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        血漿hsa_circ_0094885在川崎病患兒中的表達水平及意義

        2023-08-31 07:30:42董彤韓勇黃先玫
        浙江臨床醫(yī)學 2023年7期
        關鍵詞:血漿水平

        董彤 韓勇 黃先玫

        川崎病(kawasaki disease,KD)又被稱為黏膜皮膚淋巴結綜合征(mucocutaneous lymphnode syndrome,MCLS),是一種好發(fā)于4 個月~5 歲兒童的全身血管炎癥性疾病,男孩較為多見[1-2]。KD 血管炎癥性改變主要發(fā)生于全身的中小動脈,尤其是冠狀動脈,主要表現為擴張、不同大小的冠狀動脈瘤,嚴重時可有心肌缺血、血栓形成、心肌梗死、心包壓塞、冠脈狹窄等,是目前發(fā)達國家獲得性心臟病的主要原因[2];發(fā)病機制可能是在某種病原體感染后觸發(fā)了川崎病遺傳易感性兒童免疫介導的炎癥級聯(lián)反應[3-4]。環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)在結構上是一類通過反向剪切形成閉合環(huán)狀結構的單鏈非編碼RNA,其與線性RNA 不同之處是circRNA 缺乏3’和5’端,而直接連接成環(huán)狀結構[5];circRNA 廣泛分布于人體各個組織和細胞,具有種類豐富,表達穩(wěn)定,高度保守,特異性強的特點[6]。目前研究已發(fā)現circRNA 通過調節(jié)轉錄過程和轉錄后調控,參與了多種疾病的發(fā)病機制,可作為多種疾病潛在診斷和判斷預后的標記物,還可提供治療靶點[7]。本文分析KD 急性期circRNA 與KD 相關實驗室檢查指標的相關性,探討circRNA 對KD 的診斷價值。

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料 選取2019 年2 月至2020 年10 月杭州市第一人民醫(yī)院KD 患兒。納入標準:①均符合AHA2017 年修訂的川崎病診斷標準;②年齡2 個月至6歲;③均為在杭州市第一人民醫(yī)院首次診斷為KD 并完成治療;④病例資料完整;⑤出院后長期隨訪;⑥排除合并有其他自身免疫性疾病或入院前使用過IVIG。同時選取同期因感染性疾?。òl(fā)熱≥5 d,明確有病原體感染或臨床及實驗室檢查數據支持感染者,排除既往有KD 病史及KD 家族史者)和非感染性疾病(包莖、肝功能異常、矮小癥等非感染疾病患兒)患兒為對照組。本研究共納入患兒63 例,KD 組23 例,男12 例,女11 例;年齡(25.04±3.41)個月。感染組20 例,男10例,女10 例,年齡(30.6±3.65)個月。非感染組20例,男12 例,女8 例;年齡(29.85±2.61)個月。三組患兒一般資料比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。本研究經本院倫理會批準,患兒家屬均簽署知情同意書。

        1.2 主要試劑及耗材 (1)試劑:TRIzol(杭州欣耕生物科技有限公司,中國)、氯仿(上海沃凱生物有限公司,中國)、異丙醇(上海沃凱生物有限公司,中國)、75%乙醇(杭州歐拓普生物技術有限公司,中國)、逆轉錄試劑盒(TOYOBO,日本)、RNase R 試劑盒(廣州吉賽生物科技公司,中國)、Real-Time PCR 試劑盒(bimake,美國)、RNase Free 水(QIAGEN,美國)、引物和內參(上海生工生物工程有限公司,中國)。(2)儀器:離心機(Thermo,美國)、渦旋振蕩器(Vortex,美國)、移液槍(Thermo,美國)、恒溫水浴箱(太倉精宏儀器設備有限公司,中國)、逆轉錄儀(BIO-RAD,美國)、NanoDrop 分光光度計(Thermo,美國)、熒光定量PCR 儀(ABI7500,新加坡)。

        1.3 方法 (1)查找和篩選目的基因:先在GEO 數據庫(http://www.NCBI.nlm.nih.gov)檢索與KD 相關的circRNA 表達譜,該數據的登錄號為GSE64486;然后在CircBase 數據庫(www.circbase.org)查找circRNA 的基因來源和序列信息。(2)收集標本:使用EDTA 抗凝管收集三組晨起空腹1.5~2.0 mL 外周靜脈血。(3)分離血漿:將收集的靜脈血離心,離心條件為4℃,3,000 r/min,離心10 min,離心結束后用移液槍吸取上清液即血漿分裝在無RNA 酶EP 管內。(4)提取RNA :使用TRIzol 法提取血漿中的總RNA,提取后使用NanoDrop 分光光度計對血漿總RNA 的濃度和純度進行測量。(5)RNA 逆轉錄:先按RNase R 試劑盒說明書步驟去除血漿中的線性RNA,再將去除線性RNA 的血漿總RNA 按照TOYOBO qPCR RT 逆轉錄試劑盒說明書的要求在逆轉錄儀器上操作逆轉錄合成cDNA。(6)實時熒光定量PCR:將逆轉錄的cDNA 按照bimake 2xSYBR Green qPCR Master mix 試劑盒說明書步驟在ABI7500 儀器上進行實時熒光定量PCR 操作。目的基因circRNA 基因序列在circBase 進行查找,查找后按照circRNA 引物設計原則進行設計,由上海生工公司對引物進行合成。見表1。(7)qRT-PCR結果分析:circRNA 的相對定量采用2-△△Ct法進行分析,以GAPDH 作為內參照;其中,?Ct=Ct(目的基因)-Ct[內參基因(GAPDH)],△△Ct=實驗組△Ct- 對照組△Ct,再取各組2-△△Ct即為相對表達量,?Ct 值越大,提示circRNA 表達水平越低。

        表1 circRNA引物序列

        1.4 統(tǒng)計學方法 采用SPSS 26.0、GraphPad Prism 8.0軟件。符合正態(tài)分布計量資料以(±s)表示,兩組比較采用兩獨立樣本t檢驗,多樣本平均數間的比較采用單因素方差分析;偏態(tài)分布計量資料以中位數[M(Q1,Q3)]表示,兩組間比較采用Mann-Whitney U檢驗,多組間比較采用Kruskcal-Wailsh 檢驗;計數資料以%表示,組間比較采用χ2檢驗;采用受試者操作特征曲線(ROC)和ROC 曲線下面積(AUC)評估circRNA 在KD中的診斷價值。

        2 結果

        2.1 血漿circRNA 在KD 組、感染組及非感染組中的表達情況 KD 組患兒血漿中hsa_circ_0094885 表達水平低于感染及非感染組(P<0.05);血漿hsa_circ_0017348 表達水平在KD 組高于感染及非感染組(P<0.05);KD 組血漿hsa_circ_0003609 低于非感染組(P<0.05)。見圖1。

        圖1 三組患兒血漿circRNA的表達情況

        2.2 血漿circRNA 在KD 急性期與恢復期中的表達情況 血 漿hsa_circ_0094885、hsa_circ_001640 和hsa_circ_0003609 在KD 急性期中表達水平均低于恢復期(P<0.05)。見圖2。

        圖2 兩組患兒血漿circRNA的表達情況

        2.3 血漿circRNA 在各組中表達水平比較 KD 組血漿hsa_circ_0094885 表達水平低于感染組及非感染組(P<0.05);KD 組血漿hsa_circ_0017348 表達水平高于感染組及非感染組(P<0.05)。見表2。KD 急性期血漿hsa_circ_0094885 表達水平低于恢復期表達水平(P<0.05)。見表3。

        表2 三組血漿hsa_circ_0094885及hsa_circ_0017348表達水平比較(±s)

        表2 三組血漿hsa_circ_0094885及hsa_circ_0017348表達水平比較(±s)

        注:與感染組比較,*P<0.05;與非感染組比較,#P<0.05

        指標 感染組(n=20)非感染組(n=20)KD 組(n=23) H 值 P 值hsa_circ_0094885 1.41±0.18 1.40±0.20 0.51±0.19*# 26.438 <0.001 hsa_circ_0017348 2.94±0.41 0.39±0.03 10.29±2.90*# 8.974 <0.05

        表3 KD急性期與恢復期血漿hsa_circ_0094885表達水平比較(±s)

        表3 KD急性期與恢復期血漿hsa_circ_0094885表達水平比較(±s)

        時間急性期恢復期t 值P 值hsa_circ_00948850.43±0.03 2.02±0.90-2.38<0.05

        2.4 hsa_circ_0094885 在KD 中潛在診斷價值 采用ROC 曲線評估血漿hsa_circ_0094885 的診斷效能,結果顯示:血漿hsa_circ_0094885 的ROC 曲線下面積為0.763,標準誤0.072,95%置信區(qū)間0.621~0.905,截斷值是0.46,敏感度為78.26%,特異度為78.57%。見圖3。

        圖3 血漿hsa_circ_0094885對KD的ROC分析

        3 討論

        KD 的診斷主要依靠KD 特征性臨床表現、一般實驗室檢查及心臟超聲檢查[8]。近年來,隨著分子生物學的發(fā)展,越來越多的非編碼RNA 可能參與KD 的發(fā)病以及可作為KD 的診斷標志物。circRNA 作為近幾年來的熱點之一,被越來越多的學者發(fā)現其與諸多疾病的發(fā)生發(fā)展具有一定的相關性[9-12]。在心血管疾病中既往研究發(fā)現外周血中hsa_circ_0082081 與hsa_circ_0124644可能是冠狀動脈疾病的診斷標志物,尤其是兩者結合起來診斷效能更高[13]。此外,急性期KD 患兒血清circ_ANRIL 表達水平與健康對照組相比明顯上調,經IVIG治療后明顯下降[14]。

        本研究顯示,KD 組急性期血漿hsa_circ_0094885表達水平低于感染組及非感染組(P<0.05),經過治療后KD 患兒恢復期血漿hsa_circ_0094885 水平上調,提示hsa_circ_0094885 可能與KD 的發(fā)生相關;KD 患兒急性期血漿hsa_circ_0017348表達水平高于感染組及非感染組(P<0.05),經治療后KD 患兒恢復期hsa_circ_0017348表達水平無明顯變化,因此hsa_circ_0017348 與KD 是否具有相關性不明確;血漿hsa_circ_0003609 和hsa_circ_001640 在三組中表達水平差異無無統(tǒng)計學意義,因此hsa_circ_0003609 和hsa_circ_001640 可能與KD 發(fā)生無關。

        以往研究發(fā)現,hsa_circ_0094885 為circ_ATM,其基因位點在chr11:108098332-108100050,ATM 主要在DNA 修復和細胞周期調節(jié)中發(fā)揮重要作用,其編碼的蛋白屬于PI3/PI4 激酶家族,是多種下游蛋白包括P53、BRCA1、CHK2、RAD17 等的調節(jié)因子,此外,ATM 已經被證明其發(fā)生突變可導致共濟失調毛細血管擴張[15],然而也有較多研究證明ATM 基因多態(tài)性與肺癌、放射性肺炎、乳腺癌等有關[16],可作為這些疾病的早期預測因子。通過ROC 曲線對血hsa_circ_0094885 的診斷效能進行評估,結果顯示AUC 為0.763,敏感度為78.26%,特異度為78.57%,表明血漿hsa_circ_0094885在KD 診斷中具有較高的敏感度和特異度,進一步提示hsa_circ_0094885 有望成為診斷KD 的新型生物學標志物。

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