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        鏈霉菌次級(jí)代謝產(chǎn)物化學(xué)成分研究*

        2023-12-14 06:00:22朱夢月侍慧慧
        廣州化工 2023年14期
        關(guān)鍵詞:酮類水合苯環(huán)

        朱夢月,侍慧慧

        (南京醫(yī)科大學(xué)康達(dá)學(xué)院藥學(xué)部,江蘇 連云港 222000)

        天然產(chǎn)物是一類由動(dòng)植物和微生物等生物體代謝所產(chǎn)生的具有多種生物活性的小分子化合物[1],結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性和多樣性使它們廣泛成為藥物和藥物先導(dǎo)化合物[2]。隨著科技發(fā)展和人們對(duì)天然產(chǎn)物的深入研究,越來越多的微生物天然產(chǎn)物被分離鑒定,并作為源頭分子應(yīng)用于新藥研發(fā)[3-6],數(shù)據(jù)表明過去的四五十年間,約 46% 具有治療效果的小分子藥物來源于未經(jīng)修飾的天然產(chǎn)物或其衍生物[7]。

        微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物種類豐富,生物活性強(qiáng)。在已知結(jié)構(gòu)的 160 000 種天然產(chǎn)物中,約 50% 來自微生物,其中約 25% 是具有生物活性的小分子,包括抗生素、抗腫瘤藥物、免疫抑制劑、酶抑制劑和生物除草劑等,涉及人類生活的方方面面[8]。放線菌是自然界中分布廣泛的一類重要微生物資源,而鏈霉菌是其中數(shù)量最為龐大的屬。鏈霉菌次級(jí)代謝產(chǎn)物豐富多樣、結(jié)構(gòu)新穎、且具有較好的生物活性,是新型抗生素的重要來源。隨著測序技術(shù)和生物信息學(xué)的發(fā)展,科學(xué)家意識(shí)到鏈霉菌中大量基因簇處于沉默狀態(tài)這也就意味著鏈霉菌中仍有大量新型活性天然產(chǎn)物亟待發(fā)掘[9]。其中芳香族聚酮類化合物是一類具有抗病毒、抗真菌、細(xì)菌、抗腫瘤、抗寄生蟲、酶抑制劑以及免疫抑制劑作用等多種生物活性,結(jié)構(gòu)多樣化的細(xì)菌次生代謝物,是寶貴的藥源分子資源庫[10-14]。在數(shù)代人不懈努力下,許多聚酮類化合物及其半合成衍生物已作為高效藥物應(yīng)用于臨床,如四環(huán)素類抗生素及抗腫瘤藥物光神霉素和阿霉素等[15-16]。

        但是隨著抗生素廣泛使用甚至濫用,細(xì)菌耐藥性逐年增加,耐藥性細(xì)菌感染不僅嚴(yán)重危害人類健康,而且已成為世界范圍的棘手問題,所以深入挖掘微生物來源新型天然產(chǎn)物仍是當(dāng)今藥學(xué)領(lǐng)域的研究重點(diǎn)[17]。

        基于鏈霉菌的巨大資源優(yōu)勢,本文重點(diǎn)研究從連云港花果山上采集的土壤樣品中分離出一株鏈霉菌編號(hào)NA07292,通過基因組測序鑒定為鏈霉菌屬Streptomyces peucetius。根據(jù)NA07292次級(jí)代謝產(chǎn)物紫外圖譜,推測出次級(jí)代謝結(jié)構(gòu)上屬于聚酮類[18-19],這一類化合物具有多種生物活性、結(jié)構(gòu)多樣,有望從中分離出活性較好的藥物先導(dǎo)分子。對(duì)這一株菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),采用Sephadex LH-20 柱色譜、正相硅膠柱、反相硅膠柱、高效液相制備色譜、等手段對(duì)其次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行分離純化,最終分離出1個(gè)化合物,根據(jù)質(zhì)譜、一維和二維波譜數(shù)據(jù)、理化性質(zhì)等鑒定結(jié)構(gòu)為4-O-(β′-D-glucopyranuronosyl)-ε-rho-domycinone(1)(圖1),諸多同類吸收的化合物待分離,結(jié)構(gòu)上都屬于芳香聚酮類化合物。

        圖1 化合物1的化學(xué)結(jié)構(gòu)

        1 實(shí) 驗(yàn)

        1.1 材料、儀器、試劑、培養(yǎng)基等

        1.1.1 材料與工具

        主要材料:TLC 硅膠板(5×20 cm)煙臺(tái)江友硅膠開發(fā)有限公司;反相柱色譜(ODS 填料),日本YMC有限公司;凝膠填料(Sephadex LH-20),Pharmacia Biotech公司;柱色譜硅膠(200~300目),青島海洋化工;樹脂等。

        工具:200 μL和1 mL移液槍配備200 μL和1 mL 槍頭;培養(yǎng)皿;EP管;鑷子;剪刀;研缽;酒精燈;接種環(huán);涂布環(huán);分液漏斗;旋蒸瓶;1 L錐形瓶;青霉素小瓶等。

        1.1.2 儀器

        電子天平;生物安全柜;超凈工作臺(tái);高壓蒸汽滅菌鍋;-80 ℃超低溫冰箱;恒溫培養(yǎng)箱;高速離心機(jī);恒溫?fù)u床;超純水儀;冷凝循環(huán)裝置CA-1111;旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀EYELAN-1000;半制備色譜柱MPLC(Agilent Eclipse XDB-C18,5 μm,250 mm×9.4 mm);高效液相色譜儀HPLC(Agilient 1260 Infinity XDB-C18column,5 μm,250 mm×9.4 mm);核磁共振儀(Bruker Avance III 400/600,TMS 為內(nèi)標(biāo));紫外測定儀(Nanodrop2000);傅里葉變換紅外光譜儀(Nexus 870 FT-IR);紫外分光光度計(jì)(detector L-7400 UV)。

        1.1.3 試劑

        乙腈等(分析純),廣州金華大化學(xué)試劑公司;甲醇;乙腈等色譜級(jí)別溶劑(海市百靈威);石油醚、乙酸乙酯、正丁醇、氘代DMSO,上海市恩拿馬生物科技有限公司;二氯甲烷;纈氨酸;亮氨酸;D-FDAA,西格瑪奧德里奇有限公司。

        1.1.4 培養(yǎng)基

        PDA(馬鈴薯葡萄糖瓊脂):土豆210 g去皮,切成小塊,加入適量水,煮沸30 min后,用兩層醫(yī)用紗布過濾得濾液,加水定容至1 L,再稱取 2 g 蔗糖和 10%也就是20 g瓊脂,混勻溶解后分裝于5個(gè)錐形瓶中,115 ℃條件下滅菌 30 min,冷卻至 60 ℃以下,加氨芐青霉素和卡那霉素各150 mg,搖勻后倒入培養(yǎng)皿,冷卻凝固后備用。

        Malt(麥芽培養(yǎng)基):麥芽20 g左右加600 mL水煮沸30 min,用兩層醫(yī)用紗布過濾得濾液,加1 g蛋白胨,20 g蔗糖,加水定容至1 L后搖勻。

        GS(高氏培養(yǎng)基):1 g硝酸鉀、0.5 g 氯化鈉、0.5 g 三水合磷酸氫二鉀、0.01 g七水合硫酸亞鐵、0.5 g 七水合硫酸鎂、20 g可溶性淀粉、10 g瓊脂粉、加入1 L水定容,調(diào)節(jié)PH至7.4~7.6。

        ISP4培養(yǎng)基:2 g氯化銨,2 g七水合硫酸鎂,1.365 g磷酸氫二鉀,2 g碳酸鈣,1 g氯化鈉,0.1 mL微量元素,10 g可溶性淀粉,20 g瓊脂粉,加1 L水定容后,溶解搖勻。

        CPA(纖維素脯氨酸瓊脂培養(yǎng)基):0.5 g氯化鈣,0.25 g硝酸鉀,0.2 g磷酸氫二鉀,1.0 g脯氨酸,2.0 g丙酮酸鈉,2.5 g羧甲基纖維素鈉,0.2 g七水合硫酸鎂,10 mg七水合硫酸亞鐵,20 g瓊脂粉,加1 L水溶解定容(CMC-Na提前用熱水不斷攪拌溶解,再加入重鉻酸鉀,保證終濃度為50 μg/mL)。

        38#培養(yǎng)基:4.0 g葡萄糖,5.0 g麥芽浸出物,4.0 g酵母浸出物,1 mL復(fù)合維生素,20 g瓊脂粉,用1 L水定容溶解。

        TSB培養(yǎng)基:30 mg TSB用1 L水溶解。

        F培養(yǎng)基:0.1 g酪蛋白水解物,10.0 g葡萄糖,20.0 g蔗糖,1.0 g六水合氯化鎂,0.25 g硫酸鉀,5.0 g酵母浸出物,5 g MOPs,0.1 mL微量元素,用1 L水溶解定容。

        Y培養(yǎng)基:10.0 g麥芽浸出物,4.0 g葡萄糖,4.0 g酵母浸出物,用1 L水溶解。

        A培養(yǎng)基:1 g碳酸鈣,4 g酵母浸出物,2.0 g蛋白胨,0.04 g硫酸鐵,0.1 g溴化鉀,10.0 g可溶性淀粉,用1 L水溶解。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 菌種分離方法及菌種鑒定

        菌種分離方法:菌種編號(hào)NA07292這一株鏈霉菌是從江蘇連云港花果山上的土壤樣品中分離得到,用多種微生物培養(yǎng)基純化,最后發(fā)現(xiàn)此菌只在ISP4培養(yǎng)基平板上生長。具體步驟:將土壤樣品風(fēng)干后各稱取5 g左右,加入250 mL無菌水恒溫懸浮2 h,再使用無菌水將其稀釋成三個(gè)濃度梯度10-1、10-2、10-3,將三個(gè)濃度梯度分別用涂布棒涂布于PDA、GS、CPA、純瓊脂平板上,隨后恒溫培養(yǎng)直至長出單菌落后,再用Malt、ISP4、38#培養(yǎng)基純化,最后發(fā)現(xiàn)只有ISP4培養(yǎng)基上菌落,其他培養(yǎng)基均無菌落,菌落特征是內(nèi)生菌絲深紫色,氣生菌絲白色。

        菌種鑒定:將菌種孢子粉末沾取少量至EP管中,加入裂解液、Tris-HCl緩沖液(pH= 8.0)、 EDTA、NaCl和二烷基硫酸鈉,置于渦旋混合儀混合,放入60 ℃水浴鍋中孵育20 min,上下顛倒充分混勻。之后向混懸液中加入醋酸鉀溶液,混勻后,離心10 min,吸取500 μL 上清至新EP管中,再加入同體積異丙醇,EP管上下顛倒至出現(xiàn)白色絮狀沉淀,離心5 min,撇去上清液,再在EP管中加70%乙醇,混勻后離心3 min,再撇去上清,循環(huán)操作兩次將帶有基因組的EP管打開于室溫下晾10 min后加65 ℃熱水,基因組溶解后用NanoDrop2000 測濃度,并將提取的基因組片段送至擎科生物公司測序鑒定菌種。通過形態(tài)學(xué)和18S rRNA 序列對(duì)比,菌株鑒定結(jié)果表明屬于該海洋放線菌NA07292是Streptomyces peucetius。

        1.2.2 菌種的發(fā)酵及提取分離方法

        將鏈霉菌NA07292(Streptomyces peucetius)純化到ISP4平板培養(yǎng)基上培養(yǎng)一周,長出菌落后,配制1.0 L TSB培養(yǎng)液平均分裝到5個(gè)1 L錐形瓶中,挑一塊長有孢子的ISP4培養(yǎng)基接種到錐形瓶中,恒溫28 ℃、140 rpm/min搖至瓶中長出密集菌粒,即可作為種子液。

        配制Y培養(yǎng)基9 L,平均分裝于35個(gè)1 L的錐形瓶中,115 ℃滅菌30 min,接種培養(yǎng)液量的5%即12.5 mL種子液,30 ℃恒溫、220 rpm搖床發(fā)酵7天。

        發(fā)酵完成后,用紗布過濾,紗布下方濾液即得菌液。往菌液中加入大孔樹脂,吸附4 h,再用紗布過濾得到吸附后的樹脂,樹脂風(fēng)干后用CH3OH浸泡3次,合并3次CH3OH浸泡液進(jìn)行旋蒸濃縮后得到粗膏,再依次用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇按1:1的比例各萃取3遍粗膏,旋蒸濃縮后可得3段粗浸膏,通過HPLC分析發(fā)現(xiàn)乙酸乙酯段粗浸膏有目標(biāo)化合物。乙酸乙酯段粗浸膏共8.7 g。

        8.7 g乙酸乙酯段粗浸膏首先用中壓制備色譜MPLC分離,流動(dòng)相組成為水和甲醇,按80%~20%甲醇梯度洗脫后,將多段洗脫液進(jìn)行薄層色譜TLC分析,將有類似組分的洗脫液合并濃縮后,分為8組(Fr1-Fr8)。對(duì)Fr4和Fr6進(jìn)一步分析純化,F(xiàn)r4段首先用凝膠柱色譜Sephadex LH-20 初步分離后,再用高效液相色譜HPLC純化得到化合物1,剩余浸膏段待分離。具體分離流程如圖2所示。

        2 化合物的結(jié)構(gòu)鑒定

        化合物1:紫紅色無定形粉末,高分辨質(zhì)譜HRESIMS顯示 m/z:627.378 5[M+Na]+,合理分子式C28H28O15,不飽和度為15,核磁數(shù)據(jù)見表1。

        表1 化合物1的1H NMR (400 MHz)和13C NMR (100 MHz)數(shù)據(jù)歸屬 (DMSO-d6)

        1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)譜中,低場區(qū)也就是芳香區(qū)出現(xiàn)一個(gè)苯環(huán)上3個(gè)相鄰氫的特征信號(hào) (δC/H120.95/7.97,δC/H136.4/7.90,δC/H122.91/7.73,),中高場區(qū)出現(xiàn)糖環(huán)的5個(gè)氫的特征信號(hào) (δH3.38,3.49,3.52,4.03,5.32),高場區(qū)還出現(xiàn)2個(gè)亞甲基 (δH1.98~2.09,1.41~1.61)、2個(gè)甲基 (δH1.03,3.49 )、2個(gè)次甲基 (δH4.15,5.12)特征信號(hào) ;13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)譜中出現(xiàn)4個(gè)羰基碳特征信號(hào) (δC186.8,186.87,171.24,170.64),12個(gè)苯環(huán)區(qū)碳特征信號(hào) (δC110~158),糖環(huán)碳特征信號(hào) (δC100.32,71.52~76.35);分析譜圖發(fā)現(xiàn)H-2 (δH7.90)與C-12 (δC186.87)存在HMBC相關(guān)、H-3 (δH7.73)與C-5 (δC186.8)存在遠(yuǎn)程HMBC相關(guān),推測苯環(huán)連接對(duì)苯醌環(huán),此時(shí)還剩6個(gè)苯環(huán)碳信號(hào)未歸屬,推測此化合物的基本骨架是蒽醌,同時(shí)也發(fā)現(xiàn) H-10 (δH4.15)與C-13,C-6a,C-10a(δC171.24,135.12,139.22 )有HMBC相關(guān),說明H-10與羰基和苯環(huán)有直接相連,H-7 (δH5.12)與C-10a,C-6a(δC139.22,135.12)存在HMBC相關(guān),說明H-7與苯環(huán)也有直接相連;H-8 (δH1.98-2.09)與H-7存在COSY相關(guān),H-8與C-9 (δC71.52)、 C-10(δC51.69)存在HMBC相關(guān)H-15 (δH1.41~1.67)與 C-10、C-9有HMBC相關(guān),故H-9到H-7形成環(huán)系;根據(jù)COSY相關(guān)表明C-9連接一個(gè)CH3CH2,C-9有被羥基取代的碳位移特征信號(hào);糖環(huán)中C-1′的δC100.832符合連氧的特征,又因?yàn)镠-1′與苯環(huán)C-4相關(guān),所以糖環(huán)應(yīng)連在C-4,基于其它譜圖信息,這一結(jié)構(gòu)推測得到確認(rèn),查閱文獻(xiàn)確認(rèn)化合物1是已知化合物 4-O- (β′-D-glucopyranuronosyl)-ε-rho-domycinone(圖3)[20]。

        圖3 化合物1的結(jié)構(gòu)和二維核磁相關(guān)

        3 結(jié) 論

        本文研究鏈霉菌Streptomyces peucetius NA07292的次級(jí)代謝產(chǎn)物,通過發(fā)酵、分離和純化得到聚酮類化合物1,還有眾多聚酮類化合物待分離?;衔?是一類具有多環(huán)酚醛骨架的芳香族聚酮類化合物,這一類化合物被證明具有多種生物活性[21],目前相關(guān)結(jié)構(gòu)尚未有報(bào)道研究過相關(guān)活性,因此值得深入研究。

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