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        融合語(yǔ)義感知與模型生成的異常醫(yī)療數(shù)據(jù)識(shí)別算法設(shè)計(jì)

        2025-02-28 00:00:00高昱韓智涌
        現(xiàn)代電子技術(shù) 2025年4期
        關(guān)鍵詞:病歷語(yǔ)義膠囊

        摘" 要: 為了能夠?qū)A侩娮釉\療信息中的異常數(shù)據(jù)進(jìn)行識(shí)別,提出一種融合語(yǔ)義感知與模型生成的異常醫(yī)療數(shù)據(jù)識(shí)別算法。通過(guò)融入膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)并改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò),實(shí)現(xiàn)了對(duì)醫(yī)療電子病歷結(jié)構(gòu)和生成語(yǔ)義特征的感知提?。唤Y(jié)合膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和Transformer網(wǎng)絡(luò)的損失函數(shù),加速了模型的收斂,從而提高了模型的異常數(shù)據(jù)識(shí)別準(zhǔn)確率。在電子病歷數(shù)據(jù)集上進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,所提模型的準(zhǔn)確率可達(dá)94.2%,高于多種現(xiàn)有的主流異常數(shù)據(jù)識(shí)別診斷模型。證明該模型算法能夠?qū)︶t(yī)療電子病歷實(shí)現(xiàn)語(yǔ)義感知和異常數(shù)據(jù)識(shí)別,為實(shí)現(xiàn)智能化的輔助診療提供了技術(shù)基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞: 電子病歷; 異常數(shù)據(jù)識(shí)別; 語(yǔ)義感知; 模型生成; 膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò); Transformer網(wǎng)絡(luò); 語(yǔ)義特征提取

        中圖分類號(hào): TN911.72?34; TP183; TP391.1" " " " " 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A" " " " " " " "文章編號(hào): 1004?373X(2025)04?0159?05

        Design of abnormal medical data recognition algorithm based on semantic

        perception and model generation

        GAO Yu, HAN Zhiyong

        (Jinzhou Medical University, Jinzhou 121000, China)

        Abstract: In order to identify abnormal data in massive electronic diagnosis and treatment information, an abnormal medical data recognition algorithm that integrates semantic perception and model generation is proposed. By integrating capsule neural network and improving Transformer network, perceptual extraction of the structure and semantic features of medical electronic medical record is realized. The loss functions of the capsule neural network and Transformer network are combined to accelerate the convergence speed, so as to improve the accuracy of abnormal data identification. The experimental results conducted on the electronic medical record dataset show that the accuracy of the proposed model can reach 94.2%, which is higher than various existing mainstream abnormal data recognition and diagnosis models. It proves that this model algorithm can realize semantic perception and abnormal data recognition for medical electronic medical records, providing the technical foundation for intelligent auxiliary diagnosis and treatment.

        Keywords: electronic medical record; anomaly data recognition; semantic perception; model generation; capsule neural networks; Transformer network; semantic feature extraction

        0" 引" 言

        隨著智慧醫(yī)院理念的提出,醫(yī)療機(jī)構(gòu)對(duì)于信息化建設(shè)的要求越來(lái)越高,并通過(guò)逐步使用信息化系統(tǒng)代替了多種類型的人工作業(yè)[1]。醫(yī)療信息化的深入發(fā)展使相關(guān)的電子數(shù)據(jù)量呈現(xiàn)出了爆炸式的增長(zhǎng),電子病歷中包含了大量的患者個(gè)人信息,包括患病情況、診療記錄和用藥方案等。深入挖掘和分析這些數(shù)據(jù)中所蘊(yùn)含的豐富知識(shí)和規(guī)律,能夠有效促進(jìn)醫(yī)學(xué)的進(jìn)步與發(fā)展。然而,由于病歷數(shù)據(jù)中的文本和結(jié)構(gòu)較為復(fù)雜,且包含了大量的專業(yè)詞匯,因此數(shù)據(jù)處理的難度較高[2?3]。而如何對(duì)異常數(shù)據(jù)進(jìn)行準(zhǔn)確識(shí)別分析,也是當(dāng)前醫(yī)療信息化領(lǐng)域所面臨的主要問(wèn)題之一。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理方法通常難以應(yīng)對(duì)大規(guī)模、高維度的醫(yī)療數(shù)據(jù),且缺乏智能化的識(shí)別能力。這些方法費(fèi)時(shí)、費(fèi)力且缺乏專業(yè)性,對(duì)電子病歷的異常數(shù)據(jù)識(shí)別效果較差,因此設(shè)計(jì)一種能夠高效、準(zhǔn)確地識(shí)別異常醫(yī)療數(shù)據(jù)的算法具有重要的理論意義和應(yīng)用價(jià)值[4?5]。

        隨著深度學(xué)習(xí)技術(shù)的快速發(fā)展,已有眾多學(xué)者利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等技術(shù)大幅提升了對(duì)異常數(shù)據(jù)的識(shí)別準(zhǔn)確度[6]。文獻(xiàn)[7]提出一種基于深度學(xué)習(xí)的異常檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了大規(guī)模數(shù)據(jù)中異常點(diǎn)的識(shí)別,并能夠獲取到異常點(diǎn)背后所蘊(yùn)含的有價(jià)值信息。文獻(xiàn)[8]基于數(shù)據(jù)融合長(zhǎng)短期記憶(Data Fusion?Long Short?Term Memory, DF?LSTM)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建了一種大型醫(yī)療設(shè)備異常檢測(cè)模型,用于識(shí)別醫(yī)療設(shè)備的異常情況,且具有較高的準(zhǔn)確率。文獻(xiàn)[9]在傳統(tǒng)K?means算法基礎(chǔ)上融入了密度峰值法(Density Peaks Clustering, DPC)和主成分分析降維算法(Principal Component Analysis, PCA),實(shí)現(xiàn)了對(duì)醫(yī)療異常數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確識(shí)別,準(zhǔn)確率達(dá)到了79.2%。在上述研究背景下,本文以智慧醫(yī)院為應(yīng)用目的,提出了一種融合語(yǔ)義感知與模型生成的異常醫(yī)療數(shù)據(jù)識(shí)別算法。

        1" 基礎(chǔ)理論設(shè)計(jì)

        為了能夠?qū)﹄娮硬v的語(yǔ)義進(jìn)行感知和異常數(shù)據(jù)識(shí)別,本文以Transformer作為模型的主要網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)展開(kāi)設(shè)計(jì)。Transformer最早于2017年由谷歌團(tuán)隊(duì)Vaswani等學(xué)者提出,由于其出色的性能表現(xiàn),被廣泛應(yīng)用于自然語(yǔ)言處理中[10?11]。

        Transformer網(wǎng)絡(luò)主要包括編碼網(wǎng)絡(luò)、解碼網(wǎng)絡(luò)、位置編碼三個(gè)部分,并且每個(gè)編、解碼網(wǎng)絡(luò)均由N個(gè)多頭注意力機(jī)制、層歸一化以及前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)組成,具體結(jié)構(gòu)如圖1所示。Transformer網(wǎng)絡(luò)中最核心的是注意力機(jī)制,其可以捕捉長(zhǎng)序列之間的關(guān)系,實(shí)現(xiàn)上下語(yǔ)義之間的關(guān)聯(lián)。

        在注意力機(jī)制模塊中,對(duì)于輸入序列[X=x1,x2,…,xn,X∈Rn×d]而言,n和d為序列的長(zhǎng)度和維度,其通過(guò)注意力層轉(zhuǎn)換后即可得到鍵矩陣K、查詢矩陣Q和值矩陣V,且鍵矩陣和值矩陣是一一對(duì)應(yīng)的。

        首先需通過(guò)K和Q計(jì)算相關(guān)性,接著對(duì)V進(jìn)行加權(quán)求和,以此得到注意力輸出,具體計(jì)算過(guò)程為:

        [AttQ,K,V=SoftmaxQ?KTdQ·V] (1)

        式中:[K∈Rn×dK],[Q∈Rn×dQ],[V∈Rn×dV];[Q?KT]表示序列中不同實(shí)體之間的相關(guān)性值;[1dQ]為一個(gè)縮放因子,其作用是保持優(yōu)化模型時(shí)梯度的穩(wěn)定性。在編碼網(wǎng)絡(luò)中,K、Q、V矩陣由輸入X經(jīng)過(guò)全連接層計(jì)算獲得;在解碼網(wǎng)絡(luò)中,Q通過(guò)解碼器的輸入線性變換而來(lái),K和V則是根據(jù)編碼器的輸出計(jì)算得到。

        為了能夠進(jìn)一步使注意力機(jī)制得到更為豐富的語(yǔ)義特征,從而提高模型性能,Transformer引入了多頭注意力機(jī)制。將輸入序列X線性變換分成h組[Ki,Qi,Vi],并分別計(jì)算其自注意力,其中i∈(0,1,2,[…,]h-1)。接著利用權(quán)重矩陣[W∈RhdV×d]投影h個(gè)組的輸出,計(jì)算公式為:

        [MultiHeadAttX=Att0X,Att1X,…,Atth-1XW] (2)

        [AttiX=SoftmaxQi?KTidQi·Vi]" "(3)

        前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)包含激活函數(shù)ReLU的兩層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其作用是非線性激活,計(jì)算公式為:

        [FFNx=max0,xW1+b1W2+b2] (4)

        式中:[W1]、[W2]、[b1]、[b2]為學(xué)習(xí)參數(shù)。

        從多頭注意力的計(jì)算方式可以看出,當(dāng)輸入序列的位置發(fā)生變化時(shí),并不會(huì)影響輸出結(jié)果。為打破這種不變性,文中引入位置編碼來(lái)對(duì)序列信息的位置進(jìn)行處理,計(jì)算公式為:

        [PEpos,2i=sinpos10 0002i/dmodel]" "(5)

        [PEpos,2i+1=cospos10 0002i/dmodel] (6)

        式中:PE表示位置編碼;i表示維度;pos表示輸入序列的位置。從式中可以看出,奇偶位置所采用的編碼方式不同,而且此類編碼可以將位置歸一化到固定的區(qū)間。

        2" 異常醫(yī)療數(shù)據(jù)識(shí)別模型

        2.1" 整體架構(gòu)

        為了能夠準(zhǔn)確識(shí)別出電子病歷中的異常數(shù)據(jù),輔助臨床醫(yī)生進(jìn)行診療,幫助監(jiān)管者更好地發(fā)現(xiàn)電子病歷中存在的問(wèn)題,本文基于語(yǔ)義感知與模型生成技術(shù),提出了一種異常醫(yī)療數(shù)據(jù)的識(shí)別算法模型。該模型主要以Transformer網(wǎng)絡(luò)為主,同時(shí)融入膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)一步提升算法模型的識(shí)別準(zhǔn)確性,整體結(jié)構(gòu)如圖2所示。

        首先對(duì)電子病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,并將結(jié)果送入膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提取表層和結(jié)構(gòu)語(yǔ)義特征中;然后利用改進(jìn)的Transformer網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)對(duì)電子病歷深層次語(yǔ)義特征的提??;最后將兩者的特征進(jìn)行融合,完成對(duì)電子病歷語(yǔ)義感知和異常數(shù)據(jù)的識(shí)別。本文所提模型融合了膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),對(duì)電子病歷上下結(jié)構(gòu)和表層語(yǔ)義特征進(jìn)行提取,并考慮了電子病歷內(nèi)在的結(jié)構(gòu)邏輯,實(shí)現(xiàn)了對(duì)語(yǔ)義的感知。該模型對(duì)Transformer網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行改進(jìn),使用雙向Transformer網(wǎng)絡(luò),并使用注意力機(jī)制和位置編碼模塊,從而大幅提升了對(duì)長(zhǎng)距離語(yǔ)義依存信息的學(xué)習(xí)能力。同時(shí),模型還結(jié)合了膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)的損失,不但能夠加速收斂,而且提高了識(shí)別的準(zhǔn)確性。

        2.2" 膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

        由于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Convolutional Neural Network, CNN)在神經(jīng)元傳遞過(guò)程中表現(xiàn)為標(biāo)量,并不存在方向,所以無(wú)法表示高層次特征和低層次特征空間的關(guān)系,而且CNN中的池化層易丟失有價(jià)值的信息。因此,本文選用膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來(lái)提取上下結(jié)構(gòu)和淺層特征。

        膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Capsule Neural Networks, CapsNets)將神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的個(gè)體神經(jīng)元替換成了一組由神經(jīng)元組成的向量,并將其包裹在一起,組成一個(gè)膠囊[12?13]。普通神經(jīng)元與向量神經(jīng)元的結(jié)構(gòu)對(duì)比,如圖3所示。CapsNets的每層網(wǎng)絡(luò)都包含有多個(gè)膠囊單元,其中最重要的是動(dòng)態(tài)路由機(jī)制,其可以確保在信息選擇時(shí),能夠?qū)r(shí)序子膠囊獲得的特征傳遞給與預(yù)測(cè)最一致的時(shí)序父膠囊。

        假設(shè)上一層膠囊為父膠囊,下一層膠囊為子膠囊,父膠囊層第i個(gè)神經(jīng)元為[ui],其權(quán)重矩陣為[Wij],除第一層外,其余層膠囊的總輸入為[sj],最后通過(guò)非線性激活函數(shù)(Squash)計(jì)算得到輸出結(jié)果[vj]。

        [sj=icijujii=1nXi]" " " (7)

        [uji=Wijuii=1nXi]" " " (8)

        [vj=sj21+sj2·sjsj]" " " (9)

        式中:[cij]表示迭代路由的耦合系數(shù); [uji]表示預(yù)測(cè)向量;[uji]表示實(shí)際向量。

        通過(guò)調(diào)整耦合系數(shù)的大小決定路由最終抵達(dá)的時(shí)序父膠囊,具體過(guò)程如式(10)所示。

        [cij=ebijkebik]" " " " " (10)

        所有膠囊之間的耦合系數(shù)之和為1,通過(guò)Softmax函數(shù)可以計(jì)算路由耦合系數(shù),計(jì)算公式為:

        [bij=b′ij+vjuji]" " "(11)

        式中[bij]表示膠囊i到j(luò)的對(duì)數(shù)先驗(yàn)概率。每次當(dāng)動(dòng)態(tài)路由在前向傳播時(shí),先將[b′ij]初始化為0,然后利用式(11)對(duì)其進(jìn)行重新計(jì)算,同時(shí)使得路由耦合系數(shù)也發(fā)生更新,接著通過(guò)前向傳播進(jìn)一步更新[sj]來(lái)獲得[vj],以此不斷迭代循環(huán),最終得到最佳的一組耦合系數(shù)。

        2.3" 改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)

        CapsNets對(duì)結(jié)構(gòu)和淺層語(yǔ)義特征進(jìn)行提取后,使用改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò),即BERT網(wǎng)絡(luò)來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)電子病歷專業(yè)詞匯和深層語(yǔ)義特征的提取。BERT網(wǎng)絡(luò)[14?15]是在原始Transformer網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上加入一個(gè)雙向Transformer網(wǎng)絡(luò),并使用注意力機(jī)制和位置編碼模塊來(lái)提高對(duì)長(zhǎng)距離語(yǔ)義依存信息的學(xué)習(xí)能力,增強(qiáng)局部和全局特征的提取能力。

        BERT網(wǎng)絡(luò)能夠有效解決一詞多義的問(wèn)題,并通過(guò)數(shù)據(jù)集訓(xùn)練來(lái)克服數(shù)據(jù)規(guī)模導(dǎo)致的欠擬合問(wèn)題,從而提高整個(gè)模型的泛化能力。此外,該網(wǎng)絡(luò)還能夠捕捉到不同維度數(shù)據(jù)的語(yǔ)義特征,低層用于提取實(shí)體的語(yǔ)義信息,中層可以提取句法特征,而高層則提取深層次的語(yǔ)義特征。

        2.4" 損失函數(shù)

        本文提出模型的損失主要由CapsNets和改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)損失兩個(gè)部分構(gòu)成,而CapsNets損失又可分為間隔損失和重構(gòu)。間隔損失的計(jì)算公式為:

        [Lk=Tkmax0,m+-vk2+λ1-Tkmax0,vk-m-2] (12)

        式中:[Tk]表示類別是否存在,當(dāng)其值為1表示存在,為0則表示不存在;[m+]和[m-]分別表示懲罰假陽(yáng)性的上下限;[λ]為調(diào)節(jié)系數(shù)。

        重構(gòu)損失的計(jì)算公式為:

        [Lrec=λMSELossDt-Dr]" (13)

        式中:[Dt]表示原始數(shù)據(jù);[Dr]表示重構(gòu)數(shù)據(jù)。CapsNets損失可表示為:

        [LLoss=Lk+Lrec]" " " " (14)

        改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)損失使用均方誤差損失函數(shù),表達(dá)如下:

        [LBERT=1ki=1kyi-yi2]" " (15)

        式中:k表示樣本數(shù);y表示真實(shí)值;[yi]表示預(yù)測(cè)值。

        3" 實(shí)驗(yàn)和分析

        3.1" 數(shù)據(jù)集

        本文數(shù)據(jù)集由3家醫(yī)療機(jī)構(gòu)的電子病歷構(gòu)成,這些病歷詳細(xì)記錄了患者門(mén)急診、住院的診療情況,包含了結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)和非結(jié)構(gòu)化文本描述。為了能夠均衡抽取電子病歷樣本數(shù)據(jù),選取2021—2023年的電子病歷用于實(shí)驗(yàn),每年隨機(jī)抽取5 000份病例,并按照70%和30%的比例隨機(jī)劃分為訓(xùn)練集與測(cè)試集。

        3.2" 實(shí)驗(yàn)環(huán)境

        實(shí)驗(yàn)環(huán)境配置為:操作系統(tǒng)Windows 10,處理器i5?10400F,內(nèi)存64 GB,顯卡GTX1080Ti。采用的編程語(yǔ)言為Python,算法模型基于PyTorch 1.0實(shí)現(xiàn)。

        算法模型分為CapsNets和改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)兩個(gè)部分進(jìn)行參數(shù)設(shè)置。在CapsNets中,特征提取層由3層1D?CNN組成,其內(nèi)核大小為3,步長(zhǎng)為1;子膠囊層的膠囊為4維,個(gè)數(shù)為16,父膠囊則由8維膠囊組成,個(gè)數(shù)為32。在改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)中,隨機(jī)初始化原始參數(shù),優(yōu)化函數(shù)為Nadam,學(xué)習(xí)率設(shè)置為0.01,整個(gè)算法模型的Batch size為50,訓(xùn)練次數(shù)為200。

        3.3" 結(jié)果與分析

        為了驗(yàn)證模型能夠準(zhǔn)確地感知電子病歷的語(yǔ)義,并從海量結(jié)構(gòu)和非結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)異常數(shù)據(jù),本文使用準(zhǔn)確率(Accuracy)、精確率(Precision)、召回率(Recall)和F1分?jǐn)?shù)這4個(gè)指標(biāo)來(lái)評(píng)估模型的識(shí)別能力。準(zhǔn)確率表示預(yù)測(cè)正確的電子病歷數(shù)占總電子病歷數(shù)的比例;精確率表示預(yù)測(cè)正確的正例電子病歷占判斷為正例電子病歷的比例;召回率表示判斷正確的正例電子病歷占實(shí)際為正例電子病歷的比例;F1分?jǐn)?shù)為調(diào)和平均數(shù)。以上指標(biāo)計(jì)算公式如下:

        [Accuracy=TP+TNTP+TN+FP+FN]" " (16)

        [Precision=TPTP+FP]" " " " (17)

        [Recall=TPTP+FN]" " " " " (18)

        [F1=2TP2TP+FP+FN]" " " " (19)

        圖4給出了整個(gè)算法模型的ROC曲線圖,實(shí)線表示測(cè)試集,虛線表示訓(xùn)練集。從圖中可以看出,在迭代70次后,模型結(jié)果趨于穩(wěn)定,達(dá)到了最佳的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率0.942。

        為進(jìn)一步證明本文算法模型各部分對(duì)整個(gè)模型識(shí)別異常數(shù)據(jù)準(zhǔn)確率均有提升的作用,又進(jìn)行了消融實(shí)驗(yàn),結(jié)果如表1所示。

        從表1中可以看出:僅使用Transformer網(wǎng)絡(luò)模型的準(zhǔn)確率為80.1%;單一改進(jìn)Transformer網(wǎng)絡(luò)模型的準(zhǔn)確率為84.7%;而隨著膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的加入,識(shí)別準(zhǔn)確率逐步提升并達(dá)到最高94.2%。

        為進(jìn)一步驗(yàn)證所提算法模型的識(shí)別效果,文中還將其與目前的主流異常分類模型進(jìn)行了對(duì)比,結(jié)果如表2所示。由表中結(jié)果可以看出,本文模型的準(zhǔn)確率比CNN高出18.4%,比LSTM網(wǎng)絡(luò)模型高出12.3%,比Transformer網(wǎng)絡(luò)模型高出14.1%,且其他3個(gè)指標(biāo)也均為最高。

        4" 結(jié)" 語(yǔ)

        醫(yī)療信息化的快速發(fā)展使得相關(guān)機(jī)構(gòu)的醫(yī)療電子數(shù)據(jù)出現(xiàn)了海量增長(zhǎng),如電子病歷,其是臨床醫(yī)生診療記錄和診斷的重要依據(jù)。為實(shí)現(xiàn)對(duì)電子病歷異常數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確識(shí)別,本文提出了一種融合語(yǔ)義感知與模型生成的異常醫(yī)療數(shù)據(jù)識(shí)別算法。該算法模型通過(guò)融合膠囊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)電子病歷結(jié)構(gòu)和表層語(yǔ)義特征進(jìn)行提取,并對(duì)Transformer網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行改進(jìn),獲取到了更深層的語(yǔ)義特征;同時(shí)還結(jié)合了這兩個(gè)網(wǎng)絡(luò)的損失函數(shù),優(yōu)化了模型的收斂性。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本文模型能夠?qū)﹄娮硬v的語(yǔ)義和異常數(shù)據(jù)進(jìn)行識(shí)別,對(duì)于實(shí)現(xiàn)智能化的臨床輔助診療具有重要的意義。未來(lái)將進(jìn)一步優(yōu)化算法設(shè)計(jì),提高異常識(shí)別的精度和效率。

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        作者簡(jiǎn)介:高" 昱(1966—),女,滿族,遼寧錦州人,碩士研究生,副教授,研究方向?yàn)橹悄茚t(yī)學(xué)工程。

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