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        改寫微生物密碼的“分子剪刀”

        2024-06-01 11:41:50王治鈞宋添力
        知識就是力量 2024年4期
        關(guān)鍵詞:核酸酶剪刀科研人員

        王治鈞 宋添力

        基因,儲存著生命誕生、成長、繁衍、凋亡的全部遺傳信息。2020年,2位科學(xué)家因在基因編輯技術(shù)上的發(fā)現(xiàn)被授予諾貝爾化學(xué)獎,這項技術(shù)就是CRISPR-Cas基因編輯技術(shù)。本期TED邀請到了2020年諾貝爾化學(xué)獎其中一位獲得者——美國分子生物化學(xué)專家珍妮弗·道德納(Jennifer A.Doudna),分享近年來該項技術(shù)在各個領(lǐng)域的新突破。

        分子生物化學(xué)專家珍妮弗·道德納

        探求基因密碼

        人類的基因序列是漫長歷史長河演化中的最優(yōu)選擇,這也意味著,基因發(fā)生任何微小的改變(突變),都有可能導(dǎo)致疾病的發(fā)生。一直以來,單/多基因疾病在臨床上缺乏行之有效的治療方案,理論上,從基因?qū)用嫘迯?fù)突變的基因是解決人類遺傳疾病的最佳方案。

        那么,我們能改變基因嗎?其實科研人員一直在努力?;蚓庉嫾夹g(shù)的原理是類似的,即對照著目標DNA進行基因編碼,然后讓編碼后的基因帶著被改造的核酸酶前去“切斷”目標DNA。第一代基因編輯技術(shù)出現(xiàn)于1996年,為ZFNs(鋅指核酸酶)技術(shù);2011年,科研人員發(fā)明了第二代基因編輯技術(shù),TALENs(轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物)技術(shù)。但這兩種技術(shù)都存在局限,于是,真正成熟、快捷、高效率的第三代基因編輯技術(shù)出現(xiàn)了——CRISPR-Cas技術(shù)(以下簡稱CRISPR技術(shù))。

        CRISPR 技術(shù)示意圖

        核酸酶正在切斷DNA序列(示意圖)

        看不見的剪刀

        CRISPR,是一類存在于大部分細菌和古菌基因組中的DNA序列家族。當(dāng)有噬菌體或病毒攻擊菌體時,這段序列會將“敵人”的DNA片段記錄下來,待到菌體再次受到類似攻擊時,序列中儲存的DNA片段會成為模板,幫助細菌合成相應(yīng)的RNA,摧毀攻擊者。

        科研人員以此為靈感,開發(fā)出CRISPR技術(shù),它就像一把分子剪刀,可以準確地識別、剪切噬菌體或病毒的DNA。根據(jù)想要切割的DNA設(shè)計RNA,讓這串RNA成為“地址”,指引著可以切斷核酸分子的核酸酶“找上門”,“插入”“修改”或“刪除”DNA,就像在文檔中查找、剪切、粘貼文本一樣。

        目前,CRISPR技術(shù)已被廣泛使用,用來沉默目標基因的表達。基于CRISPR技術(shù)的轉(zhuǎn)基因動物,極大地推動了醫(yī)療科技進步;在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,科研人員基于該技術(shù)培育出抗蟲、抗旱能力更強的經(jīng)濟作物新品種;也有報道稱,該技術(shù)可用來治療包括鐮刀型細胞貧血病(臨床表現(xiàn)包括慢性溶血性貧血)在內(nèi)的多種基因疾病,但想要將該技術(shù)應(yīng)用到臨床,依然存在一系列技術(shù)和倫理問題。

        現(xiàn)在,科研人員決定用它精確編輯微生物群。

        剪開微生物群的秘密

        微生物,指肉眼看不見或看不清的、具有獨特生命特征和功能的微小生命體,包括病毒、細菌、古菌、真菌、單細胞藻類以及原生生物等。它們通常為微米級或納米級,據(jù)推測,其個體總數(shù)量占地球生物圈的90%以上。

        人類與微生物群之間的關(guān)系至關(guān)重要,健康的微生物群有助于預(yù)防疾病,失調(diào)的微生物群則可能導(dǎo)致各種疾病的發(fā)生。

        CRISPR 技術(shù)在精準編輯微生物群方面的應(yīng)用(示意圖)

        微生物的行為并不完全獨立,而是個體與群體相互作用的結(jié)果,但由于微生物群的復(fù)雜性,科研人員通常以單個微生物為研究對象?,F(xiàn)在,人類擁有了一把“剪刀”,在宏基因組測序技術(shù)的幫助下,科研人員不僅可以分析微生物群的種群結(jié)構(gòu),還能進一步分析其功能和相互協(xié)作關(guān)系,從而精準定位想要編輯的基因和種群,使用CRISPR技術(shù)解決更多的科學(xué)問題。

        小世界的大合作

        存在于牲畜腸道內(nèi)的特定微生物群在代謝中不斷生成甲烷,從工業(yè)時代開始,規(guī)模化的大型牲畜養(yǎng)殖就成了重要的溫室氣體排放源?,F(xiàn)在,通過CRISPR技術(shù),科研人員可以在牲畜出生時就對其腸道內(nèi)部的微生物群進行編輯,降低產(chǎn)甲烷微生物的微生物群種類和數(shù)量,以減少溫室氣體排放。不僅如此,還能通過類似原理編輯垃圾填埋場和廢水中的微生物群,進而保護氣候與環(huán)境。

        不同微生物及其群落

        基于CRISPR技術(shù)的微生物群編輯在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域同樣有應(yīng)用。哮喘是一種由多種細胞參與的反應(yīng)性疾病,發(fā)作時會引發(fā)支氣管痙攣和肺通氣障礙,且常見于兒童中??蒲腥藛T發(fā)現(xiàn),哮喘可能與人體腸道內(nèi)微生物群產(chǎn)生的一些特定分子有關(guān),而CRISPR技術(shù)可以通過無創(chuàng)手術(shù)的方式阻止這些分子的產(chǎn)生。這項技術(shù)還可以幫助人類治療或預(yù)防與微生物群相關(guān)的其他健康問題,如過度肥胖、糖尿病、阿爾茨海默病等。

        CRISPR技術(shù)雖操作于微小,卻潛力無窮。它正與微生物世界緊密合作,為人類開拓更加美好、更加健康的未來。

        (責(zé)任編輯 / 牛一名 美術(shù)編輯 / 周游)

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