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        新生兒高苯丙氨酸血癥篩查及PAH 基因變異和缺失分析

        2023-02-27 04:28:08馬翠霞封露露馬倩倩封紀(jì)珍
        臨床兒科雜志 2023年2期
        關(guān)鍵詞:新生兒

        馬翠霞 封露露 馬倩倩 李 揚(yáng) 封紀(jì)珍

        1.石家莊市婦幼保健院遺傳科(河北石家莊 050051);2.石家莊市第四醫(yī)院體檢中心(河北石家莊 050000);3.石家莊市婦幼保健院產(chǎn)前診斷科(河北石家莊 050051)

        高苯丙氨酸血癥(hyperphenylalaninemia,HPA)主要是由苯丙氨酸羥化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)或其輔酶四氫生物蝶呤(tetrahydrobiopterin,BH4)缺乏引起的常染色體隱性遺傳病,為最常見(jiàn)的一種氨基酸代謝障礙性疾病[1]。HPA 在不同地區(qū)、不同人群間發(fā)病率有很大不同,相關(guān)PAH基因的變異位點(diǎn)也有很大差異。本研究通過(guò)分析石家莊市新生兒HPA篩查及患兒基因檢測(cè)結(jié)果,了解石家莊市新生兒HPA發(fā)病及基因變異情況,完善石家莊HPA患兒的基因突變譜,為進(jìn)一步遺傳咨詢(xún)提供理論依據(jù)。

        1 對(duì)象與方法

        1.1 研究對(duì)象

        選擇石家莊市新生兒疾病篩查中心負(fù)責(zé)的22個(gè)區(qū)縣107所醫(yī)療機(jī)構(gòu)2017年3月至2021年5月出生的新生兒495 740例。納入標(biāo)準(zhǔn):①出生后3~20 d;②充分哺乳(6~8次以上)后采集足跟血。排除標(biāo)準(zhǔn):①重復(fù)報(bào)告;②數(shù)據(jù)不完整;③死亡;④失訪。

        本研究獲石家莊市婦幼保健院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(No.202036),研究對(duì)象監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書(shū)。

        1.2 方法

        1.2.1 足跟血采集方法 75%乙醇消毒,使用一次性采血針刺于足跟內(nèi)或外側(cè),深度<3 mm,棄去第1滴血后取樣,用與試劑盒質(zhì)控血片一致的903號(hào)血片接觸血滴,使其自然滲透,采集3 個(gè)直徑>8 mm的血斑,自然晾干,置4~8 ℃保存,每周定期送至篩查中心,篩查中心收到樣本后于5 個(gè)工作日內(nèi)進(jìn)行檢測(cè)并出具可疑結(jié)果。

        1.2.2 篩查方法及診斷標(biāo)準(zhǔn) 苯丙氨酸(Phe)測(cè)定采用免疫熒光法,試劑為芬蘭Labsystems 新生兒Phe 濃度測(cè)定試劑盒,儀器為芬蘭Wallac 公司半自動(dòng)VICTOR2D 1420 時(shí)間分辨熒光免疫分析儀。嚴(yán)格按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行檢測(cè)。初篩及復(fù)查血Phe 濃度>2.0 mg/dL(120 μmol/L)為陽(yáng)性。篩查陽(yáng)性者召回采血測(cè)定Phe 濃度仍>2.0 mg/dL,并且苯丙氨酸/酪氨酸(Phe/Tyr)>2.0 確診為HPA;進(jìn)行尿蝶呤譜分析以區(qū)分PAH 缺乏癥和BH 4缺乏癥。

        患兒根據(jù)治療前最高血Phe 濃度分為經(jīng)典型苯丙酮尿癥(classic phenylketonuria,cPKU,Phe≥1 200 μmol/L)、輕度PKU(mild phenylketonuria,mPKU,360 μmol/L ≤Phe<1 200 μmol/L)和輕度高苯丙氨酸血癥(mild hyperphenylalaninemia,MHP,120 μmol/L≤Phe<360 μmol/L)。

        1.2.3PAH基因檢測(cè) 采用基因測(cè)序技術(shù)對(duì)患兒及其父母PAH基因進(jìn)行檢測(cè)?;純杭捌涓改胳o脈血用乙二胺四乙酸抗凝后嚴(yán)格按照說(shuō)明提取DNA,并對(duì)提取物進(jìn)行質(zhì)檢,后進(jìn)行基因組文庫(kù)構(gòu)建。標(biāo)記探針與文庫(kù)DNA雜交,用磁珠結(jié)合探針以抓取目的基因,磁珠被磁力架吸附洗脫純化,目的基因得以富集,進(jìn)而進(jìn)行高通量測(cè)序。所有數(shù)據(jù)進(jìn)行單核苷酸序列多態(tài)性分析(single nucleotide polymorphisms,SNP),檢測(cè)到的變異位點(diǎn)按照美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(huì)(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南進(jìn)行致病性分析。未報(bào)道的新發(fā)變異使用MutationTaster、GERP++、SIFT、PolyPhen_2、REVEL等功能預(yù)測(cè)軟件進(jìn)行致病性預(yù)測(cè)。對(duì)發(fā)現(xiàn)的致病變異在其所在片段上、下游設(shè)計(jì)引物進(jìn)行擴(kuò)增及Sanger測(cè)序,進(jìn)一步驗(yàn)證測(cè)序結(jié)果,采用Sanger 法對(duì)患兒父母進(jìn)行目標(biāo)基因變異驗(yàn)證,基因測(cè)序相關(guān)工作由北京邁基諾醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所完成。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        采用SPSS 22.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。計(jì)量資料符合正態(tài)分布的以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,非正態(tài)分布的以中位數(shù)M(P25~P75)表示。計(jì)數(shù)資料以例數(shù)(百分比)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 HPA篩查情況

        符合納入標(biāo)準(zhǔn)的新生兒487 413例。根據(jù)排除標(biāo)準(zhǔn)排除33例,最終入組487 380例。其中男252 521例、女234 859例,采血中位日齡為3.0(3.0~4.0)d,新生兒篩查Phe濃度為0.6(0.3~0.8)mg/dL。篩查出陽(yáng)性患兒191例,確診HPA 104例,均為PAH缺乏癥。其中男55例、女49例,HPA發(fā)病率為1/4686。男嬰(2.2/萬(wàn))與女?huà)耄?.1/萬(wàn))HPA發(fā)病率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.05,P=0.827)。104例HPA患兒中61例為MHP(58.7%),23例為mPKU(22.1%),20例為cPKU(19.2%)。見(jiàn)表1。

        表1 487 380例新生兒HPA篩查情況及臨床表型

        2.2 PAH基因變異類(lèi)型及特點(diǎn)

        104 例HPA 患兒208 個(gè)等位基因中,共檢測(cè)到209 個(gè)PAH基因變異位點(diǎn),62 種基因變異,所有檢測(cè)到的變異均來(lái)自患兒父母。在209 個(gè)PAH基因變異位點(diǎn)中,8 個(gè)最常見(jiàn)的變異占總數(shù)56.0%,即c.158G>A(39/209,18.7%)、c.728G>A(22/209,10.5%)、c.611 A>G(14/209,6.7%)、c.331 C>T(10/209,4.8%)、c.721 C>T(10/209,4.8%)、c.442-1G>A(8/209,3.8%)、c.1068C>A(7/209,3.3%)、c.1197 A>T(7/209,3.3%)。PAH基因變異位點(diǎn)分布不均勻,涵蓋范圍較廣,主要在外顯子7(40/209,19.1%)、外顯子2(39/209,18.7%)、外顯子3(23/209,11.0%)、外顯子6(22/209,10.5%)、外顯子11(22/209,10.5%)。104例HPA患兒中3例為雜合變異(2.9%),3例為純合變異(2.9%),98例為復(fù)合雜合變異(94.2%)。62 種變異位點(diǎn)中涉及6種變異類(lèi)型,包括37個(gè)錯(cuò)義變異、10個(gè)剪接變異、7個(gè)無(wú)義變異、2個(gè)同義變異、1個(gè)整碼變異、5個(gè)雜合變異。

        在MHP患兒中最常見(jiàn)的變異位點(diǎn)有c.158G>A(37/209,17.7%)、c.728 G>A(8/209,3.8%)、c.611 A>G(8/209,3.8%)、c.320 A>G(5/209,2.4%);mPKU患兒中最常見(jiàn)的變異位點(diǎn)有c.721C>T(9/209,4.3%)、c.728G>A(7/209,3.4%)、c.611A>G(4/209,1.9%);cPKU患兒中最常見(jiàn)的變異位點(diǎn)有c.728G>A(7/209,3.45%)、c.331C>T(6/209,2.9%)、c.1068 C>A(5/209,2.4%)、c.442-1 G>A(4/209,1.9%)。

        2.3 PAH基因片段缺失及未報(bào)道基因變異情況

        石家莊市新生兒HPA 患兒中發(fā)現(xiàn)5 種雜合缺失,分別位于外顯子1及上游區(qū)域、內(nèi)含子1、內(nèi)含子3、外顯子4~5、外顯子6,片段缺失分析結(jié)果見(jiàn)圖1。經(jīng)HGMD文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索外顯子6雜合缺失未有與PAH相關(guān)的報(bào)道。

        圖1 HPA 患兒PAH 基因缺失重復(fù)分析結(jié)果

        基因變異位點(diǎn)c.630 T>G、c.61-1 G>A、c.912+5 G>T 和c.1055+241 C>A 經(jīng)HGMD 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索未有相關(guān)報(bào)道,ClinVar數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)該位點(diǎn)致病性結(jié)果分析。1 例患兒同時(shí)攜帶c.630 T>G 與c.61-1 G>A 兩個(gè)位點(diǎn),臨床表型為MHP,這兩個(gè)位點(diǎn)蛋白功能預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)為有害、未知,ACMG致病性分析為臨床意義未明、疑似致病性變異。c.912+5 G>T 蛋白功能預(yù)測(cè)軟件為未知,ACMG致病性分析為臨床意義未明,該患兒臨床表型為mPKU。c.1055+241C>A蛋白功能預(yù)測(cè)軟件為未知,ACMG致病性分析為臨床意義未明,該患兒臨床表型為MHP。見(jiàn)圖2。

        圖2 HPA 患兒HGMD 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)未報(bào)道基因測(cè)序圖

        3 討論

        食物中蛋白質(zhì)分解形成的Phe 在正常狀態(tài)下由肝臟PAH作用轉(zhuǎn)變?yōu)門(mén)yr,如果PAH缺乏會(huì)導(dǎo)致血中Phe 含量升高,通過(guò)血腦屏障在腦部蓄積,進(jìn)而導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)損害[2]。BH 4 是Phe、Tyr 代謝過(guò)程中的輔酶,BH 4 還原酶缺乏也會(huì)導(dǎo)致HPA,引起神經(jīng)遞質(zhì)多巴胺和5-羥色胺合成障礙,損害神經(jīng)系統(tǒng)。HPA根據(jù)病因分為PAH缺乏癥和BH4缺乏癥,在我國(guó)85%~90%為PAH缺乏癥[3]。

        HPA 在不同的國(guó)家和地區(qū)發(fā)病率有很大差異,有資料顯示,歐洲不同國(guó)家HPA 的發(fā)病率為1/3000~1/30000[4],在亞洲國(guó)家中泰國(guó)較低為1/327740[5]。我國(guó)HPA發(fā)病率在南、北方地區(qū)有所不同,南方地區(qū)發(fā)病率在1/81976~1/10567之間[6-7],北方地區(qū)在1/5452~1/3495 之間[8-9]。石家莊市發(fā)病率為1/4686,明顯高于南方地區(qū),與北方地區(qū)一致,符合HPA 南低北高的特點(diǎn)。本研究HPA患兒基因變異以錯(cuò)義變異為主,發(fā)生率較高的位點(diǎn)為c.158G>A(p.R53H)、c.728G>A(p.R243Q)與c.611 A>G(p.Y 204 C),與一些學(xué)者研究結(jié)果一致[5,10-11],青島、陜西與本地區(qū)略有差異[12-13]。青島c.611A>G(p.Y204C)發(fā)生頻率較低,陜西c.728G>A(p.R243Q)與c.721C>T(p.R241C)發(fā)生頻率最高,甘肅c.1068C>A與c.1238G>C發(fā)生頻率較高。

        本組攜帶c.158 G>A(p.R 53 H)變異位點(diǎn)的39 例患兒中37 例臨床表型為MHP(1 例患兒攜帶3 個(gè)變異位點(diǎn),其中2 個(gè)為c.158 G>A),1 例患兒為mPKU,1 例為cPKU。這與相關(guān)研究的結(jié)論,即c.158 G>A(p.R 53 H)變異對(duì)PAH 酶活性影響較低一致[11]。1例cPKU患兒所攜帶的位點(diǎn)為c.158G>A、c.194 T>C 和c.842+2 T>A,預(yù)測(cè)這3 個(gè)位點(diǎn)的復(fù)合作用對(duì)PAH酶活性的影響較大。攜帶c.728G>A(p.R 243 Q)變異的21 例患兒中8 例臨床表型為MHP,7 例為mPKU,6 例為cPKU 患兒(1 例患兒攜帶2 個(gè)c.728 G>A 變異位點(diǎn),為純合變異)。相關(guān)研究顯示c.728G>A(p.R243Q)變異對(duì)酶活性影響較大[14],而本研究中攜帶該變異的患兒臨床表型與此結(jié)論略有差異。攜帶c.611A>G(p.Y204C)變異的14 例患兒中8 例臨床表型為MHP,4 例為mPKU,2例為cPKU。有研究顯示c.611A>G(p.Y204C)變異對(duì)PAH 酶活性影響不大[15],2 例cPKU 患兒攜帶的變異位點(diǎn)分別為c.611A>G和c.331C>T、c.611A>G和c.1068C>A,考慮c.331C>T與c.1068C>A這兩種變異可能對(duì)PAH酶活性的影響作用較大。本研究中變異位點(diǎn)導(dǎo)致的不同臨床表型與其他研究結(jié)果較為一致[6]。

        中國(guó)人群PAH 缺乏癥患者攜帶包括點(diǎn)變異和片段缺失的多種基因變異。石家莊市新生兒HPA患兒中變異頻率最高的區(qū)域是外顯子7,而河南地區(qū)為外顯子6[16]。本組5種片段缺失中外顯子6雜合缺失在HGMD數(shù)據(jù)庫(kù)未有PAH基因相關(guān)性的報(bào)道,該患兒攜帶的另外1個(gè)位點(diǎn)為c.611A>G,臨床表型為mPKU,與前期研究中變異c.611 A>G(p.Y 204 C)對(duì)PAH 酶活性影響情況一致[23]。HGMD 數(shù)據(jù)庫(kù)中未報(bào)道的基因變異為c.630 T>G、c.61-1 G>A、c.912+5G>T和c.1055+241C>A,其中c.630T>G與c.61-1 G>A 存在于同一例患兒,該患兒臨床表型為MHP。攜帶c.912+5G>T變異的患兒,另1個(gè)變異為外顯子4~5 片段缺失,臨床表型為mPKU;攜帶c.1055+241 C>A 變異的患兒,另1 個(gè)變異為c.721C>T,臨床表型為MHP。

        本研究顯示,石家莊HPA 患兒基因變異以錯(cuò)義變異為主,發(fā)生率較高的位點(diǎn)為c.158 G>A、c.728G>A和c.611A>G,分布區(qū)域以外顯子7為主。本研究明確了石家莊市HPA患兒基因變異的類(lèi)型和特點(diǎn),發(fā)現(xiàn)外顯子6雜合缺失以及c.630T>G、c.61-1G>A、c.912+5G>T和c.1055+241C>A 5個(gè)變異在HGMD數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)相關(guān)報(bào)道,豐富和完善了石家莊市HPA患兒的基因變異圖譜,為患兒家庭進(jìn)行遺傳咨詢(xún)和產(chǎn)前診斷提供了重要的補(bǔ)充資料。

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