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        一株川金絲猴皮膚感染真菌的分離及鑒定

        2023-10-25 07:54:34李俊嫻鄧長林程家球李梅榮
        關(guān)鍵詞:酵母菌

        ●李俊嫻 鄧長林 程家球 李梅榮

        (南京市紅山森林動(dòng)物園 江蘇 南京 210028)

        紅酵母(Rhodotorula)是擔(dān)子菌亞門銹菌綱擔(dān)孢目隱球菌科紅酵母亞科紅酵母屬真菌,是一類產(chǎn)色素酵母菌[1]。研究認(rèn)為,紅酵母在空氣、土壤和江河湖泊等水體中普遍存在,也可以存在于動(dòng)物、植物以及人體上[2]。過去曾普遍認(rèn)為紅酵母屬于無致病性的腐生菌和污染菌[3],罕見導(dǎo)致人類感染。近年來,隨著免疫低下人數(shù)逐漸增多,不斷增加的侵襲性真菌感染案例引起研究人員的關(guān)注。繼毛孢子菌屬(Trichosporonspp·)、念珠菌屬(Candidaspp·)、隱球菌屬(Cryptococcusspp·)之后,紅酵母菌屬(Rhodotorulaspp·)成為引發(fā)侵襲性酵母菌感染的第四大類病原體,總體分離率4·2%(n=8821)[4]。經(jīng)人醫(yī)臨床統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),血流感染、眼感染、心內(nèi)膜炎、中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染、腹膜透析相關(guān)性腹膜炎、關(guān)節(jié)假體感染、皮膚感染等均為紅酵母菌的感染類型,其中最常見的類型是導(dǎo)管相關(guān)性真菌血癥[5-7]。紅酵母屬共包含8個(gè)種,膠紅酵母是人醫(yī)臨床中最常見的致病種[1,7]。江蘇某動(dòng)物園一只川金絲猴皮膚見化膿性皮損。經(jīng)分子生物學(xué)診斷為膠紅酵母感染。此為國內(nèi)首次發(fā)現(xiàn)川金絲猴皮膚感染膠紅酵母。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 主要試劑 Taq Plus MasterMix、D2000 DNA Marker、GeneGreen核酸染料均購自天根生化科技(北京)有限公司。

        1.1.2 引物合成 真菌ITS擴(kuò)增通用引物ITS1和ITS4由上海生工生物有限公司合成。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 病料采集和分離培養(yǎng) 用75%乙醇對(duì)患病川金絲猴皮損處消毒后,在相對(duì)無菌環(huán)境下采集皮損處樣本,用無菌接種針蘸取皮損處病料,接種于沙堡液體培養(yǎng)基中,于30℃恒溫?fù)u床中連續(xù)培養(yǎng)48 h。取培養(yǎng)液于沙堡瓊脂培養(yǎng)基上連續(xù)傳代培養(yǎng),獲得純化菌株。

        1.2.2 總DNA提取 取經(jīng)高壓滅菌的0·2% SDS溶液400 μL于滅菌離心管中,取單菌落溶于溶液中,封閉離心管后渦旋振蕩15 s,后沸水浴4 min,擦干離心管外壁后以12 000 r/min離心1 min,取上清液300 μL(病原菌總基因組DNA),凍存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.3 引物合成與PCR擴(kuò)增 采用真菌rDNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列通用引物ITS1(5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')和ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')進(jìn)行真菌ITS區(qū)擴(kuò)增。

        PCR反應(yīng)體系:Taq Plus MasterMix 10 μL,引物各2 μL,病原菌總基因組DNA 2 μL,加ddH2O補(bǔ)足20 μL。PCR反應(yīng)條件:98℃預(yù)變性3 min;98℃變 性10 s,59℃退火1·5 min,72℃延伸1·5 min,共30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min,將PCR產(chǎn)物于4℃保存?zhèn)溆谩H? μL PCR產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠上電泳30 min后,通過凝膠成像儀進(jìn)行檢測(cè)。

        1.2.4 PCR產(chǎn)物序列測(cè)定及系統(tǒng)發(fā)育樹建立將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物寄送至上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測(cè)序部進(jìn)行克隆測(cè)序分析,獲得片段序列后,在Gen Bank(http://www·ncbi·nlm·nih·gov/blast)中進(jìn)行分析BLAST比對(duì),找出與其相似性最高的菌株。得到序列后用軟件MEGA7·0進(jìn)行分析,制作成系統(tǒng)發(fā)育樹。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌落形態(tài)與菌體形態(tài)

        將分離株接種于沙堡瓊脂培養(yǎng)基上,在30℃培養(yǎng)溫度下生長速度一般,呈圓形酵母樣菌落,菌落呈黏質(zhì)狀,菌落產(chǎn)生橘紅色色素,光鏡下見圓形或卵圓形酵母細(xì)胞,可見出芽生殖,未見假菌絲。

        2.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果

        取純培養(yǎng)菌落提取總基因組DNA為PCR模板,并利用ITS1/ITS4引物對(duì)分離株的ITS區(qū)序列進(jìn)行擴(kuò)增。以1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,見一條長度介于500~750 bp之間的單一條帶,與真菌ITS序列堿基大小范圍相符,PCR對(duì)照組未見條帶。電泳圖如圖1所示。

        圖1 分離株ITS序列擴(kuò)增結(jié)果

        2.3 分子生物學(xué)鑒定

        將分離株的ITS1-ITS4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送交上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行克隆測(cè)序,獲得片段序列,如圖2所示。檢測(cè)結(jié)果顯示,分離株ITS區(qū)片段堿基大小為616 bp。將測(cè)序結(jié)果在 GenBank 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行 BLAST 比對(duì),發(fā)現(xiàn)與其他已報(bào)道的膠紅酵母菌ITS序列相比,該分離株與MT465994·1同源性高達(dá)99%。根據(jù)同源性分析結(jié)果,選擇同源性較高的34株不同參考菌株的序列為基礎(chǔ),建立進(jìn)化樹,結(jié)果見圖3。根據(jù)BLAST比對(duì)結(jié)果和進(jìn)化樹中親緣性分析得知,本研究中分離株為膠紅酵母(Rhodotorula mucilaginosa)。

        圖2 分離株ITS序列

        圖3 分離株 rDNA ITS 序列系統(tǒng)發(fā)育樹

        3 討論

        紅酵母菌屬是在自然界分布廣泛的一類真菌,已在生物工程等領(lǐng)域有廣泛的研究和應(yīng)用,近些年被研究確認(rèn)為條件致病菌,屬罕見酵母菌[8]。膠紅酵母感染在國內(nèi)野生動(dòng)物臨床上尚未見報(bào)道。分離菌在本次川金絲猴感染上臨床表現(xiàn)為感染處大面積脫毛,脫毛處皮膚覆蓋有結(jié)痂,結(jié)痂較厚且呈微黃色,移除結(jié)痂后可見皮膚潮紅,患處與正常皮膚有較為明顯的分界線。未結(jié)痂患處可見大量點(diǎn)狀膿皰顆粒,膿皰顆粒易受外力破壞破潰。感染導(dǎo)致患處附近淋巴結(jié)腫大。病猴表現(xiàn)明顯抓撓患處的行為。臨床獸醫(yī)師選用寵物用氟康唑,按每0·1 mL/kg·bw皮下注射,每周注射1次,同時(shí)選用頭孢曲松鈉0· 5 g、阿米卡星1 mL肌肉注射,每日1次,連續(xù)治療20日后,臨床癥狀逐漸減退,患處皮膚痊愈,病猴抓撓患處行為逐漸消失。愈后3個(gè)月2次對(duì)患處皮膚進(jìn)行復(fù)查,未見復(fù)發(fā)。紅酵母菌細(xì)胞壁因缺乏1,3-β-D-葡聚糖合成酶,對(duì)棘白菌素類抗真菌藥物有天然耐藥作用[9],故建議臨床治療中應(yīng)注意甄別致病菌類型,根據(jù)致病菌種類選擇合理藥物治療。人醫(yī)臨床上有研究表明,唑類藥物特別是氟康唑?qū)t酵母菌的最小抑菌濃度普遍≥64 mg/L[10],棘白菌素類和/或氟康唑藥物治療下曾見紅酵母暴發(fā)感染[11]。但在本例中使用寵物用氟康唑和其他抗生素及時(shí)治療后能快速控制感染,可能與本次膠紅酵母感染川金絲猴屬皮膚感染型,危害性不大,相對(duì)深部感染更易治愈有關(guān)。朱敏等[12]曾報(bào)道1例女性患者因右乳房腫塊穿刺活檢術(shù)后致膠紅酵母菌感染,出現(xiàn)真菌血癥,未使用抗真菌藥物也自行痊愈。在本次感染案例中,發(fā)現(xiàn)該川金絲猴患病后,飼養(yǎng)人員便快速將患病猴隔離,更換條件更好的籠舍進(jìn)行飼養(yǎng),加強(qiáng)護(hù)理,這些操作可能讓動(dòng)物自身抗病力有所提升而出現(xiàn)自愈。

        經(jīng)實(shí)地觀察發(fā)現(xiàn),患病川金絲猴被長期飼養(yǎng)在地勢(shì)較低的籠舍中,存在通風(fēng)不良的情況,室內(nèi)籠舍相對(duì)陰暗潮濕。飼養(yǎng)員人員日常飼養(yǎng)管理內(nèi)容局限于衛(wèi)生清掃和飼喂,這些因素可能是形成此病的主要誘因。川金絲猴是典型性樹棲動(dòng)物,常年棲息在海拔1400~3300 m的常綠落葉闊葉林、針落葉混交林或針葉林中[13]。在我國南方地區(qū)圈養(yǎng)條件下雖不能完全復(fù)制野外環(huán)境條件,但應(yīng)在籠舍設(shè)計(jì)時(shí)充分考慮籠舍朝向和結(jié)構(gòu)等因素,設(shè)計(jì)建設(shè)通風(fēng)和采光良好的籠舍,必要時(shí)需考慮利用儀器設(shè)備控制籠舍內(nèi)濕度,以減少環(huán)境條件性致病菌。在飼養(yǎng)管理中注意環(huán)境衛(wèi)生的清理和籠舍的消毒,可有效提升飼養(yǎng)環(huán)境質(zhì)量。在日常操作中應(yīng)注意運(yùn)用綜合性行為管理技術(shù),加強(qiáng)動(dòng)物與飼養(yǎng)員之間的信任關(guān)系,減少圈養(yǎng)條件下的應(yīng)激反應(yīng),提高動(dòng)物自身免疫力。這些措施都有助于減少動(dòng)物被條件性致病菌感染的概率。

        4 結(jié)論

        膠紅酵母雖屬罕見酵母菌,但作為條件性致病菌的一種,可引起如川金絲猴這類野生動(dòng)物皮膚感染,結(jié)合病原菌分離鑒定的實(shí)驗(yàn)室診斷手段可幫助確診并合理選用治療藥物。在圈養(yǎng)環(huán)境中,野生動(dòng)物可能因硬件或軟件條件不足處于長期慢性應(yīng)激壓力下而出現(xiàn)條件性致病菌感染,故圈養(yǎng)野生動(dòng)物應(yīng)為動(dòng)物提供通風(fēng)、采光、溫度、濕度均能良好控制的籠舍,與其自然棲息地條件相似,以科學(xué)尊重自然史的方式確定飼養(yǎng)管理程序,最大限度提高動(dòng)物福利,減少條件性致病菌感染的發(fā)病率。

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