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        COVID-19疫情防控措施對肺炎克雷伯菌的分布及耐藥性的影響*

        2023-01-31 14:08:28黃貴曾強林柯貴寶楊進張亞美李珊娜
        西部醫(yī)學 2023年1期
        關鍵詞:克雷伯耐藥性常態(tài)

        黃貴 曾強林 柯貴寶 楊進 張亞美 李珊娜

        (1.成都大學附屬醫(yī)院,四川 成都 610081;2.廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,廣東 廣州 510120)

        肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae, KP)屬革蘭陰性桿菌,腸桿菌科克雷伯氏菌屬其中最為重要的一類菌,也是最常見的呼吸道定植菌,對人類有較強致病性,是引起臨床感染性疾病的常見病原菌,可引起呼吸道、血液、腹腔及泌尿系統(tǒng)等部位感染,是臨床分離及住院患者發(fā)生耐藥性機會性感染的重要致病菌之一。過去的十年中,由于產生超廣譜β-內酰胺酶(Extended-spectrumβ-lactam,ESBLs)和/或耐碳青霉烯類KP(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CR-Kp)的耐多藥菌株引起的醫(yī)療相關感染的流行率越來越高,KP已成為主要的臨床和公共衛(wèi)生威脅之一[1]。全國細菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)細菌耐藥性監(jiān)測報告顯示,2014~2019年革蘭陰性菌分離居前5位中,KP排名第一[2]??刮⑸锼幬锬退幮?Antimicrobial resistance,AMR) 是全球10 大健康威脅之一,在大流行前時期, AMR是世界上最重要的健康危機,盡管它通常比 COVID-19大流行更加沉默,但它同樣也可能產生破壞性的后果。2020年新型冠狀病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19) 大流行對全球衛(wèi)生系統(tǒng)產生了重大影響,包括其他健康威脅的管理,例如AMR[3]。隨著 SARS-CoV-2的出現(xiàn),為了盡量減少病毒的傳播和感染,所有的努力都集中在 COVID-19及其管理上,導致在抗生素使用和審核方面出現(xiàn)了一定程度的妥協(xié)[4-5]。COVID-19與細菌共感染的確切患病率尚不清楚,這進一步加強了不必要的經(jīng)驗性抗生素覆蓋[6-7]。有研究顯示,KP是COVID-19患者繼發(fā)性細菌性肺部感染的主要原因之一,其病因與 COVID-19 大流行前顯著不同,同時CR-Kp感染率有增加趨勢,尤其在重癥監(jiān)護病房[8-10]。臨床實踐中,疫情的常態(tài)化防控措施對呼吸系統(tǒng)相關疾病的發(fā)生情況及診療方式均造成了顯著的影響。合并基礎疾病患者的肺部感染率發(fā)生變化,可能導致其就診及住院情況均發(fā)生變化,這也可能間接導致患者病原學檢測結果發(fā)生變化。研究顯示,在疫情爆發(fā)及控制的一段時間內,病原菌抗生素耐藥情況的變化并不明朗[5]。針對COVID-19疫情防控導致病原菌類型及抗生素耐藥性的變化尚少見報道。為進一步了解新冠疫情前及常態(tài)化防控后KP感染分布以及耐藥性差異,指導防控后期臨床合理用藥,有效控制KP感染,本研究回顧性分析了疫情前后1年內成都大學附屬醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學科KP檢出情況及耐藥性變遷?,F(xiàn)報告如下。

        1 材料與方法

        1.1 菌株來源 收集新冠疫情前1年(2019年1月~12月)及疫情常態(tài)化防控后1年(2020年5月~2021年4月)成都大學附屬醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學科住院患者各類標本分離的培養(yǎng)結果,所有菌株均經(jīng)菌種鑒定和藥敏,剔除同一患者同一時期同一部位標本的重復菌株,根據(jù)藥敏結果確定耐藥菌株組數(shù)量,并隨機在敏感菌選擇相同數(shù)量作為對照組。各類標本的采集和送檢參照《臨床微生物標本采集和送檢指南》[11]進行。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會審核通過,且所有納入患者均簽署知情同意書。

        1.2 細菌鑒定與藥敏試驗 采用美國MicroScan WalkAway40全自動微生物鑒定儀和藥敏檢測系統(tǒng)進行菌株鑒定與藥物敏感測定。藥敏檢測方法為微量稀釋法測定最低抑菌濃度 (MIC),受檢細菌的菌液濃度為0.5麥氏單位。結果判讀參考檢測年份臨床實驗室標準化委員會 (CLSI) 標準[12]。

        2 結果

        2.1 疫情前后檢出標本來源 疫情前1年送檢標本共9316株,常態(tài)化防控后1年送檢標本共5664株,去除同一患者同一時期同類標本重復菌株,疫情前1年各種標本株為5386株,常態(tài)化防控后1年各種標本株為3622株。標本主要來源于痰液/支氣管液、血液、尿液、胸腹水及分泌物等,對疫情前1年及疫情常態(tài)化防控后1年微生物送檢樣本進行對比分析,疫情前后微生物送檢來源前3位的樣本均為痰液/支氣管液、血液及尿液,疫情后較疫情前尿液標本送檢率上升,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表1。

        表1 送檢樣本來源分布情況[n(×10-2)]

        2.2 疫情前后病原菌分布及構成比 疫情前1年所分離菌株排名前4位:肺炎克雷伯桿菌>鮑曼不動桿菌>銅綠假單胞菌>大腸埃希菌,占比依次為4.01%、3.01%、2.51%、0.99%;疫情常態(tài)化防控后1年所分離菌株排名前4位:銅綠假單胞菌>肺炎克雷伯菌>鮑曼不動桿菌>大腸埃希菌,分離率依次為5.38%、4.91%、2.54%、2.51%。疫情前1年及常態(tài)化防控后1年對比顯示,作為呼吸道感染主要病原菌的KP、銅綠假單胞菌及大腸埃希菌檢出率明顯上升,差異有統(tǒng)計學意義(均P<0.05),見表2。

        表2 排名前10位的檢出病原菌分布[n(×10-2)]

        2.3 疫情前后耐藥肺炎克雷伯菌檢出情況 去除同一患者住院期間同類標本重復菌株后,疫情前1年各種標本株5386株,其中共分離216株KP(4.01%),疫情后1年各種標本3622株, 其中共分離178株KP(4.91%),較疫情前顯著上升,差異有統(tǒng)計學意義(2=4.231,P<0.040)。比較疫情前后KP耐藥率,疫情前1年KP中耐藥KP 57株,占比26.39%,常態(tài)化防控后1年KP中耐藥KP 53株(26.78%),疫情前后比較,差異無統(tǒng)計學意義(2=0.556,P=0.456)。

        2.4 疫情前后耐藥肺炎克雷伯菌檢出患者一般情況及病因分布 疫情前1年及疫情常態(tài)化防控后1年患者年齡、性別等一般信息差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),耐藥肺炎克雷伯菌檢出以肺炎、重癥肺炎、慢性阻塞性肺疾病患者為主,多數(shù)患者合并有膿毒血癥及呼吸衰竭。重癥肺炎患者比例疫情前(63.16%)較疫情常態(tài)化防控后1年(43.4%)高,差異有統(tǒng)計學意義(P=0.038);慢性阻塞性肺疾病患者比例疫情前(15.79%)較疫情常態(tài)化防控后1年(54.72%)明顯上升,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.001),見表3。

        表3 患者一般信息及病因分布

        2.5 耐藥肺炎克雷伯菌對常用抗生素的藥敏結果 疫情前1年KP耐藥前5位抗生素為氨曲南(26.39%)、頭孢他啶(26.39%)、頭孢噻肟(25.46%)、氨芐西林/舒巴坦(24.54%)、復方新諾明(18.06%);疫情常態(tài)化防控后1年檢出耐藥KP前5位的抗生素為頭孢噻肟(29.78%)、氨曲南(29.21%)、頭孢他啶(29.21%)、氨芐西林/舒巴坦(25.84%)、環(huán)丙沙星(16.29%)、厄他培南(16.29%)。疫情前后比較,對復方新諾明耐藥率顯著下降(均P<0.05)。見表4。對疫情前后產ESBL肺炎克雷伯菌耐藥率比較,疫情前后氨曲南、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢噻肟差異無統(tǒng)計學意義(均P>0.05),見表5。

        表5 疫情前后產ESBL肺炎克雷伯菌的在所有肺炎克雷伯菌占比變化[n(×10-2)]

        3 討論

        COVID-19疫情全球的大流行擾亂了世界各地的醫(yī)療保健系統(tǒng)和實踐。作為應對措施的一部分,有證據(jù)表明抗生素處方習慣已受到深刻影響,如對抗生素管理流程及方案的被迫改變,最終引起耐藥菌控制形勢日益嚴峻[13]。同時,各種致力于改善抗生素耐藥情況的管控措施執(zhí)行力度也非正常放松,這成為抗生素耐藥比例發(fā)生變化的重要原因,并可能造成長期持續(xù)性影響[14]。研究顯示COVID-19疫情對CR-Kp爆發(fā)、AMR存在影響,也有研究者探討AMR導致的全球性后果的相關議題[6-10]。

        AMR是全球健康和經(jīng)濟發(fā)展面臨的最緊迫威脅之一[15-16]。歐洲疾病預防控制中心報告稱,2019年期間,耐藥菌導致超過670000例感染和33000例死亡[17],僅在美國,抗藥性細菌和真菌每年至少造成300萬新感染和35900人死亡[18]。研究發(fā)現(xiàn)在2020年6~9月間,COVID-19可能導致印度2.164億非兒童適用制劑抗生素的過量使用,以及3800萬非兒童適用制劑阿奇霉素的過量使用[19]。在新冠疫情防控中我國取得了相對其他國家更具成效的防控成果,迅速恢復了正常經(jīng)濟、社會秩序,包括疫情防控下的醫(yī)療秩序的快速恢復[20-21]。2021年,國家衛(wèi)生健康委發(fā)布加強抗微生物藥物管理遏制耐藥工作,要求規(guī)范感染性疾病的臨床診療并加強細菌耐藥檢測及抗生素臨床應用監(jiān)測[22]。

        本研究對比分析了疫情前后KP的變化趨勢。通過對樣本來源進行分析發(fā)現(xiàn),樣本主要來源是痰/支氣管液,這與相應研究結果較為一致[23]。CHINET 2020年報顯示,自2017年起,肺炎克雷伯菌在呼吸道標本的分離率超過鮑曼不動桿菌,上升至第1位,本研究中,KP檢出率在本研究中位于第一位,這也與呼吸道標本一致[24]。本研究疫情后KP檢出率顯著上升,但KP中耐藥KP檢出比例無顯著差異,這與部分國外相關研究不一致[3,4,7-10],這可能是國外大多數(shù)相關研究以ICU中重癥或COVID-19患者為樣本來源,同時可能與我國疫情防控措施導致的患者住院情況發(fā)生改變有關。本研究發(fā)現(xiàn)疫情常態(tài)防控后耐藥KP檢出患者中重癥肺炎比例有所下降,但是慢性阻塞性肺疾病患者有所增多,考慮與慢性阻塞性肺疾病患者急性加重期間,住院次數(shù)減少,自行服藥抗菌藥物等因素有關。研究顯示,在抗菌藥物處方率高的環(huán)境中,例如內科病房和重癥監(jiān)護病房,難以治療的細菌感染越來越多與死亡率升高相關聯(lián)[25-26]。本研究顯示,在耐藥KP患者中,重癥患者比例較高,同時較多患者合并膿毒血癥、呼吸衰竭等。

        疫情期間由于患者醫(yī)院就診減少,尤其是各種針對性隔離措施,均可能增加潛在感染患者早期服用抗生素可能,這可能導致廣泛地使用抗生素,短期內引起病原體以及耐藥性的變化。本研究進一步分析耐藥KP抗生素耐藥性的變化,發(fā)現(xiàn)氨曲南、頭孢他啶、頭孢噻肟、氨芐西林/舒巴坦、復方新諾明在疫情前1年及疫情常態(tài)化防控后1年均為耐藥率較高的抗生素,而在疫情常態(tài)化防控后,復方新諾明耐藥率顯著下降。

        本研究有助于明確COVID-19導致KP耐藥性變化的一些趨勢,可能有助于促進其針對性藥物開發(fā)過程中的臨床前研究。新冠疫情發(fā)生及疫情相關防控措施導致KP檢出情況發(fā)生了變化,在疫情常態(tài)化防控期間,臨床醫(yī)師在選擇抗生素時應根據(jù)藥敏選擇本地區(qū)耐藥率相對低的藥物,優(yōu)化和改進抗生素使用策略,同時應避免抗生素濫用,減少耐藥細菌的產生。醫(yī)院在執(zhí)行嚴格疫情常態(tài)化防控措施的同時,應通過合理的防控措施進一步加強KP尤其是耐藥KP的管理。本次研究屬于單中心回顧性分析,數(shù)據(jù)來源相對局限,且樣本量偏少,僅能反應本中心的部分情況,但本研究結果初次分析了疫情前后呼吸與危重癥醫(yī)學科KP檢出特征及耐藥性的變化,可供臨床參考,后期可通過多中心、大樣本研究進一步證實。

        4 結論

        COVID-19疫情的發(fā)生導致KP檢出情況及耐藥性均發(fā)生了變化,應引起臨床高度重視,疫情常態(tài)化防控期間應對KP感染采取精準積極的干預措施,加強KP檢出患者的管理并合理選用抗生素,減少耐藥KP的產生與傳播。

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