2006年，因懷疑“活力門”公司存在嚴(yán)重違犯證券法的行為，社長堀江貴文被捕入獄成為階下囚。日本“活力門”公司創(chuàng)立于1996年，34歲的公司總裁堀江貴文實(shí)施的一系列并購活動(dòng)以及反傳統(tǒng)的經(jīng)營模式，使公司在短時(shí)間內(nèi)迅速成長為日本著名網(wǎng)絡(luò)門戶。2004年10月，公司曾宣布要通過換股把一家名為“金錢生活”的出版公司收歸旗下。

2006年2月都靈冬奧會(huì)期間，小澤一郎就任民主黨黨魁、小泉首相參拜靖國神社。9月，秋荻宮妃生子，安倍內(nèi)閣啟動(dòng)運(yùn)行。10月，朝鮮核試驗(yàn)；日本出現(xiàn)高中必修課程遺漏問題。11月，教育基本法修正案在眾議院被執(zhí)政黨強(qiáng)行通過。小泉與安倍的交接過程中，問題逐出，日本出版業(yè)伴隨上述社會(huì)政治活動(dòng)呈現(xiàn)出一個(gè)繁復(fù)多事之年。

日本出版科研所調(diào)查統(tǒng)計(jì)表明，日本全國1～10月書刊銷售總額比2005年同期減少2.4%。其中，圖書增加1.4%，雜志卻大幅減少4.7%。依據(jù)這一數(shù)據(jù)，可以推定，日本2006年書刊銷售總額負(fù)增長已成定局。

2006年5月17日，日文版哈利·波特第六卷《哈利·波特與混血王子（上·下）》初版印數(shù)200萬冊，這部超級(jí)暢銷圖書的發(fā)行，助推2006年日本圖書銷售總額逆勢而上已成為不爭的事實(shí)。2006年，長期堅(jiān)守刊高書低信條的日本出版發(fā)行業(yè)呈現(xiàn)出雜志每況愈下之頹勢。2006年日本出版界依然恪守新書主義，試圖通過增加新書種數(shù)力挽經(jīng)營困境。然而是年圖書銷售總額負(fù)增長的事實(shí)表明新書主義遭遇重創(chuàng)。

日書聯(lián)（日本書店商業(yè)組合聯(lián)合會(huì)）出臺(tái)2006年《日本全國零售書店經(jīng)營實(shí)態(tài)報(bào)告》，調(diào)查報(bào)告每6年進(jìn)行一次。報(bào)告表明日本中小書店經(jīng)營狀況日趨惡化，如果不能增加中小書店經(jīng)營活力，日本出版業(yè)將難以復(fù)蘇。報(bào)告并未指出日本出版業(yè)不景氣最主要癥結(jié)，而是將出版業(yè)實(shí)態(tài)和盤托出。

2006年日本網(wǎng)上書店動(dòng)向?yàn)槿瞬毮?，亞馬遜日本網(wǎng)上書店業(yè)務(wù)擴(kuò)展、銷售總量增幅明顯，但具體數(shù)額尚不明朗。中小出版社競相與亞馬遜日本網(wǎng)上書店聯(lián)手，今后亞馬遜日本網(wǎng)上書店市場占有率增長趨勢為人矚目。

2006年日本多家出版社參與新書（大眾通俗教養(yǎng)類普及開本圖書）選題策劃，新書種類與年俱增，每月定期出版系列分冊，與雜志發(fā)行定期趨同。日本出版業(yè)人士認(rèn)為，雜志競相發(fā)行特輯，實(shí)際上也是仿效新書出版。雜志發(fā)行頹勢在一定程度上受到新書出版過剩的影響。新書出版的多樣化，事實(shí)上卻逐漸流于陳腐化。2006年，日本新書出版過剩難以遏制，出現(xiàn)滯銷新書堆積如山，視而不見的怪圈。

2006年，日本涌現(xiàn)三種百萬暢銷圖書：《國家的品格》（藤原正彥著）、《哈利·波特與混血王子（上下）》（J·K·羅琳著）和《東京塔－母親和我和父親》（利黎·布朗基著）。2006年十大暢銷圖書中實(shí)用書與教養(yǎng)書顯得格外暢銷。2006年文藝圖書仍以芥川直木文學(xué)獎(jiǎng)獲獎(jiǎng)作為賣點(diǎn)。特別是第134屆直木文學(xué)獎(jiǎng)獲獎(jiǎng)作品——《嫌疑人Ｘ的獻(xiàn)身》（東野圭吾著）連續(xù)數(shù)周問鼎暢銷圖書排行榜榜首。

2006年日本自費(fèi)出版持續(xù)熱潮，不斷涌現(xiàn)新的優(yōu)秀寫手。隨著自費(fèi)出版名社碧天舍的破產(chǎn)，突現(xiàn)自費(fèi)出版的諸多問題，引起業(yè)內(nèi)人士的關(guān)注。

2006年，日本文藝家協(xié)會(huì)等團(tuán)體就圖書館圖書出借后，應(yīng)給予著者補(bǔ)償金問題遞交日本文化廳《共同聲明》。聲明指出，目前，英、德等十國支持認(rèn)可“公共出借權(quán)”給予著者經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償，英國財(cái)政年撥款約折合15億日元。2006年12月，日本出版業(yè)基本確立補(bǔ)償金的方針。

2006年，日本出版界繼續(xù)試驗(yàn)圖書IC芯片貨簽無線視頻系統(tǒng)數(shù)據(jù)交換與讀寫。

2006年，公取委與出版物零售業(yè)公正交易協(xié)議會(huì)制定落實(shí)針對(duì)出版物零售業(yè)提供獎(jiǎng)券的公正競爭規(guī)則以及共同實(shí)施規(guī)則，同時(shí)積極推進(jìn)讀者圖書優(yōu)惠積分卡的使用進(jìn)程。