許家豪,耿夢雅,劉海軍,裴文俊,顧靜,漆夢湘,章堯,呂坤,宋迎迎,劉苗苗,胡鑫,余翠,何春玲,王李卓,高家林,2,,
皖南醫(yī)學(xué)院1弋磯山醫(yī)院內(nèi)分泌科,2弋磯山醫(yī)院內(nèi)分泌糖尿病研究所,3臨床醫(yī)學(xué)院,4安徽省活性生物大分子研究安徽省重點實驗室,5基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生化教研室,6中心實驗室,7重大疾病非編碼RNA轉(zhuǎn)化研究安徽普通高校重點實驗室,8皖南醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院內(nèi)分泌科,安徽蕪湖 241002
目前,溶酶體為細(xì)胞穩(wěn)態(tài)關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑的角色[1]。作為溶酶體中眾多特殊蛋白質(zhì)的一種,溶酶體膜蛋白的作用與機制以及相應(yīng)的生理學(xué)功能在其維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮了重要作用[2]。研究報道,人腎優(yōu)勢蛋白NCU-G1作為一種高度保守的蛋白質(zhì),其缺失會導(dǎo)致小鼠自發(fā)性的肝纖維化[3]。溶酶體相關(guān)膜糖蛋白3通過影響小鼠氣道阻力,在調(diào)節(jié)肺表面活性劑穩(wěn)態(tài)方面至關(guān)重要[4]。在帕金森病相關(guān)的小鼠模型中,跨膜蛋白175能夠影響運動損傷和多巴胺能神經(jīng)元的數(shù)量,而在帕金森病中起到重要作用[5]。因此,了解溶酶體膜蛋白參與的發(fā)生發(fā)展機制對闡明其關(guān)鍵作用有重要價值。然而,盡管已有100多種溶酶體膜蛋白被發(fā)掘和深入研究[6],但部分溶酶體膜蛋白的作用靶點和介導(dǎo)機制仍然未知。
作為細(xì)胞死亡的一種主動機制,細(xì)胞凋亡同時也是眾多生物系統(tǒng)中的重要過程[7]。程序性細(xì)胞死亡可在溶酶體膜透化和內(nèi)容物的釋放過程中發(fā)生,這樣使得在溶酶體膜蛋白循環(huán)利用的同時,受損溶酶體功能也能得到逐漸恢復(fù)[8]。這種特殊的生理過程在溶酶體膜蛋白中有不可替代的作用。研究發(fā)現(xiàn)溶酶體相關(guān)多跨膜蛋白5水平的下調(diào)抑制了細(xì)胞增殖和其活力[8],溶酶體跨膜蛋白192的缺乏也會激活細(xì)胞凋亡的發(fā)生[9]。可見溶酶體膜蛋白與凋亡密不可分的關(guān)系。
SID1跨膜家族成員2(Sidt2)被發(fā)現(xiàn)是一種新型多通道溶酶體膜蛋白[10],已有研究發(fā)現(xiàn)Sidt2作為自噬-溶酶體降解途徑中的關(guān)鍵蛋白,對維持同樣是富含溶酶體的腎臟組織具有重要作用[11]。研究指出Sidt2可通過調(diào)節(jié)終末期的自噬來影響肝細(xì)胞的脂質(zhì)代謝[12]和引發(fā)自噬受損[13],但對于其凋亡的具體機制并未得到探究。溶酶體參與消化細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞外的物質(zhì),是否涉及自噬調(diào)節(jié)和介導(dǎo)的相關(guān)步驟尚未知?因此,本研究旨在發(fā)掘Sidt2引起肝臟細(xì)胞凋亡的潛在機制,希望為相關(guān)疾病干預(yù)找到潛在的靶點。
HL7702人肝臟細(xì)胞(中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會細(xì)胞庫),用含有10%FBS(Excell Bio)的1640培養(yǎng)液培養(yǎng),細(xì)胞培養(yǎng)箱的溫度保持在37 ℃,CO2濃度保持在5%。CQ(Sigma),用DMSO 配制成CQ 工作液,4 ℃冰箱保存。細(xì)胞自噬染色檢測(MDC)試劑盒(碧云天)。
購買Lenticrispr-v2(AddgenePlasmid49535)質(zhì)粒,利用sgRNA在線設(shè)計工具(http://crispr.mit.edu/)設(shè)計靶向Sidt2的sgRNA,序列如下(F:5'-CACCGCAGGTG CCCCTAATCCTGCG-3',R:5'-AAACCGCAGGATTA GGGGCACCTGC-3'),通過生物公司(SangonBiotech)進(jìn)行合成,使用CRISPR/Cas9 lentivirus system,將Lenticrispr-v2質(zhì)粒線性化,與退火的sgRNA雙鏈進(jìn)行連接,構(gòu)建Lenticrispr-v2-Sidt2重組質(zhì)粒。使用Vigofect(VigorousBiotechnology,China)轉(zhuǎn)染試劑,分別轉(zhuǎn)染Lenticrispr-v2質(zhì)粒和Lenticrispr-v2-Sidt2重組質(zhì)粒構(gòu)建慢病毒,將得到的慢病毒轉(zhuǎn)染HL7702細(xì)胞,48 h后使用嘌林霉素篩選72 h,生存下來的細(xì)胞即為轉(zhuǎn)染成功的Sidt2+/+組和Sidt2-/-組。
將分組處理后的HL7702細(xì)胞,用冰PBS洗滌2次后加入含PMSF(碧云天)的細(xì)胞裂解液,收集全部細(xì)胞裂解液,使用超聲波細(xì)胞粉碎機(新芝生物科技有限公司)裂解細(xì)胞2次,冰上靜置裂解細(xì)胞30 min,收集裂解液,放入預(yù)冷4 ℃的超高冷凍速離心機(Beckman)離心5~10 min,12 000g。分裝100 μL/管蛋白裂解液,加入25 μL 5×SDS-PAGE上樣緩沖液充分混勻,100 ℃煮沸10 min后進(jìn)行電泳。將電泳結(jié)束后分離的蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜上。用含有1 g脫脂奶粉和20 mL 1×TBST溶液的封閉液進(jìn)行封閉2 h。TBST輕柔漂洗后加入相應(yīng)的一抗4 ℃孵育過夜,兔抗LC3B(1∶1000;Cell signaling technology),鼠抗β-actin(1∶1000;Sigma-Aldrich),鼠抗P62(1∶1000;abcam),兔抗SIDT2(1∶1000;abnova),TBST清洗3次10 min/次后加入二抗中室溫孵育1.5~2 h,TBST清洗3次、10 min/次后使用ECL發(fā)光液和成像系統(tǒng)進(jìn)行顯影實驗結(jié)果。所有結(jié)果均使用Image J軟件對蛋白的相對表達(dá)量進(jìn)行統(tǒng)計。
取24孔板中各實驗組處于對數(shù)生長期的細(xì)胞,加入用完全培養(yǎng)基1000∶1 稀釋后的試劑A,混勻后孵育2 h,棄去培養(yǎng)基,用PBS清洗細(xì)胞2次,5 min/次,加入150 μL/孔多聚甲醛,根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)調(diào)整孵育時間,棄去固定液,每孔加入150 μL甘氨酸,孵育5 min后棄去,加入300 μL/孔PBS清洗5 min后棄去,加入300 μL/孔滲透劑(0.5%TritonX-100的PBS),孵育10 min,PBS清洗1次,5 min,加入300 μL/孔的1×Apollo染色液,避光孵育30 min后棄去,加入300 μL/孔滲透劑脫色清洗2~3次,10 min/次,棄去,加入100 μL/孔1×Hoechst33342反應(yīng)液孵育0.5 h,PBS清洗3次,5 min/次,使用Olympus CKX53熒光倒置顯微鏡進(jìn)行拍照記錄。
取12 孔板中細(xì)胞數(shù)量不低于1×105的實驗組,用不含有EDTA的胰酶對貼壁的HL7702細(xì)胞進(jìn)行消化收集,在預(yù)冷的4 ℃離心機中2000 r/min離心5 min收集懸浮細(xì)胞,4 ℃預(yù)冷的PBS 洗滌細(xì)胞兩次后,以2000 r/min離心5 min收集1×105~5×105后,每個離心管中加入500 μL的Binding Buffer進(jìn)一步懸浮細(xì)胞,各實驗組加入5 μLAnnexin V-FITC混勻后,加入5 μL Propidium Iodide,混勻后室溫避光孵育5~15 min,并在1 h內(nèi)進(jìn)行流式細(xì)胞儀(Beckman cytoflex)的上機檢測。
將細(xì)胞接種在玻底培養(yǎng)皿上,PBS清洗1次后加入MDC染液,在細(xì)胞培養(yǎng)箱中37 ℃避光孵育15 min后,吸凈MDC染色液,Assay Buffer清洗3次,再加入1 mL Assay Buffer,置于在激光共聚焦顯微鏡(Olympus,Japan)在激發(fā)波長為330~360 nm,發(fā)射波長為510~540 nm觀察自噬體的染色熒光強度。
使用GraphPad Prism 8.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。數(shù)據(jù)表示為均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差,兩組間比較使用t檢驗,P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。本研究各實驗組的實驗均至少獨立重復(fù)3次。
對HL7702細(xì)胞使用Crispr-Cas9技術(shù)進(jìn)行Sidt2基因的敲除,挑取單克隆細(xì)胞后進(jìn)行測序,測序結(jié)果顯示模型構(gòu)建成功。Western blot 結(jié)果顯示,Sidt2-/-組較Sidt2+/+組蛋白水平降低(P<0.05,圖1A、B),模型構(gòu)建成功。EdU實驗結(jié)果顯示,與野生對照組細(xì)胞相比較,Sidt2基因下調(diào)導(dǎo)致肝HL7702細(xì)胞增殖速率下降(圖1C、D)。
圖1 Sidt2剔除HL7702細(xì)胞表現(xiàn)出細(xì)胞增殖活性下降Fig.1 Sidt2 knockout (Sidt2-/-) HL7702 cells exhibit decreased cell proliferation.A,B:Western blotting for detecting Sidt2 protein expression before and after Sidt2 knockout.C,D:EdU experiments for assessing cell proliferation rates in Sidt2+/+and Sidt2-/-HL7702 cells.*P<0.05.
流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示,在野生對照組細(xì)胞中,晚期凋亡和早期凋亡細(xì)胞的比例是(2.80±0.50)%,而在Sidt2基因缺失組的細(xì)胞中,晚期凋亡和早期凋亡細(xì)胞的比例是(14.43±0.55)%,即與野生對照組細(xì)胞相比較,Sidt2基因下調(diào)導(dǎo)致肝HL7702細(xì)胞凋亡速率明顯升高(圖2,P<0.001)。
圖2 Sidt2剔除HL7702細(xì)胞表現(xiàn)出凋亡增加Fig.2 Sidt2-/- HL7702 cells exhibit increased apoptosis.A:Detection of apoptosis rate of the cells by flow cytometry;B:Quantitative analysis of the results.***P<0.001.
對Sidt2基因剔除HL7702細(xì)胞模型進(jìn)行基礎(chǔ)自噬水平的檢測(圖3A),顯示Sidt2-/-細(xì)胞比較其對照細(xì)胞,出現(xiàn)了自噬關(guān)鍵蛋白LC3B 和P62 的堆積的現(xiàn)象(P<0.05,圖3B),Sidt2-/-細(xì)胞的熒光強度大于對照組(P<0.01,圖3C、D),自噬小體含量較對照組增多。
圖3 Sidt2剔除HL7702細(xì)胞表現(xiàn)出自噬紊亂Fig.3 Sidt2-/- HL7702 cells exhibit autophagy disturbances.A,B:Western blotting for detecting the expression of the key autophagy proteins before and after Sidt2 knockout.C,D:Effects of Sidt2 on the formation of autophagosomes of HL7702 cells and quantitative analysis of the results.*P<0.05,**P<0.01.
通過設(shè)置0、10、25、50、100、200 μmol/L的不同CQ濃度梯度干預(yù),結(jié)果顯示當(dāng)CQ作用濃度達(dá)到50 μmol/L時,繼續(xù)增加CQ的作用濃度,LC3B和P62的相對表達(dá)量不再增加,即CQ的飽和濃度為50 μmol/L(圖4A~C)。經(jīng)過50 μmol/L飽和濃度的CQ處理16 h后,HL7702細(xì)胞中的LC3B的降解被充分阻斷。此時,發(fā)現(xiàn)Sidt2+/+和Sidt2-/-組間原有的LC3B豐度差異消失(圖4D~F)。
圖4 CQ可以糾正Sidt2下調(diào)引起的LC3B和P62的升高異常Fig.4 Chloroquine(CQ)can correct abnormal upregulation of LC3B and P62 expressions induced by Sidt2 knockout.A:Western blotting for detecting LC3B and P62 expressions in HL7702 cells incubated with 0,10,25,50,100,or 200 μmol/L CQ for 16 h;B:LC3B expression level in HL7702 cells;C:P62 expression level in HL7702 cells;D-F:Western blotting for detecting key autophagy proteins in HL7702 cells before and after Sidt2 knockout.*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001.
經(jīng)50 μmol/L飽和濃度的CQ處理16 h后,結(jié)果顯示,不管是對Sidt2+/+或Sidt2-/-細(xì)胞而言,飽和濃度的CQ作用下,兩組細(xì)胞的增殖活性均明顯受到抑制(P<0.05,圖5A、B),其凋亡率均明顯受到促進(jìn)(P<0.05,圖5C、D)。
圖5 氯喹會使其進(jìn)一步抑制細(xì)胞增殖,并使凋亡進(jìn)一步惡化Fig.5 Chloroquine(CQ)further inhibits cell proliferation and increases apoptosis of Sidt2-/-HL7702 cells.A,B:CQ-induced proliferation of HL7702 cells before and after Sidt2 knockout(EdU staining,Scar bar:50 μm).C,D:CQ-induced apoptosis in HL7702 cells before and after Sidt2 knockout.***P<0.001.
已有研究證據(jù)指出,溶酶體膜蛋白與肝臟功能和結(jié)構(gòu)穩(wěn)態(tài)密切相關(guān)[3,14,15]。不僅如此,作為溶酶體膜蛋白,Sidt2還被證實在系膜細(xì)胞的炎癥通路[16],糖脂代謝[17]以及骨骼肌中線粒體質(zhì)量控制[18]中都發(fā)揮了重要的作用。而在同為溶酶體膜蛋白相關(guān)的研究中,凋亡相關(guān)蛋白3參與到維甲酸誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的過程中[19],溶酶體相關(guān)膜蛋白3通過介導(dǎo)溶酶體膜透化引發(fā)細(xì)胞死亡[20],這些研究提示Sidt2可能與細(xì)胞凋亡密切相關(guān)。因此,本研究使用Crispr-Cas9技術(shù)構(gòu)建了Sidt2敲除的人肝臟HL7702細(xì)胞模型,并且研究了Sidt2缺失對人肝臟細(xì)胞凋亡發(fā)生的影響及作用機制。通過EdU細(xì)胞增殖檢測實驗和流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞的活性,本研究表明Sidt2缺失后可導(dǎo)致人肝臟細(xì)胞狀態(tài)有所下調(diào),使其增殖活性下降和凋亡率的增加。
自噬作為細(xì)胞和身體代謝的關(guān)鍵參與者[21],常見的自噬類型有:巨自噬,伴侶介導(dǎo)的自噬以及微自噬[22,23],巨自噬即為本文中的自噬。有研究發(fā)現(xiàn)自噬與溶酶體膜蛋白的關(guān)系也密不可分,例如跨膜7超家族成員1被證實是小鼠足細(xì)胞中重要的自噬調(diào)節(jié)蛋白[24]。對此,我們展開了Sidt2對自噬影響的深入研究。結(jié)果顯示,自噬關(guān)鍵蛋白LC3B和自噬底物P62的水平在Sidt2敲除后升高,即Sidt2缺失后出現(xiàn)自噬體的積累,這可能意味著自噬體數(shù)量增加或通過自噬體和溶酶體的融合阻斷自噬溶酶體的形成[25]。在影響腎臟的結(jié)構(gòu)和自噬的研究中,Sidt2缺失后發(fā)現(xiàn)自噬體與溶酶體的融合以及自噬溶酶體的降解受損,結(jié)果充分揭示了Sidt2在自噬溶酶體過程中至關(guān)重要[11]。溶酶體作為自噬過程中的重要細(xì)胞器[26],自噬的降解能力來自于溶酶體[27]。結(jié)合課題組前期的研究結(jié)果[7],通過完成對自噬小體及溶酶體標(biāo)記蛋白免疫熒光共定位的檢測和使用溶酶體示蹤劑LysoTracker對Sidt2基因缺失前后酸性溶酶體進(jìn)行標(biāo)記,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組相比,LC3B 與LAMP1的皮爾森相關(guān)系數(shù)降低,自噬小體與溶酶體融合減少,同時酸性溶酶體數(shù)量也發(fā)生了減少。因此,為了進(jìn)一步探索阻斷自噬溶酶體途徑是否會是Sidt2介導(dǎo)肝臟細(xì)胞自噬的調(diào)控機制,我們研究了靶向自噬藥物CQ通過抑制自噬下游以觀察自噬通量的變化情況,CQ通過影響溶酶體的功能來抑制自噬中自噬體和溶酶體融合的過程[28],經(jīng)典氯喹翻轉(zhuǎn)實驗發(fā)現(xiàn)Sidt2缺失引起的自噬流減少是由于自噬晚期障礙導(dǎo)致的。而在癌癥研究中,溶酶體功能障礙和自噬阻斷會有助于癌細(xì)胞的細(xì)胞死亡[29]。因此,本研究分別在對照組和Sidt2剔除組中加入了CQ,并且設(shè)置和使用不同的濃度梯度摸索在人肝臟細(xì)胞中CQ抑制自噬的飽和濃度,結(jié)果顯示,當(dāng)CQ的濃度在50 μmol/L的作用下,LC3B和P62的表達(dá)均達(dá)到飽和狀態(tài),在飽和濃度的CQ作用下,由Sidt2缺失所引發(fā)的LC3B和P62的差異完全消失,說明為自噬晚期清除障礙所致。同樣具有損害溶酶體功能和誘導(dǎo)自噬作用的吲哚利西啶生物堿Swainsonine,被發(fā)現(xiàn)可促進(jìn)細(xì)胞凋亡[30]。所以Sidt2缺失導(dǎo)致的自噬紊亂可能會引發(fā)凋亡的增加,這為我們的下一步研究指明了方向。
溶酶體作為自噬和細(xì)胞死亡的必要調(diào)節(jié)劑[31],越來越多的研究發(fā)現(xiàn)自噬體-溶酶體區(qū)室參與程序性細(xì)胞死亡[32]。與細(xì)胞凋亡相反,通過介導(dǎo)細(xì)胞質(zhì)成分的溶酶體降解提供能量和營養(yǎng)的過程,自噬可促進(jìn)細(xì)胞的存活[33]。鑒于細(xì)胞凋亡和自噬之間復(fù)雜的功能關(guān)系以及溶酶體膜蛋白缺失可引起的細(xì)胞自噬和凋亡之間的串?dāng)_[9,34,35],本研究對Sidt2剔除前后并阻斷自噬溶酶體途徑后的細(xì)胞凋亡的發(fā)生進(jìn)行探究,結(jié)果顯示,同樣在飽和濃度的CQ作用下,這種誘導(dǎo)凋亡和抑制增殖的作用更加明顯,這說明二者可能有著同樣的分子機制基礎(chǔ),進(jìn)而從自噬溶酶體途徑層面解釋了溶酶體膜蛋白Sidt2是一個重要的凋亡調(diào)控蛋白。
綜上所述,溶酶體膜蛋白Sidt2缺失后肝臟細(xì)胞的增殖受到抑制并凋亡水平上調(diào),在抑制其自噬通量后可表現(xiàn)出增加的細(xì)胞毒性死亡和活性的減弱,從凋亡層面來揭示了Sidt2不通過抑制自噬溶酶體途徑介導(dǎo)凋亡。但本研究也存在不足之處,如缺乏對ATG12、ATG15等凋亡關(guān)鍵蛋白分子的檢測,自噬水平下調(diào)后溶酶體膜蛋白Sidt2在增殖和凋亡中的詳細(xì)機制和其他自噬誘導(dǎo)劑對于其增殖和凋亡的影響還有待進(jìn)一步深究,以及在研究過程中無法選擇相對應(yīng)的陽性對照藥物。這些需要在后續(xù)的研究進(jìn)展中得出Sidt2調(diào)控肝臟細(xì)胞凋亡的具體作用機制,從而為明確溶酶體膜蛋白Sidt2可能成為早期肝臟疾病診斷的新指標(biāo)提供實驗數(shù)據(jù)的支持。