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        香椿中3個(gè)水通道蛋白基因(TsAQP)的克隆和表達(dá)分析

        2024-01-30 14:33:32趙胡沈程郝慶萍劉艷紅季春艷石瀟瀑
        關(guān)鍵詞:基因克隆香椿

        趙胡 沈程 郝慶萍 劉艷紅 季春艷 石瀟瀑

        趙? 胡,沈? 程,郝慶萍,等. 香椿中3個(gè)水通道蛋白基因(TsAQP)的克隆和表達(dá)分析[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2023,39(8):1635-1645.

        doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2023.08.003

        收稿日期:2022-11-27

        基金項(xiàng)目:安徽省高等學(xué)校自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(KJ2021A0683);阜陽(yáng)師范大學(xué)-阜陽(yáng)市2021年度市校合作科技專(zhuān)項(xiàng)(SXHZ202107);2020年度高校優(yōu)秀拔尖人才培育資助項(xiàng)目(gxgwfx2020049);阜陽(yáng)師范大學(xué)自然科學(xué)重點(diǎn)項(xiàng)目(2020FSKJ01ZD)

        作者簡(jiǎn)介:趙? 胡(1977-),男,安徽六安人,博士,副教授,主要從事植物分子生物學(xué)研究。(E-mail)zhaohu8196@sina.com

        通訊作者:石瀟瀑,(E-mail)tiramisu.shi@163.com

        摘要:水通道蛋白(Aquaporins,AQP)能夠促進(jìn)水分和小分子物質(zhì)在膜上的運(yùn)輸,維持細(xì)胞水分平衡。本研究利用香椿轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),克隆到3個(gè)香椿水通道蛋白基因(TsAQP),即??? TsPIP1-5??? (GenBank登錄號(hào)MT501152)、TsPIP2-5??? (GenBank登錄號(hào)MT501153)和??? TsTIP2-1??? (GenBank登錄號(hào)MT501154)。利用生物信息學(xué)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù),結(jié)合生理表型分析,研究TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白性質(zhì)、表達(dá)模式和在香椿芽采后貯藏中的功能。結(jié)果表明:從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中鑒定出的20個(gè)TsAQP可分為5類(lèi);TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1是通過(guò)跨膜區(qū)定位于膜的疏水性穩(wěn)定蛋白,含磷酸化位點(diǎn),無(wú)信號(hào)肽;? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在根、莖和葉中均有表達(dá)且有一定的器官差異性;? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在香椿芽低溫貯藏過(guò)程中表達(dá)量提高,暗示TsAQP在香椿芽采后脫水過(guò)程中有調(diào)控作用。本研究結(jié)果為進(jìn)一步研究香椿中TsAQP基因的功能和作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞:香椿;水通道蛋白;基因克隆

        中圖分類(lèi)號(hào):S644.4????? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A????? 文章編號(hào):1000-4440(2023)08-1635-11

        Cloning and expression analysis of three aquaporin genes (TsAQP) in Toona sinensis

        ZHAO Hu1,2 SHEN Cheng1,2 HAO Qing-ping1,2 LIU Yan-hong3 JI Chun-yan3 SHI Xiao-pu1

        (1.Biology and Food Engineering College, Fuyang Normal University, Fuyang 236037, China;2.Engineering Technology Research Center of Anti-aging Chinese Herb, Fuyang 236037, China;3.College of Information Engineering, Fuyang Normal University, Fuyang 236041, China)

        Abstract:Aquaporins (AQP) facilitate the transport of water and small molecules across membranes and maintain water balance of cells. Three aquaporin genes in Toona sinensis (TsAQP)??? TsPIP1-5??? (GenBank accession number MT501152)??? TsPIP2-5??? (GenBank accession number MT501153), and ????TsTIP2-1??? (GenBank accession number MT501154), were cloned based on transcriptome sequencing. Using a combination of bioinformatics and real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR), we studied the physiological phenotypes, protein properties, expression patterns, and function of TsPIP1-5, TsPIP2-5 and TsTIP2-1 during post harvest storage of Toona sinensis buds. The results indicated that 20 TsAQP proteins identified from the transcriptome data could be classified into five subfamilies. TsPIP1-5, TsPIP2-5 and TsTIP2-1 were hydrophobic stable proteins located on the membrane through the transmembrane region, containing phosphorylation sites and no signal peptide. Different expression levels of ????TsPIP1-5, TsPIP2-5??? , and ????TsTIP2-1??? ?were detected in the roots, stems and leaves with certain organ differences. The expression levels of ????TsPIP1-5, TsPIP2-5?? ?and ????TsTIP2-1??? ?increased during cold storage of Toona sinensis buds, suggesting that they played a regulatory role in the process of post harvest dehydration. The results of this study lay a foundation for further research on function and regulatory mechanisms of TsAQPs in Toona sinensis.

        Key words:Toona sinensis;aquaporin;gene cloning

        水通道蛋白(Aquaporin,AQP)是在生物體膜上的具有選擇性運(yùn)輸水分子功能的通道蛋白。AQP不僅運(yùn)輸水分,在氣體、硼、硅、活性氧(ROS)和陽(yáng)離子等小分子物質(zhì)的運(yùn)輸上也發(fā)揮多種生理作用[1-3]。AQP的相對(duì)分子質(zhì)量一般為2.3×104~3.1×105。X射線(xiàn)晶體學(xué)測(cè)定結(jié)果表明,AQP具有高度保守的結(jié)構(gòu)特征[4-5]。AQP有5個(gè)環(huán)狀結(jié)構(gòu)(A~E環(huán))和6個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)相互連接,其中B環(huán)和D環(huán)連接胞漿內(nèi),A環(huán)、C環(huán)、E環(huán)連接胞漿外[5]。AQP蛋白形成的中央水通道由跨膜結(jié)構(gòu)、B環(huán)、E環(huán)共同組成,AQP的典型結(jié)構(gòu)基序Asn-Pro-Ala(NPA)位于B環(huán)和E環(huán)[6]。

        AQP在植物中廣泛分布且表現(xiàn)出較高的多樣性,根據(jù)蛋白質(zhì)多肽鏈的氨基酸線(xiàn)性排列順序和蛋白質(zhì)在細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的定位,AQP可劃分為7個(gè)亞類(lèi)[7-8]:(1)具有質(zhì)膜定位的PIP蛋白,進(jìn)一步又可細(xì)分為PIP1類(lèi)和PIP2類(lèi);(2)具有液泡膜定位的TIP蛋白;(3)類(lèi)根瘤菌26膜內(nèi)在蛋白NIP;(4)小分子堿性膜蛋白SIP;(5)類(lèi)GlpF膜蛋白GIP;(6)未分類(lèi)的X蛋白XIP;(7)混合蛋白HIP。大豆中, NIP類(lèi)水通道蛋白GmNOD26定位于根系固氮菌周膜[9-10]。非豆科植物中, NIP定位于質(zhì)膜或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[11-13]。已知成員數(shù)較少的SIP主要定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[14], XIP主要定位在質(zhì)膜[15]。此外,GIP和HIP亞類(lèi)只存在于苔蘚中[7-8]。從非維管植物到維管植物,所有陸生植物均存在PIP、TIP、NIP和SIP亞類(lèi)[16],其中,大部分NIP和SIP對(duì)小分子有機(jī)物和礦物質(zhì)有良好的滲透性,而對(duì)水分子的轉(zhuǎn)運(yùn)活性和專(zhuān)一性較低[17-19],植物細(xì)胞水分的跨膜運(yùn)輸主要依賴(lài)于PIP和TIP[20-24]。

        香椿[Toona sinensis(A.Juss.)Raen]可作為樹(shù)木用于園林綠化,其嫩芽(香椿芽)更多作為蔬菜用于鮮食[25]。采后失水是香椿芽采后衰老劣變的原因之一[26]。AQP是調(diào)控植物水分運(yùn)輸和維持細(xì)胞內(nèi)水分平衡的重要基因[27-29]。目前,在分子層面上對(duì)香椿的AQP還有待進(jìn)一步了解。本研究首先在香椿轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上篩選出香椿AQP編碼基因(TsAQP)并進(jìn)行同源性分析;其次,在主要負(fù)責(zé)水分運(yùn)輸?shù)??? PIP1、PIP2和TIP??? 亞類(lèi)中各選取轉(zhuǎn)錄豐度較高且在香椿芽采后貯藏過(guò)程中表達(dá)量變化顯著的1個(gè)基因,通過(guò)PCR擴(kuò)增分別獲得??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 的基因序列,并對(duì)其編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析;最后,探究??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在香椿不同器官以及香椿芽采后貯藏過(guò)程中的表達(dá)模式。本試驗(yàn)的目的是為解析水通道蛋白參與調(diào)控香椿芽采后失水和衰老的機(jī)制提供理論依據(jù)。

        1? 材料與方法

        1.1? 植物材料及培養(yǎng)條件

        選用的香椿品種為黑油椿,2021年4月18日在安徽省太和縣香椿種植園采集香椿芽。為保證香椿芽材料遺傳背景一致,全部香椿芽均采自10年生的同株母樹(shù)。選取長(zhǎng)約15 cm生長(zhǎng)良好的嫩芽樣品,放入裝有冰袋的塑料箱中,迅速帶回實(shí)驗(yàn)室。新鮮香椿芽洗凈并晾干后放入4 ℃冰箱貯藏,分別于貯藏的第0 d、3 d和5 d取樣(每個(gè)取樣點(diǎn)設(shè)置3組重復(fù),每組重復(fù)由3~5個(gè)芽頭組成),液氮速凍,用于4 ℃貯藏期間TsAQP基因表達(dá)量的檢測(cè)。

        選取生活力和萌發(fā)率一致的香椿種子,栽培于實(shí)驗(yàn)室專(zhuān)用的塑料盆中。生長(zhǎng)條件設(shè)置為溫度20 ℃,光照度800~1 000 lx,光周期為12 h光照,12 h黑夜,相對(duì)濕度控制在65%左右。待第二對(duì)葉片展開(kāi),分別取來(lái)自3~5株小苗的根、莖和葉片組成1個(gè)生物學(xué)重復(fù)(共3組生物學(xué)重復(fù)),液氮速凍貯藏備用,用于檢測(cè)TsAQP基因在不同器官中表達(dá)量。

        1.2? 香椿采后失水試驗(yàn)

        將采摘后的香椿芽每組選取3~5個(gè)芽頭,將其分別放入100 μmol/L HgCl2溶液和蒸餾水(對(duì)照)中浸泡10 min后沖洗3~5遍,晾干表面水分,在4 ℃的冰箱里貯藏。分別在貯藏的第0 d、3 d和5 d的同一時(shí)間對(duì)香椿芽進(jìn)行形態(tài)觀察。

        1.3? 香椿水通道蛋白家族分析

        對(duì)從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得的20個(gè)TsAQP,利用MEGA 5軟件以鄰接法(Neighbor-joining method)分析氨基酸序列和同源性[30-31]。

        1.4? RNA提取和cDNA合成

        用試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品,貨號(hào)DP441]提取香椿幼苗不同部位的總RNA;1 000 ng總RNA用于反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,反轉(zhuǎn)錄試劑盒為天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品,貨號(hào)KR103。

        1.5????? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 基因克隆

        從轉(zhuǎn)錄組篩選到的TsAQP中選取主要負(fù)責(zé)水分運(yùn)輸?shù)? ??PIP1、PIP2??? 和TIP亞類(lèi)中轉(zhuǎn)錄豐度較高且在香椿芽采后貯藏過(guò)程中表達(dá)量變化顯著的? ??TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? ,設(shè)計(jì)并合成基因特異性引物(表1)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。將PCR擴(kuò)增得到的目的產(chǎn)物和線(xiàn)性化的克隆載體pMD18-T[寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司產(chǎn)品]按一定比例(參照試劑盒說(shuō)明書(shū))混合連接。連接后的產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌(E.coli DH5α)并送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。測(cè)序后分析比對(duì)堿基序列。

        1.6? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白生物信息學(xué)分析

        利用相關(guān)生物信息學(xué)在線(xiàn)軟件(表2)對(duì)3個(gè)TsAQP進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。

        1.7? 基因表達(dá)量檢測(cè)

        使用CFX96 Touch PCR儀(BIO-RAD伯樂(lè)生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品公司產(chǎn)品)進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng),檢測(cè)基因的相對(duì)表達(dá)量。采用熒光定量試劑盒FP205[天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品]中的試劑進(jìn)行試驗(yàn)?;騫RT-PCR特異性引物及內(nèi)參基因引物見(jiàn)表1。利用SPSS 18.0軟件,以ANOVA方式在P<0.05水平下進(jìn)行基因相對(duì)表達(dá)量的差異性分析。繪圖采用Origin 9軟件。

        2? 結(jié)果與分析

        2.1? 香椿AQP同源性分析

        在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中共鑒定出20個(gè)TsAQP基因,對(duì)它們所編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行同源性分析。如圖1所示,20個(gè)TsAQP可分為5類(lèi),分別為PIP2(6個(gè))、PIP1(4個(gè))、TIP(5個(gè))、NIP(2個(gè))和SIP(3個(gè))。

        CL6884.Contig9 All:TsPIP2-5;CL674.Contig4 All:TsPIP1-5;CL7513.Contig1 All:TsTIP2-1。

        2.2? 香椿??? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 基因克隆

        根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),在??? PIP1、PIP2??? 和TIP亞類(lèi)中各選取1條轉(zhuǎn)錄豐度較高且在香椿芽采后貯藏過(guò)程中表達(dá)量變化顯著的基因??? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? ,設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物(表1),以香椿嫩芽cDNA為模板,PCR擴(kuò)增后電泳,分別得到??? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 的擴(kuò)增條帶(圖2)。經(jīng)DNA測(cè)序后,明確了3個(gè)基因完整的編碼區(qū)序列(Coding sequence,CDS),并登錄NCBI比對(duì)(??? TsPIP1-5??? ?GenBank登錄號(hào)MT501152;? TsPIP2-5 ????GenBank登錄號(hào)MT501153;? TsTIP2-1??? ?GenBank登錄號(hào)MT501154)。TsPIP1-5蛋白是由867對(duì)堿基編碼的288個(gè)氨基酸構(gòu)成,TsPIP2-5蛋白是由858對(duì)堿基編碼的285個(gè)氨基酸構(gòu)成,TsTIP2-1蛋白是由744對(duì)堿基編碼的247個(gè)氨基酸構(gòu)成(圖3)。

        M:DL2000的DNA標(biāo)記物;A:TsPIP1-5;B:TsPIP2-5;C:TsTIP2-1。

        蛋白結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,3個(gè)TsAQP均有1個(gè)內(nèi)在蛋白(Major intrinsic proteins,MIP)的特征基序SGXHXNPAVTFG(圖3),表明TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1可參與小分子被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn),促進(jìn)水分子等在膜上的進(jìn)出。其中,TsPIP1-5的MIP結(jié)構(gòu)域位于氨基酸第46位至276位,TsPIP2-5的MIP結(jié)構(gòu)域位于氨基酸第31位至264位,TsTIP2-1的MIP結(jié)構(gòu)域位于氨基酸第15位至231位氨基酸(圖3)。除此之外,TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1各含有兩個(gè)非常保守的NPA(Asn-Pro-Ala)基序(圖3);TsPIP1-5、TsPIP2-5具有高等植物PIP所特有的兩個(gè)保守基序GGGANXXXXGY和TGTGINPARSLGAA(圖3A,圖3B);TsTIP2-1具有TIP特有的NPARS基序(圖3C)。

        下劃線(xiàn)(實(shí)線(xiàn)):MIP基序;下劃線(xiàn)(虛線(xiàn)):PIP保守結(jié)構(gòu)域;方框:TIP特有基序;陰影:NPA。

        2.3? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白理化性質(zhì)分析

        如表3所示,TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1的不穩(wěn)定系數(shù)分別為28.14、31.86和27.19,不穩(wěn)定系數(shù)均小于50,是穩(wěn)定蛋白。TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1親水系數(shù)平均值均大于0,屬于疏水蛋白,符合膜蛋白的特征。TsTIP2-1蛋白親水性系數(shù)平均值為0.931,疏水性高于PIP類(lèi)蛋白(TsPIP1-5蛋白親水性系數(shù)為0.385,TsPIP2-5蛋白親水性系數(shù)為0.518)。通過(guò)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè),TsPIP1-5和TsPIP2-5定位于細(xì)胞膜,TsTIP2-1定位于液泡。

        2.4? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白結(jié)構(gòu)分析

        無(wú)規(guī)則卷曲是TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白多肽主鏈形成的最主要的結(jié)構(gòu),分別占比高達(dá)48.61%、40.35%和37.25%,其次含量較高的多肽主鏈結(jié)構(gòu)是α-螺旋和延伸鏈,β-折疊占比較少(圖4A~圖4C)。其中,α-螺旋結(jié)構(gòu)含量達(dá)到30%左右(TsPIP1-5為28.4%,TsPIP2-5為36.49%,TsTIP2-1為34.01%),延伸鏈結(jié)構(gòu)含量達(dá)20%左右(TsPIP1-5為20.49%,TsPIP2-5為20.00%,TsTIP2-1為23.89%)(圖4A~圖4C)。TsPIP1-5、TsPIP2-5和TIP2-1蛋白的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)如圖4D~圖4F所示。

        2.5? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白的跨膜區(qū)、磷酸化位點(diǎn)和信號(hào)肽分析

        跨膜區(qū)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,TsPIP1-5和TsPIP2-5存在6個(gè)跨膜區(qū),TsTIP2-1存在7個(gè)跨膜區(qū)(圖5A~圖5C)。? 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,保守的絲氨酸位點(diǎn)在3個(gè)TsAQPs中大量存在,其次為蘇氨酸和酪氨酸位點(diǎn)(圖5D~圖5F),說(shuō)明TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1具有磷酸化的修飾機(jī)制。多個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)和磷酸化位點(diǎn)為蛋白質(zhì)在膜上提供結(jié)構(gòu)和功能的保障。分別對(duì)TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白多肽鏈的前60位氨基酸位點(diǎn)進(jìn)行分析,每一位點(diǎn)的得分(原始剪切位點(diǎn)C、信號(hào)肽S和綜合剪切位點(diǎn)Y)均較低,最高值不超過(guò)0.5(圖5G~圖5I),說(shuō)明3個(gè)蛋白質(zhì)均無(wú)信號(hào)肽。結(jié)合跨膜區(qū)、信號(hào)肽和亞細(xì)胞定位結(jié)果,說(shuō)明TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1為定位于膜的非分泌蛋白質(zhì)。

        2.6????? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 基因在香椿幼苗中的表達(dá)

        利用qRT-PCR檢測(cè)了3個(gè)TsAQP在香椿幼苗的根、莖和葉中的轉(zhuǎn)錄水平。? ??TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在根、莖、葉中均有表達(dá)。??? TsPIP1-5??? 在莖中的表達(dá)量是根和葉片的3倍左右(圖6A);? TsPIP2-5??? 的相對(duì)表達(dá)量由植物地下部分向地上部分逐漸升高,在葉中的表達(dá)量顯著高于根中(圖6B);? TsTIP2-1??? 則與??? TsPIP2-5??? 相反,在葉中表達(dá)量最低,在根和莖中的表達(dá)量相近,在根和莖中的表達(dá)量是葉中的5倍左右(圖6C)。

        不同小寫(xiě)字母表示在0.05水平差異顯著。

        2.7????? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 基因在香椿芽貯藏過(guò)程中的作用

        HgCl2可抑制水通道蛋白活性[20],本研究以100 μmol/L HgCl2處理香椿芽抑制水通道蛋白活性,研究TsAQP在香椿芽貯藏過(guò)程中的作用。在香椿芽低溫貯藏過(guò)程中,葉片逐漸萎蔫,在第3 d和5 d時(shí),對(duì)照組的葉片比100 μmol/L HgCl2處理組萎蔫程度更嚴(yán)重(圖7A),說(shuō)明水通道蛋白活性受抑制可延緩香椿芽采后失水。利用qRT-PCR檢測(cè)香椿芽采后低溫(4 ℃)貯藏過(guò)程中??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 的表達(dá)情況。總體來(lái)說(shuō),隨貯藏時(shí)間延長(zhǎng),3個(gè)TsAQP表達(dá)量上升,在采后0~3 d的時(shí)間內(nèi),表達(dá)量上升緩慢,采后3~5 d表達(dá)量上升迅速(圖7B)。??? TsPIP1-5??? 表達(dá)量在采后3 d是0 d的1.6倍,在采后5 d時(shí)是0 d的2.34倍(圖7B)。??? TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 的表達(dá)量變化更為劇烈,在采后3 d時(shí)分別是0 d的8.07倍和4.63倍,在采后5 d時(shí)分別是0 d的30.79倍和16.13倍(圖7B)。以上結(jié)果表明,水通道蛋白受抑制時(shí),香椿芽采后失水速率降低,香椿芽采后失水與TsAQP活性有關(guān);? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 基因在采后高量表達(dá),表明??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 可能在香椿芽采后失水及衰老過(guò)程中有重要調(diào)控作用。

        A:香椿芽表型; B:TsAQP基因相對(duì)表達(dá)量。不同小寫(xiě)字母表示在0.05水平差異顯著。

        3? 討? 論

        3.1? 香椿TsAQP基因及分類(lèi)

        植物AQP主要?jiǎng)澐譃?個(gè)亞類(lèi),其中PIP、TIP、NIP和SIP在所有植物中較為保守[32]。AQP基因家族表現(xiàn)出快速進(jìn)化的跡象,因此不同物種的AQP多樣性較高且不能必然區(qū)分物種之間的同源性[32]。在擬南芥、玉米、水稻、天山雪蓮、香石竹中分別鑒定出35、36、33、33、10個(gè)AQP基因[22-23,32-34]。香椿芽是中國(guó)特色蔬菜,但其采后訊速失水劣變,保鮮期短成為制約香椿作為鮮食蔬菜發(fā)展的重要因素。植物中AQP是調(diào)控細(xì)胞水分平衡的重要蛋白質(zhì),而香椿中AQP的基本信息尚未明確。本研究在分析香椿轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)之上共篩選出20個(gè)香椿TsAQP基因,分屬于??? PIP2、PIP1、TIP、NIP和SIP??? ?5個(gè)亞類(lèi)。利用分子克隆,獲得??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 的完整CDS序列,為深入研究TsAQP功能和香椿芽采后失水機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

        3.2? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白可能通過(guò)磷酸化執(zhí)行不同功能

        蛋白質(zhì)磷酸化是水通道蛋白執(zhí)行功能的重要保證。絲氨酸磷酸化對(duì)水通道蛋白的水轉(zhuǎn)運(yùn)活性有促進(jìn)作用[35]。對(duì)香椿TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1蛋白磷酸化位點(diǎn)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),3個(gè)TsAQP均含有較多的絲氨酸磷酸化位點(diǎn)。此外,在分析中發(fā)現(xiàn),同一磷酸化位點(diǎn)可能被多個(gè)不同激酶結(jié)合。例如,TsPIP1-5蛋白絲氨酸磷酸化位點(diǎn)S27被預(yù)測(cè)有DNAPK、ATM、CK-Ⅱ、cdc2等激酶可結(jié)合,相似的情況也見(jiàn)于TsPIP2-5和TsTIP2-1磷酸化位點(diǎn)。由此推測(cè),TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1具有靈活的調(diào)控機(jī)制,不僅在水轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中發(fā)揮重要功能,也可能通過(guò)不同的磷酸化途徑調(diào)控其他生命過(guò)程。

        3.3?? ???TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 的組織特異性表達(dá)及其作用

        基因在不同器官和組織中的表達(dá)與它們的功能相關(guān),具有不同水分轉(zhuǎn)運(yùn)活性的水通道蛋白在調(diào)節(jié)不同組織和細(xì)胞的水通量和維持水勢(shì)方面可能發(fā)揮著不同作用[28,36-39]。例如,PIP和TIP在根中的高水平表達(dá),與它們控制水的徑向運(yùn)輸、調(diào)節(jié)滲透壓有關(guān)[6,15,28,40-44]。PIP在葉肉細(xì)胞中的表達(dá)可維持細(xì)胞高水勢(shì),調(diào)控氣孔開(kāi)閉,促進(jìn)CO2擴(kuò)散,促進(jìn)葉肉細(xì)胞生長(zhǎng)[38,45-47]。不同植物的AQP基因在組織器官中的表達(dá)模式有所不同。例如,洋桔梗??? EgPIP1;3??? 在莖中表達(dá)量最高[48],龍眼??? DLPIP1??? 在根中的表達(dá)量明顯高于其他組織器官[49],香石竹??? DcaAQP4??? 在萼片和莖中有較高表達(dá)量?? DcaAQP7??? 特異表達(dá)于莖和葉組織[34]。本試驗(yàn)中?? TsPIP1-5??? 相對(duì)表達(dá)量最高的器官為莖;? TsPIP2-5??? 在莖和葉中的相對(duì)表達(dá)量明顯高于根;? TsTIP2-1??? 則是在葉片中表達(dá)量最低。說(shuō)明??? TsPIP2-5??? 可能與葉片細(xì)胞水勢(shì)維持、氣孔運(yùn)動(dòng)、CO2同化等過(guò)程有關(guān);? TsTIP2-1??? 可能主要控制徑向跨細(xì)胞水的運(yùn)輸和滲透調(diào)節(jié)。

        3.4????? TsPIP1-5、TsPIP2-5和TsTIP2-1??? 可能通過(guò)控制失水參與香椿芽采后衰老調(diào)控

        植物遭遇水分脅迫時(shí),水通道蛋白的表達(dá)及活性都受到精細(xì)復(fù)雜調(diào)控,確保細(xì)胞內(nèi)外的水分平衡[50],主要表現(xiàn)在不同水通道蛋白對(duì)水分脅迫的反應(yīng)有所差異[51-52]。水通道蛋白編碼基因? ??GhPIP2;7??? 和??? GhTIP2;1??? 可正向調(diào)節(jié)陸地棉對(duì)鹽和滲透脅迫的耐受性[29];整合有鹽生植物海蓬子(Salicornia bigelovii)水通道蛋白編碼基因??? SbPIP1??? 的轉(zhuǎn)基因煙草更能耐受干旱脅迫[53];過(guò)表達(dá)? ??MusaPIP2;6??? 的香蕉更能適應(yīng)鹽生環(huán)境[54]。高鹽堿的強(qiáng)滲透壓條件下,海刀豆水通道蛋白編碼基因??? CrPIP1;1、CrPIP2;4和CrPIP2;6??? 表達(dá)量上調(diào)響應(yīng)低水勢(shì)脅迫[55]。然而也有結(jié)果顯示,水通道蛋白編碼基因的高表達(dá)不能直接提高植物對(duì)水分脅迫的抗性[56]。例如,將擬南芥水通道蛋白編碼基因轉(zhuǎn)化進(jìn)煙草植株,可提高轉(zhuǎn)基因植株在適宜條件下的生活力但無(wú)法提高植株對(duì)鹽脅迫和生理脫水的耐受性[56]。由此看出,不同植物和不同類(lèi)型的水通道蛋白對(duì)水分脅迫響應(yīng)機(jī)制不同,這也體現(xiàn)了植物水通道蛋白的功能多樣性。從水通道蛋白表達(dá)與植株吸水能力關(guān)系來(lái)看,正常水分條件下水稻水通道蛋白對(duì)水力傳導(dǎo)度的貢獻(xiàn)為79%,而水分脅迫條件下水通道蛋白對(duì)水力傳導(dǎo)度的貢獻(xiàn)增加至85%[57]。水分脅迫條件下,根系水通道蛋白活性與水力傳導(dǎo)度、細(xì)胞膜水分通透能力同步下降[58]或同步增加[39]。由此可見(jiàn),植株在水分脅迫發(fā)生時(shí)可能通過(guò)協(xié)同調(diào)節(jié)水通道蛋白活性和表達(dá)量,實(shí)現(xiàn)一定時(shí)間內(nèi)或一定程度上對(duì)植株水分狀況的調(diào)節(jié)。香椿芽采后品質(zhì)劣變是生物學(xué)研究急需解決的問(wèn)題之一[59-60]。

        一直以來(lái),人們從活性氧代謝、酶活系統(tǒng)、次生代謝物調(diào)節(jié)等角度對(duì)香椿芽采后衰老生理機(jī)制進(jìn)行了大量研究。然而,果蔬在采后衰老過(guò)程中面臨的另一個(gè)重要問(wèn)題就是因脫水而導(dǎo)致離體器官水分平衡失調(diào)[26]。抑制水通道蛋白活性后香椿芽采后失水現(xiàn)象明顯緩解,并且??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在采后貯藏過(guò)程中表達(dá)量逐漸提高,說(shuō)明TsAQP在香椿芽采后失水過(guò)程中可能發(fā)揮了一定的調(diào)控作用。

        4? 結(jié)? 論

        香椿嫩芽采后易失水萎蔫,品質(zhì)下降。本研究明確了??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 基因序列及其編碼蛋白質(zhì)的基本理化性質(zhì);明確了??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在香椿幼苗不同器官中的表達(dá)情況。??? TsPIP1-5??? 在莖中的表達(dá)量較高?? TsPIP2-5??? 主要在莖和葉中表達(dá)量較高?? TsTIP2-1??? 在葉中表達(dá)最低;? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 的表達(dá)量在采后貯藏過(guò)程中逐漸提高,表明??? TsPIP1-5、TsPIP2-5??? 和??? TsTIP2-1??? 在香椿嫩芽采后失水過(guò)程中發(fā)揮調(diào)控作用。本研究從3個(gè)TsAQP基因入手,探討香椿嫩芽采后失水及其調(diào)控機(jī)制,為進(jìn)一步研究香椿水通道蛋白的功能奠定基礎(chǔ),同時(shí)可為生產(chǎn)上改進(jìn)香椿嫩芽采后貯藏保鮮技術(shù)提供新思路。

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        (責(zé)任編輯:成紓寒)

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