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        福建茶樹種質(zhì)資源群體結構及遺傳差異

        2023-12-29 00:00:00楊軍張力嵐張雯婧陳林海鄭國華李毅晶王讓劍
        茶葉科學 2023年6期

        摘要:利用38 對SSR 熒光引物對208 個福建茶樹種質(zhì)資源的群體遺傳結構、遺傳多態(tài)性、遺傳分化、基因流、分子方差進行分析,并調(diào)查其葉片性狀。結果表明,208 個福建茶樹資源的Nei’s 遺傳多樣性指數(shù)為0.674,Shannon’s 信息指數(shù)為1.444;葉面積與葉片長寬比平均值分別為27.442 cm2 和2.516;福建茶樹種質(zhì)資源的遺傳變異主要來源于個體間遺傳變異。經(jīng)群體結構分析將供試材料分為8 個群體,群體a、b、f、h 內(nèi)材料來源單一,群體c、d、e、g 內(nèi)材料來源復雜,不同地點間茶樹群體遺傳背景相似。群體a、群體b、群體e 內(nèi)共有40 個福建茶樹品種,群體a 內(nèi)主要為適制綠茶品種,群體b 內(nèi)主要為適制烏龍茶品種,群體e 內(nèi)代表性品種為適制綠茶品種,群體a、群體b、群體e 的群體屬性與適制茶類存在一定相關性;群體c 內(nèi)包含南靖縣、云霄縣與平和縣資源,地理位置相對較近,群體屬性與地理來源相關。群體g 與群體e 群體間基因流為6.321,表明群體間基因交流頻繁;群體相似系數(shù)聚類顯示群體d 與群體b 親緣關系較近。群體h 與其他群體間遺傳分化明顯,葉面積、葉齒數(shù)性狀特征差異顯著(Plt;0.05),群體f 與其他群體間親緣關系較遠,葉齒數(shù)、葉脈對數(shù)性狀特征差異顯著(Plt;0.05),說明群體h 和群體f 都具有一定的獨特性,需進一步鑒定。本研究結果為福建茶樹種質(zhì)資源的鑒定、篩選與利用提供一定的參考。

        關鍵詞:茶樹;福建;群體結構;遺傳差異

        中圖分類號:S571.1;S324 文獻標識碼:A 文章編號:1000-369X(2023)06-769-15

        茶樹[Camellia sinensis (L.) O. Kuntze]屬山茶科(Theaceae)山茶屬(Camellia),起源于我國西南地區(qū),至今已有三千多年的栽培歷史[1]。福建省茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性豐富,常規(guī)茶樹資源鑒定受生長環(huán)境、樹齡、加工技術水平等諸多因素的影響,鑒定與利用難度大。近些年,利用分子標記對茶樹地方茶樹種質(zhì)資源的鑒定主要集中在茶樹種質(zhì)資源的親緣關系分析、遺傳多樣性等方面。王麗鴛等[2]研究發(fā)現(xiàn),龍井群體的遺傳分化程度較低,個體間遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.050,群體間的Fst僅為0.034;雷雨等[3]利用EST-SSR 標記鑒定表明,湖南省古藺牛皮茶最有可能是茶樹新品系“53-34”的父本;陳熙等[4]分析了46 份陜西省茶樹資源,發(fā)現(xiàn)其遺傳多樣性水平較高。

        此外,研究人員對湖北省、四川省和云南省等地區(qū)的茶樹資源也進行了鑒定與分析[5-10]。群體遺傳結構分析是種質(zhì)資源鑒定分析的重要手段之一,目前利用Structure 模型進行群體結構分析在大豆[11]、茶樹[12]、菊花[13]、新麥草[14]、藍莓[15]、甘薯[16]等作物中已經(jīng)得到了廣泛應用。本研究利用SSR 標記對福建省208 個茶樹種質(zhì)資源進行群體結構、遺傳多樣性、群體遺傳分化、基因流、群體聚類以及葉片性狀等相關分析,以期揭示福建省茶樹種質(zhì)資源群體結構與遺傳差異,為福建茶樹種質(zhì)資源收集、保存、鑒定與利用提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        本研究試驗材料共計208 個(表1),其中44 個福建省主要栽培品種采自于福建省農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所的茶樹種質(zhì)資源圃(27°21′49′′N,119°57′68′′E),尤溪縣(26°74′81′′N,118°27′19′′E)、云霄縣(24°07′11′′N,117°22′41′′E)、邵武市(27°13′24′′N,117°15′18′′E)、福安市(27°05′88′′N,119°30′19′′E)種質(zhì)資源來自于福建省茶樹優(yōu)異種質(zhì)資源保護區(qū), 建甌市(26°97′23′′N,118°21′18′′E)、平和縣(24°27′41′′N,117°18′92′′E)、南靖縣(24°55′20′′N,117°09′45′′E)、仙游縣(25°12′14′′N,118°44′16′′E)種質(zhì)資源來自于地方種質(zhì)資源。于2019—2020 年采集各個材料一芽二葉鮮葉,用液氮迅速冷凍處理后保存在–80 ℃冰箱中備用。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 基因組DNA 的提取

        采用改進的CTAB 法[17]提取茶樹基因組DNA。用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳進行茶樹基因組分子量大小檢測,用756-MC 型紫外分光光度計測定茶樹基因組DNA 的純度。

        1.2.2 引物合成

        38 對引物序列信息來自文獻[18],引物由上海Sangon 公司合成,引物信息見表2。

        1.2.3 PCR 擴增和產(chǎn)物鑒定

        PCR 反應體系:ddH2O 18.8 μL,10×Buffer(Mg2+)2.5 μL,10 mmol·L-1 dNTP 0.5 μL,上、下游引物(10 μmol·L-1)各0.5 μL,Taqpolymerase(0.5 U)0.2 μL,DNA 模板1 μL。PCR 反應于美國ABI 公司9600 型擴增儀上進行,反應程序:94 ℃預變性4 min;94 ℃變性45 s,不同溫度條件退火60 s,72 ℃延伸75 s,35 個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。

        統(tǒng)一在反向引物的5' 段標記熒光(FAM/TAMRA),由百力格生物科技(上海)股份有限公司合成。取0.5 μL 擴增產(chǎn)物,0.5 μLGeneScan? 500 ROX?,9 μL 高度去離子甲酰胺(Highly deionized-formamide,HiDi),混勻后使用ABI 公司3730XL 測序儀進行毛細管電泳檢測。

        1.2.4 農(nóng)藝性狀調(diào)查

        調(diào)查本研究中208 個材料的葉長、葉寬、葉齒數(shù)等農(nóng)藝性狀,調(diào)查方法參考《茶樹種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標準》[19]。

        1.2.5 數(shù)據(jù)處理

        采用ABI 公司的GeneMapper 4.0 軟件,選擇GeneScan? 500 ROX?作為分子量標準,記錄擴增出的條帶大小。采用Struture2.3.4 軟件[20]進行供試材料群體結構分析,K值設置為2~17,重復9 次,不作數(shù)迭代數(shù)(Length of burn-in period)為50 000,MCMC(Multiple sequentially markovian coalescent)設為100 000 次,從而確定ΔK 與Q 值,用Clumpp 1.12 軟件對多次運行結果的進行整合,使用Distruct 1.1 軟件進行作圖。使用PopGen 3.2 軟件計算觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、Shannon’s 信息指數(shù)(I)、Nei’s 基因多樣性指數(shù)(H)、類群間Fst、基因流(Nm),通過PIC-CALC 軟件計算各引物的多態(tài)性信息含量指數(shù)( PIC ) 。運用NTSYSpc 2.1 和Mega 7.0 軟件對供試材料進行遺傳距離計算與UPGMA 聚類分析,并利用在線網(wǎng)站(https://itol.embl.de)進行圖片優(yōu)化。利用GenAlEx 6.5 進行分子方差分析(Analysisof molecular variances,AMOVA),采用SAS9.2 軟件進行葉片性狀方差分析。

        2 結果與分析

        2.1 引物的多態(tài)性信息量

        從表3 可知,38 對SSR 引物在供試樣品中共檢測到336 個等位基因,其中最多的為18 個,最少為4 個,平均值為8.842(毛細管電泳結果如圖1 所示);有效等位基因數(shù)(Ne)的變化范圍在1.549~10.041,平均值為3.688。PIC 值變化范圍在0.328~0.892,平均值為0.640,大于0.5,表明38 對引物整體多態(tài)性較高。Shannon’s 多樣性指數(shù)變化范圍在0.733~2.475,平均值為1.444,說明供試樣品遺傳多樣性較高。

        2.2 群體結構與遺傳聚類分析

        基于SSR 分子標記數(shù)據(jù)對208 個福建茶樹資源進行群體結構分析,當K=8 時ΔK 值最大(圖2A)。以類群屬性比率50%為標準的劃分依據(jù)[21],由圖2B 可知,群體結構將供試材料分為8 個群體(群體a~群體h)與1個混合群。其中,4 個群體遺傳來源組成相對簡單,群體a 內(nèi)福建省主要為適制綠茶品種,占83.3%;群體b 內(nèi)福建省主要為適制烏龍茶品種,占96.0%;群體f 內(nèi)建甌市茶樹種質(zhì)資源占100%;群體h 內(nèi)尤溪縣茶樹種質(zhì)資源占100%。其他4 個群體種質(zhì)資源來源組成相對復雜,群體c 主要為平和縣與云霄縣茶樹種質(zhì)資源,分別占總數(shù)的51.6%和32.2%;群體d主要為仙游縣與平和茶樹種質(zhì)資源,分別占比62.9%與25.9%;群體e 主要為邵武市與福安市茶樹種質(zhì)資源, 分別占總數(shù)的48.1%與36.5%;群體g 主要為建甌市和尤溪縣茶樹種質(zhì)資源,占比分別為41.1%和47.1%。遺傳距離聚類顯示(圖2C),群體e 與群體g 相互交集較多;群體結構顯示(圖2B),群體e 與群體g 均由紅色與藍色組成,組成比例有所不同。群體結構與遺傳距離聚類分群基本一致。

        進一步分析供試種質(zhì)資源的Q 值屬性,利用40 個福建省主要品種在群體a(綠色)、群體b(黃色)和群體e(紅色)內(nèi)的Q 值制作表4。3 種群體屬性之和平均值為0.941,說明40 個福建省品種主要由綠色、紅色、黃色屬性組成。群體a 內(nèi)的福鼎大白茶、福云6 號等8 個品種以綠色屬性為主(Q 綠值>0.8),皆為適制綠茶品種;群體b 內(nèi)的金牡丹、黃棪等22 個品種以黃色屬性為主(Q 黃值>0.8),皆為適制烏龍茶品種;群體e 內(nèi)的福安大白茶等4 個品種以紅色屬性為主(Q 紅值>0.5),皆為適制綠茶品種;其中,群體b 與群體e 內(nèi)丹桂、紫牡丹、福安大白茶、霞浦春波綠、霞浦元宵茶均由黃色、紅色屬性組成(Q 黃值>0.1和Q 紅值>0.1),丹桂、紫牡丹黃色屬性大于紅色屬性(Q 黃值>Q 紅值)為適制烏龍茶品種,福安大白茶、霞浦春波綠、霞浦元宵茶黃色屬性小于紅色屬性(Q 黃值<Q 紅值)為適制綠茶品種。綜合表明綠色、紅色屬性與適制綠茶屬性相關,黃色屬性與適制烏龍茶屬性相關。

        2.3 群體遺傳多樣性分析

        由表5 可知,208 個福建茶樹種質(zhì)資源的Shannon’s 遺傳多樣性指數(shù)為1.444,遺傳多樣性高。在群體a~群體h 中,群體c 與群體e 的Shannon’s 遺傳多樣性指數(shù)較高,分別為1.197和1.248,群體c 內(nèi)主要為平和縣、云霄縣、南靖縣地方資源,群體e 內(nèi)主要為福安市、邵武市、建甌市地方資源,群體內(nèi)資源來源廣泛。

        Hardy-Weinberg 遺傳偏離指數(shù)(D)主要反映Ho 和He 之間的平衡關系,D 值越接近0,基因型分布越接近平衡狀態(tài);D 值大于0,說明存在雜合子過剩;D 值小于0,說明存在雜合子缺失現(xiàn)象[22]。群體a 的D 值大于0,呈現(xiàn)雜合子過剩狀態(tài),可能是因為群體a 內(nèi)福云6號、福云7 號、福云10 號、福云20 號和福云595 均為福鼎大白茶與云南大葉種的后代,子代群體中產(chǎn)生了奠基者效應[23],導致連鎖不平衡現(xiàn)象的出現(xiàn)。群體f 內(nèi)材料均為建甌市茶樹種質(zhì)資源,D 值接近0,說明群體f 基因型的分布接近于平衡。除群體a 和群體f 外,其他6 個群體的D 值均小于0,說明存在雜合子缺失現(xiàn)象,其中群體c、d、e、g、h 可能是由于研究樣本數(shù)量有限引起,群體b 中14 個品種(占群體56%)可能受人工選育的影響。

        2.4 群體間遺傳分化、基因流與親緣關系分析

        群體間Fst 與Nm 是衡量種群間遺傳差異的重要指標。由表6 可知,8 個群體間Fst 值范圍為0.038~0.200,僅群體g 與群體e 間的Fst值小于0.05,均含有邵武市、建甌市地方資源,說明2 個群體間幾乎無分化;群體h 與其他群體間的Fst 值均大于0.15,種群間發(fā)生明顯分化,且群體內(nèi)均為尤溪縣種質(zhì)資源,說明群體h中的尤溪縣種質(zhì)資源群體的遺傳組成與其他群體差距大,具有一定的獨特性;其他群體間的Fst 值在0.05~0.15,均為中度遺傳分化。8 個群體間Nm 值范圍為1.000~6.321。其中,群體e與群體g、群體d 間的Nm 值大于4.000,群體間基因交流頻繁,且群體e 與群體g 都有邵武市、建甌市地方資源,群體e 與群體d 間都有福安市、仙游縣地方資源,說明群體間基因交流受取樣地點的影響;群體h 與群體d 間的Nm值最低(1.000),結合群體h 和群體d 材料來源背景,說明尤溪縣地方資源與仙游縣、平和縣資源基因交流較少。

        AMOVA 結果表明(表7),福建茶樹種質(zhì)群體的遺傳變異主要來源于材料個體間遺傳變異。群體間遺傳變異大于群體內(nèi)個體間遺傳變異,說明群體結構分類的8 個群體代表性較強,在一定程度情況排除人為取樣、地理來源等因素的影響,更能夠清晰、準確地分析種質(zhì)資源遺傳背景。

        利用8 個群體間的遺傳相似系數(shù)構建群體間的UPGMA 聚類圖。由圖3 可知,群體h、群體f、群體c 與其他群體間遺傳相似程度較遠。群體h、群體f 分別為尤溪縣、建甌市地方種質(zhì)構成,材料來源單一;群體c 由平和縣、南靖縣、云霄縣地方種質(zhì)構成,且平和縣、南靖縣、云霄縣距離較近(南靖縣到平和縣距離約25 km,平和縣到云霄縣距離約63 km、南靖縣到云霄縣距離約90 km),說明群體c 內(nèi)資源間的遺傳背景可能與地理位置相關;群體g 與群體e 間相似程度較高,親緣關系較近;群體d 與群體b 間相似程度較高,且群體b中茶樹品種主要為福建省烏龍茶品種,說明群體d 中茶樹種質(zhì)資源可能適制烏龍茶。

        2.5 群體葉片性狀分析

        葉片性狀分析結果如表8 所示,群體間葉片性狀都達到顯著性水平。8 個群體葉面積平均值為27.442 cm2,說明試驗中的福建茶樹資源多為中葉種(20 cm2<葉面積<40 cm2)。其中,群體h 的葉面積平均值為40.193 cm2,大于40 cm2,為大葉種;群體d 葉面積平均值為15.840 cm2,小于20 cm2,為小葉種;其他6 個群體葉面積在20~40 cm2,為中葉種。根據(jù)葉片長寬比將8 個群體分成2 個類型,類型Ⅰ有群體a、群體b、群體d、群體e,葉型為橢圓形(2.0<長寬比<2.5);類型Ⅱ有群體c、群體f、群體g、群體h,葉型為長橢圓形(長寬比>2.5)。群體f、群體g、群體h 在葉面積、葉齒數(shù)、葉脈對數(shù)、葉片長寬比性狀上具有一定的特點,群體f 在葉齒數(shù)、葉脈對數(shù)性狀上顯著高于其他群體;群體h 葉齒數(shù)性狀上低于其他群體;群體g 葉片長寬比高于其他群體,葉型長橢圓性狀明顯。

        3 討論

        3.1 福建茶樹資源遺傳多樣分析

        福建茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性豐富,不僅擁有很多高產(chǎn)、優(yōu)異的適制紅、綠茶和烏龍茶品種,還有大量野生茶、苦茶(尤溪縣湯川苦竹茶)以及特異茶(邵武市碎銅茶)的茶樹種質(zhì)資源。茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性分析是評價資源豐富度的重要指標。湖南黃金茶資源[24]、云南千家寨不同海拔野生茶樹種質(zhì)資源[25]、黔南野生茶樹種質(zhì)資源[26]、廣東歷史名茶群體種豐順馬圖茶種質(zhì)資源[27]、廣西部分地區(qū)野生茶樹種質(zhì)資源[28]、四川茶樹種質(zhì)資源[29]、安徽省太平猴魁茶產(chǎn)區(qū)柿大茶群體種[30]、云南西雙版納苦茶資源[31]的Shannon’s 信息指數(shù)范圍在0.550~1.464,平均值為1.154。本試驗中208 個福建茶樹種質(zhì)資源的Shannon’s 信息指數(shù)為1.444,高于湖南黃金茶、云南千家寨等8 個地方茶樹種質(zhì)資源Shannon’s 信息指數(shù)的平均值(1.154),且與最大值(1.464)相當。因此,說明本研究選取的福建省茶樹種質(zhì)資源群體遺傳多態(tài)性高,可供篩選與利用的茶樹種質(zhì)資源數(shù)量多。

        3.2 群體結構群體屬性分析

        種質(zhì)資源群體遺傳結構分析能明確亞群數(shù)目、遺傳背景與群體間基因交流,避免人為因素對類群劃分的影響[32]。寇淑君等[33]對131份糜子材料進行群體結構分析顯示,群體屬性與地理來源相關;文自翔等[34]對栽培大豆代表性地方品種群體結構分析顯示,群體屬性與地理生態(tài)類型相關聯(lián),證實地理生態(tài)類型劃分有其遺傳基礎;此外,在花椰菜[35]、葡萄[36]和玉米[37]等群體結構分析均表明群體屬性與地理來源、性狀特征存在相關性,受所選材料的地理來源、遺傳基礎、基因交流程度等綜合因素的影響。本研究群體c 內(nèi)主要來自地理位置相近的南靖縣、云霄縣與平和縣,擁有相同的紫色類群屬性,顯示群體屬性可能與地理來源相關;群體a、群體b 內(nèi)分別主要為福建省適制綠茶品種和烏龍茶品種,顯示群體屬性可能與茶類適制性相關。

        3.3 福建茶樹種質(zhì)資源初步鑒定結果

        茶樹種質(zhì)資源適制性鑒定通常選擇制作綠茶、紅茶、烏龍茶。福建省主要茶樹品種資源大多數(shù)都適制紅茶,而不都是適制烏龍茶與綠茶[38]。適制綠茶品種資源香氣以清香或栗香為主,適制烏龍茶品種資源多具備花香或果香的特征[39],適制烏龍茶和綠茶品種品質(zhì)特征的區(qū)別較大。因此,選擇優(yōu)先進行綠茶和烏龍茶適制性鑒定。此外,綠茶與烏龍茶適制性鑒定在鮮葉采摘標準、加工程序等方面差別較大,提前對茶樹種質(zhì)資源進行適制烏龍茶或綠茶屬性鑒定,有助于提高茶樹資源鑒定的效率。

        本研究中群體結構顯示,208 個福建茶樹資源存在8 種不同顏色類型屬性,受地理來源、基因交流、人工選擇等多因素的影響形成不同顏色群體屬性。福建省主要茶樹品種有綠色、紅色、黃色屬性,其中綠色、紅色屬性可能與適制綠茶屬性相關,黃色屬性可能與適制烏龍茶屬性相關。群體結構顯示,群體g 與群體e 群體部分材料都有紅色、藍色群體屬性,群體屬性相似,基因交流頻繁,群體聚類相似程度較近。因此,群體a、群體b、群體e、群體g 內(nèi)的地方資源可以通過3 種顏色的組成來判斷茶類屬性,優(yōu)先進行烏龍茶或綠茶適制性鑒定。群體c 由八仙茶以及南靖縣、云霄縣與平和縣的茶樹種質(zhì)資源組成,群體d 由仙游縣與平和茶樹種質(zhì)資源組成。其中,群體c 內(nèi)代表性品種是八仙茶,為適制烏龍茶品種,群體c 內(nèi)資源可能適制烏龍茶;仙游縣歷史上曾有鄭宅茶,以加工制作烏龍茶為主,且群體聚類顯示群體d 與群體b 相似程度近,群體d內(nèi)資源可能適制烏龍茶。群體h(均來自尤溪縣)、群體f(均來自建甌市)遺傳組成來源單一,其中群體h 與其他群體間(Fst 值>0.15)發(fā)生明顯分化,葉面積最大,葉齒數(shù)最少;群體f 基因型的分布接近于平衡,群體相對穩(wěn)定,與其他群體間相似程度較遠,葉齒數(shù)和葉脈對數(shù)顯著高于其他群體;表明群體h、群體f 都具有一定的群體獨特性,需要進一步鑒定。

        參考文獻

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