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        細(xì)胞內(nèi)源性分子輔助熒光信號(hào)放大策略及細(xì)胞成像

        2023-01-25 05:33:56馬小飛李俊彬諶委菊卿志和周怡波楊榮華
        關(guān)鍵詞:內(nèi)源性靶標(biāo)染料

        馬小飛,胡 山,李俊彬,楊 盛,諶委菊,卿志和,周怡波,楊榮華

        (1.長沙理工大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,細(xì)胞化學(xué)湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長沙 410114;2.湖南師范大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,化學(xué)生物學(xué)及中藥分析教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長沙 410081)

        準(zhǔn)確獲取細(xì)胞內(nèi)分子信息對(duì)于闡明生理和病理相關(guān)機(jī)制至關(guān)重要[1],熒光探針具有靈敏度高、實(shí)時(shí)監(jiān)測和非侵入性等優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、生物學(xué)和分析化學(xué)等領(lǐng)域[2,3].但部分靶標(biāo)的低豐度特性為傳統(tǒng)熒光探針的檢測應(yīng)用帶來巨大挑戰(zhàn).信號(hào)放大策略通過增加輸出信號(hào)強(qiáng)度來提高熒光探針檢測靈敏度,進(jìn)而對(duì)惡性疾病相關(guān)的信號(hào)分子和生物標(biāo)志物進(jìn)行檢測[4].常規(guī)細(xì)胞內(nèi)信號(hào)放大方法包括雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Hybrid chain reaction,HCR)[5~7]、等溫?cái)U(kuò)增-支點(diǎn)介導(dǎo)滾環(huán)放大(Rolling circle amplification,RCA)[8~10]及催化發(fā)夾自組裝反應(yīng)(Catalytic hairpin assembly,CHR)[11~13]等,通過在細(xì)胞內(nèi)原位產(chǎn)生DNA構(gòu)象變化對(duì)內(nèi)源性核酸靶標(biāo)物進(jìn)行高靈敏成像.但這些核酸信號(hào)放大策略依賴外源性金屬離子或核酸,而外部添加物將不可避免地對(duì)細(xì)胞內(nèi)微環(huán)境造成干擾,進(jìn)而影響機(jī)體的正常生理活動(dòng).因此,如何克服外源性添加物依賴性,發(fā)展適用于低豐度目標(biāo)物檢測的信號(hào)放大方法具有重要意義.

        核酸、蛋白質(zhì)、脂類等生物大分子,谷胱甘肽(Glutathione,GSH)和三磷酸腺苷(Adenosine triphosphate,ATP)等活性小分子以及金屬離子(Na+,K+,Ca2+,Mg2+)是構(gòu)成細(xì)胞的重要成分,且其在細(xì)胞內(nèi)濃度較高.基于此,研究者們利用高豐度胞內(nèi)分子作放大基質(zhì),構(gòu)建了多種新型熒光信號(hào)放大策略用于細(xì)胞內(nèi)重要靶標(biāo)物的檢測及熒光成像.本文對(duì)目前已報(bào)道的細(xì)胞內(nèi)源性分子輔助信號(hào)放大方法進(jìn)行了歸納整理,介紹其信號(hào)放大機(jī)制,并總結(jié)了該策略在生物傳感領(lǐng)域取得的重要研究進(jìn)展.

        1 內(nèi)源性核酸輔助信號(hào)放大

        內(nèi)源性核酸輔助信號(hào)放大策略利用高濃度內(nèi)源性核酸分子作輔助鏈,參與核酸雜交反應(yīng),通過釋放多個(gè)分子信標(biāo)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)原位信號(hào)擴(kuò)增,從而對(duì)低濃度核酸靶標(biāo)物進(jìn)行檢測.此方法無需外源性輔助鏈,彌補(bǔ)了常規(guī)細(xì)胞內(nèi)核酸信號(hào)放大方法的缺點(diǎn).

        Wang等[14]構(gòu)建了一種用于miRNA(micro RNA)放大檢測及熒光成像的納米耀斑,首次將內(nèi)源性mRNA(messenger RNA)用作信號(hào)放大基質(zhì).該納米耀斑的檢出限低至9.0 pmol/L,比常規(guī)納米耀斑低約3個(gè)數(shù)量級(jí).如圖1(A)所示,金納米顆粒負(fù)載2種類型的DNA雙鏈體(R/S和F*/R*),分別可與靶標(biāo)miRNA和內(nèi)源性輔助鏈mRNA反應(yīng).miRNA與R/S反應(yīng)后可釋放單個(gè)分子信號(hào)產(chǎn)生熒光信號(hào),同時(shí),細(xì)胞內(nèi)高濃度mRNA與F*/R*作用釋放大量單鏈核酸(R*),其與R/S發(fā)生競爭反應(yīng)后釋放靶標(biāo)miRNA,從而參與下一循環(huán),以此產(chǎn)生大量分子信標(biāo)實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)放大.細(xì)胞成像結(jié)果表明,與常規(guī)納米耀斑相比,基于內(nèi)源性mRNA輔助放大策略構(gòu)筑的納米耀斑展現(xiàn)出更高的熒光強(qiáng)度[圖1(B)].

        Huang等[15]構(gòu)建了一種用于活細(xì)胞中miRNA成像的新型光籠放大納米耀斑.將DNA雙鏈體F*/R*和光響應(yīng)的三重鏈R/P/S結(jié)合到金納米顆粒上構(gòu)建了納米耀斑,其熒光信號(hào)強(qiáng)度與miRNA濃度對(duì)數(shù)值之間的線性關(guān)系良好,檢出限為3.5 pmol/L,比傳統(tǒng)納米耀斑低約3個(gè)數(shù)量級(jí).在光照條件下,三重鏈裂解產(chǎn)生游離的P鏈,R鏈裸露的部分與靶標(biāo)物miRNA反應(yīng)后可釋放單個(gè)分子信標(biāo)產(chǎn)生熒光信號(hào).而細(xì)胞內(nèi)高濃度的mRNA可繼續(xù)參與鏈置換反應(yīng)釋放靶標(biāo)miRNA,進(jìn)而不斷循環(huán)實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)放大.與Wang等[14]報(bào)道的納米耀斑相比,該納米耀斑引入了光控裝置,可對(duì)納米機(jī)器進(jìn)行時(shí)空控制,避免產(chǎn)生非特異性信號(hào),從而提高了檢測的精準(zhǔn)度和靈敏度.在紫外光照射下,與常規(guī)納米耀斑相比,基于該策略設(shè)計(jì)的納米耀斑表現(xiàn)出更強(qiáng)的熒光信號(hào),表明該探針可通過光控對(duì)內(nèi)源性miRNA進(jìn)行精確熒光成像.

        與傳統(tǒng)的納米耀斑相比,基于內(nèi)源性核酸輔助信號(hào)放大策略所構(gòu)建的放大型熒光能量共振轉(zhuǎn)移(Fluorescence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)納米耀斑具有較強(qiáng)的抗干擾能力,可在一定程度上避免DNA水解酶和谷胱甘肽所引起的假陽性信號(hào),從而提高其檢測靈敏度和精確度.然而,該策略的檢測對(duì)象局限于核酸分子,不適用于活性小分子物種及其它生物大分子,且核酸在細(xì)胞復(fù)雜環(huán)境中不穩(wěn)定,DNA降解后將嚴(yán)重影響信號(hào)放大效率及檢測準(zhǔn)確性.

        Fig.1 An endogenous mRNA-powered nanoflare image of intracellular microRNA in living cells[14]

        2 內(nèi)源性酶輔助信號(hào)放大

        酶具有良好的催化活性,可催化相應(yīng)底物產(chǎn)生指數(shù)倍信號(hào)輸出,是提高檢測靈敏度的有效方法[16].基于酶的信號(hào)放大方法,如環(huán)介導(dǎo)的等溫放大(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[17]、鏈置換放大(Strand displacement amplification,SDA)[18]和滾環(huán)放大(Rolling circle amplification,RCA)[19,20]等可對(duì)微量目標(biāo)物進(jìn)行體外檢測,但其對(duì)酶的依賴性阻礙了其在活細(xì)胞內(nèi)的進(jìn)一步應(yīng)用.

        Su等[21]受堿基切除修復(fù)過程的啟發(fā),首次構(gòu)建了由胞內(nèi)核酸內(nèi)切酶(Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease I,APE1)驅(qū)動(dòng)的“燒橋”DNA馬達(dá).如圖2(A)所示,APE1是一種DNA損傷修復(fù)的核酸內(nèi)切酶,對(duì)雙鏈DNA中脫嘌呤嘧啶(Apurinopyrimidine,AP)位點(diǎn)具有高度特異性,可實(shí)現(xiàn)核酸定向自主運(yùn)動(dòng).如圖2(B)所示,通過單分子熒光技術(shù)監(jiān)測DNA馬達(dá)的移動(dòng)性,證實(shí)該系統(tǒng)具有優(yōu)異的可控性和連續(xù)性.該DNA馬達(dá)的速度高度依賴于APE1濃度,通過不同濃度APE1產(chǎn)生不同熒光信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)癌細(xì)胞[圖2(C1)]和正常細(xì)胞[圖2(C2)]進(jìn)行有效區(qū)分.

        Jiang等[22]構(gòu)建了一種由核酸內(nèi)切酶APE1驅(qū)動(dòng)的DNA walker,可在細(xì)胞內(nèi)原位成像尿嘧啶-DNA糖基化酶(Uracil-DNA Glycocasylase,UDG).如圖3(A)所示,通過將所有組分整合到DNA-AuNP偶聯(lián)物中,該DNA walker可有效避免功能核酸組分非特異性降解,從而降低背景熒光信號(hào).進(jìn)入細(xì)胞后,DNA walker與UDG相互作用,軌道鏈中的尿嘧啶堿基被切除,暴露出AP識(shí)別位點(diǎn),繼而與核酸內(nèi)切酶APE1發(fā)生反應(yīng),導(dǎo)致熒光素釋放,從而恢復(fù)熒光信號(hào).如此往復(fù),大量熒光團(tuán)被釋放產(chǎn)生熒光信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)UDG的高靈敏檢測.如圖3(B)所示,與以胸腺嘧啶代替尿嘧啶的對(duì)照組相比,DNA walker在細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生明顯的綠色熒光信號(hào),表明在細(xì)胞內(nèi)源性UDG和APE1的作用下,DNA walker能夠靈敏地檢測活細(xì)胞中的UDG活性.

        細(xì)胞內(nèi)的大分子擴(kuò)散決定了生物化學(xué)過程的動(dòng)力學(xué),同時(shí)也限制了仿生DNA納米機(jī)器的應(yīng)用[23~26].Zhao等[27]設(shè)計(jì)了一種可以在活細(xì)胞中原位快速“行走”的DNA分子馬達(dá),在擴(kuò)散受限的微環(huán)境(如細(xì)胞質(zhì))中啟動(dòng)粒子“行走”.如圖4(A)所示,單鏈DNA(DW)、含有識(shí)別位點(diǎn)(I,oG)的DNA(DTs)通過Au-S作用修飾在金納米顆粒上形成DNA walker.DW與DT可形成雙聯(lián),進(jìn)而激活其特異性位點(diǎn).進(jìn)入細(xì)胞后,內(nèi)源性糖苷酶與DT發(fā)生特異性反應(yīng),移除受損的8-氧鳥嘌呤(oG)或肌苷(I)堿基從而暴露AP位點(diǎn).該位點(diǎn)可與APE1酶作用從而使DT鏈斷裂,釋放熒光團(tuán).錨定的DW可以與其它DT分子形成新的雙聯(lián),以此循環(huán)釋放更多的熒光團(tuán).如圖4(B)所示,2種陰性對(duì)照系統(tǒng)(無DW和隨機(jī)序列DW)處理的細(xì)胞熒光信號(hào)極弱,而孵育DNA walker的細(xì)胞有明顯熒光信號(hào).與常規(guī)組裝系統(tǒng)相比,此方法可避免低效率的擴(kuò)散組裝并加速反應(yīng)動(dòng)力學(xué),對(duì)不同細(xì)胞的異質(zhì)環(huán)境做出可靠響應(yīng).

        Fig.2 Intracellular endonuclease-driven DNA motors for discrimination of cancer cells and normal cells[21]

        Fig.3 Endogenous enzyme-driven DNA walker image of uracil-DNA glycosylase in living cells[22]

        Fig.4 DNA walkers image of diffusion-restricted microenvironments in cells[27]

        酶是細(xì)胞內(nèi)廣泛存在的生物大分子,可作為刺激物用于分子檢測和藥物釋放[28~30].利用內(nèi)源性酶輔助信號(hào)放大可避免外源添加酶對(duì)宿主基因造成損害,但是該策略的信號(hào)放大效率依賴酶的活性,導(dǎo)致其檢測精確度較低且局限于特定的檢測對(duì)象,不適用于其它小分子(如活性氧)的檢測.

        3 胞漿蛋白輔助信號(hào)放大

        蛋白質(zhì)是細(xì)胞的重要組成部分,是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者,與細(xì)胞的生長[31,32]、新陳代謝[33,34]、應(yīng)激反應(yīng)[35,36]及免疫反應(yīng)[37,38]關(guān)系密切.借助活細(xì)胞內(nèi)高豐度胞漿蛋白輔助增強(qiáng)探針的熒光信號(hào),可實(shí)現(xiàn)低豐度靶標(biāo)物的原位檢測[39,40].

        本課題組[41]通過對(duì)大量染料與細(xì)胞裂解液作用后篩選出熒光增強(qiáng)型染料,并進(jìn)一步證明該染料可與胞漿蛋白中的肌動(dòng)蛋白發(fā)生特異性結(jié)合,使熒光信號(hào)大幅度增強(qiáng).基于此,利用介孔二氧化硅作載體,構(gòu)建了一種胞漿蛋白輔助信號(hào)放大納米探針用于檢測細(xì)胞內(nèi)羥基自由基(·OH).如圖5(A)所示,修飾單鏈DNA的功能化介孔硅負(fù)載大量熒光染料,表面吸附聚合物(PTAD)構(gòu)成納米探針.當(dāng)探針進(jìn)入細(xì)胞后,內(nèi)源性·OH裂解單鏈DNA,使表面堵孔聚合物脫離,從而釋放出大量染料,恢復(fù)其熒光信號(hào),且釋放出的染料可與胞漿蛋白結(jié)合進(jìn)一步大幅度增強(qiáng)熒光信號(hào),其放大效率高達(dá)近400倍.通過級(jí)聯(lián)式信號(hào)放大,納米探針對(duì)·OH展現(xiàn)出極高的檢測靈敏度,檢出限為6.4 pmol/L.如圖5(B)所示,將探針與巨噬細(xì)胞一起孵育后,熒光信號(hào)隨著孵育時(shí)間逐漸增強(qiáng),表明該探針可有效進(jìn)入細(xì)胞且對(duì)內(nèi)源性·OH進(jìn)行熒光成像.

        Fig.5 Nanosensor based on cytoplasmic protein-assisted signal amplification for imaging of·OH[41]

        基于蛋白結(jié)合熒光信號(hào)增強(qiáng)策略,本課題組[42]在介孔硅上修飾缺氧響應(yīng)型偶氮苯甲酸,負(fù)載熒光染料及猝滅劑后,與環(huán)糊精聚合物發(fā)生主-客體作用構(gòu)造新型納米探針(HCFA).該探針的檢測信噪比(S/B)可高達(dá)791.5倍,且信噪比與氧濃度在0~10%范圍內(nèi)具有良好的線性關(guān)系.如圖6(A)所示,當(dāng)HCFA因滯留效應(yīng)被動(dòng)靶向急性發(fā)炎的結(jié)腸組織時(shí),偶氮鍵在缺氧條件下還原為氨基衍生物,其與環(huán)糊精聚合物之間的主-客相互作用被破壞,染料逸出恢復(fù)熒光.同時(shí),游離態(tài)染料可與胞漿蛋白結(jié)合,進(jìn)一步增強(qiáng)其熒光強(qiáng)度.圖6(B)和(C)所示熒光成像結(jié)果表明,探針HCFA可區(qū)分細(xì)胞不同程度的缺氧情況,并在小鼠活體內(nèi)成像不同程度的腸炎,從而揭示急性結(jié)腸炎與缺氧的潛在關(guān)系.

        本課題組[43]還構(gòu)建了H2Sn響應(yīng)型聚合物膠束,在其內(nèi)部負(fù)載蛋白增強(qiáng)型染料及猝滅劑構(gòu)成新型熒光納米信標(biāo).該納米信標(biāo)可以在體外靈敏地響應(yīng)H2Sn,信噪比可達(dá)941.2倍,且信噪比與H2Sn濃度在0.02~30μmol/L范圍內(nèi)有較好的線性關(guān)系,檢出限低至0.42 nmol/L.如圖7(A)所示,納米信標(biāo)進(jìn)入胚胎細(xì)胞后,被內(nèi)源性H2Sn激活釋放熒光染料,染料與猝滅劑脫離后熒光信號(hào)恢復(fù),且染料可與胞漿蛋白結(jié)合,進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)的大幅度增強(qiáng),達(dá)到二次信號(hào)放大的目的.聚合物納米信標(biāo)通過兩次信號(hào)放大模式展現(xiàn)出極高的靈敏度,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)胚胎發(fā)育過程中的H2Sn進(jìn)行熒光成像.由圖7(B)所示斑馬魚成像結(jié)果可知,受精卵內(nèi)H2Sn的濃度較低,隨著胚胎發(fā)育熒光強(qiáng)度逐漸增強(qiáng)(2.5 hpf),表明H2Sn的濃度升高.但原腸胚期(6 hpf)后,熒光強(qiáng)度開始降低,其中體節(jié)期熒光強(qiáng)度降低至50%,并逐漸達(dá)到平穩(wěn),表明H2Sn在抗氧化、保護(hù)正常生理發(fā)育等過程中發(fā)揮重要作用.

        Fig.6 Nanoprobe based on cytoplasmic protein-assisted signal amplification image of hypoxia associated with acute colitis[42]

        Fig.7 Monitoring the fluctuation of hydrogen polysulfides during fertilization and embryonic development with polymeric nanobeacon[43]

        利用納米顆粒負(fù)載染料可實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)的有效放大,但染料非特異性泄露也極易誘發(fā)假陽性信號(hào),導(dǎo)致信號(hào)獲取不準(zhǔn)確.基于此,本課題組[44]提出一種以染料為支架的新型信號(hào)放大策略,構(gòu)建了自降解染料摻雜聚合物探針(SDPP)[圖8(A)].與染料負(fù)載納米探針相比,該探針穩(wěn)定性好、抗干擾能力強(qiáng),能精確檢測·OH,其放大效率可達(dá)396.9倍.如圖8(B)所示,SDPP進(jìn)入細(xì)胞后可被·OH激活,通過自降解反應(yīng)釋放染料,進(jìn)而與蛋白結(jié)合放大熒光信號(hào).與染料負(fù)載型納米探針相比,SDPP可有效避免假陽性信號(hào),精確成像細(xì)胞內(nèi)·OH.活體熒光成像結(jié)果表明,SDPP可對(duì)活體內(nèi)心肌炎相關(guān)·OH進(jìn)行準(zhǔn)確成像.該工作不僅為活體中·OH的成像提供了一種有效的分子工具,而且為精確可靠地獲取細(xì)胞內(nèi)分子信息的信號(hào)放大策略提供了新的方向[圖8(C)].

        蛋白輔助放大策略以蛋白結(jié)合熒光增強(qiáng)型染料為基礎(chǔ),利用不同納米顆粒作載體,修飾特異性響應(yīng)開關(guān)后負(fù)載染料構(gòu)建負(fù)載型熒光納米探針.該類納米探針選擇性好、抗干擾能力強(qiáng),且基于納米顆粒的高負(fù)載性及蛋白增強(qiáng)熒光機(jī)制,納米探針的響應(yīng)靈敏度高,可用于檢測各種低豐度靶標(biāo)物(如細(xì)胞內(nèi)核酸和小分子).但是,負(fù)載型納米探針在活體應(yīng)用中面臨染料泄露產(chǎn)生假陽性信號(hào)的問題.自降解染料摻雜聚合物探針雖然可以避免上述問題,但基于靶標(biāo)觸發(fā)的自降解反應(yīng)所需時(shí)間較長,在小鼠活體應(yīng)用熒光成像中面臨一定問題.

        Fig.8 Self-immolative dye-doped polymeric probe image of·OH by avoiding leakage[44]

        Fig.9 ATP-driven photosensitizers image of microRNA in cells[48]

        4 內(nèi)源性小分子輔助信號(hào)放大

        ATP作為一種高能磷酸小分子化合物,是細(xì)胞生命活動(dòng)的主要能量來源,且普遍存在于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中.同時(shí),ATP可以作為信號(hào)分子用于調(diào)節(jié)細(xì)胞主動(dòng)運(yùn)輸[45]、神經(jīng)傳遞[46]和離子通道[47],在細(xì)胞內(nèi)含量高且濃度穩(wěn)定.因此,ATP是一種理想的細(xì)胞內(nèi)源性信號(hào)放大分子.近年來,已開發(fā)了幾種利用細(xì)胞內(nèi)ATP作為燃料的DNA納米機(jī)器,用于細(xì)胞內(nèi)低豐度核酸靶標(biāo)物的檢測.

        Xu等[48]基于ATP驅(qū)動(dòng)的鏈置換級(jí)聯(lián)擴(kuò)增策略,設(shè)計(jì)了一種腫瘤靶向miRNA激活的納米光敏劑Y-motif/FA@HyNP.該光敏劑在水溶液中穩(wěn)定性好,可以特異性、高靈敏地檢測miRNA,其檢出限為0.4 pmol/L.如圖9(A)所示,在半導(dǎo)體量子點(diǎn)表面修飾葉酸及功能DNA(Y-motif)構(gòu)成納米光敏劑.當(dāng)利用葉酸靶向腫瘤細(xì)胞后,細(xì)胞內(nèi)miRNA與Y-motif特異性結(jié)合,釋放出其中的ATP適配體.適配體與胞內(nèi)高豐度ATP結(jié)合后,可進(jìn)一步釋放出miRNA特異性結(jié)合序列參與循環(huán)反應(yīng).同時(shí),Y-motif構(gòu)象變化導(dǎo)致猝滅劑脫離,恢復(fù)量子點(diǎn)熒光及光動(dòng)力學(xué)治療功能.如圖9(B)所示,與正常細(xì)胞相比,Y-motif/FA@HyNP在癌細(xì)胞中有明顯的熒光信號(hào),表明納米光敏劑可通過葉酸受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用靶向腫瘤細(xì)胞.熒光成像結(jié)果表明,Y-motif/FA@HyNPs以細(xì)胞內(nèi)ATP為燃料,可對(duì)MCF-7細(xì)胞中低水平內(nèi)源核酸Let-7a進(jìn)行靈敏熒光成像.

        Ye等[49]報(bào)道了一種簡單、高度集成的DNA納米機(jī)器,通過ATP與適配體的特異性結(jié)合驅(qū)動(dòng)納米機(jī)器產(chǎn)生熒光信號(hào),對(duì)細(xì)胞內(nèi)miRNA進(jìn)行成像.該納米機(jī)器可高靈敏、特異性地響應(yīng)miRNA,熒光強(qiáng)度與T堿基濃度在100 pmol/L~2 nmol/L范圍內(nèi)具有良好的線性關(guān)系.如圖10(A)所示,單鏈發(fā)夾搖臂及功能雙鏈結(jié)合于金納米顆粒上構(gòu)成納米機(jī)器.當(dāng)細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo)核酸與發(fā)夾搖臂結(jié)合后,發(fā)夾DNA打開,其端部序列自由擺動(dòng),與金顆粒表面功能雙鏈雜交,競爭下修飾熒光基團(tuán)的ATP適配體.同時(shí),細(xì)胞內(nèi)ATP可進(jìn)一步與適配體作用,使其遠(yuǎn)離金納米顆粒,恢復(fù)熒光信號(hào).基于細(xì)胞內(nèi)ATP的高豐度性,可使大量適配體脫離納米顆粒進(jìn)而產(chǎn)生高強(qiáng)度熒光信號(hào).如圖10(B)和(C)所示,該納米機(jī)器可以區(qū)分人胚胎腎細(xì)胞(HEK-293T)和人胚肺成纖維細(xì)胞(MRC-5)中不同濃度的miRNA-21,并靈敏地檢測到HEK-293T中低表達(dá)的miRNA-21,表明該納米機(jī)器對(duì)細(xì)胞內(nèi)miRNA成像的良好適用性和準(zhǔn)確性,且成像時(shí)間可持續(xù)2 h.

        Fig.10 DNA nanomachine powered by endogenous ATP sense target in living cells[49]

        Xian等[50]開發(fā)了一種ATP驅(qū)動(dòng)光激活DNA walker,用于活細(xì)胞中miRNA的時(shí)空可控?zé)晒獬上?該DNA walker可以高靈敏響應(yīng)miRNA,且熒光強(qiáng)度與miR-21的濃度對(duì)數(shù)在100 pmol/L~5 nmol/L范圍內(nèi)呈良好的線性關(guān)系.如圖11(A)所示,上轉(zhuǎn)換納米顆粒作為載體負(fù)載DNA發(fā)夾(HP)探針構(gòu)成納米機(jī)器.待其進(jìn)入細(xì)胞后,在近紅外光激發(fā)下上轉(zhuǎn)換納米顆粒發(fā)出紫外光,激活DNA發(fā)夾位點(diǎn)使其斷裂,暴露靶標(biāo)結(jié)合序列.靶標(biāo)物miR-21與其結(jié)合釋放激活單鏈,參與DNA walker激活循環(huán)中.與Ye等[49]報(bào)道的DNA納米機(jī)器原理類似,此DNA walker利用上轉(zhuǎn)換納米顆粒產(chǎn)生的紫外光激活傳感器,并利用ATP與適配體作用釋放熒光信號(hào)報(bào)告單元,具備時(shí)空可控性.如圖11(B)所示,該DNA Walker可對(duì)細(xì)胞內(nèi)miR-21進(jìn)行檢測和熒光成像.

        半導(dǎo)體或金納米顆粒對(duì)于組裝在其表面的DNA組分具有很強(qiáng)的保護(hù)性,可在一定程度上抵抗酶的降解,從而使納米機(jī)器具有較好的穩(wěn)定性.實(shí)驗(yàn)結(jié)果也表明,上述報(bào)道探針的穩(wěn)定性好,具有一定的抗干擾能力.但是ATP輔助信號(hào)放大方法以DNA適配體與分子相互作用為基礎(chǔ),而ATP與適體之間的相互作用不穩(wěn)定,其復(fù)合物在復(fù)雜的細(xì)胞內(nèi)微環(huán)境中容易被生物分子(如酶和蛋白質(zhì))降解,將嚴(yán)重影響信號(hào)放大效率.

        Fig.11 Imaging of intracellular microRNA with near-infrared light controllable DNA walker driven by ATP[50]

        Fig.12 Nanoprobe based on metal ion-assisted signal amplification for miRNA imaging[53]

        5 內(nèi)源性離子輔助信號(hào)放大

        細(xì)胞內(nèi)金屬離子(K+,Mg2+,Ca2+等)參與細(xì)胞分裂、神經(jīng)信號(hào)傳遞等生理過程,對(duì)維持細(xì)胞結(jié)構(gòu)及蛋白酶活性具有重要作用,且其在細(xì)胞內(nèi)濃度較高.如細(xì)胞內(nèi)Mg2+通常由各種轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和離子通道控制,其濃度保持在0.5~1.2 mmol/L范圍內(nèi)[51,52].利用金屬離子作為信號(hào)放大基質(zhì)或參與信號(hào)放大反應(yīng)過程,可有效提高檢測靈敏度.

        Wang等[53]開發(fā)了一種負(fù)載DNAzyme的金納米顆粒熒光探針,用于放大檢測細(xì)胞內(nèi)miRNA.該納米探針在Mg2+存在時(shí)可高靈敏地檢測靶標(biāo)miR-21,檢出限為10 pmol/L,且其生物相容性好,具有一定的抗干擾能力,適用于細(xì)胞中miRNA成像.如圖12(A)所示,該探針由金納米顆粒和分裂DNAzyme雜交的底物序列組成.熒光基團(tuán)靠近猝滅劑,其熒光信號(hào)被猝滅.當(dāng)探針進(jìn)入細(xì)胞后,靶標(biāo)物miRNA與分裂的DNAzyme結(jié)合形成活性二級(jí)結(jié)構(gòu),在細(xì)胞內(nèi)Mg2+催化作用下發(fā)生斷裂,釋放修飾有熒光基團(tuán)的核酸序列及靶標(biāo)物,產(chǎn)生熒光信號(hào).同時(shí),釋放的靶標(biāo)物可參與下一循環(huán),大量熒光基團(tuán)被釋放產(chǎn)生高強(qiáng)度熒光信號(hào),從而對(duì)細(xì)胞內(nèi)miRNA進(jìn)行檢測.如圖12(B)所示,在細(xì)胞生理濃度Mg2+條件下,細(xì)胞熒光強(qiáng)度隨著探針孵育時(shí)間逐漸增強(qiáng),與之對(duì)比,正常細(xì)胞(L02)始終未觀察到明顯的熒光,說明該探針利用細(xì)胞固有Mg2+催化作用,可對(duì)腫瘤細(xì)胞及正常細(xì)胞中miRNA進(jìn)行成像,并依此區(qū)分細(xì)胞.

        6 總結(jié)與展望

        本文介紹了內(nèi)源性核酸、酶、蛋白質(zhì)、ATP和金屬離子輔助信號(hào)放大探針的構(gòu)建和響應(yīng)機(jī)理,總結(jié)了其在細(xì)胞內(nèi)低豐度靶標(biāo)物檢測及相關(guān)病理研究中的應(yīng)用.該類探針基于納米顆粒(如金納米顆粒、介孔二氧化硅及聚合物膠束等)的高負(fù)載性,利用細(xì)胞內(nèi)固有的分子為放大基質(zhì),實(shí)現(xiàn)原位信號(hào)放大.與常規(guī)細(xì)胞內(nèi)信號(hào)放大策略相比,該信號(hào)放大策略不依賴外源性輔助物,所用納米顆粒均具有良好的生物相容性,且其降解物易被機(jī)體排出體外,因此不會(huì)對(duì)機(jī)體造成影響.在探針設(shè)計(jì)中充分利用了生物體系的多樣性,在靶標(biāo)相關(guān)生化信息的超靈敏獲取中展現(xiàn)其獨(dú)特優(yōu)勢(shì).

        當(dāng)然,該策略面臨眾多困難與挑戰(zhàn),如核酸輔助信號(hào)放大策略的檢測對(duì)象局限于核酸,且核酸探針在細(xì)胞復(fù)雜環(huán)境中不穩(wěn)定,降解后將影響信號(hào)放大效率及檢測準(zhǔn)確性;而ATP輔助信號(hào)放大方法由于ATP與適配體作用力弱,在細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜微環(huán)境中進(jìn)一步被削弱,進(jìn)而影響其信號(hào)放大效率;基于蛋白輔助信號(hào)放大策略構(gòu)建的負(fù)載型熒光納米探針在活體應(yīng)用中存在染料泄露產(chǎn)生假陽性信號(hào)的問題.因此,如何克服內(nèi)源性分子輔助信號(hào)放大策略的缺點(diǎn),發(fā)展更為完善的信號(hào)放大方法用于低豐度重要疾病標(biāo)志物的檢測,在熒光成像應(yīng)用方面做出新的突破,是研究者努力的方向.如利用細(xì)胞內(nèi)ATP高豐度特性,設(shè)計(jì)高親和力的信號(hào)報(bào)告單元,可避免ATP-信號(hào)體復(fù)合物在復(fù)雜環(huán)境中信號(hào)強(qiáng)度受限的問題.總之,基于內(nèi)源性分子輔助信號(hào)放大方法的提出為熒光探針在生化傳感領(lǐng)域的應(yīng)用開辟了新的方向,也為揭示重要疾病標(biāo)志物與疾病潛在關(guān)系提供了有力的工具.

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