lication of MRI radiomics predictive model in grading non-enhancing adult diffuse gliomas
LIUYanhongl,ANGYhnl2,HEZelong,WANGngxiao2,UJiayi3,ZHANGXuemeng2,LUJalin,NGul 1ChinesePLAMedicalScholBeijing853,hina;DepartmentfdiologyFirstMedicalCenterfineseGeel Hospital,Beijingo5,hina;DepartmentofRadiologyForthMedicalCenterofhinesePLAGeneralHospital,eijing 100048,China;eparmntofurosugeryrstdicalnterofnseealspialeiinga [Abstract]Objective:Toevaluate thevalueof preoperative MRIradiomicsmodelsingradingnon-enhancingadultdifuse gliomas.Methods:Aretrospectiveanalysisof153patients(16Olesions)withadultdifusegliomaswasconstructed.Al lesionshadnoenhancementonTWIcontrast-enhancement(TWI-CE)image.Amongthe16Olesions,103lesionswere clasifiedintothelow-gradegliomagroupand57lesionsinthehigh-gradegliomagroup,thenrandomlydivided into the trainingset(128lesions)andthevalidationset(32lesions)ataratioof8:2.TWIandADCimageswereco-registered with T 1 WI-CEimages,andROIsweredelineatedonTWIiamges.Atotalof1132featureswereextractedformTWI, TIWI-CEandADCimages,comprisingshape,first-orderhistogram,second-ordertextureandwaveletfeatures.Thefeatureswith stability(ICCgt;085)wereretained,andtheoptimalfeaturesubsetwasselectedviaelasticnetworkregression(ENR)comined withrecursivefeaturelimination(RFE).Sixmachineleaningclasifiersereadoptedtoconstructthemodel,includinglogistic regresion,upportctorahine(adialsisuconerel,arel),K-eresteighor(K)isioee,ive Bayes.The predictiveperformanceofthemodelswasevaluatedusingtheAUC,accuracysensivity,specificityandFl-score. Results:Radiomicsmodelsefectivelypredictedhigh-gradeglioma.Themultiparametricmodel(TWI+TWI-CE+ADC)with KNNclasifierachievedAUCsof0.892and0.805,accuraciesof0805and0.719,sensitivitiesof0.915ad0.800,speciicties of 0.753and0.727,F(xiàn)1-scoresof 0.782and 0.506in the training set and thevalidationset.Conclusion : Preoperative MRI radiomicsmodelsenableaccurategradingofnon-enhancingadultdifusegliomas,oferingcriticalsupportforclinical decision-making and patient management.
[Key words] Difuse glioma;High-grade glioma;Magnetic resonance imaging;Radiomics;Machine learning
腦膠質(zhì)瘤是中樞神經(jīng)系統(tǒng)最常見的原發(fā)性腫瘤,約占原發(fā)惡性腦腫瘤的 80%[1] 。根據(jù)2021年WHO的中樞神經(jīng)系統(tǒng)分類標(biāo)準(zhǔn),其分級基于分子遺傳特征和組織學(xué)表現(xiàn)[2]。高級別膠質(zhì)瘤(WHO 3、
4級)侵襲性強、預(yù)后差,需最大范圍安全切除,因此術(shù)前精準(zhǔn)分級至關(guān)重要[3-4]。MRI是膠質(zhì)瘤術(shù)前評估的常規(guī)檢查手段,但其更傾向于將非增強膠質(zhì)瘤診斷為低級別膠質(zhì)瘤。而 8%~18% 的非增強膠質(zhì)瘤為高級別膠質(zhì)瘤,傳統(tǒng)影像評估存在誤判風(fēng)險,易導(dǎo)致治療延誤或術(shù)式選擇不當(dāng),影響預(yù)后[5]。本研究基于術(shù)前非增強膠質(zhì)瘤的MRI圖像,結(jié)合影像組學(xué)構(gòu)建模型,預(yù)測非增強膠質(zhì)瘤的分級,為臨床決策提供支持。
1資料與方法
1.1一般資料
回顧性收集2016年1月至2023年12月在中國人民解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學(xué)中心初診為成人彌漫性膠質(zhì)瘤且未經(jīng)過相關(guān)治療的患者153例(160個病灶),其中男91例,女62例;年齡 20~77 歲,平均 (41.98±11.47) 歲。160個病灶中,低級別膠質(zhì)瘤103個(低級別組),高級別膠質(zhì)瘤57個(高級別組)。將病灶按8:2比例隨機劃分為訓(xùn)練集128個和驗證集32個。
納入標(biāo)準(zhǔn): ① 年齡 ≥18 歲; ② 術(shù)前MRI資料完整,包括 T2WI,T2 FLAIR .T1WI 增強掃描和ADC圖; ③ 術(shù)前 T1WI 增強掃描圖像顯示為非增強膠質(zhì)瘤,即腫瘤內(nèi)增強部分體積 ?1cm3[6] 。排除標(biāo)準(zhǔn): ① 病理診斷未明確級別; ② 根據(jù)2021年WH0分類標(biāo)準(zhǔn)被判定為未分類(NOS)或未評估(NEC); ③ 圖像質(zhì)量不滿足診斷要求。
本研究經(jīng)中國人民解放軍總醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)(批號:2021-006-01)。
1.2儀器與方法
采用GE Discovery MR750 3.0 T MRI掃描儀、32通道頭部線圈。掃描序列及參數(shù):軸位 T2WI ,TR5642ms ,TE 93ms ,視野 24cm×24cm ,矩陣 512× 512,層厚 5.5mm ,層距 1.5mm ;軸位 T1WI 增強掃描,TR 1743ms ,TE 27ms ,視野 24cm× 24cm ,矩陣 320×324 ,層厚 5.5mm ,層距 1.5mm ; DWI,TR 3000ms ,TE67.6ms ,視野 24cm×24cm ,矩陣160×160 ,層厚 6mm ,層距 1.5mm ,b值取 1000s/mm2 ;ADC圖在GEAW4.6工作站自動生成。
1.3 圖像分析
由1位具有3年工作經(jīng)驗的影像醫(yī)師觀察MRI圖像上病灶的長徑、短T2 錯配征、部位和水腫程度。其中占位效應(yīng)分級基于腦室及中線結(jié)構(gòu)受壓程度判定:0級,無占位效應(yīng);1級,局部腦溝/腦池受壓,但腦室及中線結(jié)構(gòu)形態(tài)正常;2級,腦室受壓變形,但中線無移位;3級,腦室受壓伴中線向?qū)?cè)移位 ?1cm ;4級,中線移位 gt; 1cm[7] 。腦水腫程度判定:輕度,水腫寬度 ?2cm ;中度,水腫寬度 gt;2cm ,但未超過同側(cè)大腦半球1/2區(qū)域;重度,水腫范圍超過同側(cè)大腦半球1/2區(qū)域。
1.4影像組學(xué)分析
1.4.1MRI圖像預(yù)處理和腫瘤分割圖像由DICOM格式轉(zhuǎn)換為NIFTI格式后,依次行N4偏置場校正和歸一化處理?;贛ATLAB軟件的SPM插件(https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm),將 T2WI 和ADC圖像配準(zhǔn)至對應(yīng)的 T1WI 增強掃描圖像上。雙盲條件下,由1位具有3年工作經(jīng)驗的影像醫(yī)師使用ITK-SNAP(版本4.0.1)軟件,在軸位 T2WI 圖像上手動勾畫全腫瘤區(qū)域ROI,包括鈣化、出血、囊變及壞死區(qū)域,但不包含瘤周水腫區(qū)域(圖1)。為準(zhǔn)確區(qū)分瘤周水腫和腫瘤,勾畫時參考 T2 FLAIR 和 T1WI 增強掃描圖像。為評估影像組學(xué)特征的可重復(fù)性,隨機抽取 30% 病灶,由同一位影像醫(yī)師在1個月后再次勾畫ROI。
1.4.2特征提取及篩選使用Python(版本3.9.0)中的Pyradiomics工具包提取影像組學(xué)特征,每個序列共提取1132個影像組學(xué)特征,包括形狀特征(14個)、一階直方圖特征(18個)、二階紋理特征(68個)和小波特征(1032個)。通過ICC行組間一致性分析,篩選出 ICC?0.85 的特征。采用彈性網(wǎng)絡(luò)回歸算法結(jié)合遞歸特征消除算法,計算最優(yōu)特征數(shù)量。最終,根據(jù)最優(yōu)特征子集的數(shù)量和特征權(quán)重排序,確定最具分級診斷價值的組學(xué)特征。
1.4.3模型建立及驗證采用邏輯回歸(logisticregression,LR)支持向量機(support vectormachine,SVM)、K-最近鄰(K-nearestneighbor,KNN)、決策樹(decision tree,DT)和樸素貝葉斯(naive Bayes,徑、壞死、囊變、占位效應(yīng)、邊緣清晰、圖1 增強掃描圖像上ROI勾畫示意圖
NB)進行模型構(gòu)建,其中SVM分類器包括徑向基函數(shù)核(SVMrbf)和線性核(SVMlinear)2種。 T1WI 增強掃描、ADC序列獨立或組合生成7個影像特征組:單序列 (T2WI,T1WI 增強掃描、ADC)、雙序列 ΔT2WI+T1WI 增強掃描、 Ω,T2WI+ADC,T1WI 增強掃描 +. ADC)、三序列 (T2WI+T1WI 增強掃描 +ADC )。7個影像特征組在6種分類器中進行訓(xùn)練和驗證,共建立42種模型,通過對比不同分類器和特征組的分類性能,篩選出診斷效能最佳的模型及影像特征組,以實現(xiàn)膠質(zhì)瘤術(shù)前分級的精確預(yù)測。
1.5 統(tǒng)計學(xué)分析
使用SPSS26.0軟件和R軟件(版本4.1.0)分析數(shù)據(jù)。計量資料以 表示,組間比較行獨立樣本χt 檢驗;計數(shù)資料以例 (%) 表示,組間比較行 χ2 檢驗。采用AUC、準(zhǔn)確率、敏感度、特異度和F1分數(shù)評估模型的預(yù)測效能。以 Plt;0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2結(jié)果
2.12組MRI特征比較
2組病灶長徑、短徑、壞死、囊變、占位效應(yīng)、邊緣 清晰、 T2 錯配征、部位、水腫程度差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均 Pgt;0.05 )(表1,圖2)。
表1低級別與高級別成人彌漫性膠質(zhì)瘤的MRI特征比較
圖2非增強成人彌漫性膠質(zhì)瘤的MRI圖像注:圖 2a~2c 為高級別膠質(zhì)瘤圖像,患者,女,29歲;圖2a為 T2WI 圖像,示右側(cè)額葉高信號病灶伴輕度瘤周水腫;圖2b為 T1WI 增強掃描圖像,示病灶無明顯強化;圖2c為ADC圖,病灶呈高信號。圖 2d~2f 為低級別膠質(zhì)瘤圖像,患者,女,23歲;圖2d為TWI圖像,示左側(cè)頂葉高信號病灶伴輕度瘤周水腫;圖2e為 T1WI 增強掃描圖像,示病灶無明顯強化;圖2f為ADC圖,病灶呈高信號
2.2影像組學(xué)特征篩選結(jié)果
經(jīng)一致性分析,篩選 ICC?0.85 的特征,利用遞歸 特征消除算法去除冗余特征,確定最佳特征數(shù)量,其 中 T1WI 增強掃描序列2個,ADC序列6個, T2WI 序列 3個, T2WI+T1WI 增強掃描序列3個, T2WI+ADC 序列 2個, T1WI 增強掃描 + ADC序列5個, T2WI+T1WI 增強 掃描 + ADC序列7個。
2.3模型的診斷效能評估
單序列組中 T1WI 增強掃描影像組學(xué)特征KNN模型效能最高,訓(xùn)練集及驗證集AUC分別為0.874、0.864;雙序列組中基于 T2WI+T1WI 增強掃描特征的KNN模型效能最高,訓(xùn)練集及驗證集AUC分別為0.887、0.839;三序列組中KNN模型效能最高,訓(xùn)練集及驗證集AUC分別為0.892、0.805(表2)。
表27個影像特征組中效能最佳的影像組學(xué)模型在訓(xùn)練集和驗證集中的診斷效能
注:KNN為K-最近鄰,DT為決策樹。
3討論
高級別成人彌漫性膠質(zhì)瘤術(shù)前MRI常表現(xiàn)為花環(huán)樣不均勻強化、周圍水腫及壞死等特征,但有 8%~ 18% 病灶術(shù)前未見明顯強化,呈低級別膠質(zhì)瘤外觀,為診斷帶來挑戰(zhàn)[5]。高、低級別膠質(zhì)瘤在手術(shù)切除范圍及預(yù)后管理上存在顯著差異,因此,準(zhǔn)確診斷對臨床制訂個性化方案至關(guān)重要。本研究應(yīng)用機器學(xué)習(xí)方法開發(fā)了一種基于術(shù)前MRI的無創(chuàng)診斷非增強高級別成人彌漫性膠質(zhì)瘤的影像組學(xué)模型,發(fā)現(xiàn)各模型均具有較好的診斷效能。
研究表明,對比增強圖像中的強化常被視為腫瘤侵襲性的影像學(xué)特征,與預(yù)后較差相關(guān)[8]。對比增強在惡性腫瘤中常被解釋為微血管增生和血-腦脊液屏障通透性增加,使得對比劑更易滲入腫瘤組織。既往研究顯示,對比增強是預(yù)測異檸檬酸脫氫酶(isocitratedehydrogenase,IDH)野生型膠質(zhì)瘤的可靠影像學(xué)特征,但非增強并不是IDH突變型膠質(zhì)瘤的有效預(yù)測指標(biāo)[9-10]。另一項研究顯示,所有非增強膠質(zhì)瘤均為IDH突變型,其用于判斷IDH1突變狀態(tài)的準(zhǔn)確率高達 97.5%[11] 。這一差異可能與不同版本的WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)分類對膠質(zhì)瘤分級標(biāo)準(zhǔn)的不同有關(guān)。自2016年WH0分類更新后,分子基因首次被納人膠質(zhì)瘤分級標(biāo)準(zhǔn),膠質(zhì)瘤的高級別判定不再僅依賴于組織學(xué)改變2,這擴大了高級別膠質(zhì)瘤的定義范圍。
人工智能作為計算機科學(xué)的一個新興分支,借助復(fù)雜的算法和訓(xùn)練模型,可從大量影像數(shù)據(jù)中集中挖掘隱藏信息,實現(xiàn)精準(zhǔn)診斷及對生存與治療反應(yīng)的預(yù)測。目前,多項研究表明影像組學(xué)在術(shù)前預(yù)測膠質(zhì)瘤分級方面具有重要潛力[12]。van der Voort等[13]開發(fā)了一種自動分割腫瘤區(qū)域并預(yù)測膠質(zhì)瘤分級的模型,其在獨立測試集中的AUC達0.81,并在IDH和 IpI9q 缺失狀態(tài)的預(yù)測上表現(xiàn)出良好的性能。Cheng等[14]基于多參數(shù)MRI及影像組學(xué)建立了術(shù)前預(yù)測膠質(zhì)瘤分級的模型,該模型在使用腫瘤內(nèi)特征、瘤周特征和融合特征時均表現(xiàn)出優(yōu)異效能,AUC達0.975。然而,目前尚缺乏針對非增強膠質(zhì)瘤術(shù)前分級的研究報道。
影像組學(xué)特征通過定量分析腫瘤強度、紋理等圖像參數(shù),可表征組織異質(zhì)性和微環(huán)境特征[15-16]本研究中多序列組篩選的7個關(guān)鍵特征中,3個一階特征反映了腫瘤組織內(nèi)像素強度的分布特征,可能與腫瘤的異質(zhì)性相關(guān);4個紋理特征則通過量化影像中灰度值的空間分布和紋理信息,反映腫瘤組織的異質(zhì)性和微觀結(jié)構(gòu)[16-17]。其中ADC的 90% 百分位數(shù)及 T1WI 增強掃描的偏度特征反映了高級別膠質(zhì)瘤的典型病理改變—高細胞密度及微血管增生[18-20],這從生物學(xué)機制層面解釋了模型的分級鑒別能力。KNN是一種基于實例的監(jiān)督學(xué)習(xí)算法,用于分類和回歸任務(wù),具有算法簡單、高效、適合小數(shù)據(jù)集等優(yōu)點。既往研究表明,KNN在腫瘤類型鑒別、基因分子改變預(yù)測、腫瘤級別與復(fù)發(fā)判斷,以及預(yù)后評估方面的表現(xiàn)優(yōu)于其他模型[21-24]
本研究具有以下局限性:僅分析臨床常用的T2WI,T1WI 增強掃描和ADC序列,今后可考慮采用更先進的MRI技術(shù),如DTI和MRS;使用6種機器學(xué)習(xí)方法(SVMrbf、SVMlinear、LR、KNN、DT和NB)構(gòu)建最佳模型,未來可探索更多機器學(xué)習(xí)方法,如深度學(xué)習(xí)和集成學(xué)習(xí)方法,進一步優(yōu)化MRI影像組學(xué)模型;樣本來源于單中心,后續(xù)擬開展多中心研究,并擴大樣本量,進一步提高預(yù)測模型的穩(wěn)健性和普適性。
綜上所述,基于術(shù)前常規(guī)MRI圖像的影像組學(xué)結(jié)合KNN模型能非侵入性地鑒別診斷非增強高級別成人彌漫性膠質(zhì)瘤,為患者的個性化診療和預(yù)后管理提供重要依據(jù)。
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(收稿日期 2024-11-26)
中國中西醫(yī)結(jié)合影像學(xué)雜志2025年4期