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        貴州海桐葉綠體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育分析

        2025-03-27 00:00:00滕堯楊加何選澤張小英李嘉昱陳彩霞袁茂琴彭熙
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年3期

        摘要:為了解貴州海桐(Pittosporum kweichowense)葉綠體基因組基本特征及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,本研究基于Illumina高通量測(cè)序技術(shù),采用生物信息學(xué)方法對(duì)序列進(jìn)行組裝,獲得貴州海桐完整葉綠體基因組,并對(duì)其功能特征、密碼子偏好性、簡(jiǎn)單重復(fù)序列、基因組比對(duì)信息及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系等進(jìn)行分析。結(jié)果表明,(1)貴州海桐葉綠體基因組呈典型的四分體結(jié)構(gòu),總長(zhǎng)度為153 582 bp,其中大單拷貝區(qū)(LSC)為84 944 bp,小單拷貝區(qū)(SSC)為18 740 bp,此外還有2個(gè)長(zhǎng)度為24 949 bp的反向重復(fù)序列區(qū)(IR),總GC含量為38.94%。(2)注釋到130個(gè)基因,其中包括85個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、37個(gè)tRNA基因和8個(gè)rRNA基因。(3)共檢測(cè)到25 910個(gè)密碼子,其中編碼亮氨酸(Leu)的密碼子數(shù)量最多,密碼子第3位堿基有較高的A/U偏好性。(4)通過(guò)微衛(wèi)星分析鑒定到44個(gè)簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)位點(diǎn),且明顯偏好使用A/T堿基。(5)海桐花屬植物的葉綠體基因組IR/SC邊界相對(duì)保守,變異主要存在于LSC。(6)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示,貴州海桐、昆明海桐(P. kunmingense)的親緣關(guān)系最近。

        關(guān)鍵詞:貴州海桐;葉綠體基因組;結(jié)構(gòu)特征;密碼子偏好性;系統(tǒng)發(fā)育分析

        中圖分類(lèi)號(hào):S718.46" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2025)03-0035-09

        滕" 堯,楊加文,何選澤,等. 貴州海桐葉綠體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2025,53(3):35-44.

        doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2025.03.005

        收稿日期:2024-08-28

        基金項(xiàng)目:貴州省科技計(jì)劃(編號(hào):黔科合基礎(chǔ)-ZK[2024]一般625);貴州省林業(yè)科研項(xiàng)目(編號(hào):黔林科合[2022]01號(hào))。

        作者簡(jiǎn)介:滕" 堯(1991—),男,貴州羅甸人,碩士,助理研究員,主要研究方向?yàn)橹参镔Y源栽培利用。E-mail:574177089@qq.com。

        通信作者:彭" 熙,碩士,副研究員,主要研究方向?yàn)橥寥琅c植物互作。E-mail:pengxi7979@163.com。

        貴州海桐(Pittosporum kweichowense)是海桐花科(Pittosporaceae)海桐花屬(Pittosporum)常綠灌木,分布于貴州、四川和湖南部分地區(qū),該科在全世界共有9屬約360種,我國(guó)有1屬約50種,主要分布于陜西、湖南、四川、貴州、云南等省份[1]。海桐花屬植物的根、樹(shù)皮、葉和種子均可入藥,種子還可用來(lái)榨油,是工業(yè)用油脂原料[1-3]?;诤M┗▽僦参镙^高的醫(yī)藥、工業(yè)價(jià)值,國(guó)內(nèi)外對(duì)該屬的研究方向主要集中在藥理作用(如抗結(jié)核、抗菌、抗癌、抗炎癥測(cè)試[4-5],對(duì)新冠病毒蛋白酶的抑制效果[6])和次生代謝物種類(lèi)及生物活性[2,7]等方面,而對(duì)該科(屬)植物系統(tǒng)進(jìn)化及資源分類(lèi)鑒定的報(bào)道較少。因此,開(kāi)展更多海桐花屬植物葉綠體基因組圖譜構(gòu)建和比較分析,既能豐富該屬植物細(xì)胞器基因組信息庫(kù),又能為該屬的種間關(guān)系、種質(zhì)資源利用提供參考依據(jù)。

        葉綠體是植物進(jìn)行光合生理所需的細(xì)胞器[8],它除了具有典型的母系遺傳特征[9]外,還具有結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、序列保守、變異位點(diǎn)信息較豐富等特點(diǎn)[10]。大多數(shù)被子植物葉綠體基因組都是雙鏈環(huán)狀四分體結(jié)構(gòu),包含1個(gè)大單拷貝區(qū)(LSC)、1個(gè)小單拷貝區(qū)(SSC)和2個(gè)反向重復(fù)區(qū)(IR)[11],加上葉綠體基因組的測(cè)序成本不高,因此常被用于資源鑒定、分類(lèi)和系統(tǒng)進(jìn)化等研究[12]。隨著研究的發(fā)展,近年來(lái)發(fā)布的海桐花科植物葉綠體基因組有近30種,但是開(kāi)展葉綠體基因組特征分析的僅有10種[13-15],這在一定程度上限制了海桐花科植物的分類(lèi)學(xué)研究。

        本研究擬基于Illumina二代測(cè)序平臺(tái)對(duì)貴州海桐的葉綠體基因組進(jìn)行測(cè)序,采用生物信息學(xué)方法對(duì)貴州海桐的葉綠體基因組進(jìn)行組裝,并初步對(duì)其基因組結(jié)構(gòu)特征、密碼子使用模式、重復(fù)序列特征、種間差異、核苷酸多態(tài)性和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系等展開(kāi)分析,以期揭示貴州海桐的遺傳特征,為今后海桐花屬植物的葉綠體基因組學(xué)研究、分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)、種質(zhì)資源分類(lèi)及利用等提供參考。

        1" 材料與方法

        1.1" 試驗(yàn)材料

        本試驗(yàn)所用材料為貴州海桐(P. kweichowense),樣品于2024年5月10日采自貴州省望謨縣樂(lè)旺鎮(zhèn)(106°25′02.07″E,25°20′01.43″N,海拔1 076 m),取樣后將葉片保存于液氮中并立即帶回貴州科學(xué)院貴州省山地資源研究所實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行預(yù)處理,將標(biāo)本保存于貴州科學(xué)院貴州省植物園標(biāo)本館內(nèi),標(biāo)本號(hào)Y240505。貴州海桐的葉綠體基因組相關(guān)數(shù)據(jù)已上傳至CNGBdb(https://db.cngb.org/),項(xiàng)目身份標(biāo)志號(hào)(ID)為CNP0005941,樣本ID為CNS1153709,測(cè)序ID為CNX1085786。

        在本研究中,14個(gè)用于校正和比對(duì)分析的海桐花科植物的完整葉綠體基因組數(shù)據(jù)下載自美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI),包括羊脆木(P.kerrii,登錄號(hào):NC_046847)、滇越海桐(P.merrillianum,登錄號(hào):NC_068010)、縫線(xiàn)海桐(P.perryanum,登錄號(hào):NC_068014)、昆明海桐(P.kunmingense,登錄號(hào):NC_068009)、短萼海桐(P.brevicalyx,登錄號(hào):NC_058267)、皺葉海桐(P.crispulum,登錄號(hào):NC_068008)、海金子(P.illicioides,登錄號(hào):NC_088055)、小果海桐(P.parvicapsulare,登錄號(hào):NC_068013)、棱果海桐(P.trigonocarpum,登錄號(hào):NC_068015)、海桐(P.tobira,登錄號(hào):NC_057165)、滇藏海桐(P.napaulense,登錄號(hào):NC_068011)、圓錐海桐(P.paniculiferum,登錄號(hào):NC_068012)、崖花子(P.truncatum,登錄號(hào):NC_068016)和P.serpentinum(登錄號(hào):NC_084331)。

        1.2" DNA提取、建庫(kù)及測(cè)序

        用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法[16]提取貴州海桐葉片的全基因組DNA,用DNA提取試劑盒(諾貝萊)獲得高質(zhì)量基因組DNA,用凝膠電泳初步檢測(cè)DNA的完整性,用NanoDrop微量分光光度計(jì)檢測(cè)DNA的純度,用安捷倫2100檢測(cè)DNA的完整性,RIN(RNA完整值)gt;7.0表明樣品完整性較好,可以用來(lái)進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建。隨后用 NEBNext UltraTMⅡDNA Library Prep Kit經(jīng)隨機(jī)擴(kuò)增、片段分選,獲得長(zhǎng)度為350~400 bp的隨機(jī)片段用于上機(jī)測(cè)序。在NGS重測(cè)序中,采用華大基因的DNBSEQ-T7平臺(tái)進(jìn)行雙端測(cè)序,下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)質(zhì)控、過(guò)濾,最終獲得150 bp的雙端測(cè)序讀段。

        1.3" 葉綠體基因組組裝及注釋

        用MAFFT軟件[17]對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行校正后,用GetOrganelle軟件[18]組裝貴州海桐的葉綠體基因組,用在線(xiàn)工具CPGAVAS2(http://47.96.249.172:16019/analyzer/annotate)[19]進(jìn)行注釋分析,用在線(xiàn)工具Chloroplot(https://irscope.shinyapps.io/Chloroplot/)[20]繪制貴州海桐的葉綠體基因組圈圖。

        1.4" 密碼子偏好性分析

        用CodonW 1.4.2軟件[21]分析貴州海桐葉綠體基因組同義密碼子相對(duì)使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)。

        1.5" 簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)分析

        通過(guò)在線(xiàn)工具M(jìn)ISA(https://webblast.ipkgatersleben.de/misa/)[22]分析貴州海桐葉綠體基因組的SSR,單核苷酸重復(fù)數(shù)量≥10個(gè),二核苷酸重復(fù)數(shù)量≥6個(gè),三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸重復(fù)數(shù)量≥5個(gè),2個(gè)SSR的最小距離設(shè)為100 bp。

        1.6" 基因組比較分析

        基于MAFFT數(shù)據(jù)比對(duì)后的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果,通過(guò)在線(xiàn)工具IRSCOPE(https://irscope.shinyapps.io/irapp/)[23]進(jìn)行葉綠體基因組的比較分析。

        1.7" 屬內(nèi)核苷酸的多態(tài)性分析

        用DnaSP軟件[24]分析海桐花屬植物核苷酸的多態(tài)性(π),根據(jù)π值篩選出變異較高的位點(diǎn)。

        1.8" 系統(tǒng)發(fā)育分析

        將MAFFT軟件的比對(duì)結(jié)果導(dǎo)入RAxML-ng-v1.2.0軟件[25],基于GTRCAT模型構(gòu)建最大似然(ML)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),Bootstrap重復(fù)1 000次。

        2" 結(jié)果與分析

        2.1" 葉綠體基因組結(jié)構(gòu)的基本特征

        貴州海桐葉綠體基因組為典型的環(huán)狀四分體結(jié)構(gòu),長(zhǎng)度為153 582 bp,包含長(zhǎng)度為84 944 bp的大單拷貝區(qū)(LSC)、長(zhǎng)度為18 740 bp的小單拷貝區(qū)(SSC)及長(zhǎng)度為24 949 bp的2個(gè)反向重復(fù)序列區(qū)(IR)(圖1)。GC總含量為38.94%,IR的GC含量高于LSC、SSC(表1)。

        注釋結(jié)果顯示,貴州海桐葉綠體基因組共編碼130個(gè)基因,包括85個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、8個(gè)rRNA基因和37個(gè)tRNA基因。按功能可將貴州海桐葉綠體基因組分為4類(lèi),其中參與光合作用的基因45個(gè),參與自我復(fù)制的基因74個(gè),其他基因6個(gè)及功能未知的基因5個(gè),其中有18個(gè)基因具有內(nèi)含子,ndhA、ndhB、petB、petD、atpF、rpl16、rpl2、rps16、rpoC1、trnA-UGC、trnG-UCC、trnI-GAU、trnK-UUU、trnL-UAA、trnV-UAC各含1個(gè)內(nèi)含子,rps12、clpP、ycf3有2個(gè)內(nèi)含子(表2)。

        2.2" 密碼子偏好性分析結(jié)果

        測(cè)序結(jié)果顯示,從貴州海桐葉綠體基因組中共檢測(cè)出25 910個(gè)密碼子, 其中編碼亮氨酸(Leu)的密碼子數(shù)量最多,為2 722個(gè),占總密碼子數(shù)的10.51%,終止密碼子(TER)數(shù)量最少,為85個(gè),占總密碼子數(shù)的0.33%,編碼亮氨酸(Leu)、絲氨酸(Ser)和精氨酸(Arg)的密碼子種類(lèi)最多,均為6種(表3、圖2)。密碼子具有較明顯的偏好性,RSCU=1的氨基酸有2個(gè),分別為甲硫氨酸(Met)和色氨酸(Trp),RSCU>1的高頻密碼子有30個(gè),其中沒(méi)有密碼子第3位堿基以C結(jié)尾,只有1個(gè)以G結(jié)尾的密碼子(Leu的UUG),剩余29個(gè)密碼子均以A/U結(jié)尾。

        2.3" 簡(jiǎn)單重復(fù)序列分析結(jié)果

        微衛(wèi)星位點(diǎn)分析結(jié)果(表4)顯示,從貴州海桐葉綠體基因組中共識(shí)別出44個(gè)SSR位點(diǎn),其中單核苷酸43個(gè),占位點(diǎn)總數(shù)的97.73%,雙核苷酸1個(gè),三核苷酸及以上的SSR位點(diǎn)未被識(shí)別出,SSR位點(diǎn)偏好使用A/T堿基。SSR位點(diǎn)主要分布在LSC,占比達(dá)74%,其余分布在SSC、IR(圖3)。

        2.4" 葉綠體基因組比較分析結(jié)果

        對(duì)貴州海桐(P.kweichowense)、羊脆木(P.kerrii)、短萼海桐(P.brevicalyx)、海金子(P.illicioides)、海桐(P.tobira)及P. serpentinum等6種海桐花屬植物葉綠體基因組IR/SC邊界分析的結(jié)果(圖4)顯示,6種海桐花屬葉綠體基因組長(zhǎng)度無(wú)明顯差異, 即無(wú)明顯的邊界收縮或擴(kuò)張,但邊界基因的位置和類(lèi)型有差別。短萼海桐邊在JLB邊界上的基因?yàn)閞pl22、rpl2,其余5種均為rps19、rpl2,且rps19基因均跨越JLB邊界,P.serpentinum的rps19基因位置與其余4種略有不同;trnN、ndhF基因分布在JSB邊界;ycf1、trnN基因分布在JSA邊界,大小相同且ycf1均橫跨該區(qū)域;rpl2、trnH基因分布在JLA邊界,大小相同且無(wú)基因跨越該區(qū)域;P. serpentinum 在JSB、JSA及JLA邊界的基因位置與其余5種稍有差異。

        以貴州海桐葉綠體基因組為參照,對(duì)海桐花屬其他5種植物葉綠體基因組進(jìn)行比較。mVISTA比對(duì)結(jié)果(圖5)表明,海桐花屬植物葉綠體基因組的基因結(jié)構(gòu)整體上十分接近,P.serpentinum在51~54 kb(LSC)處存在變異,變異基因有trnV-UAC、trnM-CAU,海金子在94~99 kb(IRA)處也存在明顯變異,變異基因包括ndhB、rps7和rps12,其余位置則無(wú)明顯差異。

        2.5" 屬內(nèi)核苷酸多態(tài)性分析結(jié)果

        核苷酸多態(tài)性π峰值圖(圖6)顯示,海桐花屬植物葉綠體基因組變異較高的位點(diǎn)主要存在于LSC,其次是SSC,IR則相對(duì)保守,其中變異最高的4個(gè)位點(diǎn)(π>0.008)均位于LSC,分別為rps4-trnT(47 446~48 084 bp)、trnT-trnL-exon1(47 885~48 485 bp)、ndhC-trnV-exon2(52 318~52 917 bp)和rpl33-rps18(69 042~69 645 bp)。

        2.6" 系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果

        ML系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)結(jié)果(圖7)表明,羊脆木(P.kerrii)和滇越海桐(P.merrillianum)聚為一支,自展值為72,二者又與縫線(xiàn)海桐(P.perryanum)聚為一支,自展值為65,再與昆明海桐(P.kunmingense)聚為一支,自展值為53,該支最終與貴州海桐(P.kweichowense)聚為一支,自展值為100。上述結(jié)果說(shuō)明,貴州海桐與羊脆木、滇越海桐、縫線(xiàn)海桐和昆明海桐的親緣關(guān)系較近,其中與昆明海桐的親緣關(guān)系最近,而與小果海桐(P.parvicapsulare)、海桐(P.tobira)和崖花子(P.truncatum)等同屬植物的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

        3" 討論與結(jié)論

        貴州海桐葉綠體基因組總長(zhǎng)度為153 582 bp,包含1個(gè)LSC(84 944 bp)、1個(gè)SSC(18 740 bp)和2個(gè)IR(24 949 bp), 為典型的四分體結(jié)構(gòu), 與已報(bào)道的大多數(shù)被子植物葉綠體基因組結(jié)構(gòu)特征一致[26]。G+C堿基對(duì)含量在植物細(xì)胞中比較穩(wěn)定,不容易受外界因素影響,常用于物種、屬的分類(lèi)[27-28],貴州海桐葉綠體基因組總GC含量為38.94%,與海桐花屬已完成葉綠體基因組測(cè)序的物種間差異很小[13-15]。有趣的是,貴州海桐葉綠體基因組中共有85個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,與Zhang等已完成測(cè)序和注釋得出的海桐花近緣屬種均為86個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的結(jié)果不同,而tRNA和rRNA的基因數(shù)量則沒(méi)有差異[15]??紤]到Zhang的試驗(yàn)材料中縫線(xiàn)海桐(P. perryanum)和小果海桐(P. parvicapsulare)樣品也采自貴州,蛋白質(zhì)編碼基因存在微小差異的原因應(yīng)該不是貴州喀斯特氣候環(huán)境,該原因需要進(jìn)一步研究。從貴州海桐葉綠體基因組中共鑒定到5個(gè)未知功能基因,均為ycf基因家族, 該基因家族在不同植物中的種類(lèi)、數(shù)量和功能均有差異[29],關(guān)于海桐屬植物ycf基因家族具體功能的研究目前尚未見(jiàn)報(bào)道。

        密碼子偏好性隨生物的突變、自然選擇和基因漂變而進(jìn)化,密碼子使用偏好是決定基因表達(dá)、細(xì)胞功能的關(guān)鍵因素,它通過(guò)影響RNA加工、蛋白質(zhì)翻譯和蛋白質(zhì)折疊等多種過(guò)程來(lái)實(shí)現(xiàn), 密碼子偏好性分析主要應(yīng)用在轉(zhuǎn)基因設(shè)計(jì)中,通過(guò)優(yōu)化密碼子來(lái)增加基因的表達(dá)水平,以開(kāi)發(fā)轉(zhuǎn)基因作物[30]。貴州海桐葉綠體基因組中RSCU>1的密碼子絕大部分以A/U堿基結(jié)尾,這與大多數(shù)雙子葉植物密碼子偏好使用A/T(U)堿基結(jié)尾的結(jié)論[31]一致。研究貴州海桐密碼子偏好性可以了解其遺傳信息傳遞規(guī)律,在后續(xù)生物技術(shù)的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用中可幫助提高外源基因在宿主細(xì)胞中的表達(dá)效率。

        SSR分子標(biāo)記具有隨機(jī)分布、多態(tài)性強(qiáng)、顯性遺傳等特性,對(duì)SSR分子標(biāo)記的比較研究有助于發(fā)掘關(guān)鍵性狀相關(guān)QTL,進(jìn)而確定候選基因[32],是植物功能基因組學(xué)中最具信息量和用途較多的遺傳標(biāo)記之一,在分子生物學(xué)中有廣泛應(yīng)用[33]。本研究從貴州海桐葉綠體基因組中共檢測(cè)出44個(gè)SSR位點(diǎn),包含單核苷酸重復(fù)、二核苷酸重復(fù),其中單核苷酸重復(fù)序列A/T的重復(fù)次數(shù)最多,這與目前已報(bào)到的多種植物葉綠體基因組SSR特征[10,34]基本一致。本研究首次完成了貴州海桐SSR的位點(diǎn)研究,可為海桐花屬植物鑒定、遺傳圖譜構(gòu)建、QTL定位及分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)等提供參考信息。

        植物在長(zhǎng)期適應(yīng)環(huán)境的過(guò)程中,其葉綠體基因組邊界的收縮/擴(kuò)張時(shí)有發(fā)生,這會(huì)導(dǎo)致序列改變、基因減少或增加等,是植物葉綠體基因組進(jìn)化的主要機(jī)制[35-36]。序列比對(duì)結(jié)果顯示,貴州海桐與5個(gè)近緣物種的葉綠體基因組LSC/IR和SSC/IR邊界分布的基因類(lèi)型、結(jié)構(gòu)及排列差異性較小,表明本研究對(duì)貴州海桐葉綠體基因組的組裝完成度較高,邊界的收縮或擴(kuò)張僅有幾十至幾百bp不等,證明海桐花屬植物的邊界保守性較高。但Zhang等研究發(fā)現(xiàn),海桐花科植物葉綠體基因組邊界區(qū)擴(kuò)張或收縮差異顯著[15],其一原因可能是筆者根據(jù)現(xiàn)有的海桐花屬植物葉綠體基因組數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)注釋結(jié)果進(jìn)行了矯正以降低分析誤差;其二原因可能是Zhang的材料及比對(duì)數(shù)據(jù)來(lái)源與本研究的差異較大, 可能由于

        不同地域的海桐花科植物為了適應(yīng)氣候環(huán)境產(chǎn)生不同程度的變異,導(dǎo)致邊界擴(kuò)張或收縮,因而在比對(duì)分析時(shí)差異顯著,這說(shuō)明海桐花科植物葉綠體基因組中基因及其排序保守性和邊界擴(kuò)張或收縮多樣性并存。

        核苷酸多態(tài)性(π值)用于量化種群內(nèi)部或不同種群間的遺傳多樣性,π值越大,說(shuō)明核苷酸的多樣性越高,也可以用來(lái)推演進(jìn)化關(guān)系[37]。核苷酸多態(tài)性分析結(jié)果顯示,海桐花屬植物葉綠體基因組變異較高的位點(diǎn)主要存在于LSC、SSC,其中LSC變異位點(diǎn)數(shù)量最多且π值更大,IR的變異程度最低,植物葉綠體基因組序列的變異程度可能與A/T密碼子使用偏好性呈正相關(guān),即GC含量低的LSC、SSC的變異程度較高,GC含量高的IR的變異程度較低。變異度較高的區(qū)域和位點(diǎn)可為種群遺傳學(xué)提供潛在的分子標(biāo)記,用于構(gòu)建DNA指紋圖譜、種間關(guān)系研究及基因克隆等[35]。

        了解物種之間的親緣關(guān)系是生物學(xué)研究的基礎(chǔ),一個(gè)精確的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)有助于理解物種進(jìn)化過(guò)程中的重大轉(zhuǎn)變,是推測(cè)新基因起源、檢測(cè)分子適應(yīng)性、理解形態(tài)特征進(jìn)化和重建最近分化物種等的關(guān)鍵[38]。本研究中的系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果與Zhang等對(duì)海桐屬系統(tǒng)發(fā)育研究結(jié)果相似,如短萼海桐和皺葉海桐聚為一支,棱果海桐和滇藏海桐聚為一支等,但個(gè)別物種的親緣關(guān)系遠(yuǎn)近有一定差異[15]。貴州海桐所在分支的其他物種自展值不高,這可能是因?yàn)楸狙芯克玫奈锓N數(shù)量較小,且部分物種的系統(tǒng)發(fā)育位置仍存在爭(zhēng)議,未來(lái)需完善物種取樣覆蓋度,并結(jié)合更多的物種信息來(lái)探索海桐科植物的進(jìn)化和發(fā)展,明確屬內(nèi)植物分類(lèi)地位,為后續(xù)系統(tǒng)發(fā)育、資源鑒定和進(jìn)化分析提供依據(jù)。

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