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        基于二階共同鄰節(jié)點(diǎn)的鏈路預(yù)測(cè)算法

        2024-06-03 00:00:00王海龍李晨璞王浩森
        軟件工程 2024年4期
        關(guān)鍵詞:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)

        摘 要:針對(duì)鏈路預(yù)測(cè)共同鄰居算法(CN算法)預(yù)測(cè)精確度偏低且不適用于多類型網(wǎng)絡(luò)的缺點(diǎn),在CN算法的基礎(chǔ)上,提出一種將共同鄰居的概念擴(kuò)展到二階的鏈路預(yù)測(cè)算法,算法將待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)的鄰節(jié)點(diǎn)分為3種類型,不同類型的鄰居點(diǎn)被賦予不同的權(quán)重,建立基于二階共同鄰節(jié)點(diǎn)的鏈路預(yù)測(cè)算法(CN2算法)。以7個(gè)真實(shí)網(wǎng)絡(luò)為例,通過(guò)計(jì)算分析AUC值(ROC曲線下的面積)測(cè)試算法預(yù)測(cè)精確度,將測(cè)試集數(shù)據(jù)劃分為5%~50%的不同比例以測(cè)試算法的魯棒性。綜合得出CN2算法的鏈路預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性較CN算法在7個(gè)網(wǎng)絡(luò)中平均提升9.9%左右,并且魯棒性更優(yōu)。

        關(guān)鍵詞:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò);鏈路預(yù)測(cè);共同鄰居

        中圖分類號(hào):TP393 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        0 引言(Introduction)

        鏈路預(yù)測(cè)的原理是通過(guò)分析現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)的鏈路和節(jié)點(diǎn)等已知部分的信息尋找和判斷網(wǎng)絡(luò)中缺失的鏈路,并預(yù)測(cè)未來(lái)可能出現(xiàn)的鏈路,這對(duì)更立體地研究復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)非常重要[1]。鏈路預(yù)測(cè)有著廣泛的應(yīng)用場(chǎng)景,研究者已在社交網(wǎng)絡(luò)、交通信息網(wǎng)絡(luò)、生物蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡(luò)、電力信息網(wǎng)絡(luò)等領(lǐng)域開(kāi)展了大量鏈路預(yù)測(cè)的研究[2]。

        鏈路預(yù)測(cè)算法主要分為三大種類:基于局部相似性的鏈路預(yù)測(cè)算法、基于路徑的鏈路預(yù)測(cè)算法、基于隨機(jī)游走的鏈路預(yù)測(cè)算法[3]。基于局部相似性的鏈路預(yù)測(cè)算法具有設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單、計(jì)算復(fù)雜度相對(duì)較低的優(yōu)點(diǎn),其主要原理為若兩個(gè)不直接相連的節(jié)點(diǎn)非常相似,比如相鄰節(jié)點(diǎn)相同、節(jié)點(diǎn)的度相同或節(jié)點(diǎn)共同鄰居相同,則兩個(gè)節(jié)點(diǎn)就極有可能在未來(lái)某段時(shí)間產(chǎn)生鏈接?;诼窂降逆溌奉A(yù)測(cè)算法是通過(guò)分析待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì)節(jié)點(diǎn)之間低路徑、高階路徑甚至全路徑進(jìn)行設(shè)計(jì)的?;陔S機(jī)游走的鏈路預(yù)測(cè)算法的設(shè)計(jì)原理是根據(jù)網(wǎng)絡(luò)信息,從當(dāng)前節(jié)點(diǎn)向其鄰居節(jié)點(diǎn)轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移的選擇由選用的算法決定,以此進(jìn)行鏈路預(yù)測(cè)。

        1 鏈路預(yù)測(cè)研究(Link prediction research)

        近年來(lái),基于隨機(jī)游走的鏈路預(yù)測(cè)算法吸引了許多學(xué)者的關(guān)注。例如,JORDAN等[4]提出機(jī)器學(xué)習(xí)中的集成學(xué)習(xí)可以很好地做到對(duì)算法取長(zhǎng)補(bǔ)短,然后引入鏈路預(yù)測(cè)科研領(lǐng)域,結(jié)合多種特征進(jìn)行系統(tǒng)地分析和研究。GUNS等[5]通過(guò)集成學(xué)習(xí)中的隨機(jī)森林算法,用非洲、中東等地區(qū)一些國(guó)家的城市疾病網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行仿真實(shí)驗(yàn),其預(yù)測(cè)精確度優(yōu)于單個(gè)鏈路預(yù)測(cè)算法。LIU等[6]提出了改進(jìn)后的圖嵌入隨機(jī)游走的鏈路預(yù)測(cè)算法,可以增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)涮匦?,提升算法的預(yù)測(cè)精確度,但大多需要提前對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理和訓(xùn)練,預(yù)測(cè)成本較高。

        在基于路徑的鏈路預(yù)測(cè)算法中,ZHOU 等[7]在共同鄰居算法的基礎(chǔ)上考慮了更深的一個(gè)層次———三階路徑,并提出在某種特定的網(wǎng)絡(luò)中,三階路徑算法的預(yù)測(cè)精確度要高于二階路徑算法的預(yù)測(cè)精確度。張齊[8]考慮將信息熵引入鏈路預(yù)測(cè)算法中以提高路徑預(yù)測(cè)算法的精確度,其中包括最短路徑的信息熵,提出了基于路徑熵的鏈路預(yù)測(cè)算法(如PE 算法等)。MOUTINHO等[9]提出了基于路徑的鏈路預(yù)測(cè)量子算法,算法使用受控的量子行走對(duì)偶數(shù)和奇數(shù)路徑進(jìn)行預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù)的編碼。基于機(jī)器學(xué)習(xí)和路徑的鏈路預(yù)測(cè)算法提高了預(yù)測(cè)精確度,但是兩類算法的時(shí)間復(fù)雜度都比較高,不適用于大型網(wǎng)絡(luò)。

        在基于局部相似性的鏈路預(yù)測(cè)算法的研究中,NEWMAN[10]提出在同一個(gè)網(wǎng)絡(luò)中有更多共同合作者的兩個(gè)節(jié)點(diǎn)在未來(lái)產(chǎn)生鏈接的可能性更大。ZHOU等[11]采用每個(gè)節(jié)點(diǎn)將單位資源平均分配給其相鄰節(jié)點(diǎn)為權(quán)重,提出了基于資源分配的鏈路預(yù)測(cè)算法。YANG等[12]在研究CN算法[13]的基礎(chǔ)上,引入引力場(chǎng)理論,提高了鏈路的預(yù)測(cè)精確度??紤]到預(yù)測(cè)精確度和預(yù)測(cè)成本,在CN算法的基礎(chǔ)上,本文將共同鄰居的概念進(jìn)行了擴(kuò)展,把這些節(jié)點(diǎn)分為3種不同的類型,不同類型的鄰居點(diǎn)被賦予不同的權(quán)重,提出二階共同鄰節(jié)點(diǎn)的鏈路預(yù)測(cè)算法(CN2算法),并將其應(yīng)用到7個(gè)真實(shí)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示本文提出的算法具有較高的預(yù)測(cè)精確度。

        2 算法介紹(Algorithm introduction)

        2.1 問(wèn)題描述

        首先對(duì)真實(shí)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)G(V,E)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)定義,其中V 為網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)集合,E 為網(wǎng)絡(luò)中的連邊集合。網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)總數(shù)為N 。通常用Sxy 表示鏈路預(yù)測(cè)算法中兩個(gè)節(jié)點(diǎn)相似度預(yù)測(cè)的量值,Sxy 的值越大,兩個(gè)節(jié)點(diǎn)間產(chǎn)生連邊的概率越高。

        2.2 鏈路預(yù)測(cè)經(jīng)典算法

        表1為下文所用符號(hào)及其含義。

        表2為幾種算法的公式定義。

        CN算法和Jaccard算法主要考慮了共同鄰居的數(shù)量對(duì)節(jié)點(diǎn)相似度的影響,AA算法、RA算法和Salton算法在此基礎(chǔ)上又考慮了共同鄰居節(jié)點(diǎn)度對(duì)節(jié)點(diǎn)相似度的影響。AA算法中兩個(gè)節(jié)點(diǎn)的共同鄰節(jié)點(diǎn)對(duì)其相似性的影響與共同鄰節(jié)點(diǎn)度的對(duì)數(shù)值成反比。RA算法考慮了資源平均分配的影響,認(rèn)為兩個(gè)節(jié)點(diǎn)的共同鄰節(jié)點(diǎn)對(duì)其相似性的影響與共同鄰節(jié)點(diǎn)的度值成反比。PA算法沒(méi)有考慮共同鄰居節(jié)點(diǎn),只考慮了待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì)兩個(gè)節(jié)點(diǎn)自身度值的影響。Katz算法考慮了兩個(gè)節(jié)點(diǎn)之間全部路徑對(duì)相似性的影響,此算法的相似性的預(yù)測(cè)精確度較高,但計(jì)算復(fù)雜度會(huì)隨著路徑長(zhǎng)度的增加而快速提升。

        2.3 基于二階共同鄰節(jié)點(diǎn)的鏈路預(yù)測(cè)算法

        在數(shù)據(jù)爆炸式增長(zhǎng)的時(shí)代,大型社交和信息網(wǎng)絡(luò)需要具備快速的處理和分析能力,這時(shí)基于局部節(jié)點(diǎn)信息的鏈路預(yù)測(cè)算法因具有較低的時(shí)效性而備受研究人員的關(guān)注。本文在CN算法的基礎(chǔ)上將共同鄰居的概念擴(kuò)展到二階鄰節(jié)點(diǎn),然后把這些節(jié)點(diǎn)分為3類,不同類型的鄰節(jié)點(diǎn)被賦予不同的權(quán)重,建立二階共同鄰節(jié)點(diǎn)鏈路預(yù)測(cè)算法,將Sxy 定義為

        SxCyN2=NⅠ+αNⅡ+α2NⅢ (1)

        CN2算法的核心思想是將待預(yù)測(cè)兩個(gè)節(jié)點(diǎn)(X 和Y)的二階鄰節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分類,第一類節(jié)點(diǎn)(N Ⅰ )是待測(cè)的兩個(gè)節(jié)點(diǎn)X 和Y 的共同鄰節(jié)點(diǎn),第二類節(jié)點(diǎn)(N Ⅱ )是與其中一個(gè)節(jié)點(diǎn)(如X)的距離為1的節(jié)點(diǎn),與另一個(gè)節(jié)點(diǎn)(如Y)的距離為2的節(jié)點(diǎn),第三類節(jié)點(diǎn)(N Ⅲ )是與X 和Y 兩個(gè)節(jié)點(diǎn)的距離均為2的節(jié)點(diǎn)。CN2算法對(duì)二階鄰節(jié)點(diǎn)集合范圍內(nèi)的節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分類,考慮到算法的時(shí)間復(fù)雜度,此算法只研究距離不大于2的鄰居節(jié)點(diǎn),CN2算法彌補(bǔ)了CN算法中預(yù)測(cè)信息較少的缺陷。

        圖1是CN2算法的一個(gè)示例網(wǎng)絡(luò),通過(guò)示例網(wǎng)絡(luò)可進(jìn)一步理解CN2算法建立的思想。圖1中,X、Y 是待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì),節(jié)點(diǎn)1和節(jié)點(diǎn)2為X 和Y 的第一類共同鄰節(jié)點(diǎn),即NⅠ,坐標(biāo)形式為(1,1),其中第一個(gè)坐標(biāo)表示鄰節(jié)點(diǎn)距離X 的步長(zhǎng),第二個(gè)坐標(biāo)表示鄰節(jié)點(diǎn)距離Y 的步長(zhǎng);節(jié)點(diǎn)3、4、6和7為第二類共同鄰節(jié)點(diǎn),即NⅡ,坐標(biāo)形式為(1,2)或(2,1);節(jié)點(diǎn)5為第三類共同鄰節(jié)點(diǎn),即NⅢ,坐標(biāo)形式為(2,2)。經(jīng)典的CN算法只考慮了待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì)X 和Y 的第一類共同鄰節(jié)點(diǎn),預(yù)測(cè)信息較少,本文將X 和Y 節(jié)點(diǎn)對(duì)的共同鄰節(jié)點(diǎn)拓展到二階,按照距離將其分為3類并賦予不同的權(quán)重,以提高鏈路預(yù)測(cè)的精確度。

        3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析(Experimental results and analysis)

        在分析階段,對(duì)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)中的所有連邊進(jìn)行數(shù)據(jù)集的劃分。每次隨機(jī)從網(wǎng)絡(luò)連邊集中抽取90%的連邊作為訓(xùn)練集,剩余部分為測(cè)試集。每種網(wǎng)絡(luò)獨(dú)立進(jìn)行100次重復(fù)實(shí)驗(yàn),取結(jié)果的平均值作為算法的最終預(yù)測(cè)效果。

        3.1 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

        為驗(yàn)證本文提出算法的有效性和精確性,本文在網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)集網(wǎng)站(https:∥networkrepository.com)中選取了7個(gè)不同的領(lǐng)域,對(duì)結(jié)構(gòu)和大小均不相同的實(shí)際網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),分別為線蟲(chóng)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(C.elegans)、科學(xué)家合作網(wǎng)絡(luò)(NS)、食物鏈網(wǎng)絡(luò)(FWFB)、海豚網(wǎng)絡(luò)(Dolphin)、柏林傳染病網(wǎng)絡(luò)(Dublin)、政治家博客網(wǎng)絡(luò)(PB)、電力網(wǎng)絡(luò)(Power)。表3為7個(gè)網(wǎng)絡(luò)的具體拓?fù)涮卣鳌?/p>

        3.2 評(píng)價(jià)指標(biāo)

        采用評(píng)價(jià)指標(biāo)AUC(ROC曲線下面積)[18]測(cè)試算法的預(yù)測(cè)精確度,原理為在網(wǎng)絡(luò)測(cè)試集中隨機(jī)選擇一條連邊,其概率大于在網(wǎng)絡(luò)中不存在的連邊中隨機(jī)選擇一條連邊的概率。例如,有n1 次選中在網(wǎng)絡(luò)測(cè)試集中連邊的概率大于不存在連邊的概率,有n2 次選中在網(wǎng)絡(luò)測(cè)試集中連邊的概率小于或等于不存在連邊的概率,AUC公式定義為

        3.3 實(shí)驗(yàn)步驟

        (1)對(duì)真實(shí)的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,得到用于實(shí)驗(yàn)的稀疏矩陣。

        (2)采用隨機(jī)抽樣的方式對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集進(jìn)行劃分。

        (3)將CN2算法和其他經(jīng)典預(yù)測(cè)算法進(jìn)行對(duì)比,計(jì)算每個(gè)算法的AUC平均值,并進(jìn)行比較。

        (4)多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)獲得平均預(yù)測(cè)值,根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果明確每一個(gè)真實(shí)網(wǎng)絡(luò)中α 的最優(yōu)值。

        (5)劃分不同比例的測(cè)試集,檢驗(yàn)算法的預(yù)測(cè)魯棒性。

        (6)對(duì)算法的預(yù)測(cè)精確度和魯棒性進(jìn)行總結(jié)。

        3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        在CN2算法中,α 是可以調(diào)節(jié)的權(quán)重參數(shù)。為了得到最優(yōu)的預(yù)測(cè)效果,本文設(shè)置α 值為0.001~1,將其分為3段。第一段為0.001~0.01,每次遞增0.001。第二段為0.01~0.1,每次遞增0.01。第三段為0.1~1,每次遞增0.1。對(duì)7個(gè)真實(shí)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行鏈路預(yù)測(cè)實(shí)驗(yàn),以AUC為評(píng)價(jià)指標(biāo),獲得每個(gè)網(wǎng)絡(luò)中最優(yōu)的α 值。AUC隨α 變化的趨勢(shì)如圖2所示。

        從圖2可以看出,當(dāng)α 取0.008時(shí),CN2算法對(duì)大部分網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測(cè)精確度較好,在FWFB網(wǎng)絡(luò)中且當(dāng)α 取0.04時(shí)的預(yù)測(cè)精確度最好。所以,在后續(xù)的計(jì)算過(guò)程中,在FWFB網(wǎng)絡(luò)中采用CN2算法進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí),α 取0.04,其他網(wǎng)絡(luò)中的α 取0.008。將CN2算法分別與CN 算法、AA 算法、PA 算法、RA算法、Salton算法、Jaccard算法和Katz算法在上述7個(gè)網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行對(duì)比,得到的AUC值如表4所示。

        由表4可知,在C.elegans、NS、FWFB、Dolphin、Dublin和Polblog六個(gè)網(wǎng)絡(luò)中,與其他七個(gè)算法相比,CN2算法預(yù)測(cè)得到的AUC值均最大,特別是在FWFB網(wǎng)絡(luò)中,AUC值有較大幅度的提高。但在Power網(wǎng)絡(luò)中,由于網(wǎng)絡(luò)中心性比較高,每個(gè)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)相差不大,因此CN2算法的預(yù)測(cè)精確度沒(méi)有達(dá)到最好的效果。從整體的實(shí)驗(yàn)結(jié)果來(lái)看,CN2算法達(dá)到了較好的預(yù)測(cè)精確度。

        為了更直觀地展示算法之間的差別,圖3顯示了8種鏈路預(yù)測(cè)算法在7個(gè)網(wǎng)絡(luò)中的AUC值直方圖。結(jié)合表4中的數(shù)據(jù)對(duì)不同網(wǎng)絡(luò)的AUC值進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),7個(gè)實(shí)驗(yàn)網(wǎng)絡(luò)中,CN2算法的AUC值在大部分情況下處于最高值,特別是在FWFB網(wǎng)絡(luò)中,CN2算法的AUC值比CN算法的AUC值高出31百分點(diǎn)左右。此外,該算法在不同的網(wǎng)絡(luò)中預(yù)測(cè)精確度都很高,在7個(gè)不同類型的網(wǎng)絡(luò)中,將CN算法的AUC值與CN2算法的AUC值進(jìn)行比較得出,CN2算法精確度平均提升9.9百分點(diǎn)左右,說(shuō)明該算法具有一定的適用普遍性,是一種較好的鏈路預(yù)測(cè)算法。

        3.5 魯棒性分析

        為了更全面地對(duì)CN2算法進(jìn)行測(cè)試,本文將網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)集進(jìn)行不同比例的劃分,比較在不同測(cè)試集比例下,CN2算法與其他7個(gè)預(yù)測(cè)算法預(yù)測(cè)精確度的差異,并對(duì)算法進(jìn)行魯棒性測(cè)試。測(cè)試集比例(Probe Size)從5%增加到50%,每次增加5百分點(diǎn)。對(duì)于Power網(wǎng)絡(luò),由于劃分測(cè)試集太大會(huì)導(dǎo)致網(wǎng)絡(luò)連通性降低,因此在Power網(wǎng)絡(luò)中將測(cè)試集的最大比例劃分定為0.2。實(shí)驗(yàn)中對(duì)所有網(wǎng)絡(luò),在每一種訓(xùn)練集比例下獨(dú)立重復(fù)100次,取AUC值均值作為最終的結(jié)果。在不同測(cè)試集比例劃分下,7個(gè)網(wǎng)絡(luò)中8種鏈路預(yù)測(cè)算法的AUC值如圖4所示。

        由圖4 可以看到,在C.elegans、NS、FWFB、Dolphin、Dublin和Polblog網(wǎng)絡(luò)中,隨著測(cè)試集比例的增大,CN2算法的AUC值均高于其他算法的AUC值,并且其AUC值隨測(cè)試集比例的增大而下降較緩慢。在Power網(wǎng)絡(luò)中,雖然CN2算法的AUC值低于Katz算法的AUC值,但是比其他算法的AUC值均高,因此綜合評(píng)測(cè)表明,CN2算法具有較高的預(yù)測(cè)魯棒性。

        4 結(jié)論(Conclusion)

        本文提出了一種基于二階共同鄰節(jié)點(diǎn)的鏈路預(yù)測(cè)算法———CN2算法,它是在CN算法的基礎(chǔ)上對(duì)共同鄰節(jié)點(diǎn)進(jìn)行了擴(kuò)展,增加了更多待預(yù)測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì)的周?chē)畔ⅲ顾惴ǐ@得了更好的預(yù)測(cè)精確度。對(duì)不同的鄰節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分類以達(dá)到更好的區(qū)分待測(cè)節(jié)點(diǎn)對(duì)的相似性。對(duì)7個(gè)不同類型的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行仿真測(cè)試,將CN2算法與7個(gè)不同的鏈路預(yù)測(cè)算法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)對(duì)比發(fā)現(xiàn),CN2算法具有較好的預(yù)測(cè)精確度。在7個(gè)不同網(wǎng)絡(luò)中精確度平均提升約9.9百分點(diǎn)。通過(guò)改變測(cè)試集比例的劃分測(cè)試算法的魯棒性發(fā)現(xiàn),CN2算法具有較好的魯棒性,綜合得出CN2算法具有較好的鏈路預(yù)測(cè)性能。

        參考文獻(xiàn)(References)

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        作者簡(jiǎn)介:

        王海龍(1998-),男,碩士生。研究領(lǐng)域:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò),鏈路預(yù)測(cè)。

        李晨璞(1979-),男,博士,副教授。研究領(lǐng)域:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論及應(yīng)用。

        王浩森(1987-),男,博士,副教授。研究領(lǐng)域:神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法及應(yīng)用。

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