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        基于PMA-qPCR方法檢測獸用消毒劑對非洲豬瘟病毒的滅活效率

        2023-03-16 03:34:38張鵬飛陳弟詩陳婉婷楊澤曉姚學(xué)萍任梅滲
        浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報 2023年2期
        關(guān)鍵詞:活率拷貝數(shù)消毒劑

        楊 悅,邵 靚,張鵬飛,陳弟詩,陳婉婷,王 印,3,*,羅 燕,3,楊澤曉,3,姚學(xué)萍,3,任梅滲,3

        (1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 動物醫(yī)學(xué)院,四川 成都 611130; 2.四川省動物疫病預(yù)防控制中心,四川 成都 611130; 3.動物疫病與人類健康四川省重點實驗室,四川 成都 611130)

        非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是由非洲豬瘟病毒(Africanswinefevervirus,ASFV)引起的一種豬急性和烈性傳染病。強毒株可引起豬的高死亡率,達90%以上[1]。由于該病的嚴(yán)重危害性與病原致病機理的復(fù)雜性,且無有效疫苗進行防控,世界動物衛(wèi)生組織(OIE)將其列為法定報告動物疫病,我國將其列為一類動物疫病。目前針對ASFV疫情,我國建立了以清洗消毒為預(yù)防手段,以隔離封鎖和精準(zhǔn)剔除為控制手段的一整套生物安全防控體系。其中,清洗消毒是防疫于未然的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。但目前防控中常見消毒劑濫用、錯用等問題,導(dǎo)致消毒效果不佳,養(yǎng)豬場防疫能力低下,且缺乏科學(xué)的消毒效果評估體系,阻礙了防控手段技術(shù)的更新,是疫情未得到有效控制的重要原因之一。

        本研究建立了可檢測非洲豬瘟病毒衣殼完整性的PMA-qPCR方法,又稱活力PCR(viability PCR,vPCR),該方法原理建立在疊氮溴化丙錠(propidium monoazide,PMA)作用機理之上,PMA是一種疊氮類核酸染料,對核酸具有高度親和力,能夠進入病毒衣殼破損的失活病毒內(nèi)部,在強光作用下,所帶的光敏性疊氮基團轉(zhuǎn)化為高活性的氮賓自由基[2-3],并與結(jié)合位點附近的任意碳氫化合物反應(yīng)形成穩(wěn)定的共價氮碳鍵[4-5],致使核酸分子永久修飾,最后阻斷核酸分子的擴增,消除了失活病毒核酸對檢測結(jié)果的影響[6-7];同時,由于活性病毒具有完整的衣殼,PMA被阻隔在病毒之外,故不能阻斷活性病毒核酸分子的擴增[8-11]。此外,駐留在溶液中沒有與核酸分子進行交聯(lián)的PMA在強光照射的同時與水分子反應(yīng)生成沒有活性的羥胺[12]。PMA具有結(jié)合游離核苷酸使其不能在PCR中擴增的特性[13-15],結(jié)合qPCR,就能通過PMA-qPCR定量檢測樣品中完整病毒粒子的數(shù)量。PMA-qPCR方法可以用于檢測細菌或病毒是否具有完整結(jié)構(gòu)、病毒理化特性研究、篩選消毒劑品類與最佳作用條件、評價生物安全措施效果[16],在ASFV的防控中具有極大的應(yīng)用潛能。

        目前豬場常用的消毒劑主要有酚類、醛類、醇類、酸類、堿類、鹵化物類、過氧化物類和季銨鹽類等,種類繁多,各類消毒劑均有其優(yōu)缺點。探尋高效消毒劑,使用高效經(jīng)濟的手段達到預(yù)期的生物安全防控效果,是科研力量集中的方向之一。本研究擬通過建立PMA-qPCR方法對消毒劑的消毒效果進行評估,并探究消毒劑的最佳作用條件。該結(jié)果可為豬場生物安全的消毒環(huán)節(jié)提供參考,為臨床生產(chǎn)中消毒劑的選擇、作用條件提供指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 主要材料

        非洲豬瘟陽性病豬脾、腎組織由四川省動物疫病預(yù)防控制中心實驗室保存,孔徑0.22 μm綠色針式過濾器購自成都浩搏優(yōu)科技有限公司,PMA購自Biotium公司,Pro Taq HS預(yù)混型探針法qPCR試劑盒購自湖南艾科瑞生物工程有限公司,通用型基因組DNA提取試劑盒購自柯菲特(香港)國際貿(mào)易有限公司。

        1.2 ASFV-PMA-qPCR方法的建立

        1.2.1 ASFV引物及探針合成

        參照《T/CVMA 5—2018 非洲豬瘟病毒實時熒光PCR檢測方法》合成引物與探針,序列見表1。

        1.2.2 ASFV-qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線建立

        提取ASFV陽性組織DNA,采取上述特異性引物PCR擴增目的基因,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,回收目的片段,克隆至pMD19-T載體。利用NanoDrop 2000核酸蛋白分析儀測定重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品濃度,并計算其拷貝數(shù)。將重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品稀釋至104~1010拷貝·μL-1并作為模板,進行qPCR擴增。以循環(huán)數(shù)為縱坐標(biāo)、模板稀釋度為橫坐標(biāo),建立qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        表1 引物與TaqMan探針序列信息

        1.2.3 PMA-qPCR方法建立

        將ASFV陽性組織研磨成勻漿,用無菌0.22 μm濾頭過濾制成病毒液,分裝保存于-80 ℃?zhèn)溆谩V苽?0 mm×10 mm的無菌方形濾紙片若干作為吸附介質(zhì),平鋪于無菌平皿內(nèi),逐片滴加20 μL病毒液,以作含毒載片。置室溫下自然陰干后備用。

        按表2設(shè)置實驗分組,將第1、3組樣品高壓蒸汽滅菌,第2、4組樣品常溫放置,每組重復(fù)處理3次,每個重復(fù)3張含毒載片。處理后加入500 μL無菌雙蒸水,振蕩離心。取200 μL各處理組樣本,第1、2組分別加20 μL(0.1 mg·mL-1)PMA染液,第3、4組分別加20 μL無菌雙蒸水,混勻后置于暗室孵育20 min。將所有管置于冰盒上,在500 W鹵素?zé)粝抡丈?0 min,期間每隔5 min翻轉(zhuǎn)離心管,使其均勻曝光。使用通用型基因組DNA提取試劑盒提取上述各處理組所得含毒載片懸液中的病毒DNA,具體操作步驟參考試劑盒說明書,提取所得DNA分裝于-80 ℃保存?zhèn)溆?。使?.2.1節(jié)中引物與探針,參照《T/CVMA5—2018非洲豬瘟病毒實時熒光PCR檢測方法》進行qPCR檢測,每組樣本設(shè)置3個技術(shù)重復(fù)。反應(yīng)參數(shù)設(shè)置如下:95 ℃ 3 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s,40個循環(huán);在每次循環(huán)的60 ℃退火延伸時收集熒光信號。試驗結(jié)束后,根據(jù)收集的Ct值判定結(jié)果,并計算拷貝數(shù)。

        表2 PMA-qPCR分組

        1.3 消毒劑作用效果的評估

        1.3.1 消毒劑作用

        按生產(chǎn)常用濃度配制消毒劑。為符合生產(chǎn)操作,無特殊說明者,一律使用硬水配制,即配即用。消毒液的稀釋度與種類為0.5%過硫酸氫鉀復(fù)合物、1%二氯異氰尿酸鈉、2.5%二氧化氯、0.2%復(fù)合碘、0.5%辛硫磷、0.2%復(fù)合戊二醛季銨鹽溶液、1%復(fù)合有機酸、0.5%溴化二甲基二癸基羥胺、0.25%戊二醛-癸甲溴胺溶液。

        試驗組:用200 μL配置好的各組消毒劑充分浸泡含毒載片,靜置30 min后,取出含毒載片于含500 μL無菌蒸餾水的離心管中振蕩混勻,8 000×g離心2 min,取200 μL上清液備用。每組消毒劑做3個重復(fù),每個重復(fù)3張含毒載片。

        陽性對照組:含毒載片經(jīng)高壓蒸汽滅菌處理,用無菌雙蒸水代替消毒劑溶液,作用至30 min,加入500 μL無菌雙蒸水,振蕩混勻,8 000×g離心2 min,上清液作為陽性對照組樣本備用。

        陰性對照組:含毒載片經(jīng)常溫放置處理,用無菌雙蒸水代替消毒劑溶液,作用至30 min,加入500 μL無菌雙蒸水,振蕩混勻,8 000×g離心2 min,上清液作為陰性對照組樣本。所得結(jié)果代表病毒液原有拷貝數(shù),以其作為計算滅活對數(shù)的初始拷貝數(shù)。

        1.3.2 PMA-qPCR

        取200 μL各處理組樣本,分別加入20 μL PMA染液(0.1 mg·mL-1),置于暗室孵育20 min。將所有管置于冰上,在500 W鹵素?zé)粝抡丈?0 min后,使用通用型基因組DNA提取試劑盒提取上述各處理組樣品的病毒DNA,用于qPCR檢測。試驗結(jié)束后,根據(jù)收集的Ct值判定結(jié)果,并計算拷貝數(shù)。

        1.4 消毒劑最佳作用條件的優(yōu)化

        在上述消毒劑中,選取消毒效果最好的一種消毒劑,按照1.3節(jié)方法依次進行消毒劑的工作濃度(2%~0.2%稀釋)、作用時間(1~30 min)的優(yōu)化,篩選出消毒劑的最適作用濃度和最佳作用時間。

        圖1 ASFV-qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.1 Standard curve of ASFV-qPCR

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ASFV-PMA-qPCR方法的建立

        2.1.1 ASFV-qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線

        將ASFV重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品分別稀釋至104~1010拷貝·μL-1并作為模板,進行qPCR擴增。以循環(huán)數(shù)為縱坐標(biāo)、模板稀釋度為橫坐標(biāo),建立qPCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線。標(biāo)準(zhǔn)曲線公式為y=-3.084x+45.770,E=111.0%,R2=0.995,x代表模板的起始拷貝濃度(copies·μL-1)的對數(shù),y代表樣品擴增的Ct值。

        2.1.2 PMA-qPCR方法結(jié)果

        由4組實驗結(jié)果(表3、圖2)可見,第1組(高壓蒸汽滅菌、添加PMA)qPCR沒有擴增曲線,第3組(高壓蒸汽滅菌、不添加PMA)有典型的S型擴增曲線,證明通過PMA處理阻止了失活病毒PCR擴增。第2組(常溫處理、添加PMA)和第4組(常溫處理、不添加PMA)都有典型的S型擴增曲線,證明PMA處理不會阻止完整病毒PCR擴增。由此可見,通過PMA-qPCR方法可以檢測病毒是否具有完整結(jié)構(gòu)。

        表3 PMA-qPCR各實驗組Ct值

        1~4,PMA-qPCR實驗第1~4組擴增曲線。1-4, Amplification curves for groups 1-4 of the PMA-qPCR experiment.圖2 PMA-qPCR各實驗組擴增曲線Fig.2 PMA-qPCR amplification curve of each experimental group

        2.2 消毒劑作用效果的評估

        用9種不同消毒劑處理后,提取病毒DNA進行PMA-qPCR檢測,每組重復(fù)處理3次。收集各組Ct值,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線公式計算病毒拷貝數(shù),采用方差檢驗法(t檢驗)對各組拷貝數(shù)進行統(tǒng)計分析。結(jié)果顯示,各組P值均小于0.000 1(圖3)。

        ****表示達到0.000 1 顯著水平。1~9,1~9號消毒劑,具體見表4。**** meant significant differences at the levels of 0.000 1.1-9, No. 1-9 disinfectants, shown in Table 4.圖3 消毒劑作用后剩余病毒拷貝數(shù)Fig.3 Copy number of virus left after disinfectants

        對拷貝數(shù)進行對數(shù)轉(zhuǎn)換處理,用病毒滅活率公式計算各組消毒劑對ASFV的滅活率,病毒滅活率(%)=[1-10(陰性組病毒拷貝數(shù)-實驗組病毒拷貝數(shù))]×100。結(jié)果(表4)表明,ASFV對不同種類的消毒劑有不同的敏感性,對過硫酸氫鉀復(fù)合物的敏感性最高;寄生蟲藥物(辛硫磷)也能滅活81.75%的ASFV。

        表4 不同消毒劑對ASFV的滅活率

        2.3 消毒劑最佳作用條件的優(yōu)化

        選取消毒效果最好的過硫酸氫鉀復(fù)合物消毒劑,稀釋為2、2.5、3、5、10、20 g·L-1并與含毒載片反應(yīng)30 min,提取病毒DNA進行PMA-qPCR檢測,每組重復(fù)處理3組,計算滅活率。2~20 g·L-1過硫酸氫鉀復(fù)合物溶液能不同程度地滅活A(yù)SFV,質(zhì)量濃度大于5 g·L-1的過硫酸氫鉀復(fù)合物溶液對ASFV的滅活率能達到99%以上,質(zhì)量濃度小于5 g·L-1的過硫酸氫鉀復(fù)合物溶液對ASFV的滅活率隨質(zhì)量濃度減小而逐漸下降(圖4-A),所以5 g·L-1是在能達到良好消毒效果要求下最經(jīng)濟的用量。

        將過硫酸氫鉀復(fù)合物消毒劑稀釋到5 g·L-1,按1、5、10、15、20、25、30 min時間梯度處理含毒載片,提取病毒DNA進行PMA-qPCR檢測,每組重復(fù)處理3組,計算滅活率。結(jié)果(圖4-B)表明,病毒滅活率隨作用時間的延長而升高,過硫酸氫鉀復(fù)合物溶液作用1 min即可滅活97.19%的ASFV,作用20 min滅活率提升到99%。實際生產(chǎn)中,應(yīng)盡量延長作用時間。

        A,不同質(zhì)量濃度過硫酸氫鉀復(fù)合物對ASFV的滅活率;B,過硫酸氫鉀復(fù)合物不同作用時間對ASFV的滅活率。A, Inactivation rate of potassium persulfate complex at different concentrations on ASFV; B, Inactivation rate of potassium persulfate complex on ASFV at different action times.圖4 過硫酸氫鉀復(fù)合物優(yōu)化結(jié)果Fig.4 Optimization results of potassium hydrogen persulfate complex

        3 討論

        本研究建立了PMA-qPCR方法,通過此方法測定了常用消毒劑對ASFV的滅活效果,篩選出了效果最好的消毒劑,優(yōu)化了消毒劑的最佳使用質(zhì)量濃度、作用時間。王巍等[17]總結(jié)闡述了養(yǎng)殖場常用消毒劑滅活A(yù)SFV的原理,發(fā)現(xiàn)消毒劑均能直接破壞病毒衣殼或阻斷膜上生化反應(yīng),最終使病毒失去結(jié)構(gòu)完整性,所以使用PMA-qPCR方法能夠更加方便快捷地得出常用消毒劑對ASFV的滅活效率。以往若要確定病毒是否具有感染性,需進行細胞實驗或動物實驗,如血細胞吸附試驗(hemadsorption,HAD),該方法原理是ASFV的EP402R基因編碼的外囊膜蛋白CD2v能夠誘導(dǎo)紅細胞吸附現(xiàn)象,但實驗所需的豬肺泡巨噬細胞價格昂貴,且ASFV細胞感染試驗需要在Ⅲ級生物安全實驗室(BSL-3)內(nèi)進行,強陽性樣品在接種細胞后24 h內(nèi)可觀察到紅細胞吸附現(xiàn)象[17-18]。細胞或動物實驗操作繁瑣,容易被受體細胞或受體動物個體差異影響。PMA-qPCR方法能夠簡捷快速地檢測ASFV的活性,可用于鑒別包膜結(jié)構(gòu)完整的ASFV。相較于細胞或動物實驗,PMA-qPCR方法的優(yōu)點在于避免了細胞培養(yǎng)、動物飼養(yǎng),更加便捷、經(jīng)濟、準(zhǔn)確,且可以定量。PMA-qPCR方法用于病原微生物的檢測,具有廣闊的應(yīng)用前景與實際價值。

        本研究結(jié)果顯示,目前使用的消毒劑種類中,過氧化物類和鹵素類的消毒效果較好,滅活率能達到95%以上,醛類和季銨鹽類次之??v觀所測試品類的消毒劑,過硫酸氫鉀復(fù)合物消毒效果最好。該結(jié)果可為過硫酸氫鉀復(fù)合物用于養(yǎng)殖場內(nèi)場地、物品消毒提供參考。消毒效果隨消毒劑作用時間和作用質(zhì)量濃度變化而變化,消毒劑質(zhì)量濃度越高、作用時間越長,消毒效果越好,但實際生產(chǎn)中還要考慮使用成本,所以養(yǎng)殖場應(yīng)選用最低的稀釋比例達到最高的消毒效果,并盡量延長作用時間。

        在規(guī)?;B(yǎng)殖生產(chǎn)中,正確使用化學(xué)消毒劑至關(guān)重要,而許多養(yǎng)殖戶對常用消毒劑了解不深,經(jīng)常錯用、濫用,從而影響了畜牧業(yè)生產(chǎn)的健康發(fā)展。因此,如何恰當(dāng)?shù)剡x擇消毒劑并合理利用對有效抵御病毒感染十分關(guān)鍵。提高對生物安全方面的重視程度,建立完善的生物安全防控體系是應(yīng)對非洲豬瘟問題的必經(jīng)之路,所以生豬養(yǎng)殖業(yè)的相關(guān)從業(yè)人員要加強對生物安全防控的重視,使養(yǎng)豬場逐漸規(guī)?;瑥亩鵀榻⒖茖W(xué)、完善的生物安全防控體系提供條件。

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