曾家鵬,呂夢迪,鄭倩望,林俊芳,葉志偉,魏韜
(華南農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,廣東省微生態(tài)制劑工程技術(shù)研究中心,廣東廣州 510642)
蛹蟲草(Cordyceps militaris)又稱蟲草花、北冬蟲夏草,是蟲草科、蟲草屬真菌,是一種在東亞地區(qū)受到廣泛歡迎的食藥用真菌。蛹蟲草在我國分布廣泛,野生的蛹蟲草以寄生為主,常寄生于鱗翅目幼蟲的繭和蛹上或者寄生于昆蟲上,產(chǎn)生子座(子實(shí)體部分)形成蟲蛹復(fù)合物,而其子實(shí)體是蛹蟲草主要食藥用部位。蛹蟲草中含有高豐度的蟲草素(Cordycepin)、多糖、蟲草酸等多種生物活性物質(zhì),它們所具有的藥理特性使蛹蟲草的應(yīng)用場景從食品行業(yè)擴(kuò)大到醫(yī)療保健品、醫(yī)藥行列中。蟲草素作為蛹蟲草產(chǎn)生的核心價(jià)值成分之一,也是重要的次級代謝產(chǎn)物,具有抗癌、抗腫瘤、抗病毒等多種生物活性功能。目前蟲草素的原材料主要通過蛹蟲草液體靜置發(fā)酵后提取純化獲得,相關(guān)菌種選育工作仍停留在采用自然選育等傳統(tǒng)研究策略的階段。經(jīng)過40余年的發(fā)展,蛹蟲草子實(shí)體培養(yǎng)、液體靜置發(fā)酵技術(shù)已經(jīng)得到了較好的發(fā)展,但隨著工業(yè)化與產(chǎn)業(yè)化蟲草素的需求逐漸增大,獲得高產(chǎn)蟲草素的蛹蟲草菌株成為了更高效、更可靠的途徑。近年,隨著組學(xué)分析技術(shù)和食用菌基因組編輯技術(shù)的發(fā)展,蛹蟲草蟲草素代謝途徑得到了不同程度的解析,這為構(gòu)建蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)以及蛹蟲草代謝工程的理性改造提供了研究基礎(chǔ)。因此,本綜述對目前已知的蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了模塊化梳理,將其劃分為中心碳代謝途徑、單磷酸肌苷(Inosinate,IMP)途徑和蟲草素底物合成途徑,并分析了前體物質(zhì)組成和多個(gè)分散途徑、關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)對蟲草素合成的影響,系統(tǒng)闡述了IMP物質(zhì)的合成與流向,佐證了IMP的合成與代謝是蟲草素合成的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),旨在為蛹蟲草蟲草素代謝工程改造提供理論支持。
蟲草素又稱蛹蟲草素、蟲草菌素,化學(xué)名為3'-脫氧腺苷,分子式為C10H13N5O3,最早于1951年由Bentley等[1]從蛹蟲草中分離獲得。過往研究發(fā)現(xiàn)蟲草素具有多種生物活性功能,因而是蟲草屬真菌所產(chǎn)生的最具價(jià)值的次生代謝產(chǎn)物之一[2]。蟲草素通過阻斷mRNA的延長影響細(xì)胞周期正常運(yùn)轉(zhuǎn),導(dǎo)致白血病、乳腺癌等疾病中的病變細(xì)胞凋亡(圖1a),從而表現(xiàn)出較好的潛在臨床應(yīng)用價(jià)值[3];蟲草素還可通過抑制NF-κB途徑,激活蛋白酶B和胞外信號調(diào)節(jié)激酶,起到抗光老化的作用(圖1b)[4,5]。基于相同阻斷作用,蟲草素可抑制病毒復(fù)制(圖1d)[6,7]。此外,蟲草素還被發(fā)現(xiàn)可通過與LigA DNA連接酶的強(qiáng)結(jié)合作用,顯著抑制梭狀芽胞桿菌等腸道致病菌的增殖,卻不會對雙歧桿菌、植物乳桿菌等益生菌的增殖造成影響(圖1e)[6],符合我國大健康產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求?;谖付咀饔玫葷撛跈C(jī)制,蟲草素還可對小菜蛾等夜蛾科的農(nóng)業(yè)害蟲起到較強(qiáng)的殺滅作用(圖1f)[6],有被開發(fā)為針對草地貪夜蛾、甜菜夜蛾等其他種類農(nóng)業(yè)害蟲的生防制劑的潛能。隨著市場上以蟲草素為核心成分的保健產(chǎn)品逐漸被開發(fā),蟲草素的價(jià)值和市場價(jià)格近年來逐步攀升。目前,市場上純度為90%以上的蟲草素的原料價(jià)格已高達(dá)25 000元/kg。
圖1 蟲草素多樣化的生物學(xué)活性功能Fig.1 The biological activity function of cordycepin diversity
目前獲得蟲草素的原材料主要有兩個(gè)途徑,一是化學(xué)合成,二是生物原材料提取。其中,化學(xué)合成法最早由Raylo化學(xué)有限公司于2000年成功開發(fā)[8]。由于存在分離手段復(fù)雜、生物活度低、底物利用率低(僅為20%)等問題,該法難以滿足原料市場的需求[9]。目前已知可天然合成蟲草素的物種有蛹蟲草(Cordyceps militaris)[10,11]、九州蟲草(Cordeceps kyusyuensis)[12,13]、雪峰蟲草(Ophiocordyceps xuefengensis)[14,15]等。其中,目前對雪峰蟲草轉(zhuǎn)錄組分析并沒有找到所有與蟲草素生物合成途徑相關(guān)的基因[16]。蛹蟲草在《衛(wèi)生部關(guān)于批準(zhǔn)蛹蟲草為新資源食品的公告(2009年第3號)》和《關(guān)于批準(zhǔn)塔格糖等6種新食品原料的公告(2014年第10號)》中被認(rèn)定為新資源食品和新食品原料。同時(shí),相關(guān)研究表明蛹蟲草基因組中未發(fā)現(xiàn)任何對人有毒的霉菌毒素基因[17],證實(shí)了其作為食品的安全性和可食用性。此外,在下表中展示了現(xiàn)有報(bào)道的蟲草素發(fā)酵產(chǎn)量(見表1),不難發(fā)現(xiàn),在靜置發(fā)酵的條件下,蛹蟲草菌株蟲草素產(chǎn)量最高可達(dá)6.84 g/L。相較于需要精密高密度發(fā)酵設(shè)備以及存在高額電費(fèi)、補(bǔ)料培養(yǎng)基費(fèi)用的常見代謝工程模式菌種[18],蛹蟲草在蟲草素產(chǎn)量、生產(chǎn)成本、操作簡便度等方面均具有較大的工業(yè)化生產(chǎn)潛力。目前,包括知名化學(xué)試劑供應(yīng)商Sigma和中國藥品生物制品檢定所所生產(chǎn)的蟲草素產(chǎn)品,均是從蛹蟲草中提取獲得[19]。
表1 現(xiàn)有報(bào)道的蟲草素發(fā)酵產(chǎn)量Table 1 Fermentation yield of cordycepin in current studies
過往受制于寄生宿主的數(shù)目和生長環(huán)境的特殊性,天然的蛹蟲草子實(shí)體是難以獲得的。直到80年代末,人工培養(yǎng)蛹蟲草才獲得成功[19]。其后經(jīng)過40余年的發(fā)展,培養(yǎng)基組成、培養(yǎng)條件等參數(shù)得到完善[32,33],靜置菌絲體發(fā)酵、振蕩菌絲體發(fā)酵、固體子實(shí)體培養(yǎng)等多種蛹蟲草人工培養(yǎng)技術(shù)趨于成熟[34,35]。至2015年,我國蛹蟲草大規(guī)模工廠化種植產(chǎn)量已達(dá)到7.4萬t[36],并形成了全球75%的蛹蟲草相關(guān)專利。
蛹蟲草子實(shí)體是作為終端商品銷售的主要形式,但其栽培過程存在培養(yǎng)周期長、培養(yǎng)基配制成本高、光照培養(yǎng)周期切換模式復(fù)雜等問題[37]。利用人工栽培的蛹蟲草子實(shí)體來提取蟲草素的綜合成本仍較高。而蛹蟲草液體發(fā)酵技術(shù)在維持接近室溫的恒溫條件下培養(yǎng)處于菌絲體狀態(tài)的蛹蟲草,具有培養(yǎng)基配制成本低、培養(yǎng)條件簡單、培養(yǎng)周期短、不涉及光照周期誘導(dǎo)“菌絲體-子實(shí)體”生長形態(tài)切換等優(yōu)點(diǎn),可在較短時(shí)間內(nèi)高效生產(chǎn)蟲草素。因此,蛹蟲草液體靜置發(fā)酵是目前蟲草素原料的主要獲得方式。
為了進(jìn)一步提高蛹蟲草的蟲草素合成效率,蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)的解析至關(guān)重要。1976年,Kunhorm等[38]利用基于[U-14C]腺苷和[3-3H]的同位素示蹤法分析了蛹蟲草蟲草素上游生物合成路徑,明確了腺苷是蟲草素合成的關(guān)鍵前體物。其后,Zheng等[17]在2011年首次對蛹蟲草進(jìn)行了全基因組序列測定及標(biāo)注,CM01菌株從此成為蛹蟲草基因組研究的模式株系。在此基礎(chǔ)上,有學(xué)者[39,40]不僅通過轉(zhuǎn)錄組測序、蛋白質(zhì)組測定、代謝組測定等多種組學(xué)方法,獲得了以葡萄糖、木糖等基礎(chǔ)性碳源為前體的蟲草素上游及中游合成途徑,還通過構(gòu)建光響應(yīng)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),驗(yàn)證了光對蟲草素合成關(guān)鍵基因的影響。然而即便如此,從腺苷到蟲草素的關(guān)鍵底物合成途徑在較長時(shí)間內(nèi)仍是未知的。直到2017年,Xia等[10]通過在蛹蟲草中進(jìn)行基因敲除,并結(jié)合靶DNA序列在酵母中的異源表達(dá)等多種策略,才完成了以腺苷為前體的蟲草素底物通道解析,成功補(bǔ)完蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)。
隨著代謝工程與合成生物學(xué)的發(fā)展,基于天然合成代謝網(wǎng)絡(luò)的自上而下的菌株改造研究已成為熱點(diǎn)。近年來,以蛹蟲草為材料的DNA元件挖掘、基因編輯技術(shù)及基因組代謝模型的開發(fā)已取得一定程度的進(jìn)步[41-43]。這使得基于蛹蟲草和蟲草素為核心的代謝工程研究成為可能。而在代謝工程研究中,代謝網(wǎng)絡(luò)的模塊化分割是協(xié)助理解和后續(xù)改造的核心底層策略。其中,模塊間及模塊內(nèi)部引起前體物質(zhì)分流的分散途徑、反饋調(diào)節(jié)機(jī)制的作用位點(diǎn)、易受培養(yǎng)條件改變所影響的柔性節(jié)點(diǎn)等,都是菌種改造中的關(guān)鍵目標(biāo)。本綜述結(jié)合過往大量的蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果,首次結(jié)合代謝工程策略,對蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行人為分割,并針對各個(gè)分隔模塊及其中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分析和闡述,并對其未來的改造工作進(jìn)行了展望。
根據(jù)現(xiàn)有的大量蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)研究結(jié)果,本綜述將蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)分為3個(gè)模塊進(jìn)行闡述(圖2),分別是中心碳代謝途徑(紅色)、IMP途徑(藍(lán)色)和蟲草素底物合成途徑(金色)。
圖2 蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)Fig.2 Cordycepin metabolic network in C.militaris
現(xiàn)有研究表明,蛹蟲草可利用多種糖類分子,如葡萄糖、木糖、核糖等作為前體,經(jīng)由糖酵解途徑、磷酸戊糖途徑等途徑,最終轉(zhuǎn)化形成蟲草素[39,44]。參照代謝工程細(xì)分學(xué)科的慣用命名方式,我們將蛹蟲草以葡萄糖、核糖和木糖為碳源進(jìn)行分解代謝獲得5-磷酸核糖的過程,命名為中心碳代謝途徑[45]。
2.1.1 糖酵解途徑
現(xiàn)有大量研究結(jié)果顯示,蟲草素合成代謝途徑的初始前體為葡萄糖[39,44]。葡萄糖被轉(zhuǎn)運(yùn)至蛹蟲草胞內(nèi),經(jīng)磷酸化反應(yīng)生成6-磷酸葡萄糖。形成6-磷酸葡萄糖后,其有兩個(gè)流向,一部分進(jìn)入了磷酸戊糖途徑,另一部分6-磷酸葡萄糖經(jīng)磷酸葡萄糖異構(gòu)酶催化,轉(zhuǎn)變?yōu)?-磷酸果糖(Fructose-6-Phosphate,F(xiàn)6P)。F6P進(jìn)一步磷酸化生成1,6-二磷酸果糖后,酶催化生成3-磷酸甘油醛,再通過糖酵解途徑中的唯一一個(gè)脫氫反應(yīng),氧化為1,3-二磷酸甘油酸。1,3-二磷酸甘油酸脫去磷酸基形成3-磷酸甘油酸,并經(jīng)過基團(tuán)轉(zhuǎn)移形成2-磷酸甘油酸。2-磷酸甘油酸脫水形成磷酸烯醇式丙酮酸(Phosphoenolpyruvate,PEP),PEP在丙酮酸激酶的作用下轉(zhuǎn)變?yōu)楸幔M(jìn)入三羧酸循環(huán),為蛹蟲草細(xì)胞生長提供能量。
2.1.2 磷酸戊糖途徑
在糖酵解途徑中間生成的另一部分6-磷酸葡萄糖進(jìn)入了磷酸戊糖途徑,并且進(jìn)行脫氫生成6-磷酸葡糖酸內(nèi)酯,并進(jìn)一步水解生成6-磷酸葡糖酸。以NADP+作為氧化反應(yīng)受體,6-磷酸葡糖酸氧化脫羧生成5-磷酸核糖。
除了葡萄糖向5-磷酸核糖的多步驟直接轉(zhuǎn)化外,蛹蟲草還可以從外界吸收核糖,并通過一步磷酸化反應(yīng),直接轉(zhuǎn)化為磷酸戊糖途徑的中間產(chǎn)物5-磷酸核糖[39]。此外,Raethong等[46]研究發(fā)現(xiàn)蛹蟲草可從外界吸收木糖,經(jīng)過木糖醇脫氫酶、木酮糖激酶等催化反應(yīng),轉(zhuǎn)化獲得另一磷酸戊糖代謝途徑的中間代謝產(chǎn)物5-磷酸核酮糖(Ribulose 5-Phosphate,RL5P)。雖然以木糖作為前體時(shí),蛹蟲草生長受限,生物量相比以葡萄糖為碳源時(shí)較低,但是蟲草素產(chǎn)量顯著提高[46]。這一結(jié)果提示,轉(zhuǎn)化步驟更少、分支途徑更少、代謝流通量更為集中的蟲草素合成途徑,可能具備更高的蟲草素合成效率。
本綜述將上游的磷酸戊糖途徑代謝產(chǎn)物5-磷酸核糖逐步轉(zhuǎn)化為單磷酸肌苷的過程,以及下游的IMP代謝分散途徑,統(tǒng)稱為IMP途徑。IMP經(jīng)多步轉(zhuǎn)化,可形成腺苷,進(jìn)入蟲草素底物合成途徑。而IMP在形成腺苷的同時(shí),還可能被分流至GTP合成途徑和肌苷合成途徑。因此,掌握IMP途徑的代謝分流情況,有助于通過改造其分支途徑提高蟲草素合成水平。
磷酸戊糖途徑的產(chǎn)物5-磷酸核糖,在酶的作用下生成5-磷酸核糖-1-焦磷酸,再與谷胺酰胺反應(yīng)生成5-磷酸核糖胺[17,39]。5-磷酸核糖胺由ATP供能,與甘氨酸結(jié)合生成甘氨酰胺核糖核苷酸。甘氨酰胺核糖核苷酸經(jīng)甲?;杉柞8拾滨0泛颂呛塑账?,并由谷氨酰胺提供酰胺基及由ATP供能,轉(zhuǎn)變?yōu)榧柞8拾彪吆颂呛塑账幔‵ormylglycinamidine Ribonucleotide,F(xiàn)GAM)。FGAM同樣在ATP存在的條件下,經(jīng)氨基咪唑核糖核苷酸酶的的作用轉(zhuǎn)變?yōu)?-氨基咪唑核糖核苷酸(5-Aminoimidazole Ribonucleotide,AIR)。AIR在咪唑環(huán)上進(jìn)一步裝配嘌呤第二個(gè)環(huán),生成羧基氨基咪唑核糖核苷酸后,進(jìn)一步反應(yīng)生成N-琥珀酸-5-氨基咪唑-4-羧胺核糖核苷酸(N-succino-5-Aminoimidazole-4-Carboxamide,SAICAR)。SAICAR脫去延胡索酸,生成5-氨基咪唑-4-羧酰胺核糖核苷酸(5-Aminoimidazole-4-Carboxamide Ribonucleotide,AICAR),并經(jīng)甲酰化生成5-氨基咪唑-4-甲酰胺-核糖酸(N-Formanidoimidazole-4-Carboxamide Ribonucleotide,F(xiàn)AICAR)。FAICAR在次黃嘌呤核苷酸合酶作用下脫水環(huán)化生成單磷酸肌苷。
IMP合成后,分別進(jìn)入腺苷酸琥珀酸、肌苷和黃苷酸(Xanthylic Acid,XMP)三條分散途徑[44,47]。在單磷酸黃苷(Xanthoside Monophosphate,XMP)途徑中,IMP轉(zhuǎn)化為XMP后,會進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為單磷酸鳥苷(Guanosine Monophosphate,GMP)和二磷酸鳥苷(Guanosine Diphosphate,GDP),并最終被轉(zhuǎn)化為三磷酸鳥苷(Guanosine Triphosphate,GTP)。由于GTP是細(xì)胞內(nèi)部的能源物質(zhì),為蛋白合成等生理生化反應(yīng)供能,無法作為底物直接參與蟲草素的合成。因此,XMP途徑是蟲草素合成途徑的旁支途徑,將分流部分前體IMP。此外,IMP可轉(zhuǎn)化為腺苷酸琥珀酸,并最終在蟲草素底物通道的催化下,轉(zhuǎn)化為蟲草素。IMP還可被轉(zhuǎn)化為肌苷。由于肌苷可重新被轉(zhuǎn)化為IMP,形成循環(huán)環(huán)路,因此肌苷途徑在蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)中起到“蓄水池”的作用,并不會分流IMP。
在真核生物基因組中,物理距離上鄰近的合成基因簇并不常見,而cns123基因簇均處在蛹蟲草第Ⅶ號染色體的1707816至1717012區(qū)間內(nèi),其編碼的酶蛋白可最終將腺苷轉(zhuǎn)化為蟲草素。因此,我們將腺苷至蟲草素的多反應(yīng)催化步驟合稱為“蟲草素底物合成途徑”。
在上述提到的IMP的其中一條分散途徑中,IMP將與天冬氨酸結(jié)合,并在XMP途徑最終轉(zhuǎn)化生成的GTP供給能量的情況下,生成了腺苷酸琥珀酸,并進(jìn)一步反應(yīng)生成單磷酸腺苷(Adenosine Monophosphate,AMP)。除了來源于腺苷酸琥珀酸,AMP還可以由ATP轉(zhuǎn)化為二磷酸腺苷(Adenosine Diphosphate,ADP)后,再進(jìn)一步脫去磷酸基團(tuán)生成。在此過程中,磷酸基團(tuán)從ATP上二次脫離釋放的能量,也可為腺苷酸轉(zhuǎn)運(yùn)激酶促進(jìn)ADP向AMP的轉(zhuǎn)變供能。AMP經(jīng)可逆酶促反應(yīng)生成腺苷和腺嘌呤,而后再度進(jìn)入分散途徑。生成的腺苷可分別轉(zhuǎn)化為肌苷、噴司他丁和3'-AMP。3'-AMP由Cns3蛋白的NK結(jié)構(gòu)域催化獲得,后經(jīng)Cns2轉(zhuǎn)化生成2'-C-3'-dA,再經(jīng)Cns1轉(zhuǎn)化獲得蟲草素。Cns3的HisG結(jié)構(gòu)域則完成另一反應(yīng),將腺苷轉(zhuǎn)化為噴司他丁?;舸杭t等[48]通過異源表達(dá)Cns1和Cns2、陳柏雄等[49]通過敲除Cns1-3基因簇,驗(yàn)證了Cns1-3對蟲草素合成的關(guān)鍵作用。
現(xiàn)有研究表明,通過改變培養(yǎng)條件中的單一因素,即可顯著改變蛹蟲草蟲草素的產(chǎn)量[44,50]。這一發(fā)酵表征提示,蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)易受外部條件擾動,因而可能存在柔性節(jié)點(diǎn)和關(guān)鍵的代謝節(jié)點(diǎn)。依照現(xiàn)有的代謝工程策略,目標(biāo)產(chǎn)物的代謝網(wǎng)絡(luò)中常見的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)主要包括限速步驟、分流節(jié)點(diǎn)和反饋抑制節(jié)點(diǎn)等。然而,蛹蟲草本身具有極易退化、魯棒性較差的特點(diǎn),會造成的代謝流分析結(jié)果不穩(wěn)定、通過異源基因表達(dá)難驗(yàn)證等問題。因此,目前尚難以確定蛹蟲草蟲草素代謝網(wǎng)絡(luò)中的限速步驟。相對而言,基于組學(xué)分析所得的分流節(jié)點(diǎn)和反饋節(jié)點(diǎn)較為明確,本文將其視為蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)中潛在的關(guān)鍵改造節(jié)點(diǎn)。
3.1.1 前體物質(zhì)組成的分流效應(yīng)
除以葡萄糖為前體外,核糖(Ribose)、木糖(Xylose)等多種單糖也可作為蛹蟲草合成蟲草素的前體[39,46]。這一相對較寬的前體譜可能與蛹蟲草自然生境中的營養(yǎng)物質(zhì)成分的復(fù)雜性是對應(yīng)的。然而,多樣化的前體譜可能同時(shí)造成更多的副反應(yīng)終端產(chǎn)物積累、非必須合成代謝負(fù)擔(dān)和關(guān)鍵合成途徑通量下降,這對于提高蟲草素產(chǎn)量的目標(biāo)是不利的。換句話說,多樣化的前體、轉(zhuǎn)化步驟冗余復(fù)雜的前體,都會在蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)的源頭上造成不必要的分流,這也提示了,阻斷代謝負(fù)荷較大的前體途徑,或提高核心前體途徑的通量,有望減少菌體代謝負(fù)擔(dān),提高蟲草素的單位產(chǎn)量。
3.1.2 IMP分流節(jié)點(diǎn)
SAICAR經(jīng)酶促反應(yīng)獲得的AICAR,是蟲草素關(guān)鍵前體物質(zhì)IMP的前體。但是,現(xiàn)有研究也表明,在培養(yǎng)基中添加的多種氨基酸被轉(zhuǎn)化為組氨酸后,可進(jìn)一步轉(zhuǎn)化生成AICAR,參與蟲草素的合成[22]。因此,AICAR的合成是由多種前體物質(zhì)匯聚得到的。
當(dāng)AICAR經(jīng)兩步反應(yīng)被轉(zhuǎn)化為IMP后,由于IMP會進(jìn)入三條分散途徑,且僅有部分IMP會被用于蟲草素的合成,因此本綜述將5-磷酸核糖經(jīng)多步反應(yīng)轉(zhuǎn)化進(jìn)入三條分散途徑的整體途徑模塊重命名為IMP途徑。三條分散途徑中,XMP途徑合成供能物質(zhì),與細(xì)胞生長相關(guān);腺苷酸琥珀酸途徑經(jīng)多步反應(yīng)轉(zhuǎn)化為蟲草素,是蟲草素底物合成途徑的上游核心途徑;肌苷途徑內(nèi)部循環(huán),并不與細(xì)胞生長或蟲草素合成直接相關(guān),因此,IMP是蟲草素合成的一個(gè)關(guān)鍵分流節(jié)點(diǎn)。
而在宏觀發(fā)酵層面,蛹蟲草的細(xì)胞生長與蟲草素合成已被證實(shí)是部分偶聯(lián)關(guān)系[51]。在菌絲對數(shù)生長期,蟲草素合成較為緩慢;待細(xì)胞干重越過峰值拐點(diǎn)后,腺苷、IMP等前體物質(zhì)快速消耗,蟲草素快速積累[24,44]。這一特性提示,在菌絲對數(shù)生長期,蛹蟲草可能采取了優(yōu)先保證菌絲生長的策略,將大部分IMP分流至GMP途徑;而在對數(shù)期結(jié)束后,細(xì)胞整體代謝轉(zhuǎn)為以蟲草素合成為主。然而,目前三條分散途徑在不同培養(yǎng)方式、不同培養(yǎng)時(shí)間時(shí)的代謝流通量及變化機(jī)制尚屬未知。
3.2.1 IMP的雙重反饋抑制機(jī)制
在XMP途徑中,XMP作為IMP轉(zhuǎn)化獲得GTP的中間產(chǎn)物,會抑制IMP環(huán)化脫水酶活性,從而抑制IMP的合成(圖3)[52]。此外,高豐度的谷氨酰胺也會進(jìn)一步抑制IMP脫水酶GuaB的活性,使得XMP無法轉(zhuǎn)化為GMP,鎖死IMP的合成,從而減少蟲草素的合成[52]。由于上述雙重反饋抑制機(jī)制是由蛹蟲草天然演化獲得的,且三大分散途徑分別與細(xì)胞生長和次級代謝產(chǎn)物合成有關(guān),因此推測IMP的合成與代謝可能是蛹蟲草調(diào)節(jié)自身蟲草素合成速率的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)[1]。
圖3 蛹蟲草IMP分散途徑分子調(diào)節(jié)機(jī)制圖Fig.3 Molecular regulation mechanism of IMP dispersion pathway in C.militaris
此外,現(xiàn)有研究表明,人、酵母等物種中,IMP環(huán)化脫水酶為IMP途徑中的關(guān)鍵限速步驟[53,54]。但由于缺少代謝流檢測、異源表達(dá)等實(shí)驗(yàn)證明,該結(jié)論尚未在蛹蟲草得到驗(yàn)證。
3.2.2 蟲草素合成的Protector-Protégé反饋機(jī)制
在蛹蟲草生長周期的大部分時(shí)間里,噴司他丁在胞內(nèi)通過抑制脫氨酶的活性,保證蟲草素的合成及其在胞內(nèi)的低豐度存在[10,55]。現(xiàn)有研究表明,蛹蟲草合成所得的蟲草素,大部分會排至胞外,因此胞內(nèi)蟲草素濃度相對較低。但當(dāng)蛹蟲草胞內(nèi)蟲草素積累過多,產(chǎn)生胞內(nèi)毒性時(shí),細(xì)胞啟動對噴司他丁的外排[10]。隨著胞內(nèi)噴司他丁含量的下降,脫氨酶活性恢復(fù),脫去蟲草素的氨基并轉(zhuǎn)化獲得3'-dl,從而降低蟲草素胞內(nèi)含量過高所產(chǎn)生的胞內(nèi)毒性[1]。蛹蟲草利用噴司他丁調(diào)節(jié)蟲草素胞內(nèi)濃度的機(jī)制,與抗生鏈霉菌中的機(jī)制相似,被稱為Protector-Protégé機(jī)制[10]。
分別由IMP和腺苷轉(zhuǎn)化得到的肌苷,既可經(jīng)酶促反應(yīng)生成次黃嘌呤(Hypoxanthine),也可由次黃嘌呤重新轉(zhuǎn)化為腺苷,并最終合成蟲草素[39]。由于尚未有確切的代謝流分析數(shù)據(jù)表明肌苷轉(zhuǎn)化所得的次黃嘌呤和腺苷的比例,因此上述分散途徑仍可被視為前體途徑。
在IMP轉(zhuǎn)化獲得蟲草素的多步反應(yīng)中,AMP與腺苷、腺苷與腺嘌呤(Adenine)、肌苷與腺苷等物質(zhì)之間的轉(zhuǎn)化均為可逆反應(yīng)[39]。然而同樣的是,此類途徑信息是由組學(xué)比對分析所得到的。在缺乏代謝流檢測、基因敲除、異源表達(dá)等實(shí)驗(yàn)結(jié)果的情況下,上述可逆反應(yīng)在蛹蟲草中的平衡偏好性是未知的。這些可逆反應(yīng)的存在,造成了蛹蟲草蟲草素合成網(wǎng)絡(luò)的魯棒性低下。在培養(yǎng)基成分、培養(yǎng)條件出現(xiàn)變化時(shí),前體合成途徑中的多步反應(yīng)都可能成為柔性節(jié)點(diǎn),從而使得代謝流變化較大。這一情況在生產(chǎn)工藝的擴(kuò)大化和異地重現(xiàn)方面是不利的。因此,簡化蛹蟲草蟲草素底物合成途徑,增大核心途徑的通量,可能是構(gòu)建穩(wěn)定高產(chǎn)的產(chǎn)蟲草素蛹蟲草菌株的重要方式。
蟲草素現(xiàn)已被證實(shí)具有抗病毒、抗癌、抗腫瘤等多種生物活性功能,是蟲草屬真菌最受關(guān)注的次級代謝產(chǎn)物。本綜述對蛹蟲草蟲草素代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了模塊化,劃分為中心碳代謝途徑、IMP途徑和蟲草素底物合成途徑3個(gè)模塊,并對每個(gè)模塊進(jìn)行了分段式闡述,細(xì)致描繪和分析了蛹蟲草蟲草素代謝網(wǎng)絡(luò)的代謝流走向。此外,本文還對蟲草素代謝網(wǎng)絡(luò)中的多個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),如分流節(jié)點(diǎn)和反饋節(jié)點(diǎn)進(jìn)行了深入的剖析,為蛹蟲草代謝工程改造提供理論性指引。
隨著根瘤農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化法、split-marker、CRISPR-Cas9等蛹蟲草基因組編輯技術(shù)的建立,蛹蟲草基因組精準(zhǔn)編輯已成為了可能,這也為繼續(xù)深入探究及改造蛹蟲草蟲草素代謝網(wǎng)絡(luò)鋪平了道路。前期同位素示蹤及組學(xué)研究中獲得的蛹蟲草蟲草素合成代謝網(wǎng)絡(luò)中上游潛在基因靶點(diǎn),均可利用新近開發(fā)的蛹蟲草CRISRP-Cas9-TRAMA基因組編輯技術(shù),通過典型的“三部曲”基因功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因的敲除、過表達(dá)和回補(bǔ))進(jìn)行“基因型-表型”關(guān)系分析。而通過迭代基因編輯,有望構(gòu)建高產(chǎn)蟲草素或其他腺苷衍生物的蛹蟲草工程菌株,從而發(fā)揮蛹蟲草液體靜置培養(yǎng)體系的生產(chǎn)成本及操作簡便性優(yōu)勢,將蛹蟲草進(jìn)一步開發(fā)成新型食品安全級的細(xì)胞工廠。