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        有機廢棄物對辣椒、番茄幼苗生長及根際微生物群落的影響

        2023-07-17 07:51:22解志強趙強彪朱德顏毛振坤彭翠仙
        熱帶農(nóng)業(yè)科技 2023年3期
        關(guān)鍵詞:菌門根際廢棄物

        王 燦,解志強,孫 媛,趙強彪,朱德顏,毛振坤,彭翠仙*

        (1.文山州農(nóng)業(yè)科學(xué)院,云南文山 663000;2.文山州植保植檢站,云南文山 663000)

        蔬菜是云南高原特色農(nóng)業(yè)重點產(chǎn)業(yè)。其中辣椒(Capsicum annuumL.)、番茄(Lycopersicon esculentumMill.)已成為云南省主要的外銷亞熱帶果蔬作物之一。隨著產(chǎn)業(yè)化、機械化、規(guī)模化、自動化程度的不斷提高,對育苗基質(zhì)的需求量也急劇上升[1]。目前市場上普遍使用的育苗基質(zhì)主要成分是草炭,但其資源有限、短期內(nèi)不可再生,大量開發(fā)會導(dǎo)致生態(tài)環(huán)境惡化,且國內(nèi)草炭品質(zhì)參差不齊,影響育苗效果。為此,利用一些農(nóng)業(yè)有機廢棄物,通過發(fā)酵腐熟、炭化、添加外源物等方式[2],開發(fā)價格低廉的新型有機復(fù)合育苗基質(zhì)代替草炭已成為當務(wù)之急和研發(fā)的熱點,具有重要的經(jīng)濟和生態(tài)意義。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)過程中產(chǎn)生的有機廢棄物富含有機質(zhì)、N、P、K 等營養(yǎng)元素[3],通過堆肥發(fā)酵、炭化處理、添加外源物料等方式制成育苗基質(zhì),一方面育苗效果顯著,提高了農(nóng)業(yè)廢棄物利用率,另一方面保護了生態(tài)環(huán)境。Yousry 等[4]研究發(fā)現(xiàn),葡萄果實廢棄物堆肥發(fā)酵后與泥炭或蛭石1∶1 混合作為黃瓜育苗基質(zhì),可顯著提高種子萌發(fā)、幼苗成活率及質(zhì)量,同時降低育苗成本,可用于園藝苗圃的商業(yè)化生產(chǎn)。Perez-Murcia 等[5]利用城市污泥替代草炭作為基質(zhì)觀察對西蘭花生長的影響,結(jié)果表明城市污泥用量為30%時西蘭花生長最快。

        辣椒、番茄主要采用育苗盤方式進行育苗,育苗基質(zhì)是影響幼苗質(zhì)量的主要因素,不僅為幼苗生長提供水分與養(yǎng)分,同時也起到對外界環(huán)境不利因素刺激的緩沖作用[6]。有研究表明,基質(zhì)的理化性狀會影響微生物類群、數(shù)量、養(yǎng)分釋放量,進而影響植物對養(yǎng)分的利用情況[7-9]。王闖等[9]研究表明,椰糠+菇渣+珍珠巖制成育苗基質(zhì)明顯促進番茄植株生長,其產(chǎn)量、光合特性、根呼吸和微生物含量都顯著高于對照(草炭)。宋佳澤[10]通過將不同處理的秸稈用于黃瓜種植,結(jié)果發(fā)現(xiàn)各處理均在一定程度上促進了根際土壤中酶活性和芽單胞菌科、鞘脂單胞菌科等土壤微生物生長繁殖,進而提高土壤養(yǎng)分,促進黃瓜生長發(fā)育。張凱歌等[11]發(fā)現(xiàn),檸條堆肥結(jié)合適度深翻有效促進了土壤細菌群落的多樣性,提高功能基因豐度與6 大碳源利用水平。

        大量研究表明,有機廢棄物基質(zhì)對植物幼苗生長有顯著促進作用,但對辣椒、番茄幼苗根際微生物群落結(jié)構(gòu)的影響鮮有報道。因此,本研究采用16S/ITS rDNA 對成苗期的辣椒、番茄根際微生物進行擴增子測序,旨在探究有機廢棄物基質(zhì)對辣椒、番茄幼苗根際微生物群落結(jié)構(gòu)的影響,為利用有機廢棄物作為育苗基質(zhì)提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 供試材料

        辣椒品種為‘京滇皺皮椒’,購買于云南京滇種業(yè)有限公司。番茄品種為‘305’,由云南農(nóng)業(yè)大學(xué)滇臺特色農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化工程研究中心提供。

        有機廢棄物育苗基質(zhì)主要材料包括稻殼生物炭、發(fā)酵茶渣等,為上一階段試驗篩選得出的最佳配比[12]。商品育苗基質(zhì)為‘綠成豐’牌,由連云港恒奧達肥料科技有限公司生產(chǎn),主要成分為草炭土、蘑菇渣、珍珠巖、礦石、豆粕渣。基質(zhì)理化性狀由試驗前期完成測定(表1、表2)。

        表1 基質(zhì)物理性狀

        表2 基質(zhì)化學(xué)性狀

        1.2 方法

        試驗于2021 年4 月—2021 年12 月在文山州農(nóng)業(yè)科學(xué)院進行,共設(shè)2 個處理,A 處理為有機廢棄物育苗基質(zhì),CK 處理為商品育苗基質(zhì)。

        將發(fā)芽整齊一致的辣椒、番茄種子播種于每盤36 孔的育苗盤中,每盤為一次重復(fù),每個處理各3 次重復(fù)。苗齡65 d 時,采用5 點取樣法選取整齊一致的植株整株,拔出并抖落附著的土壤基質(zhì),用無菌刷刷取粘附在根表面的土壤基質(zhì)混合于50 mL 無菌離心管中,迅速置于干冰中保存運輸,后置于-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆?,同時收集抖落土壤用于檢測理化性質(zhì);將植株保存于4 ℃用于生化檢測。

        植株干重用分析天平測量,株高和莖粗用刻度尺、游標卡尺測量。葉綠素采用紫外分光光度法測定[12],根系活力采用TTC 法測定[13],可溶性糖含量采用蒽酮比色法測定[14],蛋白質(zhì)含量采用考馬斯亮藍G-520 染色法測定[15]。

        生長函數(shù)(mg/d)=全株干重/苗齡

        壯苗指數(shù)=(地下部分干重/地上部分干重+莖粗/株高)×全株干重

        秧苗根際微生物DNA 提取均使用HiPure Soil DNA Kit 核酸提取試劑盒,使用Qubit? dsDNA HS Assay Kit 檢測DNA 濃度。由GENEWIZ,Inc(South Plainfield, NJ)公司完成二代測序文庫構(gòu)建和測序。16S rDNA 上V3 及V4 區(qū) 引物 系列 如下:F:5’-CCTACGGRRBGCASCAGKVRVGAAT-3’;R:5’-GGACTACNVGGGTWTCTAATCC-3’。ITS rDNA 上的ITS2 可變區(qū) 引物如下:F:5’-GTGAATCATCGARTC-3’;R:5’- TCCTCCGCTTATTGAT-3’。通過Illumina MiSeq 進行雙端測序。

        1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與處理

        數(shù)據(jù)差異顯著性分析使用DPS 7.05(Duncan新復(fù)極差法,P<0.05)。測序數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)化使用Cutadapt 1.9.1、Vsearch 1.9.6、Qiime 1.9.1。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 對幼苗生長代謝的影響

        不同處理下辣椒、番茄的株高、莖粗無顯著差異(表3),在干重、生長函數(shù)、壯苗指數(shù)方面,A 處理顯著高于CK。在生化指標上(表4),辣椒中A處理葉綠素含量、根系活力顯著高于CK,可溶性蛋白和可溶性糖含量則無顯著差異;番茄中A 處理葉綠素、可溶性蛋白、可溶性糖含量、根系活力均顯著高于CK。

        表3 不同處理對幼苗生長的影響

        表4 不同處理對幼苗生化指標的影響

        2.2 根際微生物群落組成

        試驗共收集4 個樣本,質(zhì)控后依據(jù)97 %相似性聚類獲得269 個細菌OTUs、142 個真菌OTUs(不同樣本取并集所得)。A 處理下辣椒、番茄根際土壤 細 菌OTU 個 數(shù) 分 別 為186、219,CK 則 分 別 為247、227(圖1a)。A 處理辣椒、番茄根際土壤真菌OTU 個數(shù)分別為71、77,CK 則分別為97、126(圖1b)。A 處理作物根際土壤細菌和真菌OTU 數(shù)均低于CK。

        圖1 根際微生物OTU花瓣圖

        土壤細菌門水平組成如圖2a 所示,4 個土壤樣本共得到9 個類群,相對豐度從大到小依次為變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteria)、藍細菌門(Cyanobacteria)、Patescibacteria、酸桿菌門(Acidobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、綠彎菌門(Chloroflexi)。A 處理辣椒和番茄根際土壤中酸桿菌門占比分別是5.97%和8.27%,低于CK(10.48%、21.92%),芽單胞菌門、綠彎菌門、Patescibacteria、藍細菌門占比也均低于CK。但A 處理下辣椒、番茄根際土壤中厚壁菌門分 別 為 2.21% 和 3.93% ,高 于 CK(1.24% 和0.59%)。土壤細菌屬水平下(Top15),黃桿菌屬(Flavobacterium)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、Devosia為主要細菌屬,且A 處理以上細菌屬相對豐度均高于CK(圖2b)。真菌門水平下,除A 處理辣椒樣本外,其余樣本物種數(shù)目均為4,主要菌群為子囊菌門(Ascomycota)和擔子菌門(Basidiomycota)。A 處理辣椒、番茄根際土壤中擔子菌門相對豐度分別為26.43%和20.52%,高于CK(1.67%和1.61%,圖2c)。屬 水 平 下(Top15),毛 孢 子 菌(Trichosporon)、Aspergillus、Graphium為主要菌屬,且A 處理以上真菌屬相對豐度均高于CK(圖2d)。

        圖2 根際土壤細菌、真菌門水平與屬水平群落組成

        2.3 根際微生物群落多樣性分析

        根據(jù)表5 可知,辣椒A 處理根際土壤細菌豐富度指數(shù)Ace 和Chaol(200.66 和197.04)顯著低于CK(254.26 和253.38),多 樣 性 指 數(shù)Shannon 和Simpson(5.03 和0.98)同 樣 顯 著 低 于CK(6.83 和1.10);真菌情況與細菌相似,A 處理根際土壤真菌豐富度指數(shù)和多樣性指數(shù)均顯著低于CK 處理。A 處理番茄根際土壤細菌豐富度指數(shù)和多樣性指數(shù)均低于CK,但兩者間無顯著差異;真菌豐富度指數(shù)和多樣性指數(shù)則顯著低于CK。表明A處理顯著降低了辣椒根際土壤細菌、真菌群落的豐富度和多樣性,對番茄根際細菌群落多樣性無顯著影響,但顯著影響真菌群落多樣性。

        主坐標分析中,樣本點距離的遠近代表了樣本中微生物群落的相似性,距離越近,相似度越高;聚集在一起的樣本由相似的微生物群落構(gòu)成。如圖3a,在細菌中第一主坐標揭示了樣本間72.26%的差異并將A 處理和CK 處理區(qū)分開,第二主坐標揭示了樣本18.12 %的差異。真菌中(圖3b)第一主坐標揭示了樣本間61.5%的差異并將A處理和CK 處理區(qū)分開,第二主坐標揭示了樣本35.33%的差異。

        圖3 根際微生物PCoA分析

        2.4 微生物群落與基質(zhì)性狀相關(guān)性分析

        冗余分析中選擇基質(zhì)土壤相關(guān)理化性狀與屬水平下豐度前10 的微生物進行分析。根據(jù)圖4a,持水孔隙度、通氣孔隙度、速效P、速效K、pH 及腐殖質(zhì)均對A 處理辣椒、番茄的根際細菌群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生顯著影響,是導(dǎo)致細菌群落組成改變的影響因子。而速效P、速效K、pH 及有機質(zhì)對A 處理真菌群落結(jié)構(gòu)組成有顯著影響(圖4b)。

        圖4 細菌(a)、真菌(b)與土壤理化性質(zhì)的冗余分析

        土壤細菌群落與理化性質(zhì)的Spearman 分析中(圖5a),A 處理優(yōu)勢菌厚壁菌門相對豐度與pH值、有機質(zhì)、速效K 含量顯著正相關(guān),與速效N 含量顯著負相關(guān)(P<0.05)。而CK 處理中的優(yōu)勢菌酸桿菌門、芽單胞菌門、綠彎菌門則正好相反。酸桿菌門相對豐度與pH 值、有機質(zhì)、速效K 含量顯著負相關(guān);芽單胞菌門相對豐度與pH 值、有機質(zhì)、通氣孔隙度顯著負相關(guān),與速效N 含量顯著正相關(guān);綠彎菌門豐度與pH 值、有機質(zhì)顯著負相關(guān),與EC 值、速效N 顯著正相關(guān)(P<0.05)。在土壤真菌與理化性質(zhì)的相關(guān)性分析中(圖5b),A 處理的優(yōu)勢菌擔子菌門相對豐度與pH 值、通氣孔隙度、有機質(zhì)、速效K 含量顯著正相關(guān),與EC 值、速效N 含量顯著負相關(guān)(P<0.05)。

        圖5 細菌(a)、真菌(b)與土壤理化性質(zhì)的Spearman分析

        3 討論

        本試驗發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)的商業(yè)育苗基質(zhì)相比,有機廢棄物基質(zhì)處理并未降低辣椒和番茄的生長質(zhì)量,反而提高了葉綠素含量、根系活力等指標。表明有機廢棄物基質(zhì)具有與商品基質(zhì)同樣育苗效果的潛力,這與前人研究結(jié)果一致[16]。通過16S/ITS rDNA 擴增子測序進一步對兩者間根際微生物群落結(jié)構(gòu)進行分析,發(fā)現(xiàn)A 處理辣椒、番茄根際土壤細菌和真菌的OTU 數(shù)均低于CK,表明A 處理降低了根際微生物的OTU 個數(shù)。在A 處理下辣椒和番茄根際土壤中酸桿菌門、芽單胞菌門、綠彎菌門、Patescibacteria 和藍細菌門的相對豐度均低于CK,但厚壁菌門的相對豐度則高于CK。真菌中主要菌群為子囊菌門和擔子菌門,且A 處理辣椒、番茄根際土壤中擔子菌門相對豐度顯著高于CK。表明有機廢棄物基質(zhì)處理改變了根際微生物群落結(jié)構(gòu),使辣椒和番茄根際中厚壁菌門、黃桿菌屬、假單胞菌屬和Devosia、毛孢子菌、Aspergillus、Graphium等顯著富集。這可能是廢棄物基質(zhì)中添加有生物炭,而研究表明生物炭可直接(提供易分解的有機碳和營養(yǎng)元素)或間接(改變土壤基質(zhì)物理性質(zhì)增加孔隙度等)影響微生物群落[17-18],同時基質(zhì)中的茶渣含有豐富的有機質(zhì)和腐殖質(zhì),也為微生物的繁殖提供了營養(yǎng)物質(zhì)。厚壁菌門中的許多成員都是植物益生菌,具有固氮和纖維素降解作用,能夠分解相關(guān)營養(yǎng)物質(zhì)供作物生長利用,從而促進作物生長[20]。

        α 多樣性指數(shù)中,Ace 和Chao1 反映菌群豐富度,數(shù)值越小表明豐富度越低,Shannon、Simpson反映菌群多樣性,其數(shù)值越小表明群落多樣性越低。A 處理顯著降低了辣椒根際細菌、真菌多樣性與豐富度,顯著降低番茄根際真菌群落多樣性,對番茄根際細菌豐富度無顯著影響。廢棄物基質(zhì)中添加了適量殼聚糖,研究表明殼聚糖可顯著降低環(huán)境中微生物群落豐富度及多樣性[19]。董春娟等[19]分析認為,殼聚糖可促進某些可分解利用殼聚糖的微生物繁衍,抑制其它微生物生長,導(dǎo)致相關(guān)微生物富集。主坐標分析表明,不同處理下的辣椒、番茄根際微生物群落結(jié)構(gòu)差異較大,A 處理下辣椒和番茄幼苗間根際細菌、真菌群落結(jié)構(gòu)差異較小,CK 處理下辣椒、番茄細菌、真菌群落結(jié)構(gòu)差異均較大。表明農(nóng)業(yè)廢棄物基質(zhì)定向改變了辣椒、番茄根際土壤細菌、真菌群落結(jié)構(gòu)。

        冗余分析和Spearman 分析表明有機質(zhì)含量、孔隙度等是改變微生物群落豐度的主要因素。土壤基質(zhì)不僅為幼苗生長提供水分與養(yǎng)分,同時也為微生物生長與繁殖提供適宜的環(huán)境,其物理化學(xué)性質(zhì)影響了基質(zhì)中微生物群落組成[21]。進一步說明了農(nóng)業(yè)廢棄物有機質(zhì)含量、孔隙度等對根際微生物群落結(jié)構(gòu)有一定影響。向羽等[22]研究表明,向種植土壤中添加腐熟菜籽餅肥可顯著促進煙株生長,提高烤煙根際土壤微生物對氨基酸、聚類化合物碳源的利用能力,其根際微生物代謝功能及多樣性指數(shù)顯著高于對照。農(nóng)業(yè)有機廢棄物中含有豐富的營養(yǎng)物質(zhì),如有機酸,氨基酸、糖類等其它的大分子有機化合物,對土壤微生物群落組成、功能和碳源利用效率均有顯著影響[23-25],同時有機廢棄物增加了土壤孔隙度,為好氧微生物提高了良好生存環(huán)境。Dombrowski等[26]研究多年生黃花亭薺在自然和控制條件下根際細菌群落組成,發(fā)現(xiàn)土壤性質(zhì)能夠解釋根內(nèi)細菌15%的群落變異性,而環(huán)境條件和植物基因型最多解釋了11%的群落變異性,且土壤類型對根內(nèi)細菌門分類水平上的影響更加顯著。因此,可以通過調(diào)控作物根際生長環(huán)境,定向改變其根際微生物群落,抑制某些有害微生物,讓相關(guān)有益微生物富集,從而促進作物生長。

        4 結(jié)論

        本研究結(jié)果表明,在相同基質(zhì)土壤環(huán)境中,同科不同屬(辣椒屬、番茄屬)的作物幼苗根際微生物群落結(jié)構(gòu)存在一定差異,但有機廢棄物基質(zhì)可通過改變環(huán)境因子如增加適量有機質(zhì)含量和孔隙度等來調(diào)控它們之間的差異,達到定向改變微生物群落,促進有益微生物富集,進而協(xié)助作物生長或抑制相關(guān)病原微生物。這為有機廢棄物作為育苗基質(zhì)的應(yīng)用提供了新的見解。

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