凌思雨,王 洲,張會敏,李 闖,劉慶濤,劉 艷,薛正蓮
(安徽工程大學(xué)生物與食品工程學(xué)院,安徽省工業(yè)微生物分子育種工程實驗室,微生物發(fā)酵安徽省工程技術(shù)研究中心,安徽 蕪湖 241000)
谷胱甘肽是一種由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸組成的非蛋白類三肽化合物[1],廣泛存在于大多數(shù)真核生物和某些原核生物中[2]。在生物體內(nèi)具有還原型和氧化型兩種形式[3],其中還原型谷胱甘肽占大多數(shù),約為90%[4-5]。由于其具有抗氧化性[6]、清除自由基[7]、解毒[8]、美白[9]等功能,谷胱甘肽被廣泛應(yīng)用于食品、醫(yī)藥和化妝品等行業(yè)[3,10]。因此,近年來國內(nèi)外對谷胱甘肽的需求呈現(xiàn)出一種上升趨勢[11]。目前,酵母發(fā)酵法生產(chǎn)谷胱甘肽是工業(yè)生產(chǎn)上的主流,常用的生產(chǎn)菌種主要包括釀酒酵母[12-13]、產(chǎn)朊假絲酵母[14]和畢赤酵母[15]。
由于傳統(tǒng)的菌種選育方法過程繁瑣、效率低下[16],由清華大學(xué)與天木生物科技有限公司合作研發(fā)的常壓室溫等離子體(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)誘變技術(shù)可有效解決上述問題。ARTP誘變具有高突變率、操作簡單、誘變速度快且對環(huán)境無污染等優(yōu)點[17-18],是一種新型誘變技術(shù),已被廣泛應(yīng)用到各類微生物菌種篩選過程中[19]。同時,基于液滴微流控技術(shù)研發(fā)而成的一款全自動高通量微生物微液滴培養(yǎng)(microbial microdroplet culture system,MMC)系統(tǒng)具有高通量、微量化及自動培養(yǎng)和傳代等功能[20-21],為菌種誘變之后的復(fù)雜篩選工作提供了一種高效方法[22-23]。目前,將ARTP與MMC聯(lián)合應(yīng)用于菌種選育的相關(guān)研究還鮮見報道,因此具有一定的研究前景和理論價值。
為了獲得高產(chǎn)谷胱甘肽的畢赤酵母菌株,以實驗室保藏的1 株畢赤酵母BY-1作為出發(fā)菌株,首先通過ARTP誘變技術(shù)并結(jié)合梯度濃度1,2,4-三氮唑平板篩選方法,驗證在高質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑抗性平板上生長菌株的谷胱甘肽產(chǎn)量,明顯高于低濃度1,2,4-三氮唑平板上生長的菌株。然后進(jìn)一步以1,2,4-三氮唑作為篩選因子,利用MMC對經(jīng)過誘變的菌株進(jìn)行適應(yīng)性進(jìn)化,提高出發(fā)菌株對1,2,4-三氮唑耐受性的同時篩選出高產(chǎn)谷胱甘肽的畢赤酵母菌株。本實驗旨在將ARTP誘變技術(shù)與MMC適應(yīng)性進(jìn)化聯(lián)合應(yīng)用于高產(chǎn)谷胱甘肽畢赤酵母菌株的選育,相比傳統(tǒng)的物理誘變、化學(xué)誘變和生物合成學(xué)手段相比,提供一種簡便高效的育種方式,具有廣泛的市場應(yīng)用價值。
1.1.1 菌種
畢赤酵母(Pichia pastoris)菌株,本實驗室命名為BY-1。
1.1.2 培養(yǎng)基
菌種培養(yǎng)用液體和固體培養(yǎng)基為酵母浸出粉胨葡萄糖(yeast extract peptone dextrose,YPD)培養(yǎng)基:葡萄糖20 g/L,胰蛋白胨20 g/L,酵母提取物10 g/L;固體培養(yǎng)基中額外添加20 g/L瓊脂粉。誘變菌株進(jìn)行搖瓶培養(yǎng)所用液體培養(yǎng)基:葡萄糖20 g/L,酵母提取物10 g/L,硫酸銨5 g/L,無水磷酸二氫鉀5 g/L,七水硫酸鎂5 g/L,氯化鈉0.1 g/L,氯化鈣0.1 g/L。培養(yǎng)基需115 ℃滅菌30 min后使用。
1.1.3 試劑
1,2,4-三氮唑、Tris-HCl緩沖液、2-硝基苯甲酸(2-nitrobenzoic acid,DTNB) 生工生物工程(上海)股份有限公司;40%乙醇溶液 國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
ARTP-IIS ARTP誘變育種儀 無錫源清天木生物科技有限公司;MMC-B2 MMC培養(yǎng)儀 洛陽華清天木生物科技有限公司;1510酶標(biāo)儀 賽默飛世爾(上海)儀器有限公司;D3024高速微量離心機(jī) 大龍興創(chuàng)實驗儀器(北京)股份公司;ZQZY-78BN恒溫培養(yǎng)搖床 上海知楚儀器有限公司;Mixer 4K微型旋渦混合儀 生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.3.1 畢赤酵母ARTP誘變
1.3.1.1 BY-1菌株生長曲線制作及對數(shù)生長期的確定
將活化好的畢赤酵母菌(BY-1)轉(zhuǎn)移至裝液量為30 mL的250 mL搖瓶中,置于恒溫培養(yǎng)搖床中30 ℃、220 r/min過夜培養(yǎng)。將BY-1菌懸液濃度稀釋到OD600nm約1.0,轉(zhuǎn)入MMC專用進(jìn)樣瓶,在MMC系統(tǒng)中創(chuàng)建液滴培養(yǎng)單元,并使用MMC系統(tǒng)自帶的光密度檢測裝置檢測液滴中BY-1菌株生長過程中OD600nm值的變化,用于制作生長曲線,以確定BY-1進(jìn)入對數(shù)生長期的時間。
1.3.1.2 ARTP誘變致死率曲線的制作及最佳ARTP誘變處理時間的確定
取對數(shù)生長期的BY-1菌液,稀釋菌液濃度到OD600nm約為0.6~0.8。取10 μL稀釋好的菌液,將其均勻涂布在ARTP專用載片上,置于ARTP誘變育種儀中對BY-1菌株進(jìn)行誘變處理[24]。ARTP誘變育種儀配備純度超過99.99%的氦氣;設(shè)置處理參數(shù):入射功率120 W,氣體流量10 L/min,照射距離2 mm。設(shè)置不同誘變處理時間:40、80、120、160、200 s和240 s,并計算不同處理時間的菌株致死率,以繪制ARTP誘變致死率曲線。菌株致死率的計算方法為:將處理結(jié)束的載片裝入含有990 μL無菌生理鹽水中,經(jīng)微型旋渦混合儀充分振蕩,以未經(jīng)誘變處理過的菌液作為對照,稀釋成不同梯度后均勻涂布于YPD固體培養(yǎng)基。而后置于30 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5 d,并計算致死率。根據(jù)ARTP誘變致死率曲線確定最佳誘變處理時間。致死率的計算公式如下:
1.3.1.3 1,2,4-三氮唑梯度濃度平板法篩選突變菌株
將熔化好的YPD固體培養(yǎng)基倒入直徑為9 cm的無菌培養(yǎng)皿中,傾斜一定角度(約15°),使得位于液面高處的培養(yǎng)基處于培養(yǎng)皿邊與皿底之間,待其凝固后,水平放置培養(yǎng)皿,將含有2 g/L 1,2,4-三氮唑的YPD培養(yǎng)基加入其中,制得含有不同質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑(0~2 g/L)的固體平板。隨后將經(jīng)過誘變并稀釋好的酵母菌液均勻涂布于梯度平板中,倒置于30 ℃培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng)3~5 d,觀察不同質(zhì)量濃度梯度下菌體的生長情況,并驗證在高質(zhì)量濃度抗性下生長的菌落與其谷胱甘肽產(chǎn)量是否正相關(guān)。
1.3.1.4 對數(shù)生長期初篩菌株在最佳ARTP誘變時間下的ARTP誘變
將經(jīng)過ARTP誘變及梯度平板篩選獲得的優(yōu)勢菌株,在最佳誘變時間下再次處理,隨后均勻涂布于YPD固體平板中,挑選單菌落用于后續(xù)MMC適應(yīng)性進(jìn)化。通過ARTP誘變和MMC篩選后獲得的畢赤酵母菌株,在30 ℃、220 r/min條件下進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),測定其谷胱甘肽產(chǎn)量和細(xì)胞生物量,以優(yōu)選高產(chǎn)谷胱甘肽的誘變菌株。
1.3.2 DTNB法測定谷胱甘肽產(chǎn)量
取2 mL搖瓶培養(yǎng)液,8000 r/min離心5 min后獲得上清液和細(xì)胞沉淀,使用上清液檢測胞外谷胱甘肽產(chǎn)量,使用細(xì)胞沉淀檢測胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量,本實驗谷胱甘肽總產(chǎn)量為胞外和胞內(nèi)產(chǎn)量之和[25-26]。對于胞內(nèi)谷胱甘肽的檢測需要額外使用40%乙醇溶液,30 ℃水浴破壁2 h,8000 r/min離心5 min后取上清液進(jìn)行顯色反應(yīng)。在pH 8.0的Tri-HCl緩沖液中,谷胱甘肽與DTNB反應(yīng)可以生成黃色的5-硫代-2硝基苯甲酸,在波長412 nm處有最大吸收峰,利用酶標(biāo)儀檢測OD412nm,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法檢測谷胱甘肽產(chǎn)量[27]。
1.3.3 細(xì)胞生物量的測定
取2 mL搖瓶培養(yǎng)液,8000 r/min離心5 min,棄上清液,而后用蒸餾水洗滌菌體3 次,85 ℃烘干至質(zhì)量恒定,減去空離心管質(zhì)量后除以搖瓶培養(yǎng)液體積2 mL即可得到細(xì)胞干質(zhì)量(g/L)。
1.3.4 優(yōu)選菌株的MMC適應(yīng)性進(jìn)化
將經(jīng)過ARTP誘變且經(jīng)過搖瓶培養(yǎng)證實生產(chǎn)性能較穩(wěn)定的菌株BY-1-26,接入到Y(jié)PD液體培養(yǎng)基中,30 ℃、220 r/min條件下過夜培養(yǎng),調(diào)節(jié)OD600nm,使其控制在1.0以下。設(shè)置傳代方式(time)及傳代參數(shù)(24 h)后,在不同濃度梯度的1,2,4-三氮唑篩選因子條件下進(jìn)行BY-1-26菌株的MMC適應(yīng)性進(jìn)化,實時檢測OD600nm以跟蹤菌株的適應(yīng)性進(jìn)化生長情況。隨著培養(yǎng)時間的延長,1,2,4-三氮唑濃度逐漸遞增,達(dá)到最高設(shè)定濃度時,將生長情況良好的液滴提取出來,通過平板劃線,分離單菌落后,作為下次實驗的出發(fā)菌株。
1.3.5 突變菌株遺傳穩(wěn)定性分析
將最終經(jīng)過篩選獲得的優(yōu)勢菌株,經(jīng)過固體平板劃線連續(xù)傳代7 次,于30 ℃、220 r/min條件下檢測每代的生長情況(生物量)及谷胱甘肽產(chǎn)量,驗證其遺傳穩(wěn)定性。
實驗數(shù)據(jù)采用Excel 2019進(jìn)行處理,圖像采用Origin 2018進(jìn)行繪制。實驗結(jié)果以表示。
BY-1畢赤酵母菌株為ARTP誘變的出發(fā)菌株,其具有代謝產(chǎn)生谷胱甘肽能力,已知其在搖瓶培養(yǎng)48 h可達(dá)到最高谷胱甘肽產(chǎn)量(胞內(nèi)產(chǎn)量與胞外產(chǎn)量總量)(133.24±0.86)mg/L,對應(yīng)生物量(15.22±0.21)g/L(圖1a)。圖1b為BY-1菌株在MMC培養(yǎng)中的生長曲線,不同液滴培養(yǎng)單元之間一致性良好,菌株BY-1從3 h起開始進(jìn)入對數(shù)生長期,20 h后進(jìn)入穩(wěn)定期。進(jìn)一步檢測BY-1菌株在不同ARTP誘變處理時間下的致死率,由圖1c可知,隨著處理時間的延長,菌株的死亡率也在逐漸提高。處理時間為120 s時,致死率高達(dá)80%;處理時間增加到160 s,致死率為90%;進(jìn)一步增加處理時間至200 s,致死率達(dá)到100%。根據(jù)文獻(xiàn)報道[28],致死率在80%~90%之間,更有利于后續(xù)誘變菌株的篩選工作。為此,考慮到誘變菌株的篩選效率,本研究將160 s確定為后續(xù)ARTP誘變的最佳處理時間。
圖1 菌株BY-1的谷胱甘肽產(chǎn)量及生物量(a)、生長曲線(b)和ARTP誘變致死率曲線(c)Fig.1 GSH yield and biomass (a),growth curve (b) and ARTP mutagenicity lethality curve (c) of strain BY-1
畢赤酵母經(jīng)ARTP誘變后,涂布在含有梯度質(zhì)量濃度(0~2 g/L)的1,2,4-三氮唑YPD培養(yǎng)基中,培養(yǎng)3 d,如圖2a所示,在相對低質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑培養(yǎng)基中,誘變菌株生長良好,數(shù)量多且菌落形態(tài)較大。隨著1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度增大,畢赤酵母生長情況受到抑制,形態(tài)變小且數(shù)量減少。平板中高質(zhì)量濃度與低濃度區(qū)域分別選取30 個單菌落,進(jìn)行搖瓶培養(yǎng)驗證。結(jié)果表明,低質(zhì)量濃度抗性突變株的產(chǎn)量普遍低于高質(zhì)量濃度抗性突變株,且低濃度區(qū)域谷胱甘肽產(chǎn)量的中位數(shù)明顯低于高質(zhì)量濃度區(qū)域(圖2b)。在高質(zhì)量濃度區(qū)域發(fā)現(xiàn)編號為26的突變株(圖2a),其谷胱甘肽產(chǎn)量最高,達(dá)到(203.20±4.18)mg/L,將其命名為BY-1-26。在后續(xù)的ARTP誘變中,選擇BY-1-26作為新的出發(fā)菌株。
圖2 畢赤酵母誘變菌株梯度平板篩選結(jié)果(a)及其谷胱甘肽產(chǎn)量測定結(jié)果(b)Fig.2 Results of gradient plate screening (a) and yield of GSH produced by mutant (b)
已知1,2,4-三氮唑的抗性突變株具有較高的谷胱甘肽合成能力[29]。本研究通過ARTP誘變結(jié)合1,2,4-三氮唑梯度濃度的平板篩選方法,驗證了其對高產(chǎn)谷胱甘肽的畢赤酵母菌株具有很好的篩選效果。目前尚無在發(fā)酵階段添加1,2,4-三氮唑以提升谷胱甘肽產(chǎn)量的報道。因此需要確定好1,2,4-三氮唑在發(fā)酵過程中的適宜添加時間和添加濃度,以準(zhǔn)確考察1,2,4-三氮唑?qū)Ξ叧嘟湍赴l(fā)酵過程中產(chǎn)谷胱甘肽的影響。
2.3.1 搖瓶培養(yǎng)中初步添加1,2,4-三氮唑?qū)入赘孰漠a(chǎn)量的影響
在搖瓶培養(yǎng)的不同階段添加1,2,4-三氮唑,會直接影響到菌體的生長及谷胱甘肽產(chǎn)量[30]。參考圖2結(jié)果,選擇1,2,4-三氮唑在“高質(zhì)量濃度區(qū)域”的中位數(shù)質(zhì)量濃度1.5 g/L初步進(jìn)行搖瓶培養(yǎng)中的1,2,4-三氮唑添加實驗。為此根據(jù)出發(fā)菌株的生長曲線(圖1b),在菌株BY-1-26進(jìn)入搖瓶培養(yǎng)的0、5、10、15、20、25、30 h分別添加1.5 g/L的1,2,4-三氮唑,以確定其生長曲線的不同階段對菌株BY-1-26代謝產(chǎn)生谷胱甘肽的影響。以未加入1,2,4-三氮唑的BY-1-26菌株搖瓶培養(yǎng)實驗為對照,分別分析加入1.5 g/L 1,2,4-三氮唑后搖瓶培養(yǎng)48、60、72 h后其谷胱甘肽產(chǎn)量。
如圖3所示,搖瓶培養(yǎng)48 h后,誘變菌株BY-1-26生物量在48 h達(dá)到最高值,同時其谷胱甘肽產(chǎn)量也達(dá)到最大值,胞內(nèi)谷胱甘肽達(dá)到(153.85±2.80)mg/L,胞外谷胱甘肽達(dá)到(49.34±2.11)mg/L,總量達(dá)到(203.20±4.18)mg/L,比出發(fā)菌株增產(chǎn)52.51%。表明ARTP誘變可有效提升畢赤酵母菌株BY-1代謝產(chǎn)生谷胱甘肽的能力。
圖3 菌株BY-1-26在不同培養(yǎng)時間下的谷胱甘肽產(chǎn)量(a)和生物量(b)Fig.3 GSH yield (a) and biomass (b) of strain BY-1-26 at different incubation times
進(jìn)一步加入1,2,4-三氮唑,搖瓶培養(yǎng)48 h 后(圖4a),胞外谷胱甘肽產(chǎn)量增加3.9%~80.9%,達(dá)到89.25 mg/L,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量降低5.3%~33.9%,達(dá)到101.73 mg/L,推測加入1,2,4-三氮唑使BY-1-26菌株細(xì)胞壁滲透性增強(qiáng),使代謝產(chǎn)生的谷胱甘肽更容易從胞內(nèi)釋放到胞外。不同時間添加1,2,4-三氮唑的樣本相比,谷胱甘肽總量分別在培養(yǎng)5、10、20 h加入1,2,4-三氮唑的樣本中有所增加(2.3%~9.2%),而在培養(yǎng)0、15、25、30 h后加入1,2,4-三氮唑的樣本中有所減少(3.3%~17.9%),在搖瓶培養(yǎng)10 h后加入1,2,4-三氮唑的樣本,谷胱甘肽產(chǎn)量增加最多(9.2%,221.83 mg/L),推測可能與對數(shù)期菌株細(xì)胞壁通透性更容易受1,2,4-三氮唑影響,谷胱甘肽釋放到胞外有利于解除產(chǎn)物抑制促進(jìn)菌株谷胱甘肽的進(jìn)一步合成[31]。
搖瓶培養(yǎng)60 h后(圖4b),與培養(yǎng)48 h(圖4a)相比,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量略有提高(1.38%,133.06 mg/L),胞外谷胱甘肽平均產(chǎn)量顯著降低為48 h 的94.06%(61.91 mg/L),推測可能與長時間發(fā)酵營養(yǎng)物質(zhì)損耗及菌株代謝能力降低有關(guān)。與未加入1,2,4-三氮唑(圖3a)相比,加入1,2,4-三氮唑的樣本,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量減少9.4%~26.1%,胞外谷胱甘肽產(chǎn)量變?yōu)?3.6%~162.7%,總量變?yōu)?1.1%~104.9%。其中,搖瓶培養(yǎng)10 h后加入1,2,4-三氮唑的樣本中谷胱甘肽總量最高(210.46 mg/L),其中胞外谷胱甘肽產(chǎn)量提高62.7%(78.49 mg/L),胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量下降13.4%(131.97 mg/L)。
搖瓶培養(yǎng)72 h后(圖4c),與培養(yǎng)60 h(圖4b)相比,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量與胞外谷胱甘肽產(chǎn)量分別顯著降低為60 h的28.52%(37.82 mg/L)和70.43%(42.39 mg/L)。推測長時間發(fā)酵使菌株代謝生長所需的營養(yǎng)物質(zhì)嚴(yán)重不足。與未加入1,2,4-三氮唑(圖3a)相比,加入1,2,4-三氮唑的樣本,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量減少24.19%~28.41%,胞外谷胱甘肽產(chǎn)量變?yōu)?0.00%~104.18%,總量變?yōu)?8.38%~44.60%(73.72~85.65 mg/L)。其中,搖瓶培養(yǎng)20 h后加入1,2,4-三氮唑的樣本中谷胱甘肽總量最高(85.65 mg/L),胞外谷胱甘肽產(chǎn)量47.83 mg/L,胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量37.82 mg/L。
圖4 不同時間添加1,2,4-三氮唑?qū)?8(a)、60 h(b)和72 h(c)培養(yǎng)液中谷胱甘肽的影響Fig.4 Effects of different addition times of 1,2,4-triazole on GSH yield in 48 (a),60 (b) and 72 h (c) cultures
綜上,與出發(fā)菌株相比((133.24±0.86)mg/L),ARTP誘變可以顯著提高BY-1-26菌株在發(fā)酵48 h的谷胱甘肽產(chǎn)量52.51%((203.20±4.18)mg/L);在搖瓶培養(yǎng)10 h添加1,2,4-三氮唑有助于胞內(nèi)谷胱甘肽釋放到胞外,可以進(jìn)一步提高其在發(fā)酵48 h的谷胱甘肽產(chǎn)量66.49%((221.83±2.10)mg/L)。誘變菌株在搖瓶培養(yǎng)48 h其谷胱甘肽產(chǎn)量達(dá)到最高值,隨著培養(yǎng)時間延長到60 h和72 h,其谷胱甘肽產(chǎn)量持續(xù)下降。
2.3.2 搖瓶培養(yǎng)過程中添加高質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑?qū)Ξ叧嘟湍府a(chǎn)谷胱甘肽的影響
由2.3.1節(jié)結(jié)果可知,在搖瓶培養(yǎng)10 h添加1,2,4-三氮唑可顯著提高菌株的谷胱甘肽產(chǎn)量。為了進(jìn)一步探索更高質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑?qū)φT變菌株代謝谷胱甘肽的影響,繼續(xù)嘗試在搖瓶培養(yǎng)10 h添加終質(zhì)量濃度為1.6、1.8、2.0、2.2、2.4、2.6、2.8 g/L的1,2,4-三氮唑,并且分別在48 h測定谷胱甘肽產(chǎn)量和生物量,結(jié)果如圖5所示。與未加入1,2,4-三氮唑(圖3)相比,菌株在48 h的生物量((15.66±0.49)g/L)基本沒有變化;菌株在48 h的谷胱甘肽產(chǎn)量提高2.66%~13.22%,其中,加入終質(zhì)量濃度為2.4 g/L 1,2,4-三氮唑的樣本谷胱甘肽產(chǎn)量最高,提高13.22%((230.07±1.26)mg/L)。與加入1.5 g/L的1,2,4-三氮唑的樣本(圖3a,(221.83±2.10)mg/L)相比,其谷胱甘肽產(chǎn)量有進(jìn)一步增加;與出發(fā)菌株相比((133.24±0.86)mg/L),提高72.67%。以上研究表明,提高1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度可以進(jìn)一步提高畢赤酵母菌株產(chǎn)谷胱甘肽的能力。
圖5 添加不同質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑于BY-1-26菌株搖瓶培養(yǎng)液培養(yǎng)48 h后的谷胱甘肽產(chǎn)量(a)和生物量(b)Fig.5 GSH yield (a) and biomass (b) of BY-1-26 after 48 h shake flask culture with the addition of different concentrations of 1,2,4-triazole
以上實驗證實,ARTP誘變技術(shù)結(jié)合添加1,2,4-三氮唑培養(yǎng)可以有效篩選并促進(jìn)畢赤酵母菌株高產(chǎn)谷胱甘肽。為此,本研究使用MMC儀,繼續(xù)對誘變菌株BY-1-26進(jìn)行1,2,4-三氮唑的適應(yīng)性進(jìn)化。
2.4.1 BY-1-26菌株對1,2,4-三氮唑的適應(yīng)進(jìn)化質(zhì)量濃度分析
基于2.3節(jié)實驗,BY-1-26菌株培養(yǎng)液可以耐受2.8 g/L的1,2,4-三氮唑。在MMC體系初步嘗試在更大的0~5 g/L質(zhì)量濃度范圍內(nèi)檢測1,2,4-三氮唑?qū)Y-1-26菌株的適應(yīng)性進(jìn)化影響。根據(jù)24 個液滴在8 個質(zhì)量濃度梯度的生長曲線(圖6a),當(dāng)1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度增加到4.444 g/L時,BY-1-26菌株的生長盡管受到一定抑制,其仍顯示出較好的生長趨勢。BY-1-26菌株在0~10 g/L范圍內(nèi)的適應(yīng)性進(jìn)化曲線(圖6b)顯示,BY-1-26菌株在10 g/L 1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度條件下顯示明顯的不均一性,表明其生長一致性受到影響。BY-1-26菌株在10~12 g/L范圍內(nèi)的適應(yīng)性進(jìn)化曲線(圖6c)顯示,BY-1-26菌株在12 g/L的1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度顯示明顯的不均一性。BY-1-26菌株在更高的1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度(12~15 g/L)下無法顯示規(guī)律性的適應(yīng)性進(jìn)化曲線(圖6d)。因此,本研究將BY-1-26菌株對1,2,4-三氮唑的適應(yīng)進(jìn)化濃度范圍設(shè)定為5~12 g/L,以獲得可耐受更高1,2,4-三氮唑抗性的畢赤酵母菌株。
圖6 菌株BY-1-26在不同1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度下的生長結(jié)果Fig.6 Growth status of strain BY-1-26 with different 1,2,4-triazole concentrations
使用MMC體系將BY-1-26菌株在5~12 g/L的1,2,4-三氮唑質(zhì)量濃度范圍下進(jìn)行1 輪適應(yīng)性進(jìn)化后,挑選長勢較好的液滴提取出來,通過劃線培養(yǎng),提取單菌落菌株,繼續(xù)進(jìn)行下一輪適應(yīng)性進(jìn)化,以此類推,直到獲得耐受較高質(zhì)量濃度(接近12 g/L)1,2,4-三氮唑且適應(yīng)性進(jìn)化曲線良好的菌株。最終挑選了24 個液滴進(jìn)行后續(xù)的菌株純化和搖瓶培養(yǎng)驗證實驗。
2.4.2 適應(yīng)性進(jìn)化菌株的生物量和谷胱甘肽產(chǎn)量分析
將經(jīng)過適應(yīng)性進(jìn)化得到的24 個液滴,經(jīng)過平板劃線,挑取單菌落,各得到1 株分離的單菌株。將分離的24 個單菌株進(jìn)一步進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),培養(yǎng)48 h后,檢測每個菌株胞內(nèi)和胞外谷胱甘肽含量。
經(jīng)過MMC適應(yīng)性進(jìn)化,搖瓶培養(yǎng)后,24 個菌株的谷胱甘肽平均產(chǎn)量達(dá)到(292.68±7.76)mg/L(圖7a),對比適應(yīng)性進(jìn)化之前BY-1-26菌株的谷胱甘肽產(chǎn)量(圖3a,(203.20±4.18)mg/L),進(jìn)一步提高了44.04%。其中胞外平均產(chǎn)量為(64.39±2.57)mg/L,對比適應(yīng)性進(jìn)化之前BY-1-26菌株的胞外產(chǎn)量((49.34±2.11)mg/L),提高了30.50%;胞內(nèi)平均產(chǎn)量為(228.33±6.55)mg/L,對比適應(yīng)性進(jìn)化之前B Y-1-26 菌株的胞內(nèi)產(chǎn)量((153.85±2.80)m g/L),提高了48.41%。24 個菌株的平均生物量達(dá)到(31.75±2.02)g/L(圖7 b),與未經(jīng)過MMC適應(yīng)性進(jìn)化生物量相比(圖3 b,(15.65±0.43)g/L),提高了102.8%,表明MMC適應(yīng)性進(jìn)化促進(jìn)了菌株的生長能力。推測通過MMC適應(yīng)性進(jìn)化,加強(qiáng)了誘變菌株谷胱甘肽的胞外滲透性,促進(jìn)了菌株代謝合成谷胱甘肽的能力。其中液滴編號為24的菌株谷胱甘肽產(chǎn)量最高,達(dá)到(312.13±2.62)mg/L,相比BY-1-26的谷胱甘肽產(chǎn)量((203.20±4.18)mg/L)提高53.61%,將其命名為BY-2-24。由此可以得出結(jié)論,經(jīng)過ARTP誘變所得到的菌株,將其接入MMC進(jìn)行適應(yīng)性進(jìn)化培養(yǎng)后,菌株的生長能力得到加強(qiáng),而且其谷胱甘肽生產(chǎn)能力也高于馴化之前,更為誘變育種之后的篩選方法提供了新的嘗試。
圖7 搖瓶培養(yǎng)適應(yīng)高質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑進(jìn)化的畢赤酵母菌株谷胱甘肽產(chǎn)量(a)和生物量(b)Fig.7 GSH yield (a) and biomass (b) of 24 single strains obtained by adaptive evolution with high concentrations of 1,2,4-triazoles
2.4.3 適應(yīng)性進(jìn)化的高產(chǎn)谷胱甘肽菌株的遺傳穩(wěn)定性
為了驗證突變菌株遺傳性狀是否穩(wěn)定,將畢赤酵母BY-2-24連續(xù)傳代培養(yǎng)7 次,進(jìn)行搖瓶發(fā)酵培養(yǎng),待發(fā)酵結(jié)束測定每代的谷胱甘肽產(chǎn)量和生物量,如圖8所示,經(jīng)過7 次固體平板劃線培養(yǎng),BY-2-24仍能保持較好的生長趨勢,每代的谷胱甘肽產(chǎn)量波動較小、基本穩(wěn)定((310.17±3.87)mg/L),生物量穩(wěn)定在(32.67±0.55)g/L。由此說明經(jīng)過誘變及馴化獲得的突變株,其遺傳穩(wěn)定性良好,為后續(xù)谷胱甘肽的發(fā)酵生產(chǎn)研究提供了穩(wěn)定的菌種。
圖8 傳代培養(yǎng)7 次后畢赤酵母BY-2-24的谷胱甘肽產(chǎn)量(a)和生物量(b)Fig.8 GSH yield (a) and biomass (b) of P.pastoris BY-2-24 after one to seven passages
通過ARTP誘變技術(shù)與MMC適應(yīng)性進(jìn)化相結(jié)合,構(gòu)建了一種谷胱甘肽高產(chǎn)畢赤酵母菌株的高效誘變篩選方法。以畢赤酵母菌株BY-1為出發(fā)菌株,通過ARTP誘變初步提高菌株BY-1-26的谷胱甘肽產(chǎn)量52.51%,達(dá)到(203.20±4.18)mg/L,進(jìn)一步通過在搖瓶培養(yǎng)10 h加入終質(zhì)量濃度為2.4 g/L的1,2,4-三氮唑,提高了菌株的谷胱甘肽產(chǎn)量72.67%,達(dá)到(230.07±1.26)mg/L,而對菌株的生物量基本無影響(提高2.9%,達(dá)到(15.66±0.49)mg/L)。本研究最終經(jīng)過高質(zhì)量濃度1,2,4-三氮唑(5~12 g/L)的MMC適應(yīng)性進(jìn)化,提高畢赤酵母菌株BY-2-24生物量118.33%,達(dá)(33.23±0.60)g/L,其中提高胞外谷胱甘肽產(chǎn)量47.12%,達(dá)(67.57±1.12)mg/L,提高胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量179.15%,達(dá)(243.39±2.33)mg/L,提高谷胱甘肽總產(chǎn)量134.26%,達(dá)(312.13±2.62)mg/L。推測與出發(fā)菌株相比,誘變菌株谷胱甘肽的細(xì)胞壁滲透性增強(qiáng),解除產(chǎn)物抑制,促進(jìn)了菌株代謝合成谷胱甘肽的能力。目前傳統(tǒng)的誘變育種方法主要是通過物理誘變(如紫外誘變)和化學(xué)誘變(如硫酸二乙酯誘變、甲基磺酸乙酯誘變)進(jìn)行,陳葉福等[32]通過紫外誘變結(jié)合鎘鹽抗性篩選,最終獲得了1 株谷胱甘肽產(chǎn)量達(dá)151.88 mg/L的釀酒酵母突變株,比出發(fā)菌株提高15.89%。孫姜等[33]通過制備釀酒酵母原生質(zhì)體,利用多輪亞硝酸誘變處理,最終篩選到1 株胞內(nèi)谷胱甘肽產(chǎn)量達(dá)14.85 mg/g干質(zhì)量的突變菌株,僅比出發(fā)菌株的產(chǎn)量提升24%。另外,目前研究人員已經(jīng)通過基因工程手段開展了高產(chǎn)谷胱甘肽酵母菌株的選育工作,高宇豪等[15]以畢赤酵母GS115為出發(fā)菌株,通過基因的串聯(lián)表達(dá)、前體氨基酸的添加和優(yōu)化檸檬酸鈉添加量的方法,使得谷胱甘肽產(chǎn)量達(dá)到(371.12±8.47)mg/L,對比出發(fā)菌株提升288%。本實驗以野生型畢赤酵母為出發(fā)菌株,最終谷胱甘肽產(chǎn)量提高134.26%,達(dá)(312.13±2.62)mg/L,相比傳統(tǒng)的誘變篩選效率有了大幅提升。盡管與基因工程手段獲得的產(chǎn)量相比尚有差距,后續(xù)可將BY-2-24菌株作為新的基因工程出發(fā)菌株,以進(jìn)一步提升谷胱甘肽產(chǎn)量。
綜上,本研究表明,1,2,4-三氮唑作為抗性篩選標(biāo)記,不僅可以在梯度平板篩選過程中提高篩選效率,還可以在液體篩選(適應(yīng)性進(jìn)化)過程中發(fā)揮出色作用。本研究將ARTP結(jié)合微液滴培養(yǎng)技術(shù)聯(lián)合運用于谷胱甘肽生產(chǎn)菌株的篩選過程,與傳統(tǒng)的物理誘變、化學(xué)誘變和合成生物學(xué)手段相比,不僅操作簡便,而且提升了篩選效率,為現(xiàn)代工業(yè)生產(chǎn)應(yīng)用所需菌株的誘變篩選工作提供了一定的借鑒與參考。