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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析文癡方治療阿爾茨海默病的作用機制

        2023-04-25 12:34:16孔玉鳳譚浩肖幸
        中國醫(yī)藥科學(xué) 2023年7期
        關(guān)鍵詞:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)阿爾茨海默病槲皮素

        孔玉鳳 譚浩 肖幸

        [關(guān)鍵詞]阿爾茨海默病;文癡方;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);槲皮素

        阿爾茨海默?。ˋlzheimer’sdisease,AD)是以認(rèn)知障礙、精神及行為異常和社會功能減退為特征的疾病,是癡呆的最常見病因。根據(jù)2019年《世界阿爾茨海默病報告》,預(yù)計到2050年全球AD患者人數(shù)將增加至15200萬[1]。AD主要表現(xiàn)為認(rèn)知功能障礙,在中醫(yī)上屬于“癡呆”“健忘”等范疇,病位在腦,為本虛標(biāo)實證,腎虛、髓海虧虛為本,痰濁瘀血閉阻腦絡(luò)為標(biāo)。文癡方是全國第一批名老中醫(yī)藥專家胡毓恒在前人的基礎(chǔ)上總結(jié)得出的良方,由人參、肉蓯蓉、淫羊藿、三七、何首烏等組成,治以補腎健脾、豁痰祛瘀,具有很好的臨床療效[2]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是近年來研究中藥治療疾病的有效手段,通過數(shù)據(jù)庫檢索、數(shù)據(jù)分析等揭示藥物-基因-靶點-疾病相互作用的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,本文從網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)角度探討文癡方治療AD的潛在作用機制。

        1 材料與方法

        1.1 文癡方活性成分及對應(yīng)靶點篩選

        在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php)檢索文癡方中所有組成藥物的化學(xué)成分,設(shè)置生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18對化學(xué)成分進(jìn)行篩選,獲得文癡方的活性成分。將有意義的活性成分的InChlKey輸入PubChem數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索,得到標(biāo)準(zhǔn)SMILES結(jié)構(gòu)文件,并將其導(dǎo)入SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫,限定物種為“Homosapiens”,獲得活性成分靶點信息,選擇Probability>0.5的預(yù)測靶點。將重復(fù)值刪除后,最終得到活性成分的靶點。

        1.2 疾病靶點獲取

        在TherapeuticTargetDatabase(TTD)數(shù)據(jù)庫和GeneCards數(shù)據(jù)庫中以“Alzheimer’sdisease”作為關(guān)鍵詞對AD相關(guān)靶點進(jìn)行檢索,在GeneCards中設(shè)定RelevanceScore≥15為篩選條件,并將兩個數(shù)據(jù)庫檢索到的疾病靶點合并,去重后獲得AD的疾病相關(guān)靶點。

        1.3 篩選關(guān)鍵靶點

        將藥物活性成分作用靶點與AD疾病相關(guān)靶點進(jìn)行韋恩分析,取交集,得到藥物-疾病共同靶點,即為文癡方治療AD的關(guān)鍵靶點。

        1.4 GO富集和KEGG通路分析

        將關(guān)鍵靶點輸入DAVID數(shù)據(jù)庫,進(jìn)行GO功能富集分析和KEGG分析

        1.5 藥物-活性成分-作用靶點-通路-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        使用Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建藥物-活性成分-作用靶點-通路-疾病網(wǎng)絡(luò),再利用NetworkAnalyzer功能獲得的度和中介度等參數(shù)對模型進(jìn)行分析。

        2 結(jié)果

        2.1 活性成分和作用靶點預(yù)測結(jié)果

        通過TCMSP數(shù)據(jù)庫的檢索,并剔除重復(fù)值,共獲得文癡方153個活性成分及127個作用靶點。

        2.2 疾病相關(guān)靶點

        在GeneCards數(shù)據(jù)庫中檢索出9600個疾病靶點,設(shè)定RelevanceScore≥15,可篩選出706個疾病相關(guān)靶點,在TTD數(shù)據(jù)庫中檢索出139個疾病相關(guān)靶點,去重后共獲得791個AD相關(guān)靶點。

        2.3 獲得關(guān)鍵靶點

        將藥物活性靶點及疾病相關(guān)靶點進(jìn)行韋恩分析,共獲得46個關(guān)鍵靶點(圖1)。

        2.4 GO富集分析

        運用DAVID數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵靶點進(jìn)行GO富集分析,富集結(jié)果設(shè)置以P值<0.05進(jìn)行篩選,共富集到生物學(xué)過程208條、分子功能63條、細(xì)胞組成45條,分別篩選出前10位使用微生信網(wǎng)站將富集結(jié)果進(jìn)行可視化分析(圖2)。

        發(fā)現(xiàn)生物過程包括:G蛋白偶聯(lián)5-羥色胺受體信號通路、激酶活性的積極調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)自磷酸化等;分子功能包括:酶結(jié)合、神經(jīng)遞質(zhì)受體活性、G蛋白偶聯(lián)乙酰膽堿受體活性等;細(xì)胞組分包括:樹突、質(zhì)膜、受體復(fù)合物等。

        2.5 KEGG通路分析

        運用DAVID數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵靶點進(jìn)行KEGG通路富集分析,富集結(jié)果設(shè)置以P值<0.05進(jìn)行篩選,共富集到56條通路,使用微生信網(wǎng)站將富集結(jié)果進(jìn)行可視化(圖3),包括癌癥信號通路、鈣信號通路、AD、PI3K-Akt信號通路等。

        2.6 文癡方-活性成分-作用靶點-通路-AD相互作用網(wǎng)絡(luò)分析

        將文癡方的主要活性成分、潛在作用靶點及信號通路、疾病信息導(dǎo)入Cytoscape3.7.2軟件,建立文癡方-活性成分-作用靶點-通路-AD相互作用網(wǎng)絡(luò)(圖4),該網(wǎng)絡(luò)中共包含182個節(jié)點和463條邊,每條邊代表兩者之間存在相互作用的關(guān)系,邊數(shù)越多表示該節(jié)點的關(guān)鍵程度越高。從圖中可以看出,槲皮素度值最大,其次是山柰酚、木犀草素,由此可以認(rèn)為,文癡方治療AD的主要活性成分可能是槲皮素、山柰酚和木犀草素。同時,在該網(wǎng)絡(luò)中,AKT1、EGFR、VEGFA、SRC、MMP9、MMP2、GSK3B、KDR是排名前8的靶點基因,這些靶點可能是文癡方治療AD的關(guān)鍵靶點。癌癥信號通路、AD、PI3K-Akt信號通路、鈣信號通路、神經(jīng)退行性變的信號通路是排名前5的信號通路,提示這些通路可能是文癡方治療AD的關(guān)鍵信號通路。由此可見,文癡方可能通過多成分、多靶點、多通路治療AD。

        3 討論

        《內(nèi)經(jīng)精義》云:“事物所以不忘,賴此記性,記在何處,則在腎經(jīng)。益腎生精化為髓,而藏于腦”,提示腎虛髓海不足會引起癡呆健忘。陳士鐸《石室秘錄》指出“痰氣最盛,呆氣最深”,提示痰濁也是癡呆健忘的致病因素之一?!镀⑽刚摗吩唬骸吧蠚獠蛔悖X為之不滿……皆由脾胃先虛,而氣不上行之所致也?!碧崾酒⑻撋υ?,氣不上行可以導(dǎo)致癡呆;同時,脾為生痰之源,脾胃虛弱運化失常致痰濁內(nèi)生亦可發(fā)生癡呆。《傷寒論》有云“其人喜忘者,必有蓄血。所以然者,本有久瘀血,故令喜忘”,提示瘀血也可導(dǎo)致癡呆健忘。因此有人提出[3],“腎虛髓虧為本,痰瘀阻滯為標(biāo)”是AD的病機特點。文癡方從其病機入手,補腎健脾、豁痰祛瘀,有中醫(yī)理論的支持。

        從現(xiàn)代醫(yī)學(xué)角度,本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對文癡方治療AD進(jìn)行分析。以上數(shù)據(jù)表明,AKT1、EGFR、VEGFA、SRC、MMP9、MMP2、GSK3B、KDR是文癡方治療AD的關(guān)鍵靶點。PI3K/Akt是一條調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝、生存及凋亡的信號傳導(dǎo)通路,神經(jīng)系統(tǒng)中廣泛存在,在AD發(fā)生發(fā)展過程中具有重要調(diào)控作用。研究證實[4],AD模型小鼠中,PI3K/Akt通路活性被抑制后β-淀粉樣蛋白(Aβ)大量沉積可導(dǎo)致小鼠學(xué)習(xí)記憶能力出現(xiàn)障礙。鄭清等[5]通過電針改善AD模型大鼠的學(xué)習(xí)記憶和認(rèn)知功能障礙,并推斷其機制可能與調(diào)控PI3K/AKT/mTOR信號通路、誘導(dǎo)自噬、促進(jìn)神經(jīng)原纖維纏結(jié)清除有關(guān)。(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)又稱血管內(nèi)皮生長因子,具有直接營養(yǎng)神經(jīng)的作用,還可以促進(jìn)移植和內(nèi)源性神經(jīng)前體細(xì)胞的增殖、存活和分化,具有潛在的促進(jìn)腦修復(fù)的作用[6]。糖原合酶激酶3β(GSK3B)能夠促進(jìn)Aβ的沉積和以過度磷酸化Tau蛋白為核心的神經(jīng)原纖維纏結(jié)的形成。一項研究通過生物計算方法整合了大量文獻(xiàn)數(shù)據(jù)及基因表達(dá)數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)研究顯示,VEGFA、AKT1、GSK3B與AD的發(fā)病息息相關(guān)[7]。表皮生長因子受體(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)可參與調(diào)節(jié)腦發(fā)育和神經(jīng)元的存活與功能調(diào)節(jié)等活動,被認(rèn)為是治療β-淀粉樣蛋白誘導(dǎo)的記憶喪失的首選靶點[8]。研究表明,Src基因編碼形成的Src蛋白激酶可能可以促進(jìn)淀粉樣蛋白依賴性小膠質(zhì)細(xì)胞增生,從而促進(jìn)炎癥變化及AD的發(fā)生發(fā)展,抑制Src激酶活性可減輕AD小鼠模型中淀粉樣蛋白相關(guān)的小膠質(zhì)細(xì)胞增生,減輕炎癥反應(yīng),減緩AD的發(fā)展[9]。MMP又稱基質(zhì)金屬蛋白酶,可通過影響Aβ的代謝、參與Tau低聚物的形成、破壞腦部屏障功能、促進(jìn)神經(jīng)炎癥、影響突觸可塑性等改變AD的病理進(jìn)程[10]。

        槲皮素、山柰酚和木犀草素是文癡方治療AD的主要活性成分,三者都屬于黃酮類化合物,具有抗炎、抗氧化的作用,可通過減少Aβ的形成、抑制Tau蛋白磷酸化、減少神經(jīng)細(xì)胞凋亡等途徑治療AD[11]。槲皮素具有神經(jīng)保護(hù)作用[12],可改善AD的學(xué)習(xí)、記憶和認(rèn)知功能[13]。據(jù)報道,槲皮素可逆轉(zhuǎn)細(xì)胞外β-淀粉樣變性,并減少海馬和杏仁核中的tau蛋白變性、星形膠質(zhì)細(xì)胞增生和小膠質(zhì)細(xì)胞增生,從而保護(hù)三重轉(zhuǎn)基因AD模型小鼠的AD病理表現(xiàn)和相關(guān)認(rèn)知缺陷[14]。多項研究顯示[15-18],山柰酚具有神經(jīng)保護(hù)作用,可作為AD的潛在神經(jīng)保護(hù)劑。一項體外實驗研究顯示[19],木犀草素可能通過激活PI3K/Akt通路,抑制氧化應(yīng)激及Tau蛋白的磷酸化來實現(xiàn)神經(jīng)保護(hù)作用。

        綜上所述,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),初步探討了文癡方治療AD的潛在機制,通過槲皮素、山柰酚和木犀草素等關(guān)鍵成分對核心靶點AKT1、EGFR、VEGFA、SRC、MMP9、MMP2、GSK3B、KDR的調(diào)控,最終作用于PI3K-Akt信號通路、AD、癌癥信號通路、鈣信號通路、神經(jīng)退行性變等相關(guān)通路,為文癡方治療AD提供了理論依據(jù)。

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