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        施氮水平對花生根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響

        2023-08-28 06:01:54梁滿孟維偉陳志德沈一劉永惠沈悅劉柱南鎮(zhèn)武徐杰張正
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年2期
        關(guān)鍵詞:施氮放線菌菌門

        梁滿 孟維偉 陳志德 沈一 劉永惠 沈悅 劉柱 南鎮(zhèn)武 徐杰 張正

        摘要:本試驗(yàn)通過16S rRNA基因測序技術(shù),研究零氮(0 kg/hm2)、低氮(75 kg/hm2)、中氮(150 kg/hm2)和高氮(225 kg/hm2)4個氮肥梯度對花生根際土壤微生物群落組成和結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果表明,施氮可以提高花生根際土壤微生物群落的豐富度和多樣性,不同氮肥處理中以中氮處理的Chao 1指數(shù)和Shannon指數(shù)最高。施氮處理下的OTUs個數(shù)均多于不施氨,且隨著氮肥施人量的增加呈先升高后降低的趨勢,中氮處理較零氮、低氮和高氨分別高11.21%、4.90%和7.01%。不施氮和在一定施氮范圍內(nèi),土壤微生物群落穩(wěn)定,但是高氮會導(dǎo)致土壤微生物群落不穩(wěn)定。16S rRNA功能預(yù)測分析顯示,施氮處理下的細(xì)胞運(yùn)動等功能基因的豐度相對升高,對花生根際土壤微生物群落的功能豐度譜產(chǎn)生一定的影響。本研究明確了施氮對花生根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響,為深入研究不同施肥措施對花生根際微生態(tài)的影響提供了借鑒。

        關(guān)鍵詞:花生根際;施氨水平;土壤微生物群落功能多樣性;16S rRNA

        中圖分類號:S565.2:S154.34 文獻(xiàn)標(biāo)識號:A 文章編號:1001-4942(2023)02-0078-06

        花生是我國重要的油料作物,也是重要的植物油脂和蛋白質(zhì)來源。氮是花生吸收量最大的營養(yǎng)元素,增施氮肥能提高花生產(chǎn)量、改善花生品質(zhì)。此外,地下部微生物群落也受到氮肥的影響。土壤氮水平是影響根際微生物的重要因素,對土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性有一定的影響。研究發(fā)現(xiàn),氮肥的施用可以提高土壤微生物群落碳源利用率、微生物群落的豐富度和功能多樣性。付智丹等發(fā)現(xiàn)適宜的施氮量不僅能夠增加玉米、大豆套作土壤中的真菌、放線菌和固氮菌的數(shù)量,還能調(diào)節(jié)土壤氮素的轉(zhuǎn)化。趙帆等發(fā)現(xiàn)微生物群落結(jié)構(gòu)受多種土壤環(huán)境因子的影響,以土壤全氮含量和pH值對微生物群落的影響最顯著。丁紅等發(fā)現(xiàn)在于旱低氮雙重脅迫下,花生根際細(xì)菌可能在花生生長和響應(yīng)逆境脅迫中起重要作用。然而,目前關(guān)于氮肥用量和微生物類群之間的關(guān)系仍未明確,不同施氮量對花生土壤微生物群落的影響還缺乏系統(tǒng)研究。

        本試驗(yàn)探究不同施氮水平對花生根際土壤微生物群落組成和結(jié)構(gòu)的影響,預(yù)測細(xì)菌群落功能,以期為花生建立合理的施肥制度和提高氮肥利用率提供理論依據(jù)。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)地概況與試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)于2018年在山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院濟(jì)陽試驗(yàn)基地進(jìn)行,土壤類型為潮土,質(zhì)地沙壤,0-20cm土層有機(jī)質(zhì)含量為12.3g/kg,全氮0.5 g/kg,堿解氮52.8 mg/kg,速效磷93.1 mg/kg,速效鉀10.2 mg/kg,鹽分0.21%,pH 7.3。

        供試花生品種為花育25號,壟作種植,壟底寬80 cm,壟面寬40 cm,壟上播2行花生,行距35cm,穴距18 cm,每穴2株。

        1.2試驗(yàn)設(shè)計(jì)

        試驗(yàn)設(shè)4個處理:NO(零氮,0 kg/hm2)、Nl(低氮,75 kg/hm2)、N2(中氮,150 kg/hm2)、N3(高氮,225 kg/hm2)。3次重復(fù)。磷肥為P2O5120 kg/hm2、鉀肥為K2O 120 kg/hm2,均作底肥一次性施入。

        1.3根際土壤采集

        于花生結(jié)莢期將整株挖出,抖落根系表層土壤,用滅菌刷子將根際1~10 mm的土壤拂刷下來放入無菌袋中,同一處理的花生根際土壤樣品混合成一個土壤樣品,液氮速凍后置于-80℃超低溫冰箱保存。相關(guān)測試由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司完成。

        1.4測定方法

        根據(jù)OMEGA Soil DNA Kit試劑盒(USA)說明書進(jìn)行土壤微生物總DNA的提取,用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)量檢測,NanoDrop ND-2000核酸蛋白測定儀分析檢測DNA的濃度和純度。以提取的土壤樣本DNA為模板,對土壤細(xì)菌16SrRNA基因進(jìn)行擴(kuò)增,引物為V3-V4區(qū)的343F(5-TACGGRAGGCAGCAG -3')以及798R(5-AGGGTAT CTAATCCT-3')。PCR擴(kuò)增體系(20uL):預(yù)混液10 uL,正、反向引物(10 umol/L)各0.8 uL,DNA模板(10 ng)1 uL,ddH2O補(bǔ)足至20uL。擴(kuò)增程序:95℃ 3 min;95℃ 30 s,50℃ 30 s,72℃ 60 s,共30個循環(huán):72℃ 10 min。PCR產(chǎn)物使用2%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測,采用AxyPrepDNA Gel Extraction Kit (Axygen Biosciences,UnionCity,USA)進(jìn)行純化,利用QuantiFluorTM -ST(Promega,USA)進(jìn)行定量和Illumina公司的MiseqPE300平臺進(jìn)行測序。

        1.5生物信息學(xué)分析

        采用Alpha多樣性分析方法,對樣本間的主成分進(jìn)行分析(PCA),以挖掘花生根際土壤細(xì)菌群落組成的差異?;贕reengenes數(shù)據(jù)庫注釋的16S rRNA測序數(shù)據(jù),使用PICRUSt軟件預(yù)測已知微生物基因功能的構(gòu)成,從而統(tǒng)計(jì)不同樣本和分組之間在功能上的差異。

        2結(jié)果與分析

        2.1土壤微生物群落豐富度和多樣性變化

        由表1可以看出,各處理間覆蓋度無顯著差異,平均值均在0.95以上,土壤樣本文庫覆蓋率較高。施氮處理下的Observed species指數(shù)和Chao 1指數(shù)均高于不施氮處理,且均隨氮肥施入量的增加呈先升高后降低的趨勢,其中N1和N2的Observed species指數(shù)差異不顯著,但顯著高于NO和N3,Chao 1指數(shù)以N2處理最高。Shannon指數(shù)隨著施氮量的增加先增加后減少,在N2處理達(dá)到最大值;施氮處理下的Simpson指數(shù)差異不顯著,但均低于不施氮處理,說明施氮處理群落物種分配不均勻,多樣性高。表明施氮可以提高花生根際微生物群落的豐富度和多樣性,不同施氮水平以N2處理最優(yōu)。

        2.2土壤微生物群落組成分析

        圖1可見,在門分類水平上,各處理中根際土壤細(xì)菌群落排名前5位的優(yōu)勢菌門均為變形菌門(Proteobacteria,41.41%~47.50%)、放線菌門(Actinobacteria,15.76%-16.80%)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes,12.34%~15.04%)、擬桿菌門(Bacteroidetes,11.81%-15.38%)和厚壁菌門(Firmicutes,4.87%-5.18%)。在優(yōu)勢菌門中,施氮處理下的變形菌門和放線菌門的相對豐度均高于不施氮處理,其中變形菌門相對豐度以N2處理最高,放線菌門的相對豐度在N1和N2處理下差異不顯著,但均高于N3處理,說明花生根際土壤微生物群落的優(yōu)勢菌門相對豐度并沒有隨著施氮量的增加而一直增多。施氮量對其它3種優(yōu)勢菌群(芽單胞菌門、擬桿菌門和厚壁菌門)的相對豐度影響不大。

        2.3土壤微生物群落OTUs聚類分析

        如圖2所示,所有處理中共有的OTUs為1 385。在97%的相似度下,NO、N1、N2、N3各處理分別平均獲得2 445、2 592、2 719、2 541個OTUs,3種施氮處理下的OTUs數(shù)均多于不施氮,且隨著氮肥施人量的增加呈先升高后降低的趨勢.其中N2處理較NO、N1和N3高11.21%、4.90%和7.01%。表明,施氮可以提高花生根際微生物群落的OTUs數(shù)。

        2.4土壤微生物群落主成分分析

        如圖3所示,橫坐標(biāo)(PCl)能夠解釋12.6%的樣本差異,縱坐標(biāo)(PC2)能夠解釋11.4%的樣本差異。聚類分析表明,同一處理3次重復(fù)聚集到同一分支,不同處理樣本間距離較遠(yuǎn),差異較大,聚集于不同分支。PC1將NO和N1與N2和N3明顯區(qū)分,NO處理全部分布在PC1的負(fù)方向,N2和N3處理分布在PC1的正方向,而N1處理在PC1正負(fù)方向上均有分布。PC2將N3處理與NO、N1和N2明顯區(qū)分,N3處理全部分布在PC2的負(fù)端,NO、N1和N2處理主要出現(xiàn)在PC2的正端。說明施氮影響了花生根際土壤環(huán)境,使根際土壤細(xì)菌群落多樣性產(chǎn)生較大差異。從圖3還可以看出,NO、N1和N2處理得分系數(shù)離散小,N3處理得分系數(shù)變異較大,這一研究結(jié)果表明,不施氮和在一定施氮范圍內(nèi),土壤微生物群落穩(wěn)定,但是過量施入氮肥會導(dǎo)致土壤微生物群落不穩(wěn)定。

        2.5土壤微生物群落潛在功能預(yù)測

        如圖4所示,氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝(amino acid transport and metabolism)、轉(zhuǎn)錄(transcription)、信號傳導(dǎo)(signal transduction mechanisms)、細(xì)胞壁/膜/包膜生物發(fā)育(cell wall/membrane/envelope biogenesis)、能量生產(chǎn)與轉(zhuǎn)化(energy production and conversion)和碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝(carbo-hydrate transpon and metabolism)這6類功能所占的比重較大。與不施氮相比,施氮處理下的細(xì)胞運(yùn)動(cell motility)、細(xì)胞骨架(cytoskeleton)和細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸、分泌和囊泡運(yùn)輸(intracellular trafficking,secretion,and vesicular transport)等功能基因的豐度相對升高,說明花生根際土壤細(xì)菌群落在適量氮素的調(diào)控下會產(chǎn)生較高的活性。

        3討論

        根際是植物根系與土壤微生物之間相互作用所形成的微生態(tài)環(huán)境,在植物生長和發(fā)育過程中起著重要作用,根際微生物作為根際的重要組成部分,其群落多樣性反映群落總體的動態(tài)變化??茖W(xué)的肥料管理通過影響土壤微生物量和菌群結(jié)構(gòu),從而在一定程度上改變土壤養(yǎng)分和作物產(chǎn)量。本研究顯示,施氮可以提高花生根際微生物群落的豐富度和多樣性,其中150kg/hm2氮肥施用量的Chao 1指數(shù)和Shannon指數(shù)最高。聶江文等研究湖南雙季稻區(qū)微生物群落發(fā)現(xiàn),在冬種紫云英不還田條件下配施氮肥處理的多樣性指數(shù)以及物種豐富度指數(shù)均高于不施氮。謝文軍、覃瀟敏等發(fā)現(xiàn),施用無機(jī)化肥可以提高土壤微生物的Shannon指數(shù)。說明土壤氮水平對土壤微生物的多樣性和群落結(jié)構(gòu)有一定的影響,本研究發(fā)現(xiàn)中氮處理下的土壤微生物活性最佳,高氮處理對微生物的活性產(chǎn)生抑制作用。

        秸稈還田及配施氮肥條件下,水稻田根際土壤中優(yōu)勢菌門為變形菌門、放線菌門、擬桿菌門等,干旱脅迫和低氮處理下花生根際土壤中的變形菌門相對豐度降低。本研究中,各根際土壤細(xì)菌群落的處理中排名前5位的優(yōu)勢菌門分屬變形菌門、放線菌門、芽單胞菌門、擬桿菌門和厚壁菌門,其中,變形菌門相對豐度以中氮處理最高,說明變形菌門在低氮條件下的相對豐度較低,這與丁紅等的研究結(jié)果一致。施肥對土壤微生物群落的影響存在一定的不確定性,白震等發(fā)現(xiàn)不同配施會抑制黑土中大多數(shù)菌群的生長,但在氮肥優(yōu)化條件下,能提高微生物的菌群含量。本研究發(fā)現(xiàn),施氮影響了花生根際土壤環(huán)境,使根際土壤細(xì)菌群落多樣性產(chǎn)生較大差異,過量施人氮肥會導(dǎo)致土壤微生物群落不穩(wěn)定,可能是在含氮較高的土壤中,花生結(jié)瘤固氮量少,固氮細(xì)菌群落的生長受到抑制。16S rRNA功能預(yù)測表明施氮對花生根際土壤微生物群落的功能豐度譜產(chǎn)生一定的影響,施氮處理下的細(xì)胞運(yùn)動等功能基因的豐度相對升高,可能與土壤環(huán)境的變化導(dǎo)致花生根際土壤細(xì)菌代謝發(fā)生改變有關(guān)。氮肥對土壤中微生物的影響也與土壤的環(huán)境因素和作物管理等條件有關(guān),施氨水平對花生根際微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響還需要進(jìn)一步深入研究和驗(yàn)證。因此,今后還應(yīng)深入研究不同施肥措施對花生根際微生態(tài)的影響,探討根系發(fā)育與土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的關(guān)系,以期為花生建立合理的施肥制度和提高氮肥利用率提供理論支撐。

        4結(jié)論

        與不施氮相比,施氮可以提高花生根際微生物群落的豐富度和多樣性,以中量氮肥的Chao 1指數(shù)和Shannon指數(shù)最高?;ㄉH土壤細(xì)菌群落以變形菌門、放線菌門、芽單胞菌門、擬桿菌門和厚壁菌門等優(yōu)勢菌門為主,施氮處理提高了變形菌門和放線菌門的相對豐度,但其豐度并沒有隨著施氮量的增加而一直增多。施氮處理下的OTUs數(shù)均多于不施氮,中氮處理下的OTUs數(shù)最多,且隨著氮肥施入量的增加呈先升高后降低的趨勢。不施氮和在低、中量氮肥施用范圍內(nèi),土壤微生物群落穩(wěn)定,過量施入氮肥會導(dǎo)致土壤微生物群落不穩(wěn)定。

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