許小艷,康厚祥,劉峰,鄒學(xué)校1,
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院,湖南 長沙 410128;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081;3.湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,湖南 長沙 410125)
辣椒(Capsicum annuum L.)是一種重要的調(diào)味品,也是一種深受人們喜愛的蔬菜,在國內(nèi)外市場上占有重要地位,為5大蔬菜作物之一。辣椒的病蟲害較多,主要的病害有病毒病害、細菌性病害、真菌性病害,蟲害有根結(jié)線蟲等。各種病蟲害是嚴重阻礙辣椒生產(chǎn)發(fā)展的重要因素,化學(xué)防治在一定程度上能抑制其發(fā)生流行,但也會造成辣椒品質(zhì)下降和環(huán)境污染等問題。因此,培育優(yōu)良的抗病蟲品種一直是辣椒育種者的重要目標(biāo)。常規(guī)的育種方法周期長,而迅速發(fā)展的分子標(biāo)記技術(shù)大大地縮短了育種年限,為辣椒抗病蟲育種提供了有利的輔助工具。近年來,辣椒分子標(biāo)記研究發(fā)展很快,如抗煙草花葉病毒、瘡痂病、疫病及線蟲等的基因相繼得到了定位。為此,現(xiàn)將分子標(biāo)記技術(shù)在辣椒抗病蟲基因定位研究中的應(yīng)用進展介紹如下。
Boukema曾報道過侵染辣椒的TMV包括P0、P1、P2、Pl-2-3等小種。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn):L1基因抗P0小種;L2基因抗P0、P1小種;L3基因抗P0、P1、P1-2小種;L4基因抗所有TMV小種。L1~4基因在30℃時失去抗性;L1a基因抗PaMMV-J、P0、P1,在30℃時抗P0;Hk基因在30℃時抗PaMMV-J,而在24℃時不抗。L1~4基因的定位研究較早,Lefebvre等(1995,2002)把L基因定位到P11-Brun染色體上[1-3]。Sugita等(2005)通過DH群體將L3基因定位在LG6上[4],Tomita等(2008)進一步對L3基因進行精細定位,將其定位在一個包含兩個不同BAC庫的毗連區(qū)域[5]。Kim等(2008)獲得一個與L4緊密連鎖的SCAR標(biāo)記,在回交群體T102圖譜中,與L4的遺傳圖距為1.8 cm;在回交群體T101圖譜中,與L4的遺傳圖距為0.9 cm,比Matsunaga等(2003)開發(fā)的SCAR標(biāo)記更靠近L4基因[6]。
CMV是世界上最流行的植物病毒之一,每年在世界范圍內(nèi)對辣椒生產(chǎn)造成嚴重的危害和損失。目前國際上多數(shù)學(xué)者認為辣椒對CMV的抗性是由多基因控制的。Caranta等(1997)利用DH群體進行抗CMV QTL分析,獲得3個QTLs,分別定位于染色體Noir、Pourpre和LG3上,能解釋57%的表型變異。Ben Chaim等(2001)在‘Maor×Perennial’的180個F3家系上,發(fā)現(xiàn)4個抗CMV QTLs,分別為cmv 4.1、cmv 6.1、cmv 11.1和cmv 13.1,其中cmv 11.1為主效QTLs,能解釋16%~33%的表型變異,并發(fā)現(xiàn)cmv 11.1與TMV抗性位點L連鎖。Caranta等(2002)利用Vania和H3,經(jīng)CIM方法發(fā)現(xiàn)7個抗CMV的QTLs,主效QTL cmv 12.1能解釋總表型變異的45%~63.6%[7]。
在我國,PVY對辣椒的危害僅次于TMV和CMV,包含PVY(0)、PVY(l)和PVY(1,2)小種。目前在辣椒上已發(fā)現(xiàn)7個抗PVY的單抗基因(pvr1、pvr2、pvr3、pvr4、pvr5、pvr6、pvr7),pvr1與pvr2連鎖。Caranta等(1997)將Pvr2和Pvr6分別定位于P4-orange和Pourpre上,還發(fā)現(xiàn)一組具有數(shù)量遺傳特性的QTLs,其中1個主效QTLs定位于orange上,抗PVY(0)、PVY(1,2)、Potyvirus E。Grube等(2000)發(fā)現(xiàn)pvr7與pvr4緊密連鎖,并將它們定位到P10;Arnedo-Andrés等(2002)獲得1個與pvr4緊密連鎖,能有效區(qū)分抗PVY基因型的SCAR標(biāo)記[1,8]。
瘡痂?。˙acterial spot)是由野油菜黃單胞菌辣椒斑點病致病型(Xanthomonas campestris pv.vesicatoria)引起的。根據(jù)寄主的抗性反應(yīng),將病原菌劃分為9個小種(P0~P8)。目前在辣椒上共發(fā)現(xiàn)4個抗瘡痂病基因(Bs1、Bs2、Bs3、Bs4),均為顯性基因。Bs1基因抗P0、P2、P5;Bs2基因抗P0、P1、P2、P3、P7、P8;Bs3基因抗P0、P1、P4、P7;Bs4基因抗P0、P1、P3、P4、P6。Tai等(1999年)運用RAPD和AFLP技術(shù),得到1個與Bs2基因完全能分離的AFLP標(biāo)記,并將Bs2基因分離克隆出來了。Pierre等(2000)利用BSA和AFLP技術(shù)對Bs3基因進行定位,與最近的AFLP標(biāo)記的遺傳圖距為1 cm[1]。
辣椒疫病是由疫霉菌(Phytophthora capsici Leon.)引起的土傳性病害,常在短期內(nèi)突發(fā)成災(zāi),對辣椒生產(chǎn)影響極大。研究表明,辣椒對疫霉菌的抗性遺傳規(guī)律相當(dāng)復(fù)雜,既存在垂直抗病性,也存在水平抗病性。Lefebvre和Palloix(1996)利用‘Perennial×Yolo Wonder’DH群體,得到13個與抗疫病基因相關(guān)的QTLs,主效QTLs能解釋表型變異的41%~55%,具有上位和加性作用的中等效應(yīng)QTLs,可以解釋表型變異的17%~28%,加上QTL之間的互作,QTLs的聯(lián)合效應(yīng)能解釋表型變異的90%。Thabuis等(2003)在CM334、Van和Perennial 3個辣椒種內(nèi)群體進行抗疫病QTLs分析,將主效QTL定位在P5上,將只存在于Van和Perennial群體中的QTL定位在P10上[1]。易圖永等(2007)通過F2群體將與辣椒抗疫病感受性有關(guān)的QTLs定位在第5條連鎖群上,與誘導(dǎo)性有關(guān)的QTLs分別定位在第1、第2、第5和第8條連鎖群上,與穩(wěn)定性有關(guān)的QTLs定位在第1、第2、第5和第7條連鎖群上,各QTLs可解釋表型變異率在64%以上[9]。同時,安靜等(2007)在第4連鎖群上檢測到2個與辣椒疫病相關(guān)QTLs,分別可以解釋表型變異的9.5%和16.4%[10]。
目前辣椒白粉病多以有性世代的病原菌命名,為韃靼內(nèi)絲白粉菌(Leveillula taurica),屬子囊菌亞門內(nèi)絲白粉菌屬。研究表明,辣椒對白粉病的遺傳規(guī)律較為復(fù)雜。Lefebvre等(2003)通過田間和人工接種方式進行兩種條件下的抗性鑒定試驗,對‘H3ⅹVania’的101個DH株系進行抗白粉病QTL分析,在6條染色體(P2、P5、P6、P9、P10、P12)上共檢測到7個QTLs,即5個加性QTLs和2個上位互作QTLs,有2個QTLs在人工和田間接種條件下都可檢測到。5個加性QTLs在大田接種條件下,能解釋表型變異的18.0%~37.7%;在人工接種條件下,能解釋表型變異的62.5%。加性和上位互作QTLs能解釋表型變異的50%以上[1]。
根結(jié)線蟲(Meloidogyne spp.)是當(dāng)前中國最重要的農(nóng)作物病原線蟲之一,寄主范圍很廣,超過3000種植物。根結(jié)線蟲主要包括南方根結(jié)線蟲、花生根結(jié)線蟲、爪哇根結(jié)線蟲及北方根結(jié)線蟲,其中以南方根結(jié)線蟲危害最重。1956年,Hare首次發(fā)現(xiàn)了辣椒單顯性抗線蟲基因N。目前,在辣椒上已發(fā)現(xiàn)并且命名的抗線蟲基因有10個(N、Me1、Me2、Me3、Me4、Me5、Me7、Mech1、Mech2、Cami),其中Me3與Me4連鎖,Me7與Mech1連鎖。Djian-Caporalino等(2001)通過RAPD、AFLP技術(shù)和DH群體構(gòu)建了辣椒抗線蟲基因Me3和Me4的高分辨率遺傳圖譜,發(fā)現(xiàn)2個與Me3基因能分離的AFLP標(biāo)記,與最近標(biāo)記的遺傳圖距為0.5、1.0、1.5和3.0 cm;2007年,Djian-Caporalino等進一步進將Me基因家族定位在P9上[11]。Wang等(2009)獲得1個與N基因緊密連鎖的SCAR標(biāo)記,遺傳圖距為6.3 cm[12]。
綜上所述,在辣椒抗病蟲基因分子標(biāo)記研究方面,人們已取得了重要進展,但是應(yīng)用于抗病育種的研究卻很少。這可能在于目前開發(fā)的辣椒抗病分子標(biāo)記多為AFLP和RAPD標(biāo)記,像SSR、CAPS、SNP等操作簡單,穩(wěn)定性好的標(biāo)記還很少。但是有理由相信,隨著分子標(biāo)記技術(shù)的不斷發(fā)展完善,更多抗病基因?qū)⒌靡远ㄎ?,勢必促進辣椒分子標(biāo)記輔助選擇育種技術(shù)的發(fā)展,從而使辣椒的品種改良朝著育種工作者設(shè)計的方向發(fā)展。
[1]王立浩,張寶璽,杜永臣,等.辣椒基因遺傳定位及分子遺傳圖譜的研究進展[J].園藝學(xué)報,2005,32(6):1147-1154.
[2]Boukema I W.Resistance to TMV in Capsicum chacoense Hunz.is governed by an allele of the L-locus[J].Capsicum Newsl,1982,3:47-48.
[3]Sawada H,Takeuchi S,Matsumoto K,et al.A new tobamovirus-resistance gene,Hk,in Capsicum annuum.[J].Journal of the Japanese Society for Horticultural Science,2005,74:289-294.
[4]Sugita T,Kinoshita T,Kawano T,et al.Rapid construction of a linkage map using high-efficiency genome scanning/AFLP and RAPD,based on an intraspecific,doubled-haploid population of Capsicum annuum[J].Breeding Science,2005,55(3):287-295.
[5]Tomita R,Murai J,Miura Y,et al.Fine mapping and DNA fiber FISH analysis locates the tobamovirus resistance gene L 3 of Capsicum chinense in a 400-kb region of R-like genes cluster embedded in highly repetitive sequences[J].Theor Appl Genet,2008,117(7):1107-1118.
[6]Kim H J,Han J,Yoo J H,et al.Development of a Sequence Characteristic Amplified Region Marker linked to the L4Locus Conferring Broad Spectrum Resistance to Tobamoviruses in Pepper Plants[J].Molecules and cells,2008,25(2):205-210.
[7]方榮,陳學(xué)軍,繆南生,等.辣椒(Capsicum spp.)QTL定位研究進展[J].江西農(nóng)業(yè)學(xué)報,2005,17(3):68-73.
[8]Arnedo-Andrés M S,Gil-Ortega R,Luis-Arteaga M,et al.Development of RAPD and SCAR markers linked to the Pvr4 locus for resistance to PVY in pepper(Capsicum annuum L.)[J].Theor Appl Genet,2002,105(6):1067-1074.
[9]易圖永,謝丙炎,張寶璽,等.辣椒抗疫病性狀遺傳及其相關(guān)AFLP標(biāo)記分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,2007,15(5):847-854.
[10]安靜,胡勇勝,張寶璽,等.辣椒分子連鎖遺傳圖譜的構(gòu)建及抗疫病QTL定位[J].中國蔬菜,2007,(10):9-12.
[11]顧曉慧,王立浩,毛勝利,等.辣椒根結(jié)線蟲防治與抗性育種研究進展[J].中國蔬菜,2006,(5):33-36.
[12]Wang L H,Gu X H,Hua M Y.A SCAR marker linked to the N gene for resistance to root knot nematodes(Meloidogyne spp.)in pepper(Capsicum annuum L.)[J].Scientia Horticulturae,2009,122:318-322.