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        藜霜霉病病原菌的鑒定

        2023-11-02 14:01:50高國香
        工業(yè)微生物 2023年5期

        高國香,王 艷,2*,張 婷

        1.甘肅中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,甘肅 蘭州 730000;2.西北中藏藥省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心,甘肅 蘭州 730000

        藜(Chenopodium album L.)是莧科藜屬的一年生草本植物,別名“灰條菜”“灰灰菜”,常生于路旁、荒地及田間,在全國各地都有分布[1]。藜具有較強的抗逆性,常常與作物爭奪水分和養(yǎng)料,致使作物減產(chǎn),是中國北方田間常見的雜草之一[2]。但由于其表面特殊的“鹽囊泡”結(jié)構(gòu),具有耐干旱、抗鹽堿等優(yōu)良特性,有望用于改良鹽堿地[3]。其營養(yǎng)價值、適口性與豆科、禾本科的牧草基本相似,因此亦有較高的飼用價值[4]。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究表明,藜含有揮發(fā)油、藜堿、黃酮類化合物、有機酸、多糖、甾醇等多種有效活性成分,具有抑菌、抗氧化、止癢、止瀉痢、治痢疾腹瀉的功效[5-9],亦能預(yù)防貧血、促進兒童生長發(fā)育、為中老年人補充鈣質(zhì)[10]。發(fā)生在藜上的病害主要有葉斑病[11-12]、霜霉病[13-14]等。本文擬對甘肅省采集的藜霜霉病病原菌進行鑒定,以期為病害的防治提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 標(biāo)樣采集

        本研究于2020 年8 月在甘肅省張掖市民樂縣南豐鄉(xiāng)秦家莊村(100°92′ E,38°27′ N,海拔2 681 m)進行了對藜霜霉病的病害調(diào)查,描述了其癥狀并拍照記錄,采集了標(biāo)樣并壓制成了標(biāo)本。

        1.2 病原菌形態(tài)鑒定

        從干燥標(biāo)本發(fā)病葉片的背面刮取菌樣置于載玻片上,滴加一滴乳酸,蓋上蓋玻片,用酒精燈緩慢加熱,在顯微鏡(BX51-32H01,Olympus,日本)下觀察病原菌的形態(tài),測定其大小,并拍照記錄。

        1.3 DNA 提取、PCR 擴增和系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建

        根據(jù)尹玲等[15]的研究,本研究嘗試?yán)靡环N改良的CTAB 法提取病原菌的DNA。利用引物對ITS300/ITS4[16]、OomCoxI-Levup/OomCoxI-Levlo 和cox2-F/cox2-R 分別擴增病原菌的ITS rDNA、cox1、cox2 mtDNA 片段。PCR 的反應(yīng)體系為20 μL,其中包括2×Taq PCR Mix 10 μL,模板DNA 2 μL,上下游引物各1 μL(10 μmol/L),ddH2O 6 μL,將其混合均勻并離心,置于PCR 儀(Agilent Sure Cycler 8800,博日科技有限公司)中進行擴增。PCR 反應(yīng)程序為:95 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃變性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸10 min,循環(huán)40 次;72 ℃延伸1 min。擴增產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳進行檢測,所得目標(biāo)產(chǎn)物委托上海生工生物工程有限公司進行純化和測序。登錄GenBank,將所得序列在NCBI 中進行比對,下載相關(guān)序列,利用MEGA X 軟件中的鄰接法(N-J)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[17]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 病原菌形態(tài)學(xué)特征

        藜霜霉病病原菌孢子囊呈褐色或淡褐色,形狀為圓形或橢圓形,長23.75~35.36 μm(平均28.70 μm),寬18.74~28.69 μm(平均23.50 μm),分布較多,圖1 為藜霜霉病病原菌孢子囊的兩種不同形態(tài)。

        圖1 藜霜霉病病原菌孢子囊形態(tài)

        2.2 系統(tǒng)發(fā)育分析

        菌株LSM 的cox1、cox2、ITS 基因序列測序得出其長度分別為516 bp、381 bp、478bp,(登錄號正在提交),將三個序列利用BLAST 進行比對后下載相關(guān)序列,構(gòu)建cox1-cox2-ITS 基因序列聯(lián)合的系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖2 所示。從構(gòu)建完成的系統(tǒng)發(fā)育樹中可以看出,樹分為兩個大支,一支上的四個菌株分別為寄生在莧科植物菠菜Spinacia oleracea 上的P.effusa、寄生在莧科植物紅甜菜B. vulgaris subsp.vulgaris 上的P. schachtii、霜霉屬的模式種酸模霜霉、寄生在石竹科植物田野牛漆姑Spergularia rubra上的P. lepigoni;另一支為本菌(菌株“LSM”)與四個藜麥霜霉,分別為寄生在藜上的三個菌株菌株S2019-8、2018-1、10CHE 及寄生在藜麥上的菌株S2019-23。基于寄主植物、病原菌的形態(tài)特征見表1,結(jié)合形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果,將該菌鑒定為藜麥霜霉菌Peronospora variabilis。

        表1 cox1,cox2 和ITS 片段系統(tǒng)發(fā)育選用菌株Genbank 登錄號

        圖2 藜霜霉病病原菌cox1-cox2-ITS 基因序列聯(lián)合系統(tǒng)發(fā)育樹

        3 討論

        本研究中的菌株與寄生在藜上的藜麥霜霉緊密聚類在一起,共同與寄生在藜麥上的藜麥霜霉聚類在一起,結(jié)合寄主植物和病原菌的形態(tài)特征,將本研究中的病原菌鑒定為藜麥霜霉菌。

        藜霜霉病在世界各地均有發(fā)生,該病原菌最大的寄主植物藜麥?zhǔn)且环N古老的作物,營養(yǎng)均衡,其種植現(xiàn)已遍布全球。但霜霉病會嚴(yán)重影響藜麥的生產(chǎn),因此,了解病原菌的種類,明確病原菌的特性是十分有必要的,能夠為病害防治提供理論依據(jù)。

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