譜有助于人類腫瘤的組織分型,而且miRNA表達譜在提示組織譜系方面比傳統(tǒng)的miRNA表達譜效果更好。此外,miRNA表達譜還可以為低分化腫瘤找到其組織來源[5]。

        miRNA既可作為抑癌基因,下調(diào)原癌基因的活性,也可作為癌基因,下調(diào)抑癌基因的活性。Calin GA等[6]首次驗證了microRNA在某些類型的白血病和淋巴瘤中發(fā)生了功能障礙,其中miR-15和miR-16起著關(guān)鍵作用,這兩種miRNA通過抑制Bcl-2蛋白的表達調(diào)節(jié)細胞凋亡過程,Bcl-2蛋白主要通過作用于線粒體來實現(xiàn)其抑制凋亡的生物學活性,因此當miR-15和miR-16丟失或突變時,Bcl-2蛋白的表達量上調(diào),細胞凋亡受阻,因而導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。作為癌基因的miR-21,研究證明在膠質(zhì)母細胞瘤中表達升高,同時乳腺癌樣品中表達也有增加,故認為miR-21可能在腫瘤發(fā)生中起到廣泛的作用。而人的肺癌細胞中瞬時的表達let-7,作為抑癌基因,可以抑制細胞的增殖,如果肺癌患者的let-7表達降低,患者預(yù)后更差,非小細胞肺癌患者的let-7表達水平越低,其預(yù)后越差,術(shù)后生存期越短。同時最近研究也發(fā)現(xiàn)miR-31抑制抑癌基因促進肺癌的發(fā)生,它作用的目標基因是抑癌基因Last2(large tumor suppressor 2)和Ppp2r2a(PP2A regulatory subunit B alpha isoform),與它們結(jié)合后促進腫瘤的生成,抑制抑癌基因發(fā)揮抑癌作用,人工敲除miR-31,Lats2和Ppp2r2a表達明顯上升,肺癌病人和肺癌鼠的miR-31和目標mRNA的表達相反,充分證實了這個結(jié)論[7]。

        2.2 miRNA與內(nèi)分泌疾病

        在我國內(nèi)分泌疾病有很大的人群,從功能上說主要表現(xiàn)為兩種情況,一是功能亢進,二是功能減退,雖然發(fā)病緩慢,但對病人造成的痛苦不可小覷。miRNA的出現(xiàn)為內(nèi)分泌疾病的診斷和治療帶來了新的思路和方法。從胰腺B細胞分泌、胰島素的作用等每個環(huán)節(jié)都有miRNA的參與,而且影響其它相關(guān)分子。對來自1型糖尿病和正常人的Treg細胞進行miRNA篩查,利用TaqMan arry分析發(fā)現(xiàn)與正常人相比1型糖尿病病人Treg細胞miR-510上升近100倍,而miR-342和miR-191下降為近2倍和3倍。雖然具體的作用機制還沒有明確,但圖譜的改變已經(jīng)說明miRNA在1型糖尿病中的重要作用[8]。

        雌激素受體(ERα)是配體激活的轉(zhuǎn)錄因子,由荷爾蒙、DNA、和轉(zhuǎn)錄活化因子幾個重要結(jié)合區(qū)域組成,miR-22與表達ERα的mRNA的3’端非翻譯區(qū)(UTR)結(jié)合強力抑制ERα產(chǎn)生,過表達的miR-21通過誘導(dǎo)mRNA的降解而使ERα產(chǎn)生減少使雌激素的作用減弱,因而可以從另一方面思考miR-21的過表達可以抑制雌激素依賴性乳腺癌細胞的生長[9]。MiR-18已經(jīng)被證實作用于編碼ERα的基因ESR1,過表達MiR-18降低ERα水平但同時促進肝癌細胞 (HCC)的增殖,對女性肝癌病人來說miR-18的過表達阻礙了雌激素潛在的保護作用而促進了肝癌的發(fā)展[10]。

        2.3 miRNA與自身免疫性疾病

        已經(jīng)證實miRNA在免疫調(diào)節(jié)和免疫細胞發(fā)育扮演了重要角色。到目前為止,已經(jīng)揭示一群特異性的miRNA在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。利用LPS對人monocytic THP-1細胞進行刺激發(fā)現(xiàn)miR-146、miR-155和miR-132上調(diào),TNF-a和IL-1b可以誘導(dǎo)miR-146的表達。進一步的分析揭示這是NFkB依賴性的[11]。由IFN-b和多種TLR配體的作用,鼠巨噬細胞miR-155表達上升,這些說明miR-155參與細菌和病毒的先天性免疫。而LPS刺激鼠巨噬細胞會引起miR-125的下調(diào),因此推斷miR-125可能作用于TNF-amRNA,在LPS誘導(dǎo)TNF-a產(chǎn)生時miR-155表達下調(diào)[12]。系統(tǒng)性紅斑狼瘡(Systemic lupus erythematosus,SLE)是一種自身免疫性疾病,產(chǎn)生多種自身物質(zhì)的抗體包括染色質(zhì)、核糖和磷脂等而且臨床表現(xiàn)多樣。Dai等利用microarry分析來自23名SLE患者和10名健康者的外周血單核細胞 (peripheral blood mononuclear cell,PBMC)miRNA的表達,結(jié)果得出7種 miRNAs(miR-196a,miR-17-5p,miR-409-3p,miR-141,miR-383,miR-112,and miR-184) 表達下調(diào),9 種 miRNAs(miR-189,miR-61,miR-78,miR-21,miR-142-3p,miR-342,miR-299-3p,miR-198,andmiR-298)表達下調(diào)[13]。對狼瘡腎炎活檢組織的miRNA的圖譜分析也有改變,36種上調(diào)和30種下調(diào)[14]。這些資料表明對于SLE患者miRNA可作為潛在診斷標志物和疾病相關(guān)分析因子。

        2.4 miRNA與其它

        皮膚是人體分布最廣的器官,在表皮和毛囊中的一些miRNA的高表達是皮膚正常發(fā)育必不可少的,將鼠胚胎皮膚祖細胞Dicer敲除發(fā)現(xiàn)皮膚上皮不能產(chǎn)生成熟miRNA,毛胚芽進入表皮層而不是正常的到真皮層。正常毛囊分化關(guān)鍵信號分子(sonic hedgehog,Shh 和 Notch homolog 1,Notch1)的表達在出生后7d消失[15]。MiR-203與皮膚形成有關(guān),胚胎發(fā)育至13.5~15.5d時,鼠基底層細胞相比基底細胞miR-203增高25倍,miR-203抑制p63的表達,p63是表皮細胞增殖和分化的重要因子[16],在胚胎形成中p63基因啟動上皮形成,維持表皮基底層成熟角質(zhì)細胞的增殖潛力。皮膚microRNA的改變會引起增殖、分化的錯誤信號,最終導(dǎo)致皮膚疾病的產(chǎn)生。

        3 循環(huán)miRNA

        3.1 循環(huán)miRNA的來源與檢測方法

        對于循環(huán)miRNA的來源目前主要觀點有:循環(huán)RNA來自于凋亡或壞死的細胞,細胞的主動釋放,以及循環(huán)細胞的裂解.但對于特定循環(huán)miRNA的真實來源還存在許多未知的因素。研究表明,內(nèi)源性的循環(huán)RNA分子具有良好的抗RNase降解能力,有較高的穩(wěn)定性。雖然目前機制還不是很清楚,但并不影響對其的研究。為了驗證內(nèi)源性miRNAs在血漿中的穩(wěn)定性,Mitchell等[17]將血漿放置室溫24h或經(jīng)過8次凍融對目的基因的量進行測試發(fā)現(xiàn)影響很小,沒有顯著差異,充分證實了miRNA在血漿中的穩(wěn)定性,具備作為臨床檢測指標的條件之一。

        目前對microRNA的檢測主要有兩種方法,一是利用microarray芯片,對基因進行篩查,二是利用real-time PCR對目的基因進行相對定量檢測,有Taqman探針和SYBgreen法,Taqman探針因其具有特異、敏感和快速優(yōu)于SYBgreen法而逐步成為實驗方法的金標準。由于在血清中miRNA的含量少且其分子量小,因而在進行樣本抽提時不同于普通的RNA抽提。利用mirVana PARIS試劑盒,用等體積酸性酚-氯仿抽提樣品以去除蛋白成分,通過不同梯度100%乙醇的加入達到對不同RNA成分的分離最終獲得高濃度的miRNA洗脫液用于下面的逆轉(zhuǎn)錄和定量檢測。

        3.2 循環(huán)miRNA是檢測的潛在標志物

        與組織表達的miRNA一樣,循環(huán)miRNAs首先最廣泛地用于對腫瘤疾病的研究。在血清中檢測腫瘤組織中高表達miRNA并對其分析來判斷miRNA對疾病診斷、治療、預(yù)后的檢測作用。循環(huán)miR-1可作為急性心肌梗死 (acutemyocardial infraction,AMI)的潛在標記物,與正常組比較AMI在疾病組的Ct值中值有明顯的差別(CtI=32.11,AMI=28.35),利用ROC 曲線(receiver–operator characteristic curve,ROC)分析來肯定它的診斷價值,并且回歸分析miR-1的水平與年齡、性別、高血壓、糖尿病等與AMI有關(guān)的因素都無相關(guān)[18]。miRNA還可用來對懷孕不同時段的監(jiān)測,與未孕對照組比較孕期第一階段(6~12周)和孕期第三階段(34~41周)let-7d、miR-527、miR-520d5p、miR-526a、miR-141 的表達隨著孕齡增加而增高,對胎兒發(fā)育起到監(jiān)測的作用[19]。

        4 展望

        通過miRNA檢測達到對疾病的檢測、治療和預(yù)后的檢測已經(jīng)是目前關(guān)于RNA研究的熱點,miRNA的表達有高度保守性、時序性和組織特異性,而且在血清或血漿中通過實驗方法可以檢測量的表達變化。雖然大部分miRNA的功能和作用機制還沒有完全清楚,但其在維持機體健康和疾病監(jiān)控的作用越來越受到關(guān)注。目前蛋白水平檢測是在轉(zhuǎn)錄翻譯后,而miRNA則通過影響轉(zhuǎn)錄后翻譯達到調(diào)控,對疾病的臨床意義更大,并且就當前的技術(shù)可以很快地建立起miRNA為系統(tǒng)的檢測方法,以miRNA為新的檢測標志物的建立是可以期盼的。

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