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        100份西瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性評(píng)價(jià)

        2024-12-06 00:00:00張露瑤陳中全卿東山孫小武蔡雁平戴思慧
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年21期
        關(guān)鍵詞:種質(zhì)資源相關(guān)性分析聚類分析

        摘要:以100份西瓜種質(zhì)資源為試材,采用變異系數(shù)分析、多樣性分析、相關(guān)性分析、主成分分析和聚類分析的方法,研究100份西瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣性。結(jié)果表明:34個(gè)農(nóng)藝性狀變異系數(shù)平均為24.91%,子房形狀、果實(shí)形狀、覆紋形狀和單瓜種子數(shù)4個(gè)指標(biāo)均超過50%;多樣性指數(shù)(H′)范圍在0.44~2.10,最小為葉片缺刻類型,最大為果皮硬度。果實(shí)重與果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、果皮硬度、果皮厚度、中心糖含量均呈極顯著正相關(guān)關(guān)系;15個(gè)果實(shí)性狀根據(jù)特征值和累計(jì)貢獻(xiàn)率簡(jiǎn)化為4個(gè)主成分,這4個(gè)主成分代表100份西瓜種質(zhì)資源的大部分遺傳信息,累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)75.817%。聚類分析顯示在歐氏距離為5時(shí),100份西瓜種質(zhì)資源分為4個(gè)類群:第Ⅰ類群含51份西瓜種質(zhì)資源,主要為圓形中果形瓜,種質(zhì)綜合性狀中等;Ⅱ類群包含33份種質(zhì)材料,主要為圓形小果形瓜,含1份特異覆紋種質(zhì);第Ⅲ類群的2份種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀優(yōu)異,主要為橢圓形大果,且果皮硬度大,宜作運(yùn)輸儲(chǔ)藏親本材料;第Ⅳ類群有14份種質(zhì)資源,主要為圓形大果形瓜,宜作籽小高糖的親本材料。

        關(guān)鍵詞:西瓜;種質(zhì)資源;相關(guān)性分析;主成分分析;聚類分析

        中圖分類號(hào):S651.037 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2024)21-0175-07

        收稿日期:2023-10-26

        基金項(xiàng)目:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(編號(hào):2020YFD1000300);國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(編號(hào):CARS-25)。

        作者簡(jiǎn)介:張露瑤(1998—),女,湖南婁底人,碩士研究生,主要從事西瓜分子育種研究。E-mail:2506572954@qq.com。

        通信作者:戴思慧,博士,教授,主要從事西甜瓜種子生產(chǎn)與育種研究。E-mail:daisihui@126.com。

        西瓜是我國重要的園藝作物,在瓜果類生產(chǎn)和供應(yīng)中具有重要的地位。但由于西瓜遺傳背景狹窄,目前全球西瓜育種面臨的首要任務(wù)是拓寬西瓜遺傳基礎(chǔ)、培育優(yōu)異種質(zhì)以及提高西瓜品種改良效率[1 。種質(zhì)資源是作物育種的重要物質(zhì)基礎(chǔ),全面了解和分析種質(zhì)資源的遺傳多樣性,是破解西瓜育種困境的重要手段[2,所以研究西瓜種質(zhì)資源不同表型性狀間的相互關(guān)系及其遺傳多樣性尤其重要。近年來,我國開展了西瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性研究并取得了一定進(jìn)展。孫波等利用23對(duì)西瓜核心SSR引物對(duì)湖南省主栽西瓜品種進(jìn)行了遺傳多樣性分析,聚類結(jié)果顯示在遺傳距離為0.66處可將湖南省主栽品種分為4類[3。王志強(qiáng)等對(duì)29份西瓜種質(zhì)資源的6個(gè)主要數(shù)量性狀進(jìn)行了主成分分析、多樣性分析以及相關(guān)性分析,綜合評(píng)價(jià)了29份參試材料,最終選出10份表現(xiàn)優(yōu)異的品種,為優(yōu)異品質(zhì)的選育提供了重要參考[4。高寧寧等利用相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(SRAP)分子標(biāo)記研究了45份小果型西瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣性和親緣關(guān)系,研究表明,雄性可育比雄性不育小果型的遺傳多樣性豐富,為今后小果型西瓜種質(zhì)及遺傳育種研究奠定了基礎(chǔ)[5

        本研究對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源進(jìn)行了農(nóng)藝性狀調(diào)查,觀察記錄了34個(gè)形態(tài)學(xué)性狀,通過多種表型性狀分析方法,研究了西瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣性特點(diǎn);同時(shí)通過聚類分析,明確了它們的分類和親緣關(guān)系,以期為西瓜種質(zhì)資源的分類和新品種選育提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        參試的100份西瓜種質(zhì)資源均由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所國家西瓜甜瓜中期庫提供。具體名稱見表1。

        1.2 試驗(yàn)方法

        試驗(yàn)于2023年3—7月在湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)人民東路試驗(yàn)基地(113°E,28°N)和園藝作物種質(zhì)創(chuàng)新與新品種選育教育部工程研究中心進(jìn)行。3月25日播種,穴盤育苗;5月4日4葉期定植。每份材料定植10株,株、行距分別為0.4、2.0 m,采用爬地栽培方式,雙蔓整枝。開花期進(jìn)行人工套袋授粉,每株留1果。常規(guī)水肥管理。每份材料隨機(jī)選取5株進(jìn)行性狀記載及數(shù)據(jù)調(diào)查。

        1.3 測(cè)定指標(biāo)

        對(duì)100份西瓜種質(zhì)的34個(gè)農(nóng)藝性狀的調(diào)查主要參考馬雙武等《西瓜種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》[6。數(shù)量性狀利用游標(biāo)卡尺、電子秤、手持測(cè)糖儀、硬度計(jì)進(jìn)行測(cè)量,質(zhì)量性狀按照表2進(jìn)行賦級(jí)。

        1.4 數(shù)據(jù)處理及分析

        采用Excel 2019對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總,計(jì)算每份種質(zhì)資源數(shù)量性狀的最大值、最小值、平均值、標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù);采用SPSS 26.0軟件進(jìn)行相關(guān)性分析、主成分分析和聚類分析。數(shù)量性狀測(cè)量值根據(jù)平均值(X)、標(biāo)準(zhǔn)差(S)將每個(gè)性狀測(cè)量數(shù)據(jù)分為10級(jí),從第1級(jí)<X-2S到第10級(jí)≥X+2S,中間每0.5S為1級(jí),統(tǒng)計(jì)各性狀在10個(gè)級(jí)別中的分布頻率。每級(jí)的相對(duì)頻率(Pi)用于計(jì)算多樣性指數(shù)。采用Shannon’s信息指數(shù)(H′)對(duì)各性狀的遺傳多樣性進(jìn)行評(píng)價(jià)。公式為H′=-∑(Pi)(lnPi)(i=1,2,3,…,n),式中:Pi表示某個(gè)性狀處于第i級(jí)別內(nèi)的材料份數(shù)占總樣本數(shù)的比例。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 西瓜種質(zhì)資源質(zhì)量性狀遺傳多樣性分析

        對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的15個(gè)質(zhì)量性狀進(jìn)行頻率統(tǒng)計(jì)和變異分析,結(jié)果(表3)表明,15個(gè)質(zhì)量性狀的變異系數(shù)范圍為11.42%~58.52%,平均值為28.22%。葉片缺刻類型的變異系數(shù)最低,為11.42%,變異幅度小,遺傳較穩(wěn)定。變異系數(shù)最高的為果實(shí)形狀,變異系數(shù)為58.52%,其次是覆紋形狀(53.30%)和子房形狀(52.29%),均高于50%,變異系數(shù)高,變異豐富。15個(gè)質(zhì)量性狀的多樣性指數(shù)范圍為0.44~1.65,其中葉片缺刻類型的多樣性指數(shù)數(shù)值最小,僅為0.44;最大的為果肉顏色,為1.65。多樣性指數(shù)>1的還有果皮底色(1.58)、覆紋顏色(1.18)、果肉質(zhì)地(1.18)和覆紋形狀(1.01)。多樣指數(shù)>1說明遺傳多樣性高,種質(zhì)間差異越大,性狀的多樣性越豐富。

        參試的100份西瓜種質(zhì)資源子葉顏色大部分為綠色(74.00%),子葉形狀大部分為卵圓形(74.00%)。62%的種質(zhì)資源株型為疏散型,38.00%為緊湊型。葉片顏色74.00%為綠色,葉片缺刻類型主要為3對(duì)(86.00%), 有19%的種質(zhì)資源開雌雄兩性花。子房形狀和果實(shí)形狀大部分為圓形,均占76.00%,52.00%的果皮無果粉附著。果皮底色為綠色(37.00%)最多,覆紋顏色最多的為深綠色(42.00%),覆紋形狀58.00%為網(wǎng)條,果肉顏色大部分為紅色(39.00%),果肉質(zhì)地有57.00%為脆。

        2.2 西瓜種質(zhì)資源數(shù)量性狀遺傳多樣性分析

        對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的19個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行觀察統(tǒng)計(jì),計(jì)算各值,結(jié)果見表4。19個(gè)數(shù)量性狀變異系數(shù)的平均值為22.30%,變化范圍在10.28%~50.19%,葉形指數(shù)的變異系數(shù)最小,表明該性狀離散程度低,變異較穩(wěn)定。單瓜種子數(shù)的變異系數(shù)最大,表明該性狀離散程度高,變異豐富。其余變異系數(shù)>30%的還有種子千粒重(41.94%)、果皮厚度(31.09%)和果實(shí)重(33.95%),表明這3個(gè)農(nóng)藝性狀變異較豐富。變異系數(shù)<15%的有葉形指數(shù)(10.28%)、果實(shí)橫徑(12.74%)、葉片長(zhǎng)度(13.28%)、邊糖含量(14.15%)、葉片寬度(14.30%)和中心糖含量(14.37%),說明這6個(gè)性狀的變異程度較低,遺傳較穩(wěn)定。19個(gè)數(shù)量性狀的多樣性指數(shù)在1.44~2.10之間,平均值為1.93,數(shù)量性狀的多樣性指數(shù)均高于質(zhì)量性狀,且均大于1,這說明西瓜種質(zhì)數(shù)量性狀的變異范圍更大。多樣性指數(shù)>2的有果皮硬度(2.10)、葉柄長(zhǎng)度(2.00)、果實(shí)重(2.01)、邊糖含量(2.02)、果皮厚度(2.03)、子葉寬度(2.04)、節(jié)間長(zhǎng)度(2.04),說明這7個(gè)數(shù)量性狀遺傳多樣性較豐富,改良潛力大。

        2.3 100份西瓜種質(zhì)資源果實(shí)性狀相關(guān)性分析

        為充分評(píng)價(jià)100份西瓜種質(zhì)資源,對(duì)10個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析(表5)。結(jié)果顯示,相關(guān)性極顯著的有15對(duì),相關(guān)性顯著的有5對(duì)。果實(shí)重與果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、果皮厚度、果皮硬度、中心糖含量呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,與邊糖含量呈顯著正相關(guān)關(guān)系,說明果實(shí)重對(duì)西瓜含糖量有較大影響。果皮厚度與果皮硬度呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,與邊糖含量呈顯著正相關(guān)關(guān)系,一般果皮厚度越厚,果皮硬度越大,越耐儲(chǔ)藏與運(yùn)輸;果皮厚度也會(huì)影響邊糖含量。中心糖含量與邊糖含量呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,一般中心糖含量越高,邊糖含量也越高;中心糖含量與種子千粒重呈極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系,這可能是長(zhǎng)期人工選擇導(dǎo)致的結(jié)果。單瓜種子數(shù)與其他果實(shí)性狀相對(duì)獨(dú)立,這說明單瓜種子數(shù)不因這些性狀的改變而改變。

        2.4 100份西瓜種質(zhì)資源果實(shí)性狀主成分分析

        對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的10個(gè)果實(shí)數(shù)量性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果見表6。前4個(gè)主成分特征值>1,且累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)75.817%,能夠概括全部性狀的75.817%的遺傳信息。第1主成分特征值為2.919,貢獻(xiàn)率為29.186%,其中果實(shí)重特征向量值最大,為0.872,主要反映了西瓜的重量,可稱為質(zhì)量因子。第2主成分特征值為1.979,貢獻(xiàn)率為19.789%,從特征向量值大小可以看出起決定作用的是中心糖和邊糖含量,其特征向量值分別為 -0.650 和-0.642,主要反映西瓜含糖量,可稱為果實(shí)糖度因子。第3主成分特征值為1.589,貢獻(xiàn)率為15.885%,單瓜種子數(shù)的特征向量值最大,為0.572,該成分主要反映西瓜種子數(shù)的多少,可稱為種子數(shù)量因子。第4主成分特征值為1.096,貢獻(xiàn)率為10.957%,單瓜種子數(shù)特征向量值最大,為0.542。

        通過主成分分析,計(jì)算100份西瓜種質(zhì)資源的主成分得分值。各主成分用F1、F2、F3、F4表示,10個(gè)果實(shí)性狀用X1~X10表示,根據(jù)各主成分的貢獻(xiàn)率權(quán)重得到以下方程式:F總=0.385F1+0.261F2+0.210F3+0.145F4計(jì)算每份材料綜合得分,得分見表7。排名前5的材料分別為MK027、MK093、MK037、MK091、MK031。

        2.5 100份西瓜種質(zhì)資源聚類分析

        利用SPSS 26.0軟件對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的34個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,繪制聚類圖(圖1),100份西瓜種質(zhì)資源在歐氏距離為5時(shí)可以分為4個(gè)類群。

        第Ⅰ類包含MK001和MK096等51份材料。以圓形瓜中果形為主,含2份橙黃色果肉種質(zhì),分別為MK021和MK053,可做特異種質(zhì)培育。單瓜重平均為3 191.61 g,中心糖含量平均為10.01%,邊糖含量平均為7.91%,單瓜種子數(shù)平均167粒。種子千粒重平均53.20 g。該類群在4個(gè)類群中各性狀均處于中等。

        第Ⅱ類含MK003和MK100等33份材料。主要為圓形小果形瓜為主,覆紋形狀以網(wǎng)條狀為主,少部分齒條和條帶,含有1份斑點(diǎn)狀覆紋種質(zhì),為MK063,可做特殊覆紋種質(zhì)利用。單瓜重平均為 1 935.62 g,中心糖含量平均為9.17%,邊糖含量平均為7.66%,單瓜種子數(shù)平均為202粒,種子千粒重平均為55.93 g,該類群是4個(gè)類群中含糖量最低的,但單瓜種子數(shù)是最多的,可作高產(chǎn)親本材料。

        第Ⅲ類僅含2份種質(zhì),分別為MK016和MK027。主要特征是橢圓形的大果形,果肉顏色為紅色。果實(shí)重平均為6 600.50 g,果皮硬度平均為12.36 kg/cm2,果實(shí)中心糖含量平均為9.35%,邊糖含量平均為7.73%。單瓜種子數(shù)平均為164粒,種子千粒重平均為67.66 g。該類群是4個(gè)類群中單瓜重最大的,且果皮硬度最大,可作大果形、宜儲(chǔ)藏運(yùn)輸?shù)挠H本材料。

        第Ⅳ類含MK031和MK091等14份材料。以圓形大果形瓜為主,其中MK031種質(zhì)為斑點(diǎn)狀覆紋,橘紅色果肉,可作為特殊種質(zhì)培育。單瓜重平均值為4 386.79 g,果實(shí)縱徑和橫徑的平均值分別為23.53 、18.75 cm。中心糖含量平均為10.88%,邊糖含量平均為8.40%。單瓜種子數(shù)平均為194粒,種子千粒重平均為43.92 g,該類群在4個(gè)類群中含糖量最高,種子千粒重最輕,可作為親本培育籽小而高糖的品種。

        3 討論與結(jié)論

        形態(tài)學(xué)標(biāo)記、染色體標(biāo)記、等位酶標(biāo)記和DNA分子標(biāo)記是植物遺傳多樣性分析的4種方法[7-9。此試驗(yàn)所使用的形態(tài)學(xué)標(biāo)記是目前諸多評(píng)價(jià)方法中最為基礎(chǔ)、直觀且容易操作的方法,在各個(gè)領(lǐng)域研究中被廣泛應(yīng)用,如黃瓜[10、番茄11、綠豆[12、芝麻13等。

        該試驗(yàn)通過對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的34個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行綜合分析,結(jié)果表明這100份西瓜種質(zhì)資源的34個(gè)植物學(xué)性狀具有豐富的遺傳多樣性。多樣性指數(shù)范圍為0.44~2.10,最大值為果皮硬度,說明該性狀的遺傳背景復(fù)雜。數(shù)量性狀的多樣性指數(shù)普遍高于質(zhì)量性狀,說明西瓜種質(zhì)數(shù)量性狀的變化幅度更大。變異系數(shù)越大表明離散程度越高,該性狀變異程度越大[14。34個(gè)農(nóng)藝性狀的變異系數(shù)范圍在10.28%~58.52%,平均值為24.91%;其中變異系數(shù)最大的是果實(shí)形狀,達(dá)到58.52%,說明供試材料中果實(shí)形狀的離散程度較高、變異幅度大,可以為今后西瓜品種改良提供多種選擇。

        相關(guān)性分析可探究不同農(nóng)藝性狀之間的相關(guān)密切程度[15。通過對(duì)果實(shí)性狀的相關(guān)性分析,結(jié)果表明100份西瓜種質(zhì)資源的果實(shí)性狀之間基本都存在極顯著或顯著的相關(guān)性。果實(shí)重與果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、果皮厚度、果皮硬度、中心糖含量都呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,說明果實(shí)重與這6個(gè)農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)性強(qiáng)。果皮厚度與果皮硬度呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,這與尚建立等的研究結(jié)果[16一致。

        主成分分析可以在一定程度上為育種者進(jìn)行重要目標(biāo)性狀的選擇提供必要信息[17-18。主成分分析結(jié)果顯示,前4個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率為75.817%,包含了果實(shí)性狀指標(biāo)的大部分信息,可作為西瓜種質(zhì)資源果實(shí)性狀平均綜合指標(biāo)。通過分析,篩選出5份綜合農(nóng)藝性狀較優(yōu)異的種質(zhì)資源,分別為MK027、MK093、MK037、MK091、MK031。

        聚類分析法廣泛應(yīng)用在揭示作物種質(zhì)資源間遺傳關(guān)系的研究中[19-20。本試驗(yàn)通過聚類分析將100份西瓜種質(zhì)資源分為4個(gè)類群,第Ⅰ類群主要特征為圓形中果,含糖量較高,該類群性狀均處于中等;第Ⅱ類群主要為圓形小果,含糖量是4個(gè)類群中最低的,單瓜種子數(shù)平均為202粒,是4個(gè)類群中最多的;第Ⅲ類群主要為橢圓形大果,平均單瓜重達(dá)到6 600.50 g,種子千粒重平均為67.66 g,是4個(gè)類群中最重的,可培育高產(chǎn)高品質(zhì)西瓜品種;第Ⅳ類群主要為圓形大果形瓜,中心糖和邊糖含量平均值分別為10.88%、8.40%,種子千粒重平均為43.92 g,是4個(gè)類群中含糖量最高、千粒重最輕的,說明小籽型瓜最多。

        綜上,通過對(duì)100份西瓜種質(zhì)資源的34個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行綜合評(píng)價(jià),表明其變異幅度大,遺傳多樣性豐富,相關(guān)性密切。但僅從形態(tài)學(xué)角度來分析,并不能全面揭示各種質(zhì)間的遺傳變異水平,還需從基因水平深入,通過分子標(biāo)記的方法來揭示種質(zhì)間的遺傳變異,為今后西瓜育種提供更科學(xué)的參考意義。

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