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        基于GGE 雙標(biāo)圖的北方地區(qū)鮮食糯玉米產(chǎn)量和品質(zhì)性狀及試點(diǎn)鑒別力分析

        2023-10-13 11:21:14謝文錦李方明李寧楊海龍付俊張中偉高旭東豐光
        作物雜志 2023年4期
        關(guān)鍵詞:標(biāo)圖穩(wěn)產(chǎn)糯玉米

        謝文錦 李方明 李寧 楊海龍 付俊 張中偉 高旭東 豐光

        (丹東農(nóng)業(yè)科學(xué)院,118109,遼寧鳳城)

        作物品種區(qū)域試驗(yàn)是通過(guò)在同一種植生態(tài)區(qū),選擇具有代表性和鑒別力的地點(diǎn),按統(tǒng)一的試驗(yàn)方案與技術(shù)規(guī)程實(shí)施,來(lái)鑒別試驗(yàn)品種的豐產(chǎn)性、穩(wěn)產(chǎn)性、生態(tài)適應(yīng)性、抗逆性及其他重要的特征特性,進(jìn)而確定新品種的利用價(jià)值和適宜推廣種植區(qū)域[1-3]。一直以來(lái),玉米品種的豐產(chǎn)性分析主要應(yīng)用簡(jiǎn)單的算術(shù)平均進(jìn)行評(píng)價(jià),穩(wěn)產(chǎn)性則多依據(jù)變異系數(shù)和回歸系數(shù)進(jìn)行比較分析,較少考慮到品種與環(huán)境相互作用的影響,很少對(duì)試驗(yàn)點(diǎn)的鑒別力進(jìn)行評(píng)價(jià)[4]。線(xiàn)性回歸的方法被普遍用于品種評(píng)價(jià)分析,該方法忽略了基因型與環(huán)境互作的特殊適應(yīng)性,僅可用于評(píng)價(jià)玉米品種的一般適應(yīng)性[5-6]。AMMI 模型是廣泛應(yīng)用于作物品種豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性分析的較為可靠的方法,是以加性主效應(yīng)的乘積交互作用為主的模型,其中主成分1 解釋了品種對(duì)環(huán)境的響應(yīng)比例,所解釋的變異比例較少,主成分2 則是單純對(duì)基因―環(huán)境互作的描述,忽略了基因型效應(yīng),也不能全面評(píng)價(jià)品種[4]。嚴(yán)威凱[7]利用基因型主效應(yīng)加基因―環(huán)境互作效應(yīng)模型(gene and gene-environment interaction,GGE)與雙標(biāo)圖技術(shù)相耦合,開(kāi)發(fā)出GGEBiplot軟件,集合了品種豐產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)性評(píng)價(jià)、試驗(yàn)點(diǎn)代表性和鑒別力評(píng)價(jià)及試驗(yàn)點(diǎn)生態(tài)區(qū)劃分三大主要功能。目前,GGE 雙標(biāo)圖已經(jīng)開(kāi)始廣泛應(yīng)用于各種作物品種的產(chǎn)量穩(wěn)定性、適應(yīng)性和試驗(yàn)地點(diǎn)的區(qū)分力代表性評(píng)價(jià)及試驗(yàn)點(diǎn)生態(tài)區(qū)的劃分。本研究應(yīng)用R 語(yǔ)言的GGEBiplotGUI、pheatmap 和agricoale 等程序包,對(duì)2020 年北方鮮食糯玉米多點(diǎn)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行GGE 雙標(biāo)圖分析,評(píng)價(jià)17 個(gè)鮮食糯玉米新品種在北方種植生態(tài)區(qū)的豐產(chǎn)性、穩(wěn)產(chǎn)性和適應(yīng)性,同時(shí)對(duì)各試驗(yàn)點(diǎn)的鑒別力和代表性進(jìn)行分析,為鮮食糯玉米品種在我國(guó)北方代表性生態(tài)區(qū)的種植與推廣提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)數(shù)據(jù)來(lái)源

        數(shù)據(jù)來(lái)源于2020 年北方鮮食糯玉米區(qū)域試驗(yàn)匯總報(bào)告。參試品種共17 個(gè)(含對(duì)照CK),于北方8 省設(shè)置10 個(gè)試驗(yàn)點(diǎn),品種與試驗(yàn)點(diǎn)詳情見(jiàn)表1 和表2。試驗(yàn)不設(shè)重復(fù)排列,小區(qū)面積24m2,6 行區(qū),種植密度52 500 株/hm2,試驗(yàn)周邊設(shè)置與小區(qū)行數(shù)相同的保護(hù)行。鮮食糯玉米最佳采收期為授粉后23~26d,各試點(diǎn)根據(jù)實(shí)際情況適時(shí)采收,實(shí)收中間4 行(面積16m2)統(tǒng)計(jì)鮮穗產(chǎn)量。為防止花粉影響籽粒品質(zhì),每個(gè)品種在2 邊行套袋自交或互交20 株(穗),套袋隔離直至采收。北方鮮食玉米區(qū)域試驗(yàn)品嘗鑒定單位是中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所、承德市農(nóng)林科學(xué)院和吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,分別聘請(qǐng)5 位品質(zhì)檢測(cè)專(zhuān)家按照行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 523-2002 執(zhí)行;品質(zhì)檢測(cè)單位是吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,具體檢測(cè)參照孫祎振等[8]和劉萍等[9]的方法。

        表2 北方鮮食糯玉米區(qū)域試驗(yàn)點(diǎn)及代號(hào)Table 2 Testing sites and codes of fresh waxy corns in the north

        1.2 數(shù)據(jù)處理

        主要采用R 語(yǔ)言的GGEBiplotGUI、pheatmap和agricoale 軟件包對(duì)北方鮮食糯玉米的豐產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)性和試點(diǎn)的鑒別力和代表性進(jìn)行綜合分析[5,10],程序如下:

        dat=read.table("D:/2020ye.csv",header=T,sep=",")

        head(dat)

        install.packages("reshape2")

        x=reshape2::dcast(dat,gen~env)

        rownames(x)=x$gen

        re=x[,-1]

        library(GGEBiplotGUI)

        GGEBiplot(re)

        2 結(jié)果與分析

        2.1 不同鮮食糯玉米多點(diǎn)產(chǎn)量比較

        對(duì)多試點(diǎn)鮮食糯玉米產(chǎn)量數(shù)據(jù)進(jìn)行多重比較分析(圖1),參試品種鮮穗產(chǎn)量變幅為14.22~30.94t/hm2。試點(diǎn)間的平均產(chǎn)量變幅為16.58~25.63t/hm2,其中E6 試點(diǎn)的產(chǎn)量普遍較低,E9 試驗(yàn)點(diǎn)的產(chǎn)量普遍較高。就不同參試品種而言,在不同種植區(qū),鮮穗產(chǎn)量的變化很大,平均產(chǎn)量變幅為18.13~23.32t/hm2,產(chǎn)量最高是E9 試點(diǎn)的G10(30.94t/hm2),G10 各點(diǎn)平均產(chǎn)量也是最高,平均產(chǎn)量最低的是G11(18.13t/hm2)。品種間和試點(diǎn)間產(chǎn)量差異明顯。

        圖1 參試糯玉米品種與試點(diǎn)平均產(chǎn)量Fig.1 Average yields of varieties of waxy corn and testing sites

        2.2 品種×環(huán)境GGE 雙標(biāo)圖分析

        GGE 雙標(biāo)圖是基于前2 項(xiàng)乘積項(xiàng)的模型[1],分別解釋了基因型和基因型與環(huán)境互作之和(G+GE)的平方和的53.50%和12.82%(圖2)。

        圖2 GGE 雙標(biāo)圖的“哪個(gè)贏在哪里”功能圖Fig.2 GGE biplot for the “which won where” view

        2.2.1 鮮食糯玉米品種區(qū)域適應(yīng)性分析 參試品種的區(qū)域適應(yīng)性主要利用“which won where”功能圖(圖2)來(lái)分析,可直觀鑒別各試驗(yàn)點(diǎn)產(chǎn)量表現(xiàn)最好的品種。將雙標(biāo)圖中各方向上距離最遠(yuǎn)的點(diǎn)相連構(gòu)成一個(gè)多邊形,再由中心對(duì)每條邊做垂線(xiàn),將多邊形分成7 個(gè)扇區(qū),每個(gè)扇區(qū)都有品種分布,位于多邊形頂點(diǎn)的品種是該扇區(qū)表現(xiàn)最好的品種;有3 個(gè)扇區(qū)有試點(diǎn)分布,同一扇區(qū)的生態(tài)環(huán)境類(lèi)似。E1 為一個(gè)扇區(qū),G16、G4 和G17 表現(xiàn)較好,G16是產(chǎn)量最高的品種;E6 為一個(gè)扇區(qū),G13、G2、G5、G3 和G7 表現(xiàn)較好,G13 是產(chǎn)量最高的品種;其余8 個(gè)試驗(yàn)點(diǎn)在一個(gè)扇區(qū),G6、G10 和G14 是在8 個(gè)試點(diǎn)表現(xiàn)較好的品種,G10 和G14 是產(chǎn)量最高的品種。未落于以上3 個(gè)扇區(qū)的參試品種在所有試點(diǎn)表現(xiàn)均不是最好,如G12。距離原點(diǎn)較近品種的產(chǎn)量表現(xiàn)為對(duì)環(huán)境變化不敏感,如G3 和G9。

        2.2.2 鮮食糯玉米品種豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性分析及綜合排序 理想的品種應(yīng)該在特定的生態(tài)環(huán)境內(nèi)表現(xiàn)出既高產(chǎn)又穩(wěn)產(chǎn)的特性,品種高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)性功能圖(圖3)就可以直觀反映出糯玉米品種的豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性。圖3 中帶箭頭的橫向直線(xiàn)為環(huán)境平均軸,箭頭位置即環(huán)境平均值,環(huán)境平均軸所指的方向是品種在所有環(huán)境下的近似平均產(chǎn)量走向[10-11]。品種位置越靠右說(shuō)明其豐產(chǎn)性越好,品種到環(huán)境平均軸垂直線(xiàn)段越短說(shuō)明其穩(wěn)產(chǎn)性越好。由圖3 可見(jiàn),G10豐產(chǎn)性最好,其次是G14、G6、G1 和G7;穩(wěn)產(chǎn)性最好的品種是G10、G6、G9 和G11。綜合豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性來(lái)看,G10 和G6 既高產(chǎn)又穩(wěn)產(chǎn)。G14、G1 和G7 有較好的豐產(chǎn)性,穩(wěn)產(chǎn)性略差,對(duì)環(huán)境響應(yīng)相對(duì)較為敏感。

        圖3 品種高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)性功能的GGE 雙標(biāo)圖Fig.3 GGE biplot of high and stable yield function of varieties

        依據(jù)平均環(huán)境軸做同心圓,構(gòu)建理想品種綜合排序功能圖。距離圓心越近的品種,其豐產(chǎn)性和基因型與環(huán)境互作的穩(wěn)產(chǎn)性越好。結(jié)果(圖4)顯示,G10 最接近理想品種,綜合排序?yàn)镚10>G6>G14>G1>G7>G3>G9>17>G4>G5>G16>G2>G15>G13>G8>G12>G11。

        圖4 GGE 雙標(biāo)圖的理想品種排序功能圖Fig.4 GGE biplot for the ideal variety rank

        2.2.3 試點(diǎn)區(qū)分力和代表性分析及排序 理想的試點(diǎn)應(yīng)具備2 個(gè)條件,一是對(duì)參試的品種有較強(qiáng)的區(qū)分能力(淘汰不穩(wěn)定的品種),二是對(duì)目標(biāo)的生態(tài)區(qū)有較強(qiáng)的代表性(選擇優(yōu)良的品種)。根據(jù)10個(gè)試點(diǎn)的區(qū)分力和代表性作圖(圖5a),試驗(yàn)點(diǎn)線(xiàn)段的長(zhǎng)短代表了試點(diǎn)的區(qū)分力,越長(zhǎng)區(qū)分力越大,試點(diǎn)線(xiàn)段與平均環(huán)境軸(帶箭頭射線(xiàn))的夾角是其對(duì)目標(biāo)環(huán)境的代表性,夾角越小,代表性越強(qiáng)。如果夾角為鈍角,則代表該試點(diǎn)不適合作為試驗(yàn)點(diǎn)。結(jié)果可見(jiàn),E3 點(diǎn)與平均環(huán)境軸夾角最小,最具有目標(biāo)環(huán)境代表性,E1 和E6 與平均環(huán)境軸夾角均較大,代表性最小。10 個(gè)試點(diǎn)與平均環(huán)境軸夾角均為銳角,均適宜做試驗(yàn)點(diǎn)。E5、E10 和E7 線(xiàn)段較短,試點(diǎn)的區(qū)分力較小,E1、E3、E9 和E6 線(xiàn)段較長(zhǎng),區(qū)分力較大。試點(diǎn)的區(qū)分力與代表性與種植環(huán)境的土壤和氣候等相關(guān),比如E9 試點(diǎn)2020 年度春季墑情好,回溫快,生育期光照充足,光熱條件好,能促進(jìn)品種發(fā)揮最大產(chǎn)能,從而篩選出優(yōu)良品種并淘汰不穩(wěn)定品種。

        圖5 GGE 雙標(biāo)圖的試點(diǎn)功能形態(tài)分析圖Fig.5 Analysis diagram of GGE biplot experimental functional morphology

        以環(huán)境平均值(環(huán)境平均軸箭頭)為圓心做擴(kuò)散同心圓,得到試點(diǎn)綜合排序圖(圖5b)。距離圓心越近的試點(diǎn)綜合排名越高,表明試點(diǎn)越接近目標(biāo)生態(tài)環(huán)境,結(jié)果可知試點(diǎn)的綜合排名為E9>E3>E4>E7>E8>E10>E5>E2>E6>E1。說(shuō)明E3 和E9 是本年度北方鮮食糯玉米區(qū)域試驗(yàn)中具備較強(qiáng)代表性和區(qū)分力的理想試驗(yàn)點(diǎn)。

        2.3 產(chǎn)量―品質(zhì)性狀雙標(biāo)圖

        鮮食糯玉米的品種評(píng)價(jià)不僅僅要考量其鮮穗產(chǎn)量,也要重視其食用品質(zhì)性狀。依據(jù)許乃銀等[12]的方法,分別構(gòu)建品種×品質(zhì)性狀雙標(biāo)圖(圖6a)和品種×產(chǎn)量―品質(zhì)性狀雙標(biāo)圖(圖6b),以便直觀地分析品質(zhì)性狀的相關(guān)性、品種×品質(zhì)性狀互作關(guān)系、產(chǎn)量―品質(zhì)性狀的相關(guān)性、對(duì)品種進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和品種與產(chǎn)量―性狀組合的互作模式[12]。

        圖6 品種與品質(zhì)性狀(a)及品種與產(chǎn)量×品質(zhì)性狀(b)的雙標(biāo)圖Fig.6 Biplots of varieties and quality traits(a)and varieties and yield×quality traits(b)

        由圖6a 可見(jiàn),參試糯玉米品種×品質(zhì)性狀雙標(biāo)圖前2 個(gè)主成分解釋了品種品質(zhì)性狀總變異的64.40%,近似表達(dá)了品質(zhì)性狀的相關(guān)性及品種與品質(zhì)性狀的互作關(guān)系。圖6a 中各個(gè)品質(zhì)性狀指標(biāo)間的夾角和分布可分為幾個(gè)主要相關(guān)的向量群,向量群內(nèi)的性狀高度正相關(guān),不同向量群的品質(zhì)性狀呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)或者相關(guān)性較弱[7,12]。皮渣率和粗淀粉含量,感官品質(zhì)和色澤,皮薄厚和糯性之間密切正相關(guān)。將參試品種的主要品質(zhì)性狀皮渣率(seed-coat residue rate,SRR)、支鏈淀粉含量(amylose content,AC)、粗淀粉含量(coarse starch content,CS)、感官品質(zhì)(sensory quality,SQ)、風(fēng)味(flavor,F(xiàn))、色澤(colour and lustre,CL)、氣味(smell,S)、糯性(waxy,WX)、柔嫩性(tenderness,T)和皮厚度(skin thickness,ST)轉(zhuǎn)化為產(chǎn)量(yield,Y)―品質(zhì)性狀乘積,分別表示為Y×SRR(-1)、Y×AC、Y×CS、Y×SQ、Y×F、Y×CL、Y×S、Y×WX、Y×T、Y×ST。由于皮渣率性狀值越小越好,利用公式“轉(zhuǎn)化后數(shù)據(jù)=最大值+最小值–原始數(shù)據(jù)”將皮渣率性狀值數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化并用Y×SRR(-1)表示。由圖6b 可見(jiàn),產(chǎn)量―品質(zhì)性狀分析的擬合度更高,變異比例更大(94.40%),結(jié)果更為可靠。由于受品種產(chǎn)量影響,產(chǎn)量―品質(zhì)性狀的相關(guān)性呈正相關(guān),Y×AC 與主要食用品質(zhì)性狀相關(guān)密切,Y×CS和Y×SRR(-1)相關(guān)性較弱。

        圖7 為品種×產(chǎn)量―品質(zhì)性狀穩(wěn)定性功能圖。圖中水平方向的單箭頭軸線(xiàn)代表各品種的產(chǎn)量―品質(zhì)性狀平均值,箭頭指的方向?yàn)槠贩N產(chǎn)量―品質(zhì)性狀綜合表現(xiàn)優(yōu)秀的方向,各品種在水平軸線(xiàn)的垂足位置越趨向箭頭方向,代表綜合表現(xiàn)越好,品種產(chǎn)量―品質(zhì)性狀綜合表現(xiàn)為G14>G6>G10>G1>G7>G9>17>G3>G5>G4>G2>G16>G15>G13>G12>G8>G11。其排序結(jié)果與理想品種產(chǎn)量穩(wěn)定性綜合排序結(jié)果(圖4)相似,可以作為品種綜合評(píng)價(jià)依據(jù)。

        圖7 品種×產(chǎn)量×品質(zhì)性狀穩(wěn)定性功能圖Fig.7 Functional diagram of variety×yield×quality characteristic stability

        3 討論

        目前,GGE 雙標(biāo)圖已在多種農(nóng)作物的多點(diǎn)試驗(yàn)中得到廣泛應(yīng)用[13-17]。周長(zhǎng)軍等[18]利用GGE 雙標(biāo)圖對(duì)黑龍江玉米聯(lián)合體參試品種進(jìn)行穩(wěn)產(chǎn)性評(píng)價(jià),并鑒別了試驗(yàn)點(diǎn)的區(qū)分力和代表性。崔順立等[19]通過(guò)GGE 雙標(biāo)圖對(duì)黃淮?;ㄉ鳟a(chǎn)區(qū)16 個(gè)花生品種2 年間的品質(zhì)性狀綜合分析,篩選了不同品質(zhì)性狀下的穩(wěn)定品種,確定了不同生態(tài)類(lèi)型試點(diǎn)下的適宜種植品種。楊天育等[20]應(yīng)用GGE 雙標(biāo)圖評(píng)價(jià)谷子區(qū)試品種的穩(wěn)產(chǎn)性和試點(diǎn)的代表性,篩選出3 個(gè)豐產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)性都較好的品種,并得出西吉試點(diǎn)是理想的試點(diǎn)。

        本研究基于GGE 雙標(biāo)圖對(duì)北方鮮食糯玉米區(qū)域試驗(yàn)進(jìn)行分析,不僅對(duì)品種豐產(chǎn)性、穩(wěn)產(chǎn)性和區(qū)域適應(yīng)性進(jìn)行了詳細(xì)探討,并且對(duì)品種×產(chǎn)量―品質(zhì)性狀進(jìn)行綜合分析,篩選出綜合產(chǎn)量與食用品質(zhì)均表現(xiàn)優(yōu)良的糯玉米品種,同時(shí)對(duì)10 個(gè)試點(diǎn)進(jìn)行生態(tài)區(qū)亞組劃分和區(qū)分力代表性評(píng)價(jià),為育種工作者的試驗(yàn)布點(diǎn)提供參考。本研究以1 年參試品種的鮮穗產(chǎn)量試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行GGE 雙標(biāo)圖分析,其結(jié)果代表當(dāng)年的品種產(chǎn)量豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性評(píng)價(jià)及試驗(yàn)點(diǎn)區(qū)分力和代表性的鑒別。在進(jìn)行品種綜合評(píng)價(jià)和種植環(huán)境推廣時(shí)應(yīng)結(jié)合產(chǎn)量和抗逆性等進(jìn)行全面分析,試驗(yàn)點(diǎn)鑒別力篩選還應(yīng)結(jié)合多年、多組區(qū)域試驗(yàn)數(shù)據(jù),并結(jié)合試點(diǎn)實(shí)際地理環(huán)境等因素進(jìn)行更全面的評(píng)價(jià)分析。

        4 結(jié)論

        通過(guò)對(duì)北方鮮食糯玉米多點(diǎn)產(chǎn)量GGE 雙標(biāo)圖分析,篩選出G10 和G6 為高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)、廣適的品種,可以在北方大部分生態(tài)區(qū)種植推廣。G14、G1和G7 具備較高的豐產(chǎn)性,穩(wěn)產(chǎn)性略差,對(duì)環(huán)境有特殊的適應(yīng)性。通過(guò)構(gòu)建理想品種,進(jìn)行品種綜合排序,G10、G6 和G14 最接近理想品種。理想的區(qū)試點(diǎn)應(yīng)該既可以淘汰不穩(wěn)定品種,又可以選擇出優(yōu)良的品種。由參試品種區(qū)域適應(yīng)性結(jié)果得出,10個(gè)試點(diǎn)所代表的北方生態(tài)區(qū)可以分成3 個(gè)組,E1為一個(gè)組,E6 為一個(gè)組,其余8 個(gè)試點(diǎn)為一個(gè)組。試點(diǎn)的區(qū)分力和代表性分析篩選出E3 和E9 的區(qū)分力和代表性最強(qiáng),可以選擇優(yōu)良品種,并淘汰不穩(wěn)定品種。E1 和E6 可以用來(lái)淘汰不穩(wěn)定品種,但其篩選優(yōu)良品種能力相對(duì)較弱。通過(guò)構(gòu)建產(chǎn)量―品質(zhì)性狀功能圖對(duì)品種綜合產(chǎn)量與品質(zhì)進(jìn)行排序分析,G14、G6、G10 和G1 是產(chǎn)量與品質(zhì)性狀綜合表現(xiàn)優(yōu)良的品種。

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