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        蓮霧調(diào)控開花基因SsSOC1 的克隆及表達(dá)分析

        2025-03-28 00:00:00楊胤延孫東宇蔡昕成胡志群吳國(guó)麟周碧燕
        熱帶作物學(xué)報(bào) 2025年3期
        關(guān)鍵詞:蓮霧基因克隆成花

        摘 要:SOC1(SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS 1)是植物中的一個(gè)開花時(shí)間調(diào)節(jié)因子,屬于MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)向生殖生長(zhǎng)的轉(zhuǎn)變中發(fā)揮關(guān)鍵作用。SOC1 參與多種生物過程,包括花器官發(fā)育、開花時(shí)間控制以及對(duì)環(huán)境刺激和激素信號(hào)的響應(yīng)。本研究通過遮蔭和噴施樂斯本的方式對(duì)蓮霧進(jìn)行催花處理,統(tǒng)計(jì)處理后的葉芽和花芽數(shù)量以及成花枝率,同時(shí),利用課題組現(xiàn)有的蓮霧轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,篩選出調(diào)控蓮霧開花的候選基因SsSOC1,并通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR 技術(shù)研究遮蔭處理和噴施樂斯本藥劑處理下蓮霧不同時(shí)期和組織中SsSOC1 表達(dá)量的差異。結(jié)果顯示:經(jīng)過遮蔭處理的蓮霧樹體芽點(diǎn)、葉片、葉尖以及葉柄中的SsSOC1 基因表達(dá)量顯著增加,其中葉尖的相對(duì)表達(dá)量最高。本研究成功克隆了蓮霧黑糖芭比品種的SsSOC1 基因,并利用生物信息學(xué)方法對(duì)其進(jìn)行啟動(dòng)子分析、蛋白理化性質(zhì)分析、保守功能域的預(yù)測(cè)和序列比對(duì)。結(jié)果表明:SsSOC1 基因的開放閱讀框長(zhǎng)度為654 bp,共編碼217 個(gè)氨基酸,其編碼蛋白的理論等電點(diǎn)為9.37,分子式為C1076H1794N322O334S10,分子量為24.91 kDa,帶正電荷氨基酸殘基總數(shù)(Lys+Arg)為40,帶負(fù)電荷氨基酸殘基總數(shù)(Asp+Glu)為32,脂肪系數(shù)為80.64,總平均親水性系數(shù)(GRAVY)為–0.729,不穩(wěn)定系數(shù)為66.17;蓮霧SsSOC1 蛋白結(jié)構(gòu)不含β-折疊,不屬于分泌蛋白與膜結(jié)構(gòu)蛋白,亞細(xì)胞定位顯示其主要存在于細(xì)胞核中,屬于不穩(wěn)定的親水性堿性蛋白,該蛋白具有MADS_MEF2_like 和K-Box保守結(jié)構(gòu)域,同時(shí)隸屬于MADS 超級(jí)家族和K-Box 超級(jí)家族,該結(jié)構(gòu)域的起止氨基酸位點(diǎn)為第3~75 位和第88~171 位,符合MADS 蛋白家族與K-Box 家族的典型結(jié)構(gòu)特征;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示,蓮霧SsSOC1 序列與油葉蒲桃的同源性最高;通過花序侵染法將SsSOC1 基因轉(zhuǎn)化擬南芥,發(fā)現(xiàn)35S::SsSOC1 表現(xiàn)出早花表型,蓮座葉數(shù)量比野生型要少。本研究初步確定了SsSOC1 基因在成花方面的重要作用,并揭示蓮霧遮蔭與成花相關(guān)的內(nèi)在調(diào)控機(jī)理,為蓮霧生產(chǎn)提供指導(dǎo)意義,以及為蓮霧反季節(jié)栽培技術(shù)改良提供理論依據(jù)。

        關(guān)鍵詞:蓮霧;成花;SsSOC1;基因克??;轉(zhuǎn)錄活性分析;表達(dá)模式分析

        中圖分類號(hào):S432.1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        蓮霧[Syzygium samarangense (BI.) Merr.etPerry]是桃金娘科蒲桃屬常綠果樹,又名洋蒲桃,被譽(yù)為“水果皇帝”,以其清甜的口味和高水分含量而深受東南亞地區(qū)消費(fèi)者的喜愛[1]。蓮霧最先被引進(jìn)我國(guó)臺(tái)灣,目前在廣東、廣西、福建等地大規(guī)模種植[2]。蓮霧具有一年多次開花結(jié)果的特點(diǎn),但主要開花結(jié)果時(shí)期在夏季。南方夏季高溫多雨,容易遭受到病蟲害的侵襲,導(dǎo)致果實(shí)品質(zhì)參差不齊,而且夏季水果大量上市,價(jià)格不具優(yōu)勢(shì),因此科研人員對(duì)蓮霧的產(chǎn)期調(diào)節(jié)技術(shù)開展了較多研究[3]。

        對(duì)于大多數(shù)植物而言,遮蔭會(huì)導(dǎo)致光線不足,限制植株的生長(zhǎng)和發(fā)育,導(dǎo)致徒長(zhǎng)和過度的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng),從而引起營(yíng)養(yǎng)器官與生殖器官之間的競(jìng)爭(zhēng),不利于開花。然而,對(duì)于蓮霧來說,遮蔭處理卻具有促進(jìn)開花的作用[4]。遮蔭處理可以使蓮霧的葉芽和花芽進(jìn)入休眠狀態(tài),控制新梢的生長(zhǎng)抽生,減少整個(gè)樹體養(yǎng)分的消耗,提高蓮霧的開花率[5]。早期的研究者對(duì)蓮霧的印度紅品種進(jìn)行了產(chǎn)期調(diào)控實(shí)驗(yàn)[6],通過噴施蓮霧促花靈、多效唑和催花劑,結(jié)合環(huán)剝、遮蔭、斷根等措施,實(shí)現(xiàn)了印度紅蓮霧反季節(jié)開花,并獲得了比正造果更好的品質(zhì)和更高的經(jīng)濟(jì)效益。研究發(fā)現(xiàn),樂斯本可以促進(jìn)蓮霧提前開花,但其促進(jìn)蓮霧開花的機(jī)制并未明晰。最近,一些學(xué)者開始對(duì)蓮霧的基因組學(xué)進(jìn)行研究,挖掘與蓮霧生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的基因,但這些基因大多數(shù)與蓮霧果實(shí)成熟相關(guān)[7-8],有關(guān)蓮霧開花相關(guān)基因的研究報(bào)道較少。

        SOC1(SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSIONOF CONSTANS 1)及其同源基因編碼MADS-box家族轉(zhuǎn)錄因子[9],影響植物的成花過程。SOC1 通常作為生殖階段轉(zhuǎn)換的潛在標(biāo)記基因[10],在擬南芥中,AtSOC1 過表達(dá)的植株表現(xiàn)出早花的現(xiàn)象,并且相較于野生型植株,AtSOC1 過表達(dá)的植株蓮座葉數(shù)量較少,表明SOC1 在調(diào)控?cái)M南芥開花中起重要作用。SOC1 通過多種途徑促進(jìn)植物開花[11],它整合來自長(zhǎng)日照、自主和春化途徑的多種開花信號(hào)并參與花發(fā)育[12-13]。此外,它還整合了來自植物年齡和赤霉素的開花信號(hào)[14],是植物開花信號(hào)的重要整合子。在光周期途徑中,CO(CONSTANS)并不直接作用于SOC1,而是激活FT(FLOWERING LOCUS T)后再調(diào)控SOC1[15]。

        研究發(fā)現(xiàn),即使關(guān)閉FT 與SOC1 之間的作用通路,赤霉素途徑仍能激活SOC1[16]。目前對(duì)于蓮霧SOC1 基因的功能分析未見報(bào)道。為此,本研究開展SsSOC1 基因的功能分析,為進(jìn)一步研究SsSOC1 在蓮霧成花等方面的功能提供理論依據(jù)和參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 植物材料

        供試材料為8 年生黑糖芭比蓮霧品種,采自廣州市天河區(qū)華南農(nóng)業(yè)大學(xué)果園(23°9?40?N,113°21?18?E)。轉(zhuǎn)基因?qū)嶒?yàn)用材料為哥倫比亞野生型擬南芥(Columbia-0)。

        1.1.2 菌株及載體

        植物雙元表達(dá)載體pGreenII-35S-C1 由高用順老師惠贈(zèng);pMD18-T 購自TaKaRa 公司;大腸桿菌菌株DH5α、根癌農(nóng)桿菌菌株GV3101 購自上海唯地生物技術(shù)有限公司購。

        1.1.3 主要試劑

        多糖多酚植物總RNA 提取試劑盒(RNA prep Pure)、植物基因組DNA 提取試劑盒(離心柱型)購自天根生化科技(北京)有限公司;RNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒[HiScript? II Q RTSuperMix for qPCR(+gDNA wiper)]、同源重組試劑盒(ClonExpress?Ⅱ One Step Cloning Kit)購自諾唯贊(南京)公司;qPCR 試劑(HieffUNICON? Power qPCR SYBR Green MasterMix)、菌落PCR 鑒定試劑(Hieff? PCR MasterMix)購自翌圣生物科技(上海)有限公司;PCR高保真酶(PrimeSTAR? Max DNA Polymerase)購自寶生生物工程(大連)有限公司;限制性內(nèi)切酶、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、氨芐青霉素(Amp)、卡那霉素(Kan)、利福平(Rif)、LB 培養(yǎng)基、Glufosinate Ammonium 10%Solution(Basta)購自生工生物工程(上海)股份有限公司。

        1.1.4 引物

        內(nèi)參基因選用β -actin 基因,使用Primer Premier 5.0(Premier 公司)軟件設(shè)計(jì)引物(表1),委托生工生物工程(上海)股份有限公司合成。qRT-PCR 采用LightCycler? 480 Real-Time PCR system 儀器(Roche, Basel, Switzerland)。熒光定量采用艾科瑞(湖南)生物的SYBRGreen Pro TagHS 預(yù)混型qPCR 試劑盒。

        1.2 方法

        1.2.1 遮蔭處理后蓮霧花芽、成花枝率及枝梢長(zhǎng)度的統(tǒng)計(jì)

        為了探究遮蔭處理對(duì)黑糖芭比蓮霧樹體成花的影響,分別記錄未經(jīng)遮蔭處理[對(duì)照組,光合有效外輻射( PARe ): (1448.9±41.3)μmol/(m2·s),0%遮蔭率]與經(jīng)過遮蔭處理[處理組,PARe:(145.2±12.1)μmol/(m2·s),90%遮蔭率]在解除遮蔭處理后21 d 時(shí)的花芽數(shù)、成花枝率(以成花枝的數(shù)量除蓮霧樹體總成熟枝數(shù))以及枝梢長(zhǎng)度。

        1.2.2 遮蔭對(duì)蓮霧SsSOC1 基因表達(dá)水平的影響分析

        在遮蔭期間,每隔3 d 采集1 次芽點(diǎn)(在對(duì)照組中為葉芽,處理組中為花芽)、葉片、葉尖以及葉柄。采集后的各個(gè)組織立即用液氮進(jìn)行冷凍處理,于–80 ℃冰箱保存,之后進(jìn)行RNA 提取再反轉(zhuǎn)錄為cDNA。利用qRT-PCR 技術(shù)進(jìn)行SsSOC1 基因不同組織的表達(dá)模式分析。反應(yīng)體系:cDNA 稀釋模板3 μL,Primer F(0.25 μmol/L)1 μL,Primer R(0.25 μmol/L)1 μL,SYBR GreenPCR Master mix 5 μL。反應(yīng)程序參照qPCR 試劑( Hieff UNICON? Power qPCR SYBR GreenMaster Mix)說明書。

        1.2.3 生物信息學(xué)分析 基于轉(zhuǎn)錄組篩選出合適的序列,在NCBI 數(shù)據(jù)庫使用ORF finder 工具找到最長(zhǎng)開放閱讀框(ORF),根據(jù)最長(zhǎng)ORF 區(qū)設(shè)計(jì)引物進(jìn)行克隆測(cè)序。利用在線工具(表2)對(duì)SsSOC1 進(jìn)行生物信息學(xué)分析。通過NCBI 數(shù)據(jù)庫的BLAST 功能篩選與SsSOC1 基因相似的不同于蓮霧的其他物種中的SOC1 基因,獲得其蛋白質(zhì)序列,利用MEGA 7.0 軟件中的NJ 法對(duì)其構(gòu)建進(jìn)化樹,其中boostrap 設(shè)置為1000,用以驗(yàn)證可信度。

        1.2.4 目的基因克隆及載體構(gòu)建

        使用多糖多酚植物總RNA 提取試劑盒提取蓮霧總RNA,得到RNA 樣品后,取1 μL 樣品使用Thermo scientificNanoDrop 2000 測(cè)定總RNA 濃度及純度。取2 μL樣品通過瓊脂糖凝膠電泳檢查RNA 的完整性和濃度。用RNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,用于基因擴(kuò)增。利用課題組現(xiàn)有的蓮霧轉(zhuǎn)錄組查找到SsSOC1 序列(Unigene0006265)后,于Primer Premier 5.0 軟件設(shè)計(jì)SsSOC1 的擴(kuò)增引物(SsSOC1-pMD18-T-F,SsSOC1-pMD18-T-R,表1)。以反轉(zhuǎn)錄后所得cDNA 為模板,PCR 擴(kuò)增SsSOC1 編碼區(qū)片段,反應(yīng)體系:2×PCR buffer forKOD FX 25 μL , 2 mmol/L dNTPs 10 μL ,10 pmol/μL 正/反引物各1.5 μL,Template cDNA1 μL,KOD FX(1.0 U/μL)1 μL,ddH2O 補(bǔ)充至50 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性2 min;98 ℃10 s,58 ℃ 30 s,68 ℃ 2 min,35 個(gè)循環(huán)。4 ℃保存。擴(kuò)增產(chǎn)物2 μL 經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)確定目的片段大小后,采用瓊脂糖凝膠回收試劑盒進(jìn)行回收。目的片段經(jīng)過回收后采用同源重組試劑盒與pMD18-T 載體連接,連接后均勻涂布于含100 mg/mL Amp 抗性的LB 固體培養(yǎng)基上,平板倒置,37 ℃培養(yǎng)12 h。使用無菌的槍頭將單個(gè)菌落挑至20 mL 滅菌水中混勻,37 ℃孵育30 min。取1 μL 作為PCR 模板,進(jìn)行菌液PCR 及電泳鑒定,將含有目的基因片段加入含100 mg/mL Amp的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃ 200 r/min 振蕩培養(yǎng)8 h 后,送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。測(cè)序驗(yàn)證后用質(zhì)粒提取試劑盒提取pMD18-T-SsSOC1 質(zhì)粒。以pMD18-T-SsSOC1 載體質(zhì)粒為模板,使用引物(SsSOC1-C1- F/SsSOC1-C1-R)對(duì)其進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,使用Hind III 和Xba I 限制性內(nèi)切酶對(duì)pGreen II-35S-C1 載體進(jìn)行酶切。以未酶切質(zhì)粒為對(duì)照采用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)。隨后進(jìn)行切膠回收。純化后的目的基因片段與線性化功能載體使用同源重組試劑盒將pGreenII-35S-C1 載體與SsSOC1 基因片段連接。反應(yīng)體系:SsSOC1 基因片段100 ng,pGreenII-35S-C1 線性化載體100 ng,5×CE II Buffer 4 μL,ddH2O 補(bǔ)充至20 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?7 ℃ 30 min,0 ℃ 5 min。隨后轉(zhuǎn)化至DH5α,挑取單克隆菌落進(jìn)行菌落PCR 鑒定,鑒定完成后送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,測(cè)序正確的菌株進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),抽提質(zhì)粒保存。

        1.2.5 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的擬南芥過表達(dá)實(shí)驗(yàn)

        取100 ng pGreenII-35S-C1-SsSOC1 質(zhì)粒加入50 μL農(nóng)桿菌感受態(tài)(GV3101)中,撥打混勻,冰上靜置5 min,液氮5 min,37 ℃水浴5 min,冰浴5 min;加入700 μL 無抗生素的LB 液體培養(yǎng)基,于28 ℃,200 r/min 振蕩培養(yǎng)3 h;6000 r/min 離心1 min;留取100 μL 左右上清液輕輕吹打重懸,將菌塊涂布于含Rif 25 mg/L+Kan 50 mg/L 的LB 平板上倒置,28 ℃培養(yǎng)2 d。挑取單克隆菌落進(jìn)行菌落PCR鑒定,最后將檢測(cè)正確的農(nóng)桿菌保存于10%甘油中,并于–80 ℃保存。采用花序浸染法[17]進(jìn)行擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化,含有重組質(zhì)粒的上述甘油農(nóng)桿菌,在含有Rif 25 mg/L+Kan 50 mg/L 的LB 平板上劃線,于28 ℃,200 r/min 振蕩培養(yǎng)16 h。吸取4 mL 搖濃的菌液加入到200 mL 含相應(yīng)抗生素的LB 液體培養(yǎng)基中,28 ℃,200 r/min,培養(yǎng)至OD600=1.0;5000 r/min 離心10 min,收集細(xì)胞并懸浮于0.5%蔗糖滲透培養(yǎng)液(含有0.02% Silwet-77),調(diào)整OD600=0.8;將盛花期擬南芥花完全浸入農(nóng)桿菌懸浮液中侵染2 min,放入黑色托盤中,置于黑暗環(huán)境下避光培養(yǎng)24 h 后于正常光照下培養(yǎng)。

        1.2.6 陽性苗的鑒定

        將收取到的T0 代種子經(jīng)過4 ℃低溫浸泡后均勻播撒在花盤中,在生長(zhǎng)條件為23 ℃,長(zhǎng)日照(16 h/8 h)培養(yǎng)室中培養(yǎng)。培養(yǎng)至1 周左右時(shí)(子葉展平),噴施0.1%Basta 進(jìn)行篩選。取葉片組織提取DNA 和RNA,隨后進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳和定量PCR 的測(cè)定,對(duì)檢測(cè)正確的陽性苗和野生型植株進(jìn)行跟蹤觀察,待擬南芥抽薹開花長(zhǎng)至1 cm 時(shí),統(tǒng)計(jì)所需天數(shù)以及蓮座葉數(shù)量。

        1.3 數(shù)據(jù)處理

        使用Excel、SPSS(v 26.0)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和差異顯著性分析,使用GraphPad Prism(v8.0.2)軟件制圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 遮蔭處理對(duì)蓮霧成花的影響

        遮蔭處理對(duì)蓮霧樹體中的花芽數(shù)、成花枝率及新梢長(zhǎng)度有著顯著的影響(圖1),經(jīng)過遮蔭處理(T)的花芽數(shù)比未經(jīng)遮蔭處理(CK)高123.39%。同時(shí),處理組的成花枝率比對(duì)照組高115.06%。而處理組蓮霧樹體的新梢長(zhǎng)度明顯短于對(duì)照組,表明一定程度的遮蔭處理會(huì)減短新梢長(zhǎng)度。

        2.2 遮蔭處理對(duì)蓮霧不同組織部位中SsSOC1基因表達(dá)水平的影響

        在對(duì)照組的各個(gè)組織中,SsSOC1 的相對(duì)表達(dá)量差異不大,且數(shù)值較低。但遮蔭處理組蓮霧的芽點(diǎn)、葉片、葉尖以及葉柄中的SsSOC1 相對(duì)表達(dá)量均增加,其中,葉尖中的SsSOC1 相對(duì)表達(dá)量最高,是對(duì)照組的10 倍;葉柄中的SsSOC1 相對(duì)表達(dá)量與對(duì)照組之間差異最大,是對(duì)照組的14倍;處理組花芽中的SsSOC1 相對(duì)表達(dá)量是對(duì)照組葉芽的4 倍(圖2)。

        2.3 SsSOC1 基因的克隆

        本研究從黑糖芭比蓮霧葉片中提取總RNA,并用1%濃度的瓊脂糖膠檢測(cè)其質(zhì)量,膠圖顯示質(zhì)量良好(圖3A)。反轉(zhuǎn)錄成cDNA 后,以其為模板,用PCR 擴(kuò)增出SsSOC1 編碼區(qū)序列,獲得全長(zhǎng)654 bp 的目的基因(圖3B)。為驗(yàn)證得到的SsSOC1序列的準(zhǔn)確性,將擴(kuò)增的SsSOC1 編碼區(qū)序列與pMD18-T 載體進(jìn)行連接并測(cè)序,測(cè)序結(jié)果發(fā)現(xiàn)擴(kuò)增獲得的基因序列與轉(zhuǎn)錄組中對(duì)應(yīng)的基因序列完全一致(Unigene0006265),成功得到目的基因SsSOC1(圖3C)。

        2.4 SsSOC1 蛋白序列結(jié)構(gòu)分析

        利用相關(guān)在線工具對(duì)蓮霧的SsSOC1 蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果顯示,SsSOC1 蛋白的理論等電點(diǎn)為9.37,分子式為C1076H1794N322O334S10,分子量為24.91 kDa,帶正電荷氨基酸殘基總數(shù)(Lys+Arg)為40,帶負(fù)電荷氨基酸殘基總數(shù)(Asp+Glu)為32,脂肪系數(shù)為80.64,總平均親水性系數(shù)(GRAVY)為–0.729,不穩(wěn)定系數(shù)為66.17;SsSOC1 蛋白親水性最低點(diǎn)值為–3.144,疏水性最高點(diǎn)值為2.122(圖4A),推測(cè)該蛋白為親水性蛋白;SsSOC1 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋占比最高,為60.83%,延伸鏈和無規(guī)則卷曲占比分別為9.22%、25.81%,無β-折疊(圖4B),SsSOC1 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)見圖4C;SsSOC1 蛋白具有MADS_MEF2_like 和K-Box 保守結(jié)構(gòu)域,同時(shí)隸屬于MADS 超級(jí)家族和K-Box 超級(jí)家族,該結(jié)構(gòu)域的起止氨基酸位點(diǎn)為第3~75 位和第88~171 位,符合MADS蛋白家族與K-Box 家族的典型結(jié)構(gòu)特征(圖4D);SsSOC1 蛋白的信號(hào)肽預(yù)測(cè)顯示SsSOC1蛋白不含信號(hào)肽(圖4E);SsSOC1 蛋白的跨膜區(qū)域檢測(cè)和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白不是分泌蛋白與膜結(jié)構(gòu)蛋白,定位于細(xì)胞核中(圖4F)。

        2.5 SsSOC1 蛋白同源序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析

        通過NCBI 數(shù)據(jù)庫中的BLAST 功能對(duì)SsSOC1 的氨基酸序列與油葉蒲桃(Syzygiumoleosum)、大桉(Eucalyptus grandis)、銀葉玫瑰木(Rhodamnia argentea)、胡桃(Juglans regia)、歐洲榛(Corylus avellana)、小果胡桃與核桃雜交種(Juglans microcarpa × Juglans regia)、棗(Ziziphus jujuba)、歐洲凱木(Alnus glutinosa)、美國(guó)山核桃(Carya illinoinensis)、可可(Theobromacacao)、楊梅(Morella rubra)、石榴(Punicagranatum)、白櫟(Quercus lobata)、榴蓮(Duriozibethinus)、山核桃(Carya cathayensis)、川桑(Morus notabilis)等16 種植物的SOC1 氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果顯示,蓮霧SsSOC1 蛋白序列與油葉蒲桃的同源性最高,相似度高達(dá)99.08%,而與川桑的蛋白序列同源性最低,相似度只有78.24%(圖5A)。利用MEGA 7 軟件構(gòu)建SsSOC1 氨基酸序列與以上16 個(gè)物種的SOC1 氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖5B),發(fā)現(xiàn)蓮霧與油葉蒲桃聚于同一分支,親緣關(guān)系相比其他物種最近,而與小果胡桃與核桃雜交種、胡桃的親緣關(guān)系則較遠(yuǎn)。

        2.6 SsSOC1 基因的功能分析

        為了驗(yàn)證蓮霧SsSOC1 基因的功能,本研究構(gòu)建過表達(dá)載體35S::SsSOC1,并將其轉(zhuǎn)入哥倫比亞野生型擬南芥中,通過噴施Basta 和PCR 鑒定篩選轉(zhuǎn)基因植株,觀察轉(zhuǎn)基因的開花相關(guān)表型,并統(tǒng)計(jì)T1 和T2 代的開花時(shí)間和蓮座葉數(shù)量。通過觀察轉(zhuǎn)基因后代表型,并與野生型擬南芥(WT)進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)35S::SsSOC1 株系營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期明顯短于野生型植株,并且其抽薹時(shí)間顯著提前(圖6A),在抽薹開花時(shí),葉片數(shù)量與野生型相比明顯減少(圖6B),成功轉(zhuǎn)入SsSOC1 基因的植株平均提早8 d 開花(圖6C)。結(jié)果表明成功轉(zhuǎn)入SsSOC1 基因能夠使擬南芥的開花時(shí)間提前。

        3 討論

        遮蔭對(duì)蓮霧的開花時(shí)間已經(jīng)有相關(guān)報(bào)道[18]。目前,大多數(shù)蓮霧種植者使用遮蔭技術(shù)結(jié)合化學(xué)調(diào)控來調(diào)節(jié)蓮霧的開花,然而這種調(diào)控機(jī)制的具體原理仍知之甚少。遮蔭對(duì)植物的生長(zhǎng)影響復(fù)雜,不同植物受到的影響也各不相同。遮蔭對(duì)紅椿(Toonaciliata)、香樟(Cinnamomum camphora)[19]幼苗和擬單性木蘭(Parakmeria yunnanensis)[20]不利,會(huì)顯著抑制苗高和地徑。然而,對(duì)于移栽期的超級(jí)水稻,遮蔭后植株高度顯著增加[21]。此外,遮蔭也促進(jìn)了油茶(Camellia oleifera)的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)[22]。

        本課題組前期已對(duì)SsSOC1 基因和SsCOP1基因進(jìn)行了基礎(chǔ)的功能驗(yàn)證,并初步探究了遮蔭處理對(duì)蓮霧光合特性的影響[3]。本研究基于前期研究結(jié)果展開更為細(xì)致的探索,重點(diǎn)分析SsSOC1 的結(jié)構(gòu)、特性以及其在蓮霧中的具體作用。

        SOC1 在對(duì)植物成花的過程發(fā)揮著重要的作用,是花器官分生組織形成過程中的關(guān)鍵基因之一,其能夠整合外界以及內(nèi)在因素等各種信號(hào),從而激活下游花器官發(fā)育相關(guān)基因[23]。經(jīng)過遮蔭處理蓮霧的葉片、花芽、葉尖以及葉柄中SsSOC1相對(duì)表達(dá)量都增加。其中,葉尖在處理組中SsSOC1相對(duì)表達(dá)量最高,葉柄中SsSOC1 的相對(duì)表達(dá)量在處理組與對(duì)照組之間的差異最大。

        SOC1 基因編碼的轉(zhuǎn)錄因子,是典型的MIKC蛋白[24]。本研究克隆了蓮霧的SOC1 基因并命名為SsSOC1,利用ProtParam、ProtScale 以及Prabi等在線工具對(duì)SsSOC1 進(jìn)行生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),SsSOC1 中不存在β-折疊,α-螺旋占比最高,其屬于不穩(wěn)定親水性蛋白質(zhì),不含信號(hào)肽且無跨膜結(jié)構(gòu),不屬于分泌蛋白和膜結(jié)構(gòu)蛋白,定位于細(xì)胞核。保守結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)SsSOC1 中存在MADS_MEF2_like 和K-Box 保守結(jié)構(gòu)域。通過多重序列比對(duì)以及構(gòu)建進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn)SsSOC1 蛋白與油葉蒲桃SOC1 蛋白的同源性最高,與其他植物的SOC1序列同源性均在75%以上,表明SOC1 序列在多數(shù)物種中具有著極大的保守性,這對(duì)于今后分析蓮霧中K-box 基因家族具有重要的便利性,可通過了解其他物種K-box 基因家族中SOC1 基因的功能機(jī)制,推測(cè)蓮霧SOC1 基因的詳細(xì)表達(dá)模式和作用機(jī)制。

        據(jù)報(bào)道,過表達(dá)SOC1 基因可以促進(jìn)植株提前開花,而SOC1 基因突變體則會(huì)導(dǎo)致植株開花延遲[25]。本研究轉(zhuǎn)入SsSOC1 基因的植株開花時(shí)間早于野生型植株,并且蓮座葉數(shù)量顯著少于野生型植株。這成功驗(yàn)證了SsSOC1 基因的轉(zhuǎn)入對(duì)提早開花表型的促進(jìn)作用,與預(yù)期效果一致。

        果樹的產(chǎn)量在一定程度上決定于當(dāng)年開花的數(shù)量以及質(zhì)量。蓮霧是我國(guó)新興果樹品種,經(jīng)濟(jì)效益較高,但其開花數(shù)量及時(shí)間的不穩(wěn)定極大地限制了其經(jīng)濟(jì)效益,本研究能夠?yàn)榻窈笈嘤荒陜?nèi)多次開花、反季節(jié)開花并且高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)的蓮霧品種提供一定的指導(dǎo),同時(shí)本研究基于蓮霧基因組學(xué),對(duì)蓮霧中SOC1 基因編碼的蛋白特征、進(jìn)化關(guān)系以及其在不同時(shí)期不同組織的表達(dá)差異進(jìn)行分析,初步鑒定了調(diào)控蓮霧開花的主要基因之一的SsSOC1,并且對(duì)其進(jìn)行了基因驗(yàn)證得出了較好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,為深入揭示蓮霧開花結(jié)實(shí)過程中SOC1 基因的調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

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        基金項(xiàng)目 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No. 32072515);廣州市重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(No. 202206010023)。

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