馮繼鵬, 胡洲, 張曼曼, 汪小利,易倩, 朱世平, 趙曉春
1. 西南大學(xué) 柑桔研究所/國(guó)家柑桔工程技術(shù)研究中心,重慶 400712;2. 西部(重慶)科學(xué)城種質(zhì)創(chuàng)制大科學(xué)中心,重慶 401329
柑橘是我國(guó)最重要的水果, 主要種植在南方各省市的山地和丘陵地區(qū). 柑橘產(chǎn)區(qū)橫跨幾個(gè)氣候帶, 許多柑橘產(chǎn)區(qū)的降雨量季節(jié)分配不均勻, 因此季節(jié)性缺水造成的干旱是制約我國(guó)許多地區(qū)柑橘產(chǎn)業(yè)發(fā)展的一個(gè)主要因素[1]. 植物有多種抗旱和耐旱機(jī)制應(yīng)對(duì)干旱脅迫, 以維持正常的生長(zhǎng)和發(fā)育. 近年的研究發(fā)現(xiàn), 一些小分子RNA不僅與植物的生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān), 而且在植物的抗旱中也發(fā)揮著至關(guān)重要的作用[2]. 小分子RNA主要有3種類型, siRNAs,miRNAs和piRNAs, 其中miRNAs是目前生物體內(nèi)存在最廣泛的, 也是研究最多的一類小RNA. 這些小RNA長(zhǎng)度大約在20~24個(gè)核苷酸, 它們通過堿基互補(bǔ)配對(duì)與靶基因結(jié)合, 進(jìn)而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá), 促使mRNA降解或抑制其翻譯, 起負(fù)調(diào)控靶基因的作用[3-4]. miRNA通過調(diào)控靶基因參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境響應(yīng)[5], 許多研究報(bào)道指出, 有多種miRNA參與植物的干旱脅迫響應(yīng). miR196g是最早在水稻中被發(fā)現(xiàn)的與干旱相關(guān)的miRNA[6], 豇豆中發(fā)現(xiàn)了有近20個(gè)miRNA以不同的方式響應(yīng)干旱脅迫[7], 干旱逆境誘導(dǎo)碧桃葉片及根部中262和368個(gè)miRNA差異表達(dá)[8], miR168和miR396在擬南芥和煙草中的表達(dá)也受干旱脅迫誘導(dǎo)[9]. 在模式植物擬南芥中, miR171在干旱、 低溫、 低氧、 低磷、 低硫等脅迫下表達(dá)量都會(huì)發(fā)生變化[10]. 豆科植物中miR171也響應(yīng)干旱脅迫[11]. 在水稻中, 過表達(dá)osa-miR171f可以通過調(diào)控類黃酮生物合成基因的表達(dá)來增強(qiáng)水稻的耐旱性[12], 它通過調(diào)節(jié)SCL6-I和SCL6-II的轉(zhuǎn)錄水平在抗旱性中發(fā)揮作用. 在蘋果中, 敲除mdm-miR171i和過表達(dá)它的靶基因MsSCL26.1均可增強(qiáng)其抗旱性[13]. 進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn), mdm-miR171通過調(diào)節(jié)抗氧化基因表達(dá)和抗壞血酸代謝來響應(yīng)干旱脅迫. 以上研究結(jié)果表明, miR171家族成員響應(yīng)植物的干旱脅迫. 目前的研究表明, miR171家族的功能高度保守. 因此可以推測(cè)柑橘中的Cre-miR171也可能響應(yīng)干旱脅迫, 但柑橘中Cre-miR171是否響應(yīng)干旱脅迫以及調(diào)控的靶基因的研究還未見報(bào)道.
為明確Cre-miR171對(duì)柑橘耐旱的作用, 本研究通過對(duì)Cre-miR171在不同柑橘砧木品種、 組織及根系不同部位、 發(fā)育時(shí)期的表達(dá)特征進(jìn)行分析, 對(duì)Cre-miR171過表達(dá)的柑橘砧木枳和模式植物擬南芥進(jìn)行耐旱性及根系形態(tài)評(píng)價(jià), 探究Cre-miR171對(duì)植物響應(yīng)干旱脅迫的影響. 并在轉(zhuǎn)基因柑橘中對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行表達(dá)分析, 為深入研究Cre-miR171調(diào)控柑橘耐旱性的分子機(jī)理提供參考.
柑橘砧木品種枳(PoncirustrifoliataRaf.)、 扁平橘(CitrusdepressaHayata. ‘Shiikuwasha’)、 紅檸檬(C.limoniaOsbeck. ‘Canton Lemon’)的種子采自國(guó)家果樹種質(zhì)柑橘圃(重慶, 北碚). 本氏煙(Nicotianabenthamiana)、 擬南芥(Arabidopsisthaliana)種子為本實(shí)驗(yàn)室自繁.
DNA提取試劑盒(植物基因組DNA快速提取試劑盒), 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Revert Aid First Strand cDNA Synthesis Kit), RNA提取試劑盒(天根DP504), 限制性內(nèi)切酶(Thermo Fisher scientific), DNA Marker (Takara), 引物合成和測(cè)序由北京擎科生物科技有限公司完成.
將枳、 扁平橘和紅檸檬的種子去除種皮后于(28±1) ℃下保濕催芽. 挑選萌芽一致的種子播種于膨脹珍珠巖∶蛭石(體積比1∶1)的基質(zhì)中, 在溫室(25±1) ℃中培養(yǎng). 選取一月齡左右的不同砧木幼苗, 取其根、 莖、 葉用于Cre-miR171的組織表達(dá)分析. 分別于枳種子播種后30 d, 60 d和90 d, 取全根用于根的不同發(fā)育時(shí)期Cre-miR171的表達(dá)分析. 于枳種子播種后45 d, 取根尖和側(cè)根發(fā)生區(qū)樣品用于Cre-miR171在根不同部位的表達(dá)分析. 于枳種子播種后60 d, 取莖、 葉、 側(cè)根發(fā)生區(qū)以及根尖用于Cre-miR171靶基因的表達(dá)分析. 以上取樣各5株, 設(shè)5個(gè)生物學(xué)重復(fù).
選取長(zhǎng)勢(shì)一致的1月齡枳的水培幼苗, 分別用15%的PEG6000及100 μM的脫落酸(ABA)水溶液進(jìn)行脅迫處理, 在處理的0 h, 3 h, 6 h, 12 h, 24 h分別采集全根作為樣品, 用于脅迫處理下Cre-miR171的表達(dá)分析. 選取播種后2個(gè)月、 長(zhǎng)勢(shì)一致的盆栽枳幼苗于溫室內(nèi)進(jìn)行干旱處理, 在干旱處理的0 d, 5 d, 10 d, 15 d分別采集根尖區(qū)與側(cè)根發(fā)生區(qū)的組織樣品, 用于干旱脅迫下Cre-miR171的表達(dá)分析.
Cre-miR171的前體序列來自本實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的小RNA文庫(kù). 利用Tbtools對(duì)Cre-miR171前體序列與從柑橘基因組數(shù)據(jù)庫(kù)下載得到的克里曼丁橘(C.clementina)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行序列比對(duì), 獲得Cre-miR171前體序列上游3 000 bp啟動(dòng)子序列, 其順式作用元件通過PlantCARE(http: //bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/ plantcare/html/)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析. 利用psRNATarget: A Plant Small RNA Target Analysis Server (2017 Update) 在線網(wǎng)站psRNATarget(2017 update)軟件進(jìn)行小RNA靶基因的互補(bǔ)配對(duì), 以miRNA的5′端為種子序列與參考基因組克里曼丁橘的轉(zhuǎn)錄本3’UTR區(qū)對(duì)Cre-miR171的靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè). 靶基因序列從在線網(wǎng)站Phytozome(https: //phytozome-next.jgi.doe.gov/pz/portal.html)上獲取.
采用Primer 3在線軟件設(shè)計(jì)1對(duì)Cre-miR171前體序列的特異引物, 分別在序列的兩端加上SwaI,BamHI酶切位點(diǎn)(表1), 以枳的DNA為模板, 對(duì)Cre-miR171進(jìn)行克?。?用Solution I連接酶將Cre-miR171前體序列的全長(zhǎng)與經(jīng)SwaI,BamHI雙酶切后的PGBi載體進(jìn)行連接, 轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5a感受態(tài)細(xì)胞中, 挑選單克隆送往北京擎科生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序. 經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證正確的過表達(dá)載體轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞, 用枳上胚軸進(jìn)行柑橘的遺傳轉(zhuǎn)化[14], 采用花序侵染法進(jìn)行擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化[15].
表1 Cre-miR171的核苷酸序列與引物序列
利用PCR方法對(duì)Cre-miR171的過表達(dá)柑橘植株和擬南芥植株進(jìn)行鑒定. 正向引物是35S啟動(dòng)子一段序列, 反向引物為Cre-miR171前體序列(表1), 以轉(zhuǎn)基因植株的DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增. 采用莖環(huán)法qRT-PCR檢測(cè)各轉(zhuǎn)基因柑橘植株的Cre-miR171相對(duì)表達(dá)量, 選擇Cre-miR171表達(dá)量最高的3株進(jìn)行嫁接擴(kuò)繁. 同時(shí)對(duì)其靶基因的表達(dá)進(jìn)行定量分析.
構(gòu)建兩類煙草瞬時(shí)表達(dá)載體進(jìn)行Cre-miR171與其靶基因的互作驗(yàn)證. 一類為Cre-miR171前體序列超表達(dá)的GUS載體, 將Cre-miR171的前體序列與線性化的GUS載體連接; 另一類為改造過的超表達(dá)載體pMS4載體, pMS4載體在GFP基因前后有兩個(gè)酶切位點(diǎn)XhoI和XbaI, 經(jīng)雙酶切之后用于插入miRNA靶基因位點(diǎn). 靶基因位點(diǎn)是通過人工合成的兩條寡核苷酸鏈退火后形成的雙鏈, 分為SCclscl6,SCclscl22,SCclscl26以及經(jīng)過改造的MTSCclscl6, MTSCclscl22, MTSCclscl26兩類(表2). 重組后的質(zhì)粒經(jīng)北京擎科生物科技有限公司測(cè)序驗(yàn)證正確后, 轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌GV3101菌株的感受態(tài)細(xì)胞, 在煙草中利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的侵染共同表達(dá)miRNA及其靶基因.
表2 載體構(gòu)建所用引物
莖環(huán)qRT-PCR和qRT-PCR分別被用來分析miRNA及其靶基因的相對(duì)表達(dá)量. miRNA的內(nèi)參基因?yàn)閁6, 靶基因的內(nèi)參基因?yàn)楦涕貱sActin. 用Primer5軟件設(shè)計(jì)miRNA的反轉(zhuǎn)錄引物和靶基因、 內(nèi)參基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物(表3). qRT-PCR反應(yīng)體系為: 2×NovoStart?SYBR qPCR SuperMix 5 μL, 正、 反向引物各0.2 μL, RNase Free Water 2.6 μL, cDNA 2 μL(500 ng). 擴(kuò)增程序?yàn)? 95 ℃預(yù)變性10 min, 然后95 ℃ 15 s, 58 ℃ 60 s, 共設(shè)置40個(gè)循環(huán). 所有的定量反應(yīng)都在實(shí)時(shí)PCR System (Applied Biosystems 7 500 Fast, Applied Biosystems, USA)上完成. 每個(gè)qRT-PCR反應(yīng)重復(fù)3次. miRNA及其靶基因的相對(duì)表達(dá)量采用2-ΔΔCT法進(jìn)行計(jì)算[16].
表3 qRT-PCR引物及序列
選擇長(zhǎng)勢(shì)一致的過表達(dá)Cre-miR171的擬南芥植株進(jìn)行26 d的干旱處理, 并觀察其在干旱情況下的表型變化. 在處理14 d時(shí)取葉片樣, 測(cè)定POD與脯氨酸的含量.
選擇長(zhǎng)勢(shì)一致的枳野生型和轉(zhuǎn)基因植株, 剪取相同生長(zhǎng)部位的葉片, 放置在干燥的濾紙上, 測(cè)定脫水處理60 min內(nèi)的質(zhì)量變化, 計(jì)算相對(duì)失水率. 對(duì)脫水處理后的葉片進(jìn)行電導(dǎo)率的測(cè)定, 計(jì)算處理后葉片的相對(duì)電導(dǎo)率.
剪取對(duì)照組和Cre-miR171表達(dá)量最高的過表達(dá)枳的枝條, 扦插于蛭石基質(zhì)中, 待其長(zhǎng)出根系后, 評(píng)價(jià)分析根的生長(zhǎng)發(fā)育表現(xiàn).
利用PlantCARE對(duì)Cre-miR171前體上游啟動(dòng)子順式作用元件進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖1), 結(jié)果發(fā)現(xiàn): 該小RNA的啟動(dòng)子區(qū)域除了含有典型的具有轉(zhuǎn)錄起始功能的TATA-box,CAAT-box核心元件外, 還包括激素和脅迫響應(yīng)相關(guān)元件, 如脫落酸、 水楊酸和茉莉酸甲酯響應(yīng)元件. 此外, 還包含一些光響應(yīng)、 厭氧、 晝夜響應(yīng)等相關(guān)元件. 根據(jù)以上結(jié)果, 推測(cè)Cre-miR171的表達(dá)受多種因素的誘導(dǎo), 能參與逆境脅迫下的應(yīng)答及調(diào)控.
圖1 Cre-miR171前體上游調(diào)控區(qū)相關(guān)啟動(dòng)子元件
在枳、 扁平橘、 紅檸檬的幼苗中對(duì)Cre-miR171的組織表達(dá)模式進(jìn)行分析, 這3種砧木的耐旱性明顯不同, 其中枳的耐旱性最強(qiáng)[15]. Cre-miR171在3種不同砧木中表現(xiàn)出相同的組織表達(dá)特征, 在根中的表達(dá)量相對(duì)較低, 在莖中的表達(dá)量最高. 同時(shí), Cre-miR171在耐旱性較強(qiáng)的枳的根和葉中的表達(dá)量顯著低于其他2種耐旱性比較弱的砧木, 與砧木的耐旱性相反, 說明Cre-miR171可能參與柑橘對(duì)干旱脅迫的響應(yīng). Cre-miR171在枳根生長(zhǎng)發(fā)育的不同時(shí)期的表達(dá)也存在明顯差異, Cre-miR171在種子發(fā)芽后第30 d時(shí)表達(dá)極低, 在30~60 d時(shí)急劇上升, 在60~90 d時(shí)表達(dá)量無明顯變化, 表明Cre-miR171可能與根系的早期發(fā)育相關(guān). Cre-miR171在根系的表達(dá)有一定的組織特異性, 在側(cè)根發(fā)生區(qū)的表達(dá)量明顯高于根尖(圖2), 說明Cre-miR171對(duì)側(cè)根發(fā)生和根伸長(zhǎng)生長(zhǎng)的作用存在差異.
不同小寫字母代表差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05).
利用psRNATarget對(duì)Cre-miR171的靶基因進(jìn)行了預(yù)測(cè), 通過生物信息學(xué)分析去除大量重復(fù)基因后, 發(fā)現(xiàn)Cre-miR171主要靶向9個(gè)靶基因, 分別為SCL家族基因Ciclev10019094m(SCL6),Ciclev10019083m(SCL22),Ciclev10000940m(SCL26); GRAS基因Ciclev10018916m、 ?;罨赶嚓P(guān)基因Ciclev10003943m、 蛋白磷酸酶相關(guān)基因Ciclev10001232m、 乙烯不敏感基因Ciclev10000617m以及2個(gè)功能未知基因Ciclev10010118m, Ciclev10027698m. 在嫁接成活的9株超表達(dá)Cre-miR171的枳植株中選取Cre-miR171表達(dá)量上調(diào)最高的OE-6,OE-8,OE-9等3個(gè)株系對(duì)靶基因的表達(dá)進(jìn)行定量分析(圖3a), 發(fā)現(xiàn)Ciclev10019094m,Ciclev10019083m和Ciclev10000940m等3個(gè)靶基因的表達(dá)在超表達(dá)植株中受到了明顯的抑制, 說明這3個(gè)靶基因明顯受Cre-miR171的負(fù)調(diào)控, 靶向關(guān)系較強(qiáng)(圖3b). 基因注釋和同源基因比較分析指出, 這3個(gè)基因是同屬于SCL家族的同源基因, 在本研究中將這3個(gè)基因分別命名為CclSCL6,CclSCL22,CclSCL26. 這3個(gè)靶基因在枳中的表達(dá)表現(xiàn)出相同的組織特異性(圖3c), 和Cre-miR171的表達(dá)均呈明顯負(fù)相關(guān), 進(jìn)一步驗(yàn)證了這3個(gè)基因是Cre-miR171的靶基因, 在功能上有明顯的相似性.
“**”代表相對(duì)于WT差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.01); 不同小寫字母代表差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05).
利用煙草瞬時(shí)表達(dá)試驗(yàn)對(duì)Cre-miR171與CclSCL6,CclSCL22,CclSCL26的相互作用進(jìn)行了驗(yàn)證(圖4). 用農(nóng)桿菌侵染煙草葉片, 分別共同表達(dá)Cre-miR171、 Cre-miRcontrol、 攜帶靶位點(diǎn)的GFP基因和攜帶修飾后的靶位點(diǎn)的GFP基因(圖4b). 結(jié)果發(fā)現(xiàn), 含有OE-miR171和OE-SCL26-GFP,OE-SCL6-GFP,OE-SCL22-GFP的農(nóng)桿菌共同侵染煙草葉片后, 葉片中GFP熒光信號(hào)均發(fā)生了明顯的減弱, 而其他組合葉片中的GFP熒光信號(hào)沒有發(fā)生明顯的改變(圖4d). 因此表明在植物體內(nèi), Cre-miR171能夠抑制靶基因CclSCL26,CclSCL6,CclSCL22的表達(dá).
圖4 瞬時(shí)表達(dá)驗(yàn)證Cre-miR171靶基因
ABA處理下, Cre-miR171的表達(dá)在根中呈現(xiàn)出逐漸下降的趨勢(shì), 但是變化幅度較小; PEG6000處理對(duì)Cre-miR171的表達(dá)影響非常顯著, 處理過程中, Cre-miR171在根中的表達(dá)呈現(xiàn)出先下降后快速上升再快速下降的趨勢(shì), 表現(xiàn)出對(duì)脅迫處理的強(qiáng)烈響應(yīng), 說明Cre-miR171對(duì)滲透脅迫比較敏感(圖5a). 為了了解干旱脅迫下Cre-miR171在根的不同部位的表達(dá), 對(duì)枳幼苗進(jìn)行了為期15 d的自然干旱處理. 在干旱處理的第10 d時(shí), 觀察到側(cè)根開始發(fā)生(圖5c), 根尖數(shù)目增加, 而地上部分形態(tài)變化不明顯. Cre-miR171的表達(dá)明顯響應(yīng)了干旱脅迫, 其在根尖中的表達(dá)量高于側(cè)根發(fā)生區(qū), 特別在干旱處理10 d后更為顯著(圖5b), 3個(gè)靶基因的表達(dá)也顯示出了對(duì)干旱脅迫的明顯響應(yīng), 并在處理10 d后出現(xiàn)劇烈的變化(圖5d), 與Cre-miR171在這期間的表達(dá)明顯負(fù)相關(guān). 從整個(gè)處理時(shí)期看, Cre-miR171與靶基因在干旱脅迫下根的兩個(gè)部位的表達(dá)均沒有達(dá)到顯著的相關(guān)性(表4), 特別在根尖的表達(dá)相關(guān)性更弱. 但在處理的第5 d后, Cre-miR171與其靶基因在根的兩個(gè)部位的表達(dá)趨勢(shì)均轉(zhuǎn)變?yōu)槊黠@的負(fù)相關(guān)(表5), 特別在10 d后均表現(xiàn)出強(qiáng)烈的變化, 說明Cre-miR171的表達(dá)受干旱脅迫的誘導(dǎo), 并在響應(yīng)脅迫后對(duì)靶基因產(chǎn)生了較強(qiáng)的調(diào)控作用. 另外, Cre-miR171在根部?jī)蓚€(gè)部位的表達(dá)在處理的第10 d后出現(xiàn)相反的趨勢(shì), 3個(gè)靶基因的表達(dá)也隨之發(fā)生相應(yīng)的變化, 說明Cre-miR171在干旱脅迫下能抑制根的伸長(zhǎng)生長(zhǎng), 促進(jìn)側(cè)根的發(fā)生.
圖5 非生物脅迫下Cre-miR171與其靶基因在根中的表達(dá)
表4 干旱脅迫下Cre-miR171與其靶基因在根中表達(dá)水平的相關(guān)性分析
表5 干旱脅迫5~15 d內(nèi)Cre-miR171與其靶基因在根中表達(dá)水平的相關(guān)性分析
miR171在植物中較為保守[17], 序列比對(duì)顯示, Cre-miR171與擬南芥miR171家族成員之間只有2個(gè)核苷酸的差異(圖6a). 對(duì)過表達(dá)Cre-miR171 3周齡的擬南芥進(jìn)行26 d的干旱處理, 結(jié)果顯示, 在干旱14 d內(nèi), 野生型擬南芥的生長(zhǎng)狀況良好, 葉片色澤鮮綠, 而轉(zhuǎn)基因植株的葉片顏色則明顯加深; 在干旱21 d時(shí)轉(zhuǎn)基因擬南芥葉片的邊緣枯黃, 野生型的擬南芥葉片的顏色也開始加深, 但轉(zhuǎn)基因擬南芥的葉片顏色更深, 而且轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的生長(zhǎng)已受到了極大的抑制, 植株明顯矮小; 干旱26 d時(shí)轉(zhuǎn)基因擬南芥的葉片因脫水而導(dǎo)致葉片大面積萎蔫(圖6c), 干旱脅迫處理對(duì)轉(zhuǎn)基因株系傷害程度明顯高于野生型株系. 以上結(jié)果說明, 過表達(dá)Cre-miR171使擬南芥對(duì)干旱逆境的敏感性顯著增加. 干旱處理14 d時(shí)轉(zhuǎn)基因植株的過氧化物酶含量高于野生型植株, 其脯氨酸含量也顯著高于野生型(圖6d), 也說明了轉(zhuǎn)基因擬南芥更早地響應(yīng)干旱脅迫.
#1, #3, #5為不同轉(zhuǎn)基因擬南芥株系; ** 代表相對(duì)于WT差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.01).
對(duì)擴(kuò)繁成活的轉(zhuǎn)基因植株OE-6,OE-8,OE-9的葉片進(jìn)行脫水處理, 在處理30 min到60 min時(shí)轉(zhuǎn)基因株系葉片的相對(duì)失水率均顯著高于野生型. 轉(zhuǎn)基因枳的葉片在脫水處理后的電導(dǎo)率高于野生型(圖7), 說明轉(zhuǎn)基因枳膜系統(tǒng)被干旱損傷的程度高于野生型, 超表達(dá)Cre-miR171明顯降低了枳的耐旱能力.
* 表示相對(duì)于WT差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05).
對(duì)扦插生根的對(duì)照組和超表達(dá)Cre-miR171的枳植株的根系進(jìn)行形態(tài)觀測(cè)(圖8a), 發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因植株的側(cè)根比對(duì)照組的少, 根系也明顯短, 說明Cre-miR171影響了枳根系的生長(zhǎng)發(fā)育, 超表達(dá)Cre-miR171抑制了枳的主根伸長(zhǎng)生長(zhǎng)和側(cè)根發(fā)生. 對(duì)扦插90 d的轉(zhuǎn)基因枳進(jìn)行表達(dá)定量分析, 結(jié)果顯示, Cre-miR171在轉(zhuǎn)基因枳的葉片與根中的表達(dá)量都顯著上調(diào)(圖8b), 其靶基因CclSCL26,CclSCL6,CclSCL22的表達(dá)量受到抑制(圖8c), 說明Cre-miR171可能通過負(fù)調(diào)控其靶基因CclSCL26,CclSCL6,CclSCL22的表達(dá)來抑制主根的伸長(zhǎng)生長(zhǎng)和側(cè)根的發(fā)生.
** 表示相對(duì)于WT差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.01).
在植物中, miR171參與調(diào)節(jié)植物基本的發(fā)育和代謝過程[18-19]. 在模式植物擬南芥中, miR171通過調(diào)控其靶基因AtSCL6-II,AtSCL6-III和AtSCL6-IV的表達(dá)影響莖尖分生組織[20-21]. 過表達(dá)miR171前體可以抑制腋芽形成和花芽數(shù)量, 從而改變擬南芥莖的結(jié)構(gòu)[22]. 擬南芥幼苗在高鹽、 低溫和干旱脅迫下miR171的表達(dá)量都會(huì)上調(diào)[9], 推測(cè)miR171參與了擬南芥非生物脅迫的調(diào)控. 番茄中miR171和SCL6通過調(diào)節(jié)激素信號(hào)去調(diào)控番茄的生長(zhǎng)發(fā)育[23]. 甘蔗中miR171響應(yīng)鹽脅迫[24].
Cre-miR171啟動(dòng)子區(qū)有光信號(hào)、 脫落酸、 水楊酸、 茉莉酸甲酯等激素和脅迫響應(yīng)元件, 同時(shí)miR171被證實(shí)響應(yīng)光信號(hào)[25]、 茉莉酸甲酯[26]、 水楊酸、 脫落酸[27]誘導(dǎo), 表明Cre-miR171可能受光信號(hào)、 茉莉酸甲酯、 水楊酸、 脫落酸等多條信號(hào)通路的影響, 推測(cè)Cre-miR171可能參與逆境脅迫下的應(yīng)答及調(diào)控. 表達(dá)Cre-miR171的擬南芥對(duì)干旱脅迫更敏感, 脫水處理對(duì)過表達(dá)Cre-miR171枳葉片的膜系統(tǒng)的傷害顯著高于對(duì)照, 說明過表達(dá)Cre-miR171的枳轉(zhuǎn)基因植株的耐旱能力降低. 這與在蘋果中的研究結(jié)果相似[13], 表明Cre-miR171對(duì)柑橘的耐旱性有負(fù)調(diào)控的作用.
有研究表明miR171在根的發(fā)育和生長(zhǎng)中發(fā)揮重要作用, miR171參與蘋果[28]和葡萄[29]的不定根形成, miR171還影響了水稻的根系發(fā)育[30], 同時(shí)miR171被證實(shí)可以影響蒺藜苜蓿的側(cè)根密度[31]. 本研究中, Cre-miR171在柑橘根發(fā)育的早期高表達(dá), 而且在側(cè)根發(fā)生區(qū)的表達(dá)量高于根尖, 表明Cre-miR171對(duì)柑橘根系的發(fā)育及側(cè)根的形成有重要影響.
本研究中預(yù)測(cè)并驗(yàn)證的3個(gè)Cre-miR171的靶基因(CclSCL6,CclSCL22,CclSCL26)是植物中特有的轉(zhuǎn)錄因子, 其功能具有多樣性, 參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育[32]、 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、 生物脅迫和非生物脅迫相關(guān)的應(yīng)答過程[33]. Cre-miR171在響應(yīng)干旱脅迫后在側(cè)根發(fā)生區(qū)下調(diào)表達(dá), 在根尖上調(diào)表達(dá), 趨勢(shì)相反, 3個(gè)靶基因的表達(dá)也隨之發(fā)生相應(yīng)的顯著變化, 說明在干旱脅迫下, Cre-miR171能通過對(duì)靶基因表達(dá)的調(diào)控抑制根的伸長(zhǎng)生長(zhǎng), 促進(jìn)側(cè)根的發(fā)生. 可以推測(cè), Cre-miR171可能調(diào)控柑橘根系在干旱脅迫下的可塑性.