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        機器學習結(jié)合太赫茲光譜的附片產(chǎn)地鑒別*

        2023-02-02 05:07:22劉泉澄侯森林
        傳感器與微系統(tǒng) 2023年1期
        關(guān)鍵詞:附片類間赫茲

        趙 偉, 何 俊, 劉泉澄, 侯森林, 鄧 琥

        (1.西南科技大學 信息工程學院,四川 綿陽 621010; 2.西南科技大學 四川天府新區(qū)創(chuàng)新研究院,四川 成都 610299)

        0 引 言

        中藥材傳統(tǒng)經(jīng)驗鑒別法在鑒別產(chǎn)地時,對個人能力依賴較大,缺乏客觀性。隨著科技的進步,現(xiàn)代鑒別方法因能客觀反映藥材的內(nèi)部質(zhì)量而被廣泛應用于中草藥鑒別[1,2]。近年來,太赫茲技術(shù)也被用于中藥材檢測,眾多學者還將機器學習與太赫茲光譜結(jié)合[3~9]實現(xiàn)中藥材的鑒別,劉燕德等人[6]利用標準正態(tài)變量變換和主成分分析(principal component analysis,PCA)及支持向量機(support vector machine,SVM)3種算法結(jié)合太赫茲光譜,實現(xiàn)了對4種貝母的識別;Liang J等人[7]利用PCA-SVM粒子群優(yōu)化(particle swarm optimization,PSO)算法對模型進行參數(shù)優(yōu)化,實現(xiàn)了對黃芩的產(chǎn)地鑒別;Yang S等人[8]將全波段的太赫茲吸收光譜作為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural network,CNN)的輸入量,實現(xiàn)了對3種產(chǎn)地咖啡豆的識別;Pan S等人[9]利用改進的杜鵑搜索(cuckoo search,CS)算法SPCS和SVM算法結(jié)合太赫茲光譜,實現(xiàn)了對3種年限人參的識別精度。

        上述識別模型具有較高的識別率,但卻缺乏普適性,即不能處理未知藥材名稱的產(chǎn)地識別問題。本文依據(jù)中醫(yī)藥的整體觀思想選取了0.2~1.5 THz全波段的數(shù)據(jù)進行分析,提出了將太赫茲光譜結(jié)合機器學習的中藥材產(chǎn)地識別方法。

        1 材料與方法

        1.1 太赫茲時域光譜系統(tǒng)

        本文使用的太赫茲時域光譜(THz-time-domain spectrum,THz-TDS)系統(tǒng)如圖1所示,系統(tǒng)由飛秒激光器(MaiTai,Spectra-Physics)和THz-TDS儀組成。激光器的中心波長為800 nm,帶寬為10 nm,經(jīng)立方體分束器分為泵浦光和探測光,當泵浦光照射光導天線時可產(chǎn)生太赫茲脈沖,其通過不同樣品[17]后可產(chǎn)生不同的THz-TDS,THz-TDS儀為美國Zomega公司的Z-3型THz-TDS系統(tǒng),該系統(tǒng)光譜范圍是0.1~2.5 THz,Z-3系統(tǒng)設(shè)置掃描開始時間為50 ps,掃描長度為60 ps,掃描速度為0.122 mm/s,為了減少水分對光譜的干擾,將Z-3THz-TDS儀放置在密封箱中,在實驗期間通入干燥空氣,將相對濕度控制在4 %RH以下,并將重復4次掃描獲得到的平均光譜作為一次有效的THz-TDS,經(jīng)傅里葉變換及Dorney等人[10]提出的光學參數(shù)提取方法可以得到其太赫茲吸收光譜。

        圖1 透射式THz-TDS系統(tǒng)光路原理

        1.2 樣品來源與制備

        實驗所用中藥材由綿陽市食品藥品檢驗所提供,其中附片有江油、云南、漢中3種產(chǎn)地,其余6種藥材為:大黃(甘肅和青海2種產(chǎn)地)、黨參、陳皮、麥冬、天麻,實驗前先將樣品干燥3 h,然后粉碎并過200目篩網(wǎng),之后將壓片機的壓力設(shè)置為5 T,壓力保持時間為3 min,壓制成直徑約13 mm,厚度約1 mm的圓片。附片每種產(chǎn)地壓制35片,共計105片,采集樣品正反兩面的太赫茲光譜,共得到210組附片的太赫茲吸收光譜數(shù)據(jù);而其他品種藥材各壓制5片,共計30片,共得到60組太赫茲吸收光譜數(shù)據(jù)。

        2 算法原理

        2.1 分類算法

        采用Python 3.7中的Sklearn學習庫實現(xiàn)隨機森林(random forest,RF)[11]、SVM和偏最小二乘判別分析(partial least square discriminant analysis,PLS-DA)等模型的建立,其操作較為便捷。其中,SVM采用線性核(linear kernel)函數(shù),SVM的懲罰參數(shù)、RF的基分類器數(shù)量、PLS-DA的主成分數(shù)均通過繪制學習率曲線獲得最佳值。另外,為保證訓練的準確度,利用train_test_split()函數(shù)將不同產(chǎn)地附片的210組光譜按7︰3比例隨機劃分為訓練集和測試集。

        2.2 模糊判別分析算法

        本文中的模糊判別分析(fuzzy discriminant analysis,F(xiàn)DA)算法是在給定標準庫情況下,利用最大隸屬度原則將待識別對象分類到對應標準庫的方法。

        1)樣本庫和細節(jié)點特征庫[12]

        將附片每種產(chǎn)地的50組原始吸收系數(shù)數(shù)據(jù)作為樣本庫。每種產(chǎn)地附片在每個頻率采樣點下的特征均值和標準差,用A(i)表示第i種產(chǎn)地藥材的特征均值,C(i)表示第i種產(chǎn)地藥材的標準差,即

        A(i)=[mi1,…,mij,…,miN]

        C(i)=[ci1,…,cij,…,ciN]

        (1)

        2)細節(jié)特征匹配

        假設(shè)細節(jié)點特征庫中包含B種產(chǎn)地的附片,現(xiàn)對待測樣本Q的模糊判別過程做進一步說明,假設(shè)待識別藥材吸收光譜記為FQ,則FQ=[fQ1,…,fQj,…,fQN]。若待測藥材被分類器預測為第i種藥材,則將待測光譜與細節(jié)點特征庫中的第i種產(chǎn)地藥材匹配,但由于樣品厚度、系統(tǒng)噪聲等因素的影響,F(xiàn)Q不可能恒等于第i種藥材的均值矢量A(i),而是以高斯分布的形式分布在A(i)附近。計算待測樣本屬于中藥材r的隸屬度drj,則

        (2)

        其中,隸屬度drj在0~1之間。求得待測藥材與細節(jié)點特征庫中某種產(chǎn)地隸屬度后,根據(jù)最大隸屬度原則以及設(shè)定的閾值即可驗證分類結(jié)果是否正確,若隸屬度大于設(shè)定閾值則分類結(jié)果正確并將其輸出,否則分類錯誤輸出結(jié)果為:未知藥材。其識別流程如圖2所示。

        圖2 3種模型的識別流程

        2.3 分類模型閾值的選擇與模型評價

        本文將等錯誤率(equal error rate,EER)處的值,即誤識率(FAR)和拒誤率(FRR)相等處的值設(shè)定為識別模型的閾值。FAR=(NFA/NIRA)×100 %,其中,NIRA為類間測試的總次數(shù),而類間測試集由不同品種的中藥材樣本組成,NFA為錯誤接受的樣本數(shù)。FRR=(NFR/NGRA)×100 %,NGRA為類內(nèi)測試的總次數(shù),而類內(nèi)測試集由不同產(chǎn)地的附片樣本組成,NFR為錯誤拒絕的樣本數(shù)。

        在進行類內(nèi)測試實驗時,隨著閾值的增大,錯誤拒絕的樣本數(shù)量越來越多,即待測光譜必須與目標光譜高度相似才能被正確識別;而對于類間測試實驗,隨著閾值的增大,錯誤接受的樣本數(shù)量越來越少,其他藥材的光譜本就與附片光譜差異較大,更容易被識別為非附片藥材。因此,將EER作為識別模型的閾值,此時識別模型在對類內(nèi)樣本的識別和對類間的樣本識別,其錯誤率均最低且相等,如圖3。

        圖3 FAR/FRR—閾值曲線示意

        識別準確率A(Accuracy)是識別正確樣本與總樣本的比例,A=((TP+TN)/(TP+FP+TN+FN))×100 %。其中,TP為真陽性,TN為真陰性,F(xiàn)P為假陽性,F(xiàn)N為假陰性。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 太赫茲光譜分析

        由于1.5 THz后信噪比變差,所以僅研究了0.2~1.5 THz波段的吸收光譜。圖4(a)~(c)為來自于漢中、江油、云南3種產(chǎn)地附片各70組太赫茲吸收光譜;在與附片相同的檢測系統(tǒng)及條件下檢測其余6種藥材,得到的60組太赫茲原始吸收光譜如圖4(d)所示,將其與部分附片光譜數(shù)據(jù)作為類間測試集的樣本;從圖中可以看出,僅靠吸收系數(shù)的大小難以區(qū)分不同產(chǎn)地的附片藥材,而使用機器學習可能是實現(xiàn)中藥材產(chǎn)地鑒別的關(guān)鍵。

        圖4 樣品的太赫茲吸收光譜

        3.2 建立識別模型

        3.2.1 識別模型的建立與對比分析

        本文將所有附片70 %的太赫茲吸收光譜數(shù)據(jù)作為輸入量輸入到SVM識別模型、RF識別模型、PLS-DA中進行訓練。各分類器最佳參數(shù)值如表1所示。

        表1 3種分類器的最佳參數(shù)

        根據(jù)表2可繪制出如圖5所示的3種模型在不同閾值下的識別準確率,從其中可以看出,PLS-DA結(jié)合FDA(PLS-DA-FDA)模型的準確率在任何閾值下均是最高的。

        表2 3種識別模型的類內(nèi)測試實驗結(jié)果

        圖5 3種模型在不同閾值下的識別準確率

        將類內(nèi)測試集(即未知產(chǎn)地的附片)的63個測試樣本輸入識別模型,同時將從附片中隨機抽取10個樣本(3漢中+3江油+4云南)和其余6種藥材各10組光譜組成類間測試集輸入3種識別模型。圖6中類內(nèi)測試集對應FAR曲線,類間測試集對應FRR曲線,同一識別模型的2條曲線的交點稱作EER點,將其所對應的值設(shè)定為識別模型在確認分類結(jié)果時的閾值。從圖中可以看出,PLS-DA-FDA模型的EER最低約2 %,優(yōu)于其他模型,此時閾值為0.16。

        圖6 FAR/FRR—閾值曲線

        3.2.2 PLS-DA-FDA模型的實驗結(jié)果

        將分類模型的閾值設(shè)置為0.16。從表3中可以看出,該模型對未知產(chǎn)地的附片平均準確率為95.23 %,訓練集準確率為95.89 %。

        表3 PLS-DA-FDA模型的類內(nèi)測試實驗結(jié)果

        PLS-DA-FDA模型進行類間測試,從附片的每種產(chǎn)地中隨機抽取共計10個樣本,與其余6種藥材各10個測試樣本,共計70個樣本組成類間測試集,并將其輸入模型進行驗證,其結(jié)果如圖7所示,其中“☆”表示真實標簽,“●”表示預測標簽,從圖中可看出,僅有2個其他品種的藥材被誤識為漢中制附片,未知藥材名稱時的識別準確率為97.14 %。

        圖7 PLS-DA-FDA模型在類間測試集上的識別結(jié)果

        4 結(jié) 論

        用6種非附片的其他藥材和附片的太赫茲光譜數(shù)據(jù)來檢驗模型對類間樣本的識別,用附片的數(shù)據(jù)驗證模型對3種產(chǎn)地的鑒別能力。結(jié)果表明:太赫茲光譜結(jié)合PLS-DA和模糊判別方法是實現(xiàn)附片產(chǎn)地快速識別的有效方法。

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